BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-054F22
Chromosome15 (Build37)
Map Location 86,842,108 - 86,985,468
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCelsr1, BC021523, Cerk, LOC100042300, Tbc1d22a, LOC100042309
Downstream geneAW049604, LOC100042329, LOC100042340
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-054F22.bB6Ng01-054F22.g
ACCDH877129DH877130
length1,2241,113
definitionDH877129|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054F22, 5' end.DH877130|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054F22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,984,251 - 86,985,468)(86,842,108 - 86,843,232)
sequence
gaattctgttgagtttgggttcctactgaaatcctagggtgtgttttata
tccaaagtgaactctctcacaaaacatgtcttgattgatgtgtatacgtg
gcttcagtctatgtctgtgtaaaaacatttgtgaatcgttgattggtgtt
atgtcaaaacttgaatttgtcactggaaatcacaaatccatcactgtgaa
ttctaatctttgtggcatctcaacttagtgaatgtttccccctaactttt
gataagatgaatttttcctttaaaaaaatttttataggtggagcatagta
ggacatgcttttaatcccatgcaggaggcagaggaagatagaagaagtta
gaatccagtttggtctacatagaatgtcccacgtcagccatgtccacttg
atgaaaaataaaattgtcaacaagaacaaatttctacatcagtgttcagc
tcaacagaacatacacagcctctgtgaaaatgacagaagactctatataa
cttacccaatttattaattttattaattggattaaacaagtcttaaaaga
attatttaattgatttaatctttttttagcatctaatgatgagagaaaac
ttgcaggatttatttgagaatattttttgatcatttacccaacacgtagg
taactgtgaattttctttttagtggttgaagaagagatactgaaatagac
aaatgggaaaaactgggagctggggaaatggcttagctggtacatcacct
gccacagagcacacagatgtgacctgggatacccagaactgtgtaagcat
ggagtaccgtaatacacgtctgcaaccccagtgccaagggagcagagact
ggaagactcttggacttcactcgccagttgtgctacctggatggatgagg
taccaagctcaccttcctgctttactctgttaacagcaacattccccttg
caaataaaacatctgactatggaaatgactccatacctaaagcccttgcc
ttgaaagtgtgaggaccacagttaggatccttaaactcatgtaaggctga
gttgagtgttggagtcacagtgccgtataggtaggtaggaggccagaggg
caggggaatccatggaacagctggctagcattctagccctgtatcagtgg
agctctagttcaggttaagggagtcgtgcctgaagagataagctctgggg
gagagttcaaagagagattcctga
gaattcaaactgggaaagaacagtcttttacatactttatgtttggatga
tccaataggatatctatatgcataaaatagttcatattgtactcccaaat
gaactcaaaattgattaaagtttaaataggactacaaactcttttgcaaa
acttaggggcaatttttgtaacactgaattgggcaagggactcctggaca
tggcaggaaatatgatgtgcagaagaagaaaaaaaaacaataaactggat
atggtaagttgaaagtgttggtatctaggaggctggcagatagcttagtt
agaccaagtgtgaggatctgagttcaagccctagtacccacagggaaatc
tggttatggtcacagtgtcctgtgatcatatcccaaggctggggagttcc
aggacagtgagagaccttgtctcaaaatcaaacaaaaaaacaaaatgaaa
cacagaggcaagtgctaactaaagaagaaggtcacagtagttgttgctag
acttccatgtgcacaaacagaggcacacatctatgcccacacaccaaaac
tcagatgccaaaatgaacacatgcagacatatacaacctccttcaaaacc
cacatatacatacaaacacatgcgtacatatttaagcacacacacacaaa
tctttgacatttgaaaagccccaacataagtaaataaaagaacggatgaa
caaacagacaaaaataaacaaataaataaatgtctctaggacgaagagta
tagttgcagaggatgaaaatgtattcactgctcatgtatttgatgaaggg
tttgtatacagaacttgagctagtaataacaagattaatggtccaattaa
atgctggacaaaggcactgaatggtcaattctccaaggaagatgatcaca
aaggcaaaaggcacatagaaagcctctcggcatcattagtcattgaggaa
tgcaataatccaaatgaggatgtgctttctgcgcaccaggggtaaagagg
gcagtactgccaaggtgttgtgagctggactcgggacacagcagcattgt
catttcatcagctggtggtgtgttttgtaagaagttagagttatagatag
gcatacagatggc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_86984251_86985468
seq2: B6Ng01-054F22.b_47_1270 (reverse)

