BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-059H08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 62,727,289 - 62,852,108
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTsg101-ps
Upstream geneMyc, Pvt1, LOC100040584, H2afy3, LOC100040430
Downstream geneEG239502, EG432959, LOC672194, Mlze, AI987692, Gsdmdc2, 9930109F21Rik, LOC665769, 9030605I04Rik, 4933426G20Rik, 0910001A06Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-059H08.bB6Ng01-059H08.g
ACCDH880737DH880738
length1,1251,060
definitionDH880737|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059H08, 5' end.DH880738|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059H08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(62,727,289 - 62,728,440)(62,851,040 - 62,852,108)
sequence
gaattctcccactttgagaaagtaatagagatgaggctagatcgactcag
accatgtttgtttcctgtaagtgaggcactacagaggatttcgtctttac
tgtggtgttatgtacaaacacctccctcagaatgagttcagtacatgttt
tggttctaacatccaaacatttccatatggtcatctggcttggattacca
agtgttgactcttctatcccttcttgcctgtgttagttctcagggtatgg
ggatggggacagcaatgttgaaggggaaagtaggtgaaagtttgtaggtc
atcttcataaagactgggtgagtcattagcagaacctaccagccacctct
tgaagcttttgcatcaaaaaaatctttagcctgactgtaggagctaggga
cacacacagctttcttgggctaatgatggtatcgtgagagctagattgct
tgtgacaagtcccatgatcaatatgtacttcatattaattcaacagagca
gaagtcataatgtcagttcagagaacaagttatctacccttaagtctgtt
gatccactgcagaggctacaggaaataatagaaatagcattggctaggat
ggaggccatactccagtctgtacaccttccttaaggggtttgtggaatag
atctcagatttcttccctctcaatcatggtgtccattctgaactatgaac
catcccagttcagcacatgttagtaagcagagaactagactctcaagtaa
taaatgttttctgatgtttgctatgagccagacactttgcaacattctgc
tagaatgctaagtaaacagaaagacatggacaaagaaaacaattaaacat
ttagaatctgttatgggatattaaaacaacaaagaaaatatgtcaaagga
aggctacaaggaatttctttgtaattatacagaaagtatgtgtcaaagaa
gtcagattgaaagcaaagcagatactataagccacatctctagatctaag
gagaaatgtttgtacttgtggcatatagctttggagagcaggagaaaaca
taaaacaaaaagattctgatctctactcaactagcacctggtgatgaaga
ttcaaatcctagctccatttctctt
gaattcttctcaaactccaatctcctttaaattttggtacatggaagtct
gaccgcaactgttgcttacttagtcacctctcaaagacaatgggatttta
cttgaatgcaggttttcactcaggtatgcagggtgtaaatgaaactccat
ctctcgttgtctctgctggtataggtatttaatgaggactcagggcggaa
ataattctgtagtactagtctgtgcaggtatttttgggaaaagaaggctc
aggcagttagcatgggatgacaaagagttcaatacacccaccaaaacata
tttgctatagcctttctcaggcctggcagtcatgaatctgagattctcca
tctgttttggaacttgggttