BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-012L15
Chromosome15 (Build37)
Map Location 63,601,700 - 63,715,861
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMlze, AI987692, Gsdmdc2, 9930109F21Rik, LOC665769
Upstream geneLOC100040430, Tsg101-ps, EG239502, EG432959, LOC672194
Downstream gene9030605I04Rik, 4933426G20Rik, 0910001A06Rik, Ddef1, Adcy8
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-012L15.bB6Ng01-012L15.g
ACCDH847738DH847739
length1,1611,205
definitionDH847738|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012L15, 5' end.DH847739|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012L15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,601,700 - 63,602,872)(63,714,635 - 63,715,861)
sequence
gaattcctactagaattcccactaccctcctccttactgaagcaggtaga
aattagacaggttcccgggtagacagaaagacagggagaggctaaggaag
aagccggccatcctgctgtgtctcttagtctctgtcctagtctctcagag
ctacagctaaaggaactcaaggccttaacctctgaaaactcaggacagct
ggcagagaccctgcttctcagcagactaggaatcacaagatggtaaggca
tgacaatcctacttgggatcacttagaaattgtcactgtggcaacattgt
cagcccaactcagcttcacaaacaaacgctgaccaggcagcctcaggacc
tttccgacagacactcatcccggcctcgtgtctccactgtctgcttcagg
actggttgcatacacatcctcacatactgaacagtgaaccaagtagcaag
ccaaggcaaagcccagagttcttctagcagatagtgtatgccttctgtat
gctgtgatacatacatacatacaggtaaagtgggatctagctaggaatgt
cacttatcacccctcctgagggaaagacatttctttaaagtgtgttcaac
tgcccaaggataccttttaaaaaaattaaccttaacaaaacacacactca
actaaattcaatgccccagaaatgaagcaagtctgtcttctacccattgc
ttctgcatctccctgttagcattgacattaggttcataacaagcctcagg
ttcgtccgtgcttagtgatcctcagcagcactaggtgctgtgctgggttc
tcctgggtgctatgctgggttatctatgcctttttacttatcttacttaa
tttaatctagtagatcaatgggctaggatgtagttcagtggtaaagcatt
gatctagcatgcatagagcttgagttgagagagagacagacagacagaga
gacagagacagagggagaggggacgagggagaggaaaacggagagagagg
gagactgattttgaaactcagaaatttgactcatttaacctgtctcaaac
tcattcccaaactcaggttcttcagctcactcatgggagcagctattcag
tattgaacctcttcgtgttctcacagaatctgagtctagaattttaacat
tcatgcctttc
gaattctagatagagcatcttcatgaagttgatgatattccaacctcact
gcccaccattggcccactctggcacactgcacacctgaccatggcccaac
tgtaggagggacagctgcccagctcctagcatgtggctgtggctctgaag
catggcatcttgcagggtctccacagcctcagttaccacgtatagactct
ccctctccttccggctgtgtagctcctggaggaaggagggcctgggtgac
ctcagtttcctggaaggcacagaaagcagagaagttctgagctgggaggg
gcatctgcacagctagtgagtccctcctggcttggtgatctctgcactga
tcacagtagctagggagaaactggcctgtgtggtggtgaggtctgtttgt
gtaaagtgagtggcatcaactgaaaaggggaaaactgaggaaagccagga
acagtcctcttcaaggtttcagatatccaaacataggcccacatgagatt
taaacatttgggagataatattaaaatggatgaaagggtcccaaattgct
aacctgggaaacctggcagcaacagagtatccaccagcttcaggcaggtg
tctccagtttgctgcagttgccaccactccctgttgccacacttctatag
tttagttccctttcctgtctctggatgcttctggcttgaagcctctgagt
ctgcatgtgggcccagggctcaatcccatgggtctactatctcatgtgcc
tcctggagctgtgggctgtcagcatccttggctttctccacatacctgga
gtaactgtggccattgtcccccatcttggagtccagctgcccacaaacct
tccctggctctcacctcttctctagcagcatctcccaggtacaaggggag
acccagagtgtctgcacagcccaggcagagaggcgggtggtcttgccact
tccagtcgcctggccctgtagctcagcactcagctcacagcccctgtcat
cctcctgcctcctctccaagtgtagatagggcactgtggttcaccttctg
caaagaaagagggcagctacagtgcctggcaaagtaggaacagtgcaagg
tggccttcagggtcaattgcctgaaccaagtctcaatgggctgcaccacc
atcctggtgtgccatgcaaactcgtgaacgtctaaagcttcaaatcctca
tctac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_63601700_63602872
seq2: B6Ng01-012L15.b_48_1208

seq1  GAATTCCTACTAGAATTCCCACTACCCTCCTCCTTACTGAAGCAGGTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTACTAGAATTCCCACTACCCTCCTCCTTACTGAAGCAGGTAGA  50

seq1  AATTAGACAGGTTCCCGGGTAGACAGAAAGACAGGGAGAGGCTAAGGAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAGACAGGTTCCCGGGTAGACAGAAAGACAGGGAGAGGCTAAGGAAG  100

seq1  AAGCCGGCCATCCTGCTGTGTCTCTTAGTCTCTGTCCTAGTCTCTCAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCGGCCATCCTGCTGTGTCTCTTAGTCTCTGTCCTAGTCTCTCAGAG  150

seq1  CTACAGCTAAAGGAACTCAAGGCCTTAACCTCTGAAAACTCAGGACAGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGCTAAAGGAACTCAAGGCCTTAACCTCTGAAAACTCAGGACAGCT  200

seq1  GGCAGAGACCCTGCTTCTCAGCAGACTAGGAATCACAAGATGGTAAGGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAGACCCTGCTTCTCAGCAGACTAGGAATCACAAGATGGTAAGGCA  250

seq1  TGACAATCCTACTTGGGATCACTTAGAAATTGTCACTGTGGCAACATTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAATCCTACTTGGGATCACTTAGAAATTGTCACTGTGGCAACATTGT  300

seq1  CAGCCCAACTCAGCTTCACAAACAAACGCTGACCAGGCAGCCTCAGGACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCAACTCAGCTTCACAAACAAACGCTGACCAGGCAGCCTCAGGACC  350

seq1  TTTCCGACAGACACTCATCCCGGCCTCGTGTCTCCACTGTCTGCTTCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCGACAGACACTCATCCCGGCCTCGTGTCTCCACTGTCTGCTTCAGG  400

seq1  ACTGGTTGCATACACATCCTCACATACTGAACAGTGAACCAAGTAGCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTTGCATACACATCCTCACATACTGAACAGTGAACCAAGTAGCAAG  450

seq1  CCAAGGCAAAGCCCAGAGTTCTTCTAGCAGATAGTGTATGCCTTCTGTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGCAAAGCCCAGAGTTCTTCTAGCAGATAGTGTATGCCTTCTGTAT  500

seq1  GCTGTGATACATACATACATACAGGTAAAGTGGGATCTAGCTAGGAATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGATACATACATACATACAGGTAAAGTGGGATCTAGCTAGGAATGT  550

seq1  CACTTATCACCCCTCCTGAGGGAAAGACATTTCTTTAAAGTGTGTTCAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTATCACCCCTCCTGAGGGAAAGACATTTCTTTAAAGTGTGTTCAAC  600

seq1  TGCCCAAGGATACCTTTTAAAAAAATTAACCTTAACAAAACACACACTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAAGGATACCTTTTAAAAAAATTAACCTTAACAAAACACACACTCA  650

seq1  ACTAAATTCAATGCCCCAGAAATGAAGCAAGTCTGTCTTCTACCCATTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAATTCAATGCCCCAGAAATGAAGCAAGTCTGTCTTCTACCCATTGC  700

seq1  TTCTGCATCTCCCTGTTAGCATTGACATTAGGTTCATAACAAGCCTCAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCATCTCCCTGTTAGCATTGACATTAGGTTCATAACAAGCCTCAGG  750

seq1  TTCGTCCGTGCTTAGTGATCCTCAGCAGCACTAGGTGCTGTGCTGGGTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGTCCGTGCTTAGTGATCCTCAGCAGCACTAGGTGCTGTGCTGGGTTC  800

seq1  TCCTGGGTGCTATGCTGGGTTATCTATGCCTTTTTACTTATCTTACTTAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGGTGCTATGCTGGGTTATCTATGCCTTTTTACTTATCTTACTTAA  850

seq1  TTTAATCTAGTAGATCAATGGGCTAGGATGTAGTTCAGTGGTAAAGCATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATCTAGTAGATCAATGGGCTAGGATGTAGTTCAGTGGTAAAGCATT  900

seq1  GATCTAGCATGCATAGAGCTTGAGTTGAGAGAGAGACAGACAGACAGAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTAGCATGCATAGAGCTTGAGTTGAGAGAGAGACAGACAGACAGAGA  950

seq1  GACAGAGACAGAGGGAGAGGGGACGAGGGAGAGGAAAAGGGAGAAGAAGA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||
seq2  GACAGAGACAGAGGGAGAGGGGACGAGGGAGAGGAAAACGGAGA--GAGA  998

seq1  GGGAGACTGATTTTGAAACTCAGAAAATTTGACTCATTTAAAACCTGTCT  1050
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||
seq2  GGGAGACTGATTTTGAAACTCAG-AAATTTGACTCATTT--AACCTGTCT  1045

seq1  CAAACCCATTCCCAAACCCAGGTCCTTCCAGCTCACTCATGGGAGGCAGC  1100
      ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||
seq2  CAAACTCATTCCCAAACTCAGGTTCTT-CAGCTCACTCATGGGA-GCAGC  1093

seq1  TTTTCAGTATTTGAACACTCTTCGTGTTCTCACCAAGATACTGAGTCTTG  1150
      | ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||| |
seq2  TATTCAGTA-TTGAAC-CTCTTCGTGTTCTCAC--AGAATCTGAGTCTAG  1139

seq1  GCATTTTTACCATTCATG-CTTTC  1173
        | ||||| |||||||| |||||
seq2  --AATTTTAACATTCATGCCTTTC  1161

seq1: chr15_63714635_63715861
seq2: B6Ng01-012L15.g_68_1272 (reverse)

seq1  GTAGATGAGGATATTGAGGCTTTGAGCGCTCAGTGGTTTCTGCATAGCAC  50
      |||||||||||| |||| |||||   || |||   |||  ||||| ||||
seq2  GTAGATGAGGAT-TTGAAGCTTTAGACGTTCACGAGTT--TGCATGGCAC  47

seq1  ACACAATGTATAGGTGGTGGCAGCCATTTTGAGACCTGGCTCAGGCCAAA  100
      || ||  | || |||||| ||||||   ||||||| ||| ||||||   |
seq2  AC-CA--GGAT-GGTGGT-GCAGCC-CATTGAGACTTGGTTCAGGC---A  88

seq1  ACTGCACCATGA--GCCACCCTGCAACCTGTCTCCTTACCTTGCCAGGCA  148
      | || ||| |||  |||||| ||||  |||| ||| ||| ||||||||||
seq2  ATTG-ACCCTGAAGGCCACCTTGCA--CTGT-TCC-TACTTTGCCAGGCA  133

seq1  CCTGTAGCTTGCCCTTCTCTCTCTGCAG-AGGTGAACCACAGTGGGCCTA  197
       ||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||
seq2  -CTGTAGC-TGCCC-TCTTTCTTTGCAGAAGGTGAACCACAGT-GCCCTA  179

seq1  TCTACACCTGGGAGAAGGAGGCAGGAGGATTGACAGGGGCTGTGAGCCTG  247
      |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||
seq2  TCTACA-CTTGGAG-AGGAGGCAGGAGGA-TGACAGGGGCTGTGAG-CTG  225

seq1  AGTGCTGGGCTACAGGGCCAGGCGACTGGAAGTGGCAAGACCACCCGCCT  297
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTGAGCTACAGGGCCAGGCGACTGGAAGTGGCAAGACCACCCGCCT  275

seq1  CTCTGCCTTGGCTGTGCAGACACTCTGGGTCTCCCCTTGTACCTGGGAGA  347
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCCTGGGCTGTGCAGACACTCTGGGTCTCCCCTTGTACCTGGGAGA  325

seq1  TGCTGCTAGAGAAGAGGTGAGAGCCAGGGAAGGTTTGTGGGCAGCTGGAC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTAGAGAAGAGGTGAGAGCCAGGGAAGGTTTGTGGGCAGCTGGAC  375

seq1  TCCAAGATGGGGGACAATGGCCACAGTTACTCCAGGTATGTGGAGAAAGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGATGGGGGACAATGGCCACAGTTACTCCAGGTATGTGGAGAAAGC  425

seq1  CAAGGATGCTGACAGCCCACAGCTCCAGGAGGCACATGAGATAGTAGACC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGATGCTGACAGCCCACAGCTCCAGGAGGCACATGAGATAGTAGACC  475

seq1  CATGGGATTGAGCCCTGGGCCCACATGCAGACTCAGAGGCTTCAAGCCAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGATTGAGCCCTGGGCCCACATGCAGACTCAGAGGCTTCAAGCCAG  525

seq1  AAGCATCCAGAGACAGGAAAGGGAACTAAACTATAGAAGTGTGGCAACAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATCCAGAGACAGGAAAGGGAACTAAACTATAGAAGTGTGGCAACAG  575

seq1  GGAGTGGTGGCAACTGCAGCAAACTGGAGACACCTGCCTGAAGCTGGTGG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGGTGGCAACTGCAGCAAACTGGAGACACCTGCCTGAAGCTGGTGG  625

seq1  ATACTCTGTTGCTGCCAGGTTTCCCAGGTTAGCAATTTGGGACCCTTTCA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTCTGTTGCTGCCAGGTTTCCCAGGTTAGCAATTTGGGACCCTTTCA  675

seq1  TCCATTTTAATATTATCTCCCAAATGTTTAAATCTCATGTGGGCCTATGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTTTAATATTATCTCCCAAATGTTTAAATCTCATGTGGGCCTATGT  725

seq1  TTGGATATCTGAAACCTTGAAGAGGACTGTTCCTGGCTTTCCTCAGTTTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATATCTGAAACCTTGAAGAGGACTGTTCCTGGCTTTCCTCAGTTTT  775

seq1  CCCCTTTTCAGTTGATGCCACTCACTTTACACAAACAGACCTCACCACCA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTTTCAGTTGATGCCACTCACTTTACACAAACAGACCTCACCACCA  825

seq1  CACAGGCCAGTTTCTCCCTAGCTACTGTGATCAGTGCAGAGATCACCAAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGCCAGTTTCTCCCTAGCTACTGTGATCAGTGCAGAGATCACCAAG  875

seq1  CCAGGAGGGACTCACTAGCTGTGCAGATGCCCCTCCCAGCTCAGAACTTC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAGGGACTCACTAGCTGTGCAGATGCCCCTCCCAGCTCAGAACTTC  925

seq1  TCTGCTTTCTGTGCCTTCCAGGAAACTGAGGTCACCCAGGCCCTCCTTCC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTTTCTGTGCCTTCCAGGAAACTGAGGTCACCCAGGCCCTCCTTCC  975

seq1  TCCAGGAGCTACACAGCCGGAAGGAGAGGGAGAGTCTATACGTGGTAACT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGAGCTACACAGCCGGAAGGAGAGGGAGAGTCTATACGTGGTAACT  1025

seq1  GAGGCTGTGGAGACCCTGCAAGATGCCATGCTTCAGAGCCACAGCCACAT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTGTGGAGACCCTGCAAGATGCCATGCTTCAGAGCCACAGCCACAT  1075

seq1  GCTAGGAGCTGGGCAGCTGTCCCTCCTACAGTTGGGCCATGGTCAGGTGT  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGAGCTGGGCAGCTGTCCCTCCTACAGTTGGGCCATGGTCAGGTGT  1125

seq1  GCAGTGTGCCAGAGTGGGCCAATGGTGGGCAGTGAGGTTGGAATATCATC  1197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGTGCCAGAGTGGGCCAATGGTGGGCAGTGAGGTTGGAATATCATC  1175

seq1  AACTTCATGAAGATGCTCTATCTAGAATTC  1227
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCATGAAGATGCTCTATCTAGAATTC  1205