BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-024L01
Chromosome15 (Build37)
Map Location 87,338,343 - 87,494,471
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAW049604
Upstream geneLOC100042309
Downstream geneLOC100042329, LOC100042340, Zdhhc25
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-024L01.bB6Ng01-024L01.g
ACCDH856247DH856248
length1,129785
definitionDH856247|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024L01, 5' end.DH856248|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024L01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(87,338,343 - 87,339,484)(87,493,687 - 87,494,471)
sequence
gaattctattatcgcacaatattaaatatcttccagttcagctcttgcag
caggctggcacagagacgcccatggcacacaccatccctccgtaaaacat
cccatctgagatgaggaatctctactcttctactgaggtcctgccgatgc
agcattctgcaaccatccaagggattgacttgaatttgtaatgattttag
gtagttttcttatttgctgaagatgtaattattctgtacccgaaaagaca
atatgacaatatctttgcctttgaatggttcatttatgggtcttttatgc
acaggcaatgtagggaagccttcagatctgctgtgttggtgaactgcctc
cagctgcaagccagaaggaggagggagtttagataccccacacacccatt
cacagtccttttatctttcagatggaggcagagaaactgggagggcttta
ctgcctccctcacagttaccttaataatttaagagaccttggtaacacgt
gtcaactctacatttcaaacacgagcctcccaaagtacatttattcagtc
agtttgattcactagcctgcatgaccatgaagaggagggaatgactgctc
acaagatgcttagcctaggaagactcagggcttctcctctctacagaaga
aacaaacacagaactacctctaagctgagattttaataaatgcacagtat
agacctttcttttaagtgatgctaagcaaggacttaggaagttggccaag
gacctgtgaatgtattcacaatgcatatcgatgcacacactcaaggagaa
gaaaagtgaaacaaccctgctagatgccattccctggtgctggacccaca
taaaccttaactagcacacagcttcaatactgtattccagtcgagtataa
aaatctgagaaagacgtgggtattgcgacaattcttcagaaaatcatgag
gggtgtatgtcatggagcttaaagagtttgtttctgatcacaagccaggc
tttgtgggaccacagcaagcagagctccttgatgctgctctacagttcct
ccagagctgctaagactttgtgggtttggggactctgctgccaagattac
gatctacctctaaagaatccagttcttcc
gaattctatgatgctcaacttgactggacacaagtaaaccctacctgatg
ggtctctggggacatttcccagagactgctgacacctgagttagcatctg
agagactgtcctatagggtggggacctgggagacacaagagtggaaaacc
agggaagccagcaaagggcctgctatgtcaccattctctgtggacatcag
actctggcttctttagttcttgggcatggactcaacaactcctagaaggg
tgaagccttccagcctcgggagctataccattttctgagggttacagctt
cttggaactgcaaagttctcagagtcttcagtgtgcacatggccatgggg
gacttaaacaccttcaatcattgaagacaatacaatgatccccacccctc
atgtggggtgttcctttagtgaaccaaaaataatacaagtgtgaacagaa
aagtaacagggaccaccatggtaggagtccggttcttaaccccacgtgca
agctgccagtcactgcagccaagtatctcctcatttctggaccagtgaga
catgagaatggcaggagaggccatttgagcagaacagccagtggggcttt
agaattttctagtcctaaaaggcatcatcattttgcttcaatgtcatccc
atcacacaggagggtgtgacagccagcctcgaggaccactgctctcagca
actgtcatcaatggaacatagaaactacaggtgtttatagtcttcatggt
tgaaaggtgcatggatgggtgggtgggtaaatgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_87338343_87339484
seq2: B6Ng01-024L01.b_46_1174

seq1  GAATTCTATTATCGCACAATATTAAATATCTTCCAGTTCAGCTCTTGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATTATCGCACAATATTAAATATCTTCCAGTTCAGCTCTTGCAG  50

seq1  CAGGCTGGCACAGAGACGCCCATGGCACACACCATCCCTCCGTAAAACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGGCACAGAGACGCCCATGGCACACACCATCCCTCCGTAAAACAT  100

seq1  CCCATCTGAGATGAGGAATCTCTACTCTTCTACTGAGGTCCTGCCGATGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATCTGAGATGAGGAATCTCTACTCTTCTACTGAGGTCCTGCCGATGC  150

