BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010C24
Chromosome15 (Build37)
Map Location 84,271,893 - 84,438,808
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1810041L15Rik, Ldoc1l
Upstream geneTtll1, Bik, Mcat, Tspo, Ttll12, Scube1, Mpped1, 4931407K02Rik, LOC667167, Sult4a1, Pnpla5, Pnpla3, Samm50, Parvb, Parvg, LOC382988
Downstream geneArhgap8, 3110043J09Rik, Phf21b, LOC100043084, 4930513L16Rik, Nup50, 5031439G07Rik, LOC628135, Upk3a, 3110048E14Rik, Smc1b, Ribc2, Fbln1, Atxn10, EG223745, Wnt7b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010C24.bB6Ng01-010C24.g
ACCDH845927DH845928
length8041,020
definitionDH845927|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010C24, 5' end.DH845928|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010C24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,438,004 - 84,438,808)(84,271,893 - 84,272,913)
sequence
gaattccataccagctagagccagggagagacaacagacacagcaggctg
cagtgggaggatggtttgagtctctcagttcacagggtcaaaggctgctg
gtggacaggctatggactatttggtgttggacagccatgttgggatcagt
tcatgtggtcttcctgtcagggtgggggaggcagcagcttggtgtgaagt
cccaaatgtcaggaccataccttgccacctgtcctgggacccccaagcca
ctgcatggacaaaagggcaggtcccaggggaaaaaagggcaagtcccagg
ggcagaagggggaggtctcagggacagaaggggcggtcccaggggcaagg
agaaaattccttgtggatttttgctgggcagaccctgagggaactggttt
ttttttttttttgttttgttttgttttgttttttgtttttcccttgtaaa
caatttccctcttgattttaagtttttaaaaatgtctgctttcatgaaat
tcattcagcttttatgaattgggggggggcaacaaaaaaaaagaagcagc
agcctgtctgctcctggcctctgggctatgggatgctgatagtgtaggac
cccctttcggggacccccactctagtctcgggagtgtgagagcacccaaa
gaaacacgaggacccactcgctgtaattacatgaggacgtttaattacgg
agctccggaccggcatgaatcccacacaggagataacaaatgccggcccc
gaggctcaaaagccaggggcttttatggggtaaggggcttagggtgtgga
tttc
gaattcagctttccttagagaatcagagatctgcttcaggctgtctgaag
gtgacaggtgacaatgggcacagaggtctaagaaacagacatgtgtcagg
ctagattgtgacaaaggaatgtattcaagcctgaaggtgtcactttgggg
ccaggtctctgtgggacacacagcattccttccagaaatgtcctttgcct
cctctgccgggcatcccttctgcacacccttcaagatgccagctagtcag
ctaaagctccctttcccaacagccctcccggccccctcaggtacctctgt
tctcctgcctccagtctacgcagcacacagccaggcaagtgggtcaaatt
ctctctgccgctctgagcctggctctgagcgagcggcttgcaaggtgctc
tgggagctgggagtgaatggacgctaactatgcttgtgttctcagctggg
ttccagctgcaggtttcccacaagcctctgtaaagcagtccccatccacc
gctgaagcacgcctggtagcgtggacgagatgctggaagggatctgcctt
taatttgtgctgatgtctaagaaaatgacattttatcctgagcccctcgt
tcatccaggagcttcggaacctggcacaggagttgaactttcccaggccc
acgctcagagcagggctctcagccagggcagctatgtccctcctccaacc
ttccctctccctgttcctaagaggctgccaggcaggaataagcagattag
ggagctggcttttaagagaccacgattggtcttgttttccatggaagtgt
gaacaacaaaaataatttttttttttctctcccaggctcatagaacttaa
ttcactgttaaacaggtgtcatttgaaacatgtaaggactctttctctct
ctccaaggtgtgtgtgcccatatctgctgaggtctgccgtgcagagagct
gttgagtgctcagcgccctctccccgaagtgaaaacaggtgctgcacacg
tggtgacctgtgtgccctat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_84438004_84438808
seq2: B6Ng01-010C24.b_42_845 (reverse)

seq1  GAATTCCACACCCCTAAGCCCCTTACCCCATAAAAGCCCCTGGCTTTTGA  50
      ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCCACA-CCCTAAGCCCCTTACCCCATAAAAGCCCCTGGCTTTTGA  49

seq1  GCCTCGGGGCCGGCATCTGTTATCTCCTGTGTGGGATTCATGCCGGTCCG  100
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCGGGGCCGGCATTTGTTATCTCCTGTGTGGGATTCATGCCGGTCCG  99

seq1  GAGCTCCGTAATTAAACGTCCTCATGTAATTACAGCGAGTGGGTCCTCGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCCGTAATTAAACGTCCTCATGTAATTACAGCGAGTGGGTCCTCGT  149

seq1  GTTTCTTTGGGTGCTCTCACACTCCCGAGACTAGAGTGGGGGTCCCCGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTTTGGGTGCTCTCACACTCCCGAGACTAGAGTGGGGGTCCCCGAA  199

seq1  AGGGGGTCCTACACTATCAGCATCCCATAGCCCAGAGGCCAGGAGCAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGTCCTACACTATCAGCATCCCATAGCCCAGAGGCCAGGAGCAGAC  249

seq1  AGGCTGCTGCTTCTTTTTTTTTGTTGCCCCCCCCCAATTCATAAAAGCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGCTGCTTCTTTTTTTTTGTTGCCCCCCCCCAATTCATAAAAGCTG  299

seq1  AATGAATTTCATGAAAGCAGACATTTTTAAAAACTTAAAATCAAGAGGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAATTTCATGAAAGCAGACATTTTTAAAAACTTAAAATCAAGAGGGA  349

seq1  AATTGTTTACAAGGGAAAAACAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTTTACAAGGGAAAAACAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAA  399

seq1  AAAAAAAACCAGTTCCCTCAGGGTCTGCCCAGCAAAAATCCACAAGGAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAACCAGTTCCCTCAGGGTCTGCCCAGCAAAAATCCACAAGGAAT  449

seq1  TTTCTCCTTGCCCCTGGGACCGCCCCTTCTGTCCCTGAGACCTCCCCCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCCTTGCCCCTGGGACCGCCCCTTCTGTCCCTGAGACCTCCCCCTT  499

seq1  CTGCCCCTGGGACTTGCCCTTTTTTCCCCTGGGACCTGCCCTTTTGTCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCCTGGGACTTGCCCTTTTTTCCCCTGGGACCTGCCCTTTTGTCCA  549

seq1  TGCAGTGGCTTGGGGGTCCCAGGACAGGTGGCAAGGTATGGTCCTGACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTGGCTTGGGGGTCCCAGGACAGGTGGCAAGGTATGGTCCTGACAT  599

seq1  TTGGGACTTCACACCAAGCTGCTGCCTCCCCCACCCTGACAGGAAGACCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGACTTCACACCAAGCTGCTGCCTCCCCCACCCTGACAGGAAGACCA  649

seq1  CATGAACTGATCCCAACATGGCTGTCCAACACCAAATAGTCCATAGCCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAACTGATCCCAACATGGCTGTCCAACACCAAATAGTCCATAGCCTG  699

seq1  TCCACCAGCAGCCTTTGACCCTGTGAACTGAGAGACTCAAACCATCCTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCAGCAGCCTTTGACCCTGTGAACTGAGAGACTCAAACCATCCTCC  749

seq1  CACTGCAGCCTGCTGTGTCTGTTGTCTCTCCCTGGCTCTAGCTGGTATGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCAGCCTGCTGTGTCTGTTGTCTCTCCCTGGCTCTAGCTGGTATGG  799

seq1  AATTC  805
      |||||
seq2  AATTC  804

seq1: chr15_84271893_84272913
seq2: B6Ng01-010C24.g_62_1081

seq1  GAATTCAGCTTTCCTTAGAGAATCAGAGATCTGCTTCAGGCTGTCTGAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCTTTCCTTAGAGAATCAGAGATCTGCTTCAGGCTGTCTGAAG  50

seq1  GTGACAGGTGACAATGGGCACAGAGGTCTAAGAAACAGACATGTGTCAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACAGGTGACAATGGGCACAGAGGTCTAAGAAACAGACATGTGTCAGG  100

seq1  CTAGATTGTGACAAAGGAATGTATTCAAGCCTGAAGGTGTCACTTTGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATTGTGACAAAGGAATGTATTCAAGCCTGAAGGTGTCACTTTGGGG  150

seq1  CCAGGTCTCTGTGGGACACACAGCATTCCTTCCAGAAATGTCCTTTGCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTCTCTGTGGGACACACAGCATTCCTTCCAGAAATGTCCTTTGCCT  200

seq1  CCTCTGCCGGGCATCCCTTCTGCACACCCTTCAAGATGCCAGCTAGTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGCCGGGCATCCCTTCTGCACACCCTTCAAGATGCCAGCTAGTCAG  250

seq1  CTAAAGCTCCCTTTCCCAACAGCCCTCCCGGCCCCCTCAGGTACCTCTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGCTCCCTTTCCCAACAGCCCTCCCGGCCCCCTCAGGTACCTCTGT  300

seq1  TCTCCTGCCTCCAGTCTACGCAGCACACAGCCAGGCAAGTGGGTCAAATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTGCCTCCAGTCTACGCAGCACACAGCCAGGCAAGTGGGTCAAATT  350

seq1  CTCTCTGCCGCTCTGAGCCTGGCTCTGAGCGAGCGGCTTGCAAGGTGCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGCCGCTCTGAGCCTGGCTCTGAGCGAGCGGCTTGCAAGGTGCTC  400

seq1  TGGGAGCTGGGAGTGAATGGACGCTAACTATGCTTGTGTTCTCAGCTGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGCTGGGAGTGAATGGACGCTAACTATGCTTGTGTTCTCAGCTGGG  450

seq1  TTCCAGCTGCAGGTTTCCCACAAGCCTCTGTAAAGCAGTCCCCATCCACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGCTGCAGGTTTCCCACAAGCCTCTGTAAAGCAGTCCCCATCCACC  500

seq1  GCTGAAGCACGCCTGGTAGCGTGGACGAGATGCTGGAAGGGATCTGCCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAAGCACGCCTGGTAGCGTGGACGAGATGCTGGAAGGGATCTGCCTT  550

seq1  TAATTTGTGCTGATGTCTAAGAAAATGACATTTTATCCTGAGCCCCTCGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTGTGCTGATGTCTAAGAAAATGACATTTTATCCTGAGCCCCTCGT  600

seq1  TCATCCAGGAGCTTCGGAACCTGGCACAGGAGTTGAACTTTCCCAGGCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCAGGAGCTTCGGAACCTGGCACAGGAGTTGAACTTTCCCAGGCCC  650

seq1  ACGCTCAGAGCAGGGCTCTCAGCCAGGGCAGCTATGTCCCTCCTCCAACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCTCAGAGCAGGGCTCTCAGCCAGGGCAGCTATGTCCCTCCTCCAACC  700

seq1  TTCCCTCTCCCTGTTCCTAAGAGGCTGCCAGGCAGGAATAAGCAGATTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTCTCCCTGTTCCTAAGAGGCTGCCAGGCAGGAATAAGCAGATTAG  750

seq1  GGAGCTGGCTTTTAAGAGACCACGATTGGTCTTGTTTTCCATGGAAGTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTGGCTTTTAAGAGACCACGATTGGTCTTGTTTTCCATGGAAGTGT  800

seq1  GAACAACAAAAATAA-TTTTTTTTTTCTCTCCCAGGCTCATAGAACTTAA  849
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAACAAAAATAATTTTTTTTTTTCTCTCCCAGGCTCATAGAACTTAA  850

seq1  TTCACTGTTAAACAGGTGTCATTTGAAACATGTAAGGACTCTTTCTCTCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTCACTGTTAAACAGGTGTCATTTGAAACATGTAAGGACTCTTTCTCTC-  899

seq1  TCTCCAAGGTGTGTGTGCCCATATCTGCTGAGGTCTGCCGTGCAGAGAGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAAGGTGTGTGTGCCCATATCTGCTGAGGTCTGCCGTGCAGAGAGC  949

seq1  TGTGAGGTGCTCAGCGCCC-CTCCCCGAAGGTGAAAACAGGGTGCTGCAC  998
      |||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  TGTTGAGTGCTCAGCGCCCTCTCCCCGAA-GTGAAAACA-GGTGCTGCAC  997

seq1  ACGTGGTGACCTGTGTGCCCTAT  1021
      |||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGGTGACCTGTGTGCCCTAT  1020