BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-454E17.T7 (MSMg01no454_e17.b1) | MSMg01-454E17.TJ (MSMg01no454_e17.g1) |
ACC | AG541105 | AG541106 |
length | 777 | 767 |
length of high quality (start - end) | 512 (41 - 552) | 428 (67 - 494) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_e17.b1 PHD_FILE: MSMg01no454_e17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:25:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_e17.g1 PHD_FILE: MSMg01no454_e17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:25:26 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATTTCGAGAGATCCGCGGAATTCT
TTGTTTTGCTCTGAGCCCCATTTTTAATTGGGCTATTTGATTTTATGGAG
TCCACCTTCTTGAGTTCTTTAAATATATTGGATATTAGTCCGCTATCCGA
TTTGGAATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGTCCTTTTGTCT
TATTGACGGTGCCTTTTGCCTTGCAGAAGCTTTGCAATTTTATGAGGTCC
CATTTATTGATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCACTGCTGTTCTATTCAG
GAATTTTTCCCCTGTATCCATATCTTCGAGGCTTTTCCCTACTTTCTCCT
CTACAGCCAGTGTGTGGATACTTTTAGAGATAATATAAGCATAAACACAT
GAATACAAAAAAATCAACAAGACAATGGAGTAGAGGACATAAAGAATAAA
GCCAAGAGGTGGTTGCAGCACACACCTTTTGGGAGGCAAAGGCAGATGGA
TCTCTGTGTTTGAGGCCAGCCTGATCTACAAGGAAAGTTCCAGGACAGCT
GGGATTACACATAGAAACCCTGTCTCACAAACAAAACAGAAAACAAAACN
GAGACAAAGACNGACCGACCGACNGACGGACCGACAGACCGACCTAAGGT
TTAGTAATAAGAGAGATAATTTTACAGACACCTTTTTTTAAAAGGTTATA
TAAATTTGCCCCGGGGCTCCAGGGTTCTGACCCCCCTTTGAGACTTTTTA
TGAAGGGAAGAAATAATTCTGTTATAA
| TGCAGTGTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXTTTTCGCGAAATTCACATCAGTCCCAGTATGAGTTAAAATTTTAGG
AGTTTGAGGCAGGTAGAGTGTTTATAGTTTAGGTAAAAACGTTTGGGTGC
TGAGAAGTGCACCCAGGGCCTTGGCTTTGTGTCTCCATCTCCTGAAGAAT
AATTTAATATAATCATCTTTCACGGGCTTTGGTTTTAAAGGCTAGGTTTG
AGACTTCAAAATTACAACAGGCAACCCTTTGGGTAGGGGTTCCGTGCAAT
CTACTTTCCTTTTTGTCTCTTGGCTTTTCCAGCAGTGTTGTTCATTCTTG
GTCCATTCAGTTATTCCTCATGTATTGAATGTGCGCTGTGTACTGGCCCT
ATGGGAGGTGCTGCAGATAAAATAGTGTTCAAGATCCAGGTCCCCATCCT
CCGAAAGTTTGTAGTCCAGACCAGGTGTCAGCATACTTTATGATTTTTAG
GATGATGGTCTCTGTTGCAACCAACCATCTTGTCATTTAAGCACCGATGC
CACCCTACAGGATATATGAACCAGGCAGCTGGCTTGAGTGTCCATAAAAT
CTTTTCTCATACAATAAAGAAGTACTCGTATGGGCTTGAAAGTCTTTTTT
TTTAACTCTCCCCAAAGGCTCTTTTAAATTTAAAAAGATTCTCCTCTTTA
TCCTCTCAACTCGTTTTTTTTACTTTTCCACTTCCTATTATAAGTTGCTG
CCTCCTTCCTTTTTTCC
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 11 12 35 37 25 24 24 20 15 19 8 8 8 17 17 37 47 25 21 10 9 9 21 19 10 9 11 7 9 9 8 8 8 8 8 8 11 18 28 30 31 31 31 33 37 33 59
59 44 27 23 10 12 9 9 9 9 9 15 22 25 28 30 33 37 37 37 47 47 57 57 53 53 42 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 48 48 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 57 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 62 62 62 62 39 43 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 59 43 36 28 14 16 13 18 13 18 16 38 38 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 47 47 47 59 59 68 59 59 59 48 48 48 48 48 54 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 48 48 59 57 44 57 48 43 43 43 41 59 43 39 43 43 40 37 43
