BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-454B24.T7 (MSMg01no454_b24.b1) | MSMg01-454B24.TJ (MSMg01no454_b24.g1) |
ACC | AG540975 | AG540976 |
length | 776 | 754 |
length of high quality (start - end) | 469 (46 - 514) | 455 (73 - 527) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_b24.b1 PHD_FILE: MSMg01no454_b24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:25:13 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_b24.g1 PHD_FILE: MSMg01no454_b24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:25:13 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCAAGGCCCATACCTAAACATGATAAAAGCAATCTACAGCAAACCAG
TAGCCAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCCACTAAAA
TCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGT
ACTTGAAGTATTAGCCAGAGCAATTTGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGA
TACAAATTGGAAAAGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATG
ATAGTATATATAAGTGACCCTAAAAATTCCACCAGAGAACTCCTAAACCT
GATAAACAGCTTTGGTGAAGTAGCTGGATATAAAGTAAACTCAAACAAGT
CAATGGCCTTTCTCGATACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGAAATTAGG
GAAACAACACACTTCTCAATAGTCAAAAATAATATAAAATATCTCGGCGT
GACTCTAACTAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCTC
TGAAGAAAGAAATTAAAGAAGATCTCCAAGATGGAAAGATCTCCCCAGCT
CATGGATTGGCAGGATCAAAATTGTAAAATGGGTAACTTGGCCAAAGCAA
TCCCCGAATTCATTGGGATCCCCCCCAAAATTCCAATTCAATTCTTCCCC
AAATAAAAAGGAAGAATTTGGCAAATTCCCCTGGGAAAAACAAAAACCCT
GGGAAGAGCCAAACCCTTTCCCCAGG
| GATGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAAGTTAATTTCGTCAACAGTAAGAACA
TGTGTCAAAATTGAAAGAAAAAAAAAAAAGAAGGAAGGAAGGAAAGATAA
AGACAAAAAGAAAGACTTTTAATCTGAAATAAGGTTTCCTAATAAAATTG
ATATTCGGTTTGTTCATATGTTAAGATTCTGAGCTTCATCTTTGTTCCTC
CTGACTTCATCCCTAACTTCAAAGGTACTAGGGACAAACTGTACAATCAA
CAAATACATATAAACTTACAGAATTAAGTGATTAAAAACCTTGACCTACA
CCAATCTGGATACTTGTTACTATCATTAAAGATTTAATAAGGAGAGATAT
TTTAAACGCATAGTCACACTAATAACTCATGACTTAATTTATCCATGACT
TTCATCTTCACCCATAATTAAGGACTGCTGAGGTCATATTCTGTAATAAT
AGCTCTGTTCGTACGTATCTCACTTTCAACCCTAAAGACAACATCTCTCT
GGATCCTTACAACCACCATGAGCAGGGCGCTATTATCCTTCCTATGCAGA
TTATGGCATCGGGGTTAAATGAATCTCTGAGAACAAGCTCCTCCTCCTTT
GGTGGTTCCCCATGAGGTAAGGCGGCCACGGTTTCTGGGGCCCCCTAAAA
AAAAAGGGCCTTTCTTTTTTTGTTTCGGGGAAAATAGTGGGGAGATATGC
CCTC
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 10 12 24 34 17 12 12 23 19 31 41 41 37 32 32 37 32 33 47 41 26 19 14 14 14 19 23 9 8 8 8 8 8 16 25 29 30 31 31 31 31 43 48 53 35
35 35 31 33 33 42 42 26 27 11 9 11 11 16 23 37 59 36 47 33 33 33 33 36 36 47 47 47 53 57 53 53 53 53 53 53 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 43 47 47 43
47 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 68 68 57 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 48 48 48 48 46 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57 59 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 54 48 48 48 48 57 59 59 59 57 59 48 48 48 48 48 48 57 57 57 48 48 48 48 57 48 57 48 48 48 48 46 46 46 41 59 59 44 37 37 41 39 37 32 35 43
39 41 39 41 41 37 37 41 41 41 39 40 40 41 37 37 32 25 25 30 30 30 30 22 20 20 30 35 31 31 25 25 30 30 15 9 9 9 9 12 16 32 28 37 31 29 17 21 13 13
13 26 26 37 37 36 31 28 35 28 24 18 24 24 28 28 18 18 18 24 24 18 24 13 11 11 16 11 14 15 17 14 9 9 9 14 15 16 11 17 11 21 17 12 11 11 11 11 11 11
19 17 17 8 8 8 8 8 12 18 18 24 10 10 10 10 11 24 21 12 11 9 9 9 9 10 10 11 9 9 9 8 8 9 8 9 8 8 8 8 8 8 9 15 9 8 8 8 8 8
8 10 10 10 10 11 12 10 10 8 8 8 8 11 10 11 10 8 8 8 9 10 12 10 10 9 19 11 8 8 8 15 10 10 10 10 9 10 10 8 8 6 8 8 9 8 9 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 9 6 7 6 6 8 6 10 10 12 12 21 20 14 11 12 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 12 11 8 8 8 8 10 8 8 11 8
8 7 6 6 6 8 6 13 6 6 6 6 6 8 11 19 17 14 8 10 8 8 8 8 10 10 10 12 12 8 8 8 8 8 8 13 11 8 8 8 8 8 11 18 15 17 11 9 9 9
8 7 9 7 10 7 6 6 6 8 10 11 16 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 15 6 6 6 6 6 6 9 6 8 8 11 23 36 39 44 44 39 39 44 39 39 44 44 39 39 25 18 9 9 12 14 11 11 11 15 22 21 37 33 31 39 37 37 37 37 37 37
37 44 44 39 37 37 23 21 9 12 9 9 9 18 18 21 14 28 28 28 30 35 32 36 36 36 59 50 53 53 53 53 53 57 53 53 50 57 57 57 68 68 68 59 59 59 54 54 50 50
53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 47 47 48 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 68 57 68 68 68 59 59 59 59 59 50 50 50 50 50 50
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 38 20 35 35 39 43 34 39 43 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 59
59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 54 54 57 59 54 54 59 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48
57 57 48 48 48 48 39 39 35 35 35 39 47 48 47 59 46 41 37 43 35 31 31 35 34 37 30 30 30 37 21 21 13 28 28 32 32 41 41 41 30 30 14 14 14 24 24 28 28 28
28 28 28 37 30 30 14 14 12 22 19 21 15 21 21 34 30 37 33 36 36 36 35 31 24 25 20 20 18 18 20 29 19 17 16 16 10 8 8 8 8 8 15 15 15 20 32 31 37 32
26 24 22 22 19 21 20 12 11 11 12 15 17 18 20 19 25 32 31 21 13 11 15 15 22 22 13 13 12 15 12 18 18 20 20 18 17 14 18 17 15 9 13 8 8 8 8 7 8 8
6 6 6 6 6 6 11 11 10 10 10 10 10 12 12 14 14 12 9 9 10 7 7 7 8 8 8 10 9 9 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 10 9
9 9 8 8 9 11 12 12 10 9 14 8 8 6 6 6 8 9 12 10 10 9 9 9 13 13 8 8 8 8 9 14 10 8 8 8 8 8 10 10 10 18 24 14 12 12 9 11 11 10
10 11 12 12 12 12 13 12 16 11 8 8 8 8 8 13 18 17 18 15 9 9 9 12 9 9 9 11 10 10 13 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 12 11
18 18 11 11 |