| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-508H13.T7 (MSMg01no508_h13.b1) | MSMg01-508H13.TJ (MSMg01no508_h13.g1) |
|---|
| ACC | AG582377 | AG582378 |
|---|
| length | 1,541 | 750 |
|---|
length of high quality
(start - end) | --- | 598 (80 - 677) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no508_h13.b1 PHD_FILE: MSMg01no508_h13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:37:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no508_h13.g1 PHD_FILE: MSMg01no508_h13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:37:23 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | GCCCTCCGGGCGCGGCGACTATCCTTACTCCGCCCTCGTAGATTAAAGAA
TATANAATTATATTCTTCTCCTCTAGTAACATAGAAGGTGGTAACACTAT
ATTCTCATAATGTTATATTAATATCATCTTCCATAGGGATGATGAGTTAC
GCTAGTGATAATATCTCGCTCTAATTAGCACTCACGCTAATTAATATATA
GACCAAGAGCGCGCGCGCCTTATACACACACACATATATCTTGATTTGGC
TGACAGTGTAAATGAACTCTAGTGGATAGCGCCGACAACGCGCGATAGTA
ATACCTTCGCGAGATGTATGAACCGCGACACCATGCGCGCCCGCGCTACT
ATAACGCGTGCGCAACGGGGCCACTGAGTCTCACCACACCACGCTATAAT
ATCTGATGATTCACCTTGCTGCGCGCGAGACGCGTAGCTGGACACAACAT
AACATAACACGACGAACGCCGCCGCTAGGCGGCTGTACGACGCGTGTACG
CGCTCCTCCTGTGTCGGCTCTGTGAGGGTGGCTAGTTATTCCGCCGTTGC
GCGCGCGCCTACAACCTACATATGCGACACAGACTATTTCTTGTATACCT
CCACGCATCGTCCCGCTCCGATGTGCAGTATATATTGCGATGTCGTAGTC
TCGGGCCGGTGAGGCGCCGGTCGTGTGAACCCGTAGGGTGGGACACCATG
CATGTGATGTAGTTATATGACATAACACTACACGGAATAAAGAAATACCC
AACAAGCCATTTACGAAGCACACTCAAGCACTAATAACACATAATGCTCA
CCGCATGTTATATTATGCTGCCCGTCGTTGACAGCACGATAGGACACGCG
TATAGTGATGTGTCGCGTGTTATAGGTGCTGAGTCGTATCTCTATCAGCG
CTCGCGTCGCGACCCTCCGGAGTTTGAGTGGCTGACGCCATGGTGAGCAA
TCGCACTACAGTGGTAGATGTACACCCGCGGCGAGAGTGTCATTACAGCT
ATANGCGTTGTGCGAGAGGCTTGTGGTTGTGCCGGCGACGTACGAGACAT
CGTGGACGACGGATGGTATCATATTCTACTCGTATCTGTCGTCTATATGA
TTGTATATGATATCAACCACCCGATATGTCTGCCTACGTAATATGACAAT
GTCTATACGAGCCGCTATTTCAGCGATGGATGTAATCAGTGCCAGTGTAC
GATCGTACTAGACACGCCACCGAGCTATGACAAATAAATACAATACATCG
AGACCCAGAGAGAACATAGATCTCGGAATGTGTCGTATATATATACATAT
GCATGACGTATGGCTGCGCGAGAGCGATCACTGTACGTCAGTCGATCTCA
ATGCGCGANATATTAATATTATGATATTACATCAGACTANTATCGAGTAT
ATGTGCATTAGTATGTTATATCTGCTCCAATCGAGTCTTACGGCCTCTNT
GTTAGGTTAGATGATGTACGTACTGGCTCAATGACCAGNAGTGTATATTC
ATATACCACANGCTCTCGCAACTGTGATGACAACGCGTGTT
| NNNNNCCGATGCTGTGGGAGGCCTGGNGGNCGCCTGGTTCACAAAATTTA
GGTGAACTATAGAAGTTTCGCGAAATTCTCCAGAGGGACTGGTAGCAAAA
GGAGGTTGAAAAAAGTGGCCGGGTCAGCCAGGCGTGATTGAACAGTGTTC
TAGTATCGAATACCTGATAAAACCGGAGGCCCCCGGGCACTGGGTTTTTA
AAGTAATCCTGTCAGTTTCCTAATAAAAGTAATAAATTAACCAAACAGCG
GATTCAGTGGTATTTTATGTCCCGAGGGTATTGCTCTCACACTTCAACTT
GATAGCATGATTTATCAAGAGATTTATTACTTGCTGAGAACGAATGGATT
TACCGACGTCAGGGAGACGACAAGTATATTCCGAAGATGTTACCCGTGAT
GGGCATGCACCTGACAAGCATACTTGAAAATCCTCAAACAAAAAGCTTCT
CTTTGAAGGCTGAGTAACTTTAATTTACACTTTGATGGTAGGTTACCGCA
AGGACAGAAGGATTTTGATGGCCCAAGTATTACTCTACCCAAGTCACTAA
GACCTGAAAGGGTGTGTAGCCACCTCAAAGCCTTTTCAGAAACCAATCAA
GATGATCAGCGACTAACATGACCAAAGGTGGGTTTATTGGCCACGCCCCC
AGGTCCCTGCATGTGAGACAGGCCACAGAGCGGAGGAAGGGCCGAGAGAC
AGAGGGATGAGGTCTCCAGGCTCTCAGGGTTAGAAGAACTTCCCTAAGAT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 17 15 8 8 8 8 8 8 11 16 11 9 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9
10 16 18 3 0 3 10 10 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 11 11 10
10 10 10 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 9 15 10 9 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 15 10
9 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 10 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 9 8 8 8 10 7 7 8 8 8 6 6 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 9 8 8 8 8 7 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 8
8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 11 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 10 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 10 8 10 10 9 11 10 8 10 8 9 12 9 9 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6
12 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 11 11 11 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 10 10 8 8 8 7 9 9 9 9 10 10 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 9 10 10 8
8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 12 10 8 8 8 8 8 11 11 9 9 9 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 8 8 8 8 8 11 10 11 11 11 11 11 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 12 8 9 9 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 8
8 15 11 9 10 8 8 8 8 10 12 8 12 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 6 6 6 6 8 8 10 10 10 12 12 8
8 6 6 6 6 8 9 9 9 10 10 10 10 10 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 6 8 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6
6 6 6 8 8 8 8 10 10 12 8 9 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 11 10 10
10 10 10 6 10 6 6 8 6 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 10 8 8 6
6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 9 8 8 8 8 6 6 8 6 9 9 9 8 10 10 6 6 6 6 8 6 6 12 8 8 7 6 6 6
6 6 6 7 8 7 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 10
12 11 11 7 8 7 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 10 8 8 10 10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10
8 8 8 10 10 10 12 8 6 8 6 6 11 10 10 6 6 8 8 6 6 6 6 8 12 12 9 10 9 10 9 9 10 13 12 8 7 7 10 8 13 13 11 10 10 10 8 6 6 6
7 8 8 7 7 8 8 15 11 10 7 6 6 6 8 8 9 8 8 8 10 10 9 10 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 10 15 9 8 7 8 8 8 6 6 6 11 8 6 6
8 6 3 0 3 8 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 13 15 10 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6
7 8 6 7 6 6 6 6 8 8 9 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 11 9 9 10 10 10 11 11 11 9 11 11 10 16 10 8 6 6 8 8 8 8 11 8 8 6 6
6 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 6 6 8 6 8 8 9 11 11 11 13 11 12 10 10 10 10 11 11 11 10 10 10 10 8
8 8 8 8 10 9 12 12 9 9 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 13 11 9
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 7 6 6 8 8 9 10 10 10 8 8 8 6 6 6 7 6 6 6 8 6 6
8 8 8 8 8 10 10 11 12 10 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 10 10 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 12 12 10 12 10 10 10 10 12 8 6
6 6 8 8 8 8 10 9 10 10 11 11 10 10 9 9 9 9 10 9 9 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 8 8 8 10 8 8 8
8 8 11 10 8 6 6 3 0 3 11 9 8 8 8 8 8 8 10 9 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 3 0 3 10 9 11 10 8 8 8 8 8
9 16 10 7 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 10 10 8 8 8 10 12 8 8 8 8 10 10 11 14 7 7 6 6 8 8 14 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 3 0 3
6 8 6 6 6 6 8 9 9 9 8 8 8 9 9 10 10 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 3 0 3 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 12 3 0 3 7 6 6 8 8 8 10 6 6 6 6 6 7 8 11 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 0 0 3 7 6 8 8 9 9 9 9 9 15 19 10 10 10 10 21 32 25 27 3 0 3 3 0 3 27 23 23 11 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 11 11
11 23 21 11 11 11 25 25 59 59 33 29 11 9 9 9 11 10 9 8 8 8 8 13 15 14 22 22 19 20 19 27 36 36 53 53 53 53 53 53 53 57 59 53 53 53 53 50 57 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 36 33 25 28 36 28 28 36 32 25 25 32 44 44 57 57 68 68 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 51 51 51 51 50 50 68 68 68 68 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68
68 48 48 37 35 21 21 14 15 15 19 34 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 54 54 54 48 50 53 59 57
57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 39 22 22 18 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 14 22 27 31 42 50 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 44 43 33 33 25 25 25 23 37 34 48 48 57 59 68 68 59 59 59 59 54 57 59 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68
57 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 44 44 42 42 42 39 43 44 57 57 57 57 68 59 59 59 59 59 68 68
68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 50 50 50 50 47 47 47 44
39 32 32 37 37 37 44 44 44 37 37 41 41 44 47 59 59 59 41 41 41 37 37 41 43 47 59 59 59 59 59 59 59 50 57 57 48 39 39 36 36 36 44 59 48 47 42 41 39 31
34 23 25 25 41 59 44 44 39 37 37 39 39 39 41 46 46 46 59 43 40 40 41 41 41 41 41 37 37 41 37 37 41 59 41 39 37 30 30 29 30 30 29 25 30 30 37 37 41 39
39 37 43 43 43 39 39 39 39 39 37 39 43 43 39 36 39 39 39 39 39 36 28 28 28 39 34 26 31 31 36 32 37 35 39 39 37 29 26 24 25 25 37 37 41 36 37 43 37 33
30 25 31 37 36 36 39 39 37 28 32 23 32 28 32 23 25 25 32 34 29 25 25 20 21 21 15 15 14 14 14 17 17 11 11 10 19 12 18 19 20 19 17 21 13 13 13 15 15 23
15 15 12 14 11 18 19 19 19 20 18 13 18 11 15 12 12 12 12 12 12 14 23 11 8 8 8 9 8 9 14 11 9 9 9 9 9 9 11 14 17 17 24 22 18 13 9 9 9 9
|
|---|