34 34 25 25 28 34 34 47 41 41 37 37 39 43 43 39 41 47 59 48 48 48 48 39 39 39 47 47 43 39 31 28 39 30 37 30 37 36 34 31 37 36 36 28 34 23 28 24 36 39
39 39 39 39 39 28 28 22 18 18 30 34 28 24 22 27 22 28 28 32 28 39 39 41 39 37 29 25 17 17 16 25 25 29 24 27 24 20 18 23 20 22 18 25 23 24 24 34 34 30
17 11 13 13 11 11 19 17 17 25 22 18 11 10 10 19 12 25 25 28 28 13 13 12 17 7 7 7 8 17 17 10 11 11 19 17 14 14 14 18 20 12 12 9 9 11 15 15 3 0
3 18 14 12 15 9 9 8 9 9 3 0 3 13 8 6 6 8 8 8 11 13 3 0 3 9 9 11 9 12 8 10 13 17 10 12 21 13 12 10 11 10 9 9 9 9 9 9 9 11
11 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 7 10 8 10 6 6 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8 10 8 7 7 7 10 13 12 10 8 12 15 9 8 8 9 8 6 6 6 6 6
8 8 11 12 8 8 8 8 8 8 11 15 11 11 9 9 9 9 12 14 15 11 11 11 13 10 8 8 10 8 8 9 14 21 19 23 18 14 11 8 8 8 10 10 9 10 13 12 10 8
8 8 8 11 10 10 11 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 10 9 9 8 8 6 6 6 6 | Open.Hide. 7 8 7 7 9 23 9 9 9 10 12 16 39 32 37 37 37 37 37 39 39 41 44 44 23 23 9 9 9 9 7 7 7 7 8 10 16 19 23 20 20 28 22 11 11 10 21 21 50 42
41 23 18 10 10 8 8 9 8 7 9 12 9 9 15 15 21 21 27 31 36 36 38 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 50 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 46 39 37 37 39 42 37 30 30 30 37 37 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68
68 57 57 47 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 41 41 20 27 27 33 42 44 44 68
68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 39 41 28 28 21 12 14 10 8 8 8 8 11 11 21 33 59 59 59 59 59 53 53 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68
59 59 35 41 39 42 43 48 48 48 46 46 47 47 54 57 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 46 48 46 57 46 47 47 43 43 37 37 28 37 37 39 59 48 48 48 37 37 28 28 28 30 30 39 39 39 35 32 34 30 26 32 35 35 37 59 39 39 36 43 43 43
40 40 41 39 34 28 23 20 22 34 29 29 15 15 14 18 21 34 34 28 18 18 14 14 14 14 14 28 28 32 32 20 24 28 25 25 19 19 28 37 22 17 10 10 9 22 19 18 9 9
12 22 20 24 24 16 12 13 21 12 17 9 10 8 8 8 10 10 10 12 10 14 21 13 11 11 11 18 20 11 12 12 9 9 9 8 8 8 10 13 12 18 18 16 20 19 22 24 15 7
6 6 6 7 10 14 14 10 15 13 16 15 15 15 12 12 12 10 13 11 8 8 8 8 7 7 8 10 10 10 9 8 10 10 15 22 13 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 9 8 10
8 8 10 9 10 10 10 15 10 12 11 11 8 8 8 8 8 8 9 9 8 10 8 8 6 8 8 6 6 8 8 9 8 8 13 8 8 8 8 10 8 7 9 9 9 10 19 18 14 11
11 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 11 16 13 16 12 12 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 11 7 6 8 6 8 6 8 8 8 10 8 10 6 6
8 8 8 6 6 8 8 10 10 11 10 8 8 8 8 10 12 8 9 10 8 8 6 6 10 10 8 6 6 6 8 8 12 12 13 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8
8 8 8 15 15 20 22 16 16 16 22 25 15 21 11 11 11 |