BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-049B02
Chromosome15 (Build37)
Map Location 40,866,329 - 41,034,657
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfpm2
Upstream geneLOC670013, LOC664872, Ppia-ps25
Downstream geneOxr1, Abra, EG432946, LOC432947
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-049B02.bB6Ng01-049B02.g
ACCDH873436DH873437
length1,020972
definitionDH873436|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-049B02, 5' end.DH873437|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-049B02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(41,033,629 - 41,034,657)(40,866,329 - 40,867,305)
sequence
gaattcagcatttttaccatgagttgtcagtgttgaacttagtatctcgt
atttgtgagacaaacactttaatagctgagctatctccctagctctagag
attttactttttatgtcatttagtcaccatacctaataatataatatata
ctatataacatgatagtttgtgcataactatttattaccttatgtgttat
cagcatgaatgccaagaacaaagcacaaagccaaatgaggttgtttctca
cagaggaatagcatatgatcaatgtataccgagaaccacagtgagccaac
ttaacaagatgctgacgctctgactgattgtacttgggtaattcacaagt
acgtcagacatgccctggattacaatatcatctggctagaataagatgct
gatgtgcttgctgattgtacttggataattcacatcagacatgccctgga
ttacaatatcatctggctagaataagatactgatgtgcttgctgattgta
cttggttaatctgttcaaattaaccaagtactttcattgtaacagtaatt
tccacttgcttttatatgaaagtgctttgagaaaagaaactgagaatata
aagtagcatggctgctgttttttagagggtgatggatttctgcacagtcc
tttcaagttaaaaaggatatgtttaactaacagacacatcaaccacagtc
attaaagagagacatgttctgaactcatacccaagcattgatcatgggga
aaactgtcatgaataaagactaagtactagatcatcttgagaatatacta
tgttctggtgtttagaaaatcttgtatagtaccatgacaaatctaagaaa
ttacctatatcctgtatctctgggttttaaaatatcagttacctaagaat
ttatcaattattaatcctatttaggatggaatgagtgagacataatttgt
ttgctcatgccagatactaatgtcatcagcgagtatatttgtctggtttc
aagctatcatacccagtctt
gaattctgatgtaattaaattaatgacaagtggtaaattctatttgtttg
ctgtgtagaggggtgatcaacaagaagagttaatatcagggattgtctgg
acttccctcagttctgcataggacctccctctcacagttgcgactggtca
ctaaacaagcagccaatgctttgtttgtttgtgcctcaacaaggtccaaa
gactacattaagattaaatcctggtcataactgagtttattaagcagctc
ccttggctagaaaggatatactcaaaatgagcaaacttatcaggtcctga
gtatccaatggatagatttggtaaatgcatcagaattcaagaagcactgc
caacagtgaacaggcaaaacattcacagggaaggaatgagtgagctgagt
tttagaaggagaaaggtcttttataatctctgctgtgcatctcatggaac
aatagaggtaggatgtgcataaatcatcaagagcacaatagacagaggtg
ttggggaaatagagaagaccataaataaatgacctgattctgctcaggta
agagaatggggataggtaaggtgagaccttgagttttggttgatcatttc
ttttctaaaacaaacaaaaatagcttacttaaaatttcacatcatacttt
ttacccattttttttagctaaaggtattgaaacatagcccagctattaac
aaaccaacccaagttgttagtgaaacacatggaaaattgtcattacccca
gggttactgagttaagaataatgagagtacctactttaatgcacttgggc
tttaaagagaaaaaaacaagattctgagctaggaagtaaacagcagactg
aacaaggtattggcttaagagttttgagttctatggaaacacaaagtagg
aatgatggcattgtctggttttacaggagattcatagagcagttgcttgt
gcttgacaagaaggatggagga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_41033629_41034657
seq2: B6Ng01-049B02.b_43_1062 (reverse)

seq1  AAGACTGGGTAATGATTAAGCTTTGATACCAGACAAATTATACTCGCTGA  50
      |||||||||| |||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||
seq2  AAGACTGGGT-ATGAT--AGC-TTGAAACCAGACAAA-TATACTCGCTGA  45

seq1  CTGACATTAGTTATCTGGCATAGAGCAAACATATTTATGTCTCACTCACT  100
       ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |
seq2  -TGACATTAG-TATCTGGCAT-GAGCAAACA-AATTATGTCTCACTCATT  91

seq1  TCATCCCTAAATAAGATTAATAATTGTTAAATTCTTAGGTAACTGATATT  150
       ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CCAT-CCTAAATAGGATTAATAATTGATAAATTCTTAGGTAACTGATATT  140

seq1  TTAAAACCCAGAGATACA-GATATAGGTAATATCTTAGATATGTCATGGT  199
      |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||
seq2  TTAAAACCCAGAGATACAGGATATAGGTAATTTCTTAGATTTGTCATGGT  190

seq1  ACTATACAAGATTATCTTAGACACCAGAACATAGTATATTCTCAAAGATG  249
      ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ACTATACAAGATTTTC-TAAACACCAGAACATAGTATATTCTC-AAGATG  238

seq1  ATCTAGTACTTAGTCTTTATTCATGACAGTTTTCCCCATGATCAATGCTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAGTACTTAGTCTTTATTCATGACAGTTTTCCCCATGATCAATGCTT  288

seq1  GGGTATGAGTTCAGAACATGTCTCTCTTTAATGACTGTGGTTGATGTGTC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTATGAGTTCAGAACATGTCTCTCTTTAATGACTGTGGTTGATGTGTC  338

seq1  TGTTAGTTAAACATATCC-TTTTAACTTGAAAGGACTGTGCAGAAATCCA  398
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGTTAAACATATCCTTTTTAACTTGAAAGGACTGTGCAGAAATCCA  388

seq1  TCACCCTCTAAAAAACAGCAGCCATGCTACTTTATATTCTCAGTTTCTTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCTCTAAAAAACAGCAGCCATGCTACTTTATATTCTCAGTTTCTTT  438

seq1  TCTCAAAGCACTTTCATAT-AAAGCAAGTGGAAATTACTGTTACAATGAA  497
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAAGCACTTTCATATAAAAGCAAGTGGAAATTACTGTTACAATGAA  488

seq1  AGTACTTGGTTAATTTGAACAGATTAACCAAGTACAATCAGCAAGCACAT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTTGGTTAATTTGAACAGATTAACCAAGTACAATCAGCAAGCACAT  538

seq1  CAGTATCTTATTCTAGCCAGATGATATTGTAATCCAGGGCATGTCTGATG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATCTTATTCTAGCCAGATGATATTGTAATCCAGGGCATGTCTGATG  588

seq1  TGAATTATCCAAGTACAATCAGCAAGCACATCAGCATCTTATTCTAGCCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTATCCAAGTACAATCAGCAAGCACATCAGCATCTTATTCTAGCCA  638

seq1  GATGATATTGTAATCCAGGGCATGTCTGACGTACTTGTGAATTACCCAAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATATTGTAATCCAGGGCATGTCTGACGTACTTGTGAATTACCCAAG  688

seq1  TACAATCAGTCAGAGCGTCAGCATCTTGTTAAGTTGGCTCACTGTGGTTC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAATCAGTCAGAGCGTCAGCATCTTGTTAAGTTGGCTCACTGTGGTTC  738

seq1  TCGGTATACATTGATCATATGCTATTCCTCTGTGAGAAACAACCTCATTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTATACATTGATCATATGCTATTCCTCTGTGAGAAACAACCTCATTT  788

seq1  GGCTTTGTGCTTTGTTCTTGGCATTCATGCTGATAACACATAAGGTAATA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTGTGCTTTGTTCTTGGCATTCATGCTGATAACACATAAGGTAATA  838

seq1  AATAGTTATGCACAAACTATCATGTTATATAGTATATATTATATTATTAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGTTATGCACAAACTATCATGTTATATAGTATATATTATATTATTAG  888

seq1  GTATGGTGACTAAATGACATAAAAAGTAAAATCTCTAGAGCTAGGGAGAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGGTGACTAAATGACATAAAAAGTAAAATCTCTAGAGCTAGGGAGAT  938

seq1  AGCTCAGCTATTAAAGTGTTTGTCTCACAAATACGAGATACTAAGTTCAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAGCTATTAAAGTGTTTGTCTCACAAATACGAGATACTAAGTTCAA  988

seq1  CACTGACAACTCATGGTAAAAATGCTGAATTC  1029
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGACAACTCATGGTAAAAATGCTGAATTC  1020

seq1: chr15_40866329_40867305
seq2: B6Ng01-049B02.g_67_1038

seq1  GAATTCTGATGTAATTAAATTAATGACAAGTGGTAAATTCTATTTGTTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGATGTAATTAAATTAATGACAAGTGGTAAATTCTATTTGTTTG  50

seq1  CTGTGTAGAGGGGTGATCAACAAGAAGAGTTAATATCAGGGATTGTCTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTAGAGGGGTGATCAACAAGAAGAGTTAATATCAGGGATTGTCTGG  100

seq1  ACTTCCCTCAGTTCTGCATAGGACCTCCCTCTCACAGTTGCGACTGGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCCTCAGTTCTGCATAGGACCTCCCTCTCACAGTTGCGACTGGTCA  150

seq1  CTAAACAAGCAGCCAATGCTTTGTTTGTTTGTGCCTCAACAAGGTCCAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACAAGCAGCCAATGCTTTGTTTGTTTGTGCCTCAACAAGGTCCAAA  200

seq1  GACTACATTAAGATTAAATCCTGGTCATAACTGAGTTTATTAAGCAGCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTACATTAAGATTAAATCCTGGTCATAACTGAGTTTATTAAGCAGCTC  250

seq1  CCTTGGCTAGAAAGGATATACTCAAAATGAGCAAACTTATCAGGTCCTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGCTAGAAAGGATATACTCAAAATGAGCAAACTTATCAGGTCCTGA  300

seq1  GTATCCAATGGATAGATTTGGTAAATGCATCAGAATTCAAGAAGCACTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCAATGGATAGATTTGGTAAATGCATCAGAATTCAAGAAGCACTGC  350

seq1  CAACAGTGAACAGGCAAAACATTCACAGGGAAGGAATGAGTGAGCTGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGTGAACAGGCAAAACATTCACAGGGAAGGAATGAGTGAGCTGAGT  400

seq1  TTTAGAAGGAGAAAGGTCTTTTATAATCTCTGCTGTGCATCTCATGGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAGGAGAAAGGTCTTTTATAATCTCTGCTGTGCATCTCATGGAAC  450

seq1  AATAGAGGTAGGATGTGCATAAATCATCAAGAGCACAATAGACAGAGGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGAGGTAGGATGTGCATAAATCATCAAGAGCACAATAGACAGAGGTG  500

seq1  TTGGGGAAATAGAGAAGACCATAAATAAATGACCTGATTCTGCTCAGGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGAAATAGAGAAGACCATAAATAAATGACCTGATTCTGCTCAGGTA  550

seq1  AGAGAATGGGGATAGGTAAGGTGAGACCTTGAGTTTTGGTTGATCATTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAATGGGGATAGGTAAGGTGAGACCTTGAGTTTTGGTTGATCATTTC  600

seq1  TTTTCTAAAACAAACAAAAATAGCTTACTTAAAATTTCACATCATACTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTAAAACAAACAAAAATAGCTTACTTAAAATTTCACATCATACTTT  650

seq1  TTACCCATTTTTTTTAGCTAAAGGTATTGAAACATAGCCCAGCTATTAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCCATTTTTTTTAGCTAAAGGTATTGAAACATAGCCCAGCTATTAAC  700

seq1  AAACCAACCCAAGTTGTTAGTG-AACACATGGATAATTGTCATTACCCCA  749
      |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AAACCAACCCAAGTTGTTAGTGAAACACATGGAAAATTGTCATTACCCCA  750

seq1  TGGTTACTGAGTTAAGAATAATGAGAGTACTTACTTCAATGCACTTTGGC  799
       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||
seq2  GGGTTACTGAGTTAAGAATAATGAGAGTACCTACTTTAATGCACTTGGGC  800

seq1  TTTAAAGAGAAAAAAACAAGATACTGAGCTAGGAAGAAAACAGCAGACTG  849
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTTAAAGAGAAAAAAACAAGATTCTGAGCTAGGAAGTAAACAGCAGACTG  850

seq1  AACAAGGTAATGGCTTAAGAGGTTTTGAGTTCTATGGAAACACAAAGTAG  899
      ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AACAAGGTATTGGCTTAAGA-GTTTTGAGTTCTATGGAAACACAAAGTA-  898

seq1  GGAATGATGGCATTGTCTAGGTTTTACAGGAAGATATCATAGAGCAGTTG  949
      |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||
seq2  GGAATGATGGCATTGTCT-GGTTTTACAGG-AGAT-TCATAGAGCAGTTG  945

seq1  CTGTTGCTTGACCATGAAGGATGGAGGA  977
      ||  ||||||| || |||||||||||||
seq2  CTTGTGCTTGA-CAAGAAGGATGGAGGA  972