seq1  AGCATTCTGCAACCATCCAAGGGATTGACTTGAATTTGTAATGATTTTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTCTGCAACCATCCAAGGGATTGACTTGAATTTGTAATGATTTTAG  200

seq1  GTAGTTTTCTTATTTGCTGAAGATGTAATTATTCTGTACCCGAAAAGACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTTTTCTTATTTGCTGAAGATGTAATTATTCTGTACCCGAAAAGACA  250

seq1  ATATGACAATATCTTTGCCTTTGAATGGTTCATTTATGGGTCTTTTATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGACAATATCTTTGCCTTTGAATGGTTCATTTATGGGTCTTTTATGC  300

seq1  ACAGGCAATGTAGGGAAGCCTTCAGATCTGCTGTGTTGGTGAACTGCCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCAATGTAGGGAAGCCTTCAGATCTGCTGTGTTGGTGAACTGCCTC  350

seq1  CAGCTGCAAGCCAGAAGGAGGAGGGAGTTTAGATACCCCACACACCCATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGCAAGCCAGAAGGAGGAGGGAGTTTAGATACCCCACACACCCATT  400

seq1  CACAGTCCTTTTATCTTTCAGATGGAGGCAGAGAAACTGGGAGGGCTTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTCCTTTTATCTTTCAGATGGAGGCAGAGAAACTGGGAGGGCTTTA  450

seq1  CTGCCTCCCTCACAGTTACCTTAATAATTTAAGAGACCTTGGTAACACGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCCCTCACAGTTACCTTAATAATTTAAGAGACCTTGGTAACACGT  500

seq1  GTCAACTCTACATTTCAAACACGAGCCTCCCAAAGTACATTTATTCAGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAACTCTACATTTCAAACACGAGCCTCCCAAAGTACATTTATTCAGTC  550

seq1  AGTTTGATTCACTAGCCTGCATGACCATGAAGAGGAGGGAATGACTGCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGATTCACTAGCCTGCATGACCATGAAGAGGAGGGAATGACTGCTC  600

seq1  ACAAGATGCTTAGCCTAGGAAGACTCAGGGCTTCTCCTCTCTACAGAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGATGCTTAGCCTAGGAAGACTCAGGGCTTCTCCTCTCTACAGAAGA  650

seq1  AACAAACACAGAACTACCTCTAAGCTGAGATTTTAATAAATGCACAGTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACACAGAACTACCTCTAAGCTGAGATTTTAATAAATGCACAGTAT  700

seq1  AGACCTTTCTTTTAAGTGATGCTAAGCAAGGACTTAGGAAGTTGGCCAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCTTTCTTTTAAGTGATGCTAAGCAAGGACTTAGGAAGTTGGCCAAG  750

seq1  GACCTGTGAATGTATTCACAATGCATATCGATGCACACACTCAAGGAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGTGAATGTATTCACAATGCATATCGATGCACACACTCAAGGAGAA  800

seq1  GAAAAGTGAAACAACCCTGCTAGATGCCATTCCCTGGTGCTGGACCCACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGTGAAACAACCCTGCTAGATGCCATTCCCTGGTGCTGGACCCACA  850

seq1  TAAACCTTAACTAGCACACAGCTTCAATACTGTATTCCAGTCGAGTATAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACCTTAACTAGCACACAGCTTCAATACTGTATTCCAGTCGAGTATAA  900

seq1  AAATCTGAGAAAGACGTGGGTATTGCGACAATTCTTCAAGAAAAATCATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
seq2  AAATCTGAGAAAGACGTGGGTATTGCGACAATTCTTCA--GAAAATCATG  948

seq1  AGGGGGTGTATGTCATGGAGCTTAAAGAGTTTGTTTCTGATCACAAGGCC  1000
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  A-GGGGTGTATGTCATGGAGCTTAAAGAGTTTGTTTCTGATCACAA-GCC  996

seq1  AGGCTTTGTGGGACCACAGCAGGCAGAGCTCCCTGATGCTGCTCTACAGT  1050
      ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGGCTTTGTGGGACCACAGCAAGCAGAGCTCCTTGATGCTGCTCTACAGT  1046

seq1  TCCTCCCAGAACCTGCTACAGACTATGTGGGTTTTGGGGACTCTGCTGCA  1100
      |||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| 
seq2  TCCT-CCAG-AGCTGCTA-AGACTTTGTGGG-TTTGGGGACTCTGCTGC-  1091

seq1  CAAGTATCCAGAATCTACCTCCTAAAGCATCCCGTGTCTTCC  1142
      ||||  |  |  |||||||| |||||| |||| || ||||||
seq2  CAAGATT--ACGATCTACCT-CTAAAGAATCCAGT-TCTTCC  1129

seq1: chr15_87493687_87494471
seq2: B6Ng01-024L01.g_69_853 (reverse)

seq1  TCCATTTACCCACCCACCCATCCATGCACCTTTCAACCATGAAGACTATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTTACCCACCCACCCATCCATGCACCTTTCAACCATGAAGACTATA  50

seq1  AACACCTGTAGTTTCTATGTTCCATTGATGACAGTTGCTGAGAGCAGTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCTGTAGTTTCTATGTTCCATTGATGACAGTTGCTGAGAGCAGTGG  100

seq1  TCCTCGAGGCTGGCTGTCACACCCTCCTGTGTGATGGGATGACATTGAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCGAGGCTGGCTGTCACACCCTCCTGTGTGATGGGATGACATTGAAG  150

seq1  CAAAATGATGATGCCTTTTAGGACTAGAAAATTCTAAAGCCCCACTGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATGATGATGCCTTTTAGGACTAGAAAATTCTAAAGCCCCACTGGCT  200

seq1  GTTCTGCTCAAATGGCCTCTCCTGCCATTCTCATGTCTCACTGGTCCAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGCTCAAATGGCCTCTCCTGCCATTCTCATGTCTCACTGGTCCAGA  250

seq1  AATGAGGAGATACTTGGCTGCAGTGACTGGCAGCTTGCACGTGGGGTTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGGAGATACTTGGCTGCAGTGACTGGCAGCTTGCACGTGGGGTTAA  300

seq1  GAACCGGACTCCTACCATGGTGGTCCCTGTTACTTTTCTGTTCACACTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCGGACTCCTACCATGGTGGTCCCTGTTACTTTTCTGTTCACACTTG  350

seq1  TATTATTTTTGGTTCACTAAAGGAACACCCCACATGAGGGGTGGGGATCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATTTTTGGTTCACTAAAGGAACACCCCACATGAGGGGTGGGGATCA  400

seq1  TTGTATTGTCTTCAATGATTGAAGGTGTTTAAGTCCCCCATGGCCATGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATTGTCTTCAATGATTGAAGGTGTTTAAGTCCCCCATGGCCATGTG  450

seq1  CACACTGAAGACTCTGAGAACTTTGCAGTTCCAAGAAGCTGTAACCCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTGAAGACTCTGAGAACTTTGCAGTTCCAAGAAGCTGTAACCCTCA  500

seq1  GAAAATGGTATAGCTCCCGAGGCTGGAAGGCTTCACCCTTCTAGGAGTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATGGTATAGCTCCCGAGGCTGGAAGGCTTCACCCTTCTAGGAGTTG  550

seq1  TTGAGTCCATGCCCAAGAACTAAAGAAGCCAGAGTCTGATGTCCACAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTCCATGCCCAAGAACTAAAGAAGCCAGAGTCTGATGTCCACAGAG  600

seq1  AATGGTGACATAGCAGGCCCTTTGCTGGCTTCCCTGGTTTTCCACTCTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTGACATAGCAGGCCCTTTGCTGGCTTCCCTGGTTTTCCACTCTTG  650

seq1  TGTCTCCCAGGTCCCCACCCTATAGGACAGTCTCTCAGATGCTAACTCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCCCAGGTCCCCACCCTATAGGACAGTCTCTCAGATGCTAACTCAG  700

seq1  GTGTCAGCAGTCTCTGGGAAATGTCCCCAGAGACCCATCAGGTAGGGTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCAGCAGTCTCTGGGAAATGTCCCCAGAGACCCATCAGGTAGGGTTT  750

seq1  ACTTGTGTCCAGTCAAGTTGAGCATCATAGAATTC  785
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTGTCCAGTCAAGTTGAGCATCATAGAATTC  785