seq1  TCAGGAATCT-TCTTTGACTTCTCCCC---AGCTTATTCTTTCAGGCA-G  45
      |||||||||| |||||||  |||||||   |||||||   |||||||| |
seq2  TCAGGAATCTCTCTTTGAACTCTCCCCCAGAGCTTATCTCTTCAGGCACG  50

seq1  GCTCTCTTAA-CTGAACCTAGAGCT-CACTGATACA-GGCTAGTATTGCT  92
       ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||||
seq2  ACTCCCTTAACCTGAA-CTAGAGCTCCACTGATACAGGGCTAG-AATGCT  98

seq1  AGCCAGCTTGTTCCATGGATTCCCCTG-CCTCT-GCCTCCTAACTA-CTA  139
      ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||
seq2  AGCCAGC-TGTTCCATGGATTCCCCTGCCCTCTGGCCTCCTACCTACCTA  147

seq1  TAACGGCAACTGTGACTCC-ACACTC-ACTCAGCCTTTACATGAGTTTTA  187
      | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||
seq2  T-ACGGC-ACTGTGACTCCAACACTCAACTCAGCC-TTACATGAG-TTTA  193

seq1  GGGATCCTAACTGTGGTCCTCACACTTTCAAGGCAAGGGCTTTAGGTATG  237
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCCTAACTGTGGTCCTCACACTTTCAAGGCAAGGGCTTTAGGTATG  243

seq1  GAGTCATTTCCATAGTCAGATGTTTTATTTGCAAGGGGAATGTTGCTGTT  287
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCATTTCCATAGTCAGATGTTTTATTTGCAAGGGGAATGTTGCTGTT  293

seq1  AACAGAGTAAAGCAGGAAGGTGAGCTTGGTACCTCATCCATCCAGGTAGC  337
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAGTAAAGCAGGAAGGTGAGCTTGGTACCTCATCCATCCAGGTAGC  343

seq1  ACAACTGGCGAGTGAAGTCCAAGAGTCTTCCAGTCTCTGCTCCCTTGGCA  387
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTGGCGAGTGAAGTCCAAGAGTCTTCCAGTCTCTGCTCCCTTGGCA  393

seq1  CTGGGGTTGCAGACGTGTATTACGGTACTCCATGCTTACACAGTTCTGGG  437
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGTTGCAGACGTGTATTACGGTACTCCATGCTTACACAGTTCTGGG  443

seq1  TATCCCAGGTCACATCTGTGTGCTCTGTGGCAGGTGATGTACCAGCTAAG  487
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCCAGGTCACATCTGTGTGCTCTGTGGCAGGTGATGTACCAGCTAAG  493

seq1  CCATTTCCCCAGCTCCCAGTTTTTCCCATTTGTCTATTTCAGTATCTCTT  537
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTCCCCAGCTCCCAGTTTTTCCCATTTGTCTATTTCAGTATCTCTT  543

seq1  CTTCAACCACTAAAAAGAAAATTCACAGTTACCTACGTGTTGGGTAAATG  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAACCACTAAAAAGAAAATTCACAGTTACCTACGTGTTGGGTAAATG  593

seq1  ATCAAAAAATATTCTCAAATAAATCCTGCAAGTTTTCTCTCATCATTAGA  637
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAAATATTCTCAAATAAATCCTGCAAGTTTTCTCTCATCATTAGA  643

seq1  TGCTAAAAAAAGATTAAATCAATTAAATAATTCTTTTAAGACTTGTTTAA  687
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAAAAAAAGATTAAATCAATTAAATAATTCTTTTAAGACTTGTTTAA  693

seq1  TCCAATTAATAAAATTAATAAATTGGGTAAGTTATATAGAGTCTTCTGTC  737
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAATTAATAAAATTAATAAATTGGGTAAGTTATATAGAGTCTTCTGTC  743

seq1  ATTTTCACAGAGGCTGTGTATGTTCTGTTGAGCTGAACACTGATGTAGAA  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCACAGAGGCTGTGTATGTTCTGTTGAGCTGAACACTGATGTAGAA  793

seq1  ATTTGTTCTTGTTGACAATTTTATTTTTCATCAAGTGGACATGGCTGACG  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTCTTGTTGACAATTTTATTTTTCATCAAGTGGACATGGCTGACG  843

seq1  TGGGACATTCTATGTAGACCAAACTGGATTCTAACTTCTTCTATCTTCCT  887
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACATTCTATGTAGACCAAACTGGATTCTAACTTCTTCTATCTTCCT  893

seq1  CTGCCTCCTGCATGGGATTAAAAGCATGTCCTACTATGCTCCACCTATAA  937
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCCTGCATGGGATTAAAAGCATGTCCTACTATGCTCCACCTATAA  943

seq1  AAATTTTTTTAAAGGAAAAATTCATCTTATCAAAAGTTAGGGGGAAACAT  987
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTTTTAAAGGAAAAATTCATCTTATCAAAAGTTAGGGGGAAACAT  993

seq1  TCACTAAGTTGAGATGCCACAAAGATTAGAATTCACAGTGATGGATTTGT  1037
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTAAGTTGAGATGCCACAAAGATTAGAATTCACAGTGATGGATTTGT  1043

seq1  GATTTCCAGTGACAAATTCAAGTTTTGACATAACACCAATCAACGATTCA  1087
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCCAGTGACAAATTCAAGTTTTGACATAACACCAATCAACGATTCA  1093

seq1  CAAATGTTTTTACACAGACATAGACTGAAGCCACGTATACACATCAATCA  1137
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGTTTTTACACAGACATAGACTGAAGCCACGTATACACATCAATCA  1143

seq1  AGACATGTTTTGTGAGAGAGTTCACTTTGGATATAAAACACACCCTAGGA  1187
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATGTTTTGTGAGAGAGTTCACTTTGGATATAAAACACACCCTAGGA  1193

seq1  TTTCAGTAGGAACCCAAACTCAACAGAATTC  1218
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGTAGGAACCCAAACTCAACAGAATTC  1224

seq1: chr15_86842108_86843232
seq2: B6Ng01-054F22.g_67_1179

seq1  GAATTCAAACTGGGAAAGAACAGTCTTTTACATACTTTATGTTTGGATGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAACTGGGAAAGAACAGTCTTTTACATACTTTATGTTTGGATGA  50

seq1  TCCAATAGGATATCTATATGCATAAAATAGTTCATATTGTACTCCCAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAATAGGATATCTATATGCATAAAATAGTTCATATTGTACTCCCAAAT  100

seq1  GAACTCAAAATTGATTAAAGTTTAAATAGGACTACAAACTCTTTTGCAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCAAAATTGATTAAAGTTTAAATAGGACTACAAACTCTTTTGCAAA  150

seq1  ACTTAGGGGCAATTTTTGTAACACTGAATTGGGCAAGGGACTCCTGGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGGGGCAATTTTTGTAACACTGAATTGGGCAAGGGACTCCTGGACA  200

seq1  TGGCAGGAAATATGATGTGCAGAAGAAGAAAAAAAAACAATAAACTGGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGGAAATATGATGTGCAGAAGAAGAAAAAAAAACAATAAACTGGAT  250

seq1  ATGGTAAGTTGAAAGTGTTGGTATCTAGGAGGCTGGCAGATAGCTTAGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAAGTTGAAAGTGTTGGTATCTAGGAGGCTGGCAGATAGCTTAGTT  300

seq1  AGACCAAGTGTGAGGATCTGAGTTCAAGCCCTAGTACCCACAGGGAAATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAAGTGTGAGGATCTGAGTTCAAGCCCTAGTACCCACAGGGAAATC  350

seq1  TGGTTATGGTCACAGTGTCCTGTGATCATATCCCAAGGCTGGGGAGTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTATGGTCACAGTGTCCTGTGATCATATCCCAAGGCTGGGGAGTTCC  400

seq1  AGGACAGTGAGAGACCTTGTCTCAAAATCAAACAAAAAAACAAAATGAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGTGAGAGACCTTGTCTCAAAATCAAACAAAAAAACAAAATGAAA  450

seq1  CACAGAGGCAAGTGCTAACTAAAGAAGAAGGTCACAGTAGTTGTTGCTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGGCAAGTGCTAACTAAAGAAGAAGGTCACAGTAGTTGTTGCTAG  500

seq1  ACTTCCATGTGCACAAACAGAGGCACACATCTATGCCCACACACCAAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCATGTGCACAAACAGAGGCACACATCTATGCCCACACACCAAAAC  550

seq1  TCAGATGCCAAAATGAACACATGCAGACATATACAACCTCCTTCAAAACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATGCCAAAATGAACACATGCAGACATATACAACCTCCTTCAAAACC  600

seq1  CACATATACATACAAACACATGCGTACATATTTAAGCACACACACACAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATATACATACAAACACATGCGTACATATTTAAGCACACACACACAAA  650

seq1  TCTTTGACATTTGAAAAGCCCCAACATAAGTAAATAAAAGAACGGATGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGACATTTGAAAAGCCCCAACATAAGTAAATAAAAGAACGGATGAA  700

seq1  CAAACAGACAAAAATAAACAAATAAATAAATGTCTCTAGGACGAAGAGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAGACAAAAATAAACAAATAAATAAATGTCTCTAGGACGAAGAGTA  750

seq1  TAGTTGCAGAGGATGAAAATGTATTCACTGCTCATGTATTTGATGAAGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTGCAGAGGATGAAAATGTATTCACTGCTCATGTATTTGATGAAGGG  800

seq1  TTTGTATACAGAACTTGAGCTAGTAATAACAAGATTAATGGTCCAATTAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTATACAGAACTTGAGCTAGTAATAACAAGATTAATGGTCCAATTAA  850

seq1  ATGCTGGACAAAGGCACTGAATGGTCAATTCTCCAAGGAAGATGATCACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGGACAAAGGCACTGAATGGTCAATTCTCCAAGGAAGATGATCACA  900

seq1  AAGGCAAAAGGCACATAGAAAGCCTCTCGGCATCATTAGTCATTGAGGAA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AAGGCAAAAGGCACATAGAAAGCCTCTCGGCATCATTAGTCATTGAGG-A  949

seq1  ATGCAAATTAAATCCAAAATGAGGATGTGCTTTCTGCGCACCAGGGGGTA  1000
      ||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATGCAA---TAATCC-AAATGAGGATGTGCTTTCTGCGCACCA-GGGGTA  994

seq1  CAGAGGGCAGTACTGCCAAGGGTGTGTGAGGCTGGGGACTCGGGACACAG  1050
       ||||||||||||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||
seq2  AAGAGGGCAGTACTGCCAAGGTGTTGTGA-GCT--GGACTCGGGACACAG  1041

seq1  CAGGCATTGTCATTTCATCAGCTGGTGTGTG-GTTTTGTTAGAAGTTAGA  1099
      || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||
seq2  CA-GCATTGTCATTTCATCAGCTGGTG-GTGTGTTTTGTAAGAAGTTAGA  1089

seq1  AGTATAGATAGGGCCATCAAGATGGC  1125
        ||||||||||  |||  |||||||
seq2  GTTATAGATAGG--CATACAGATGGC  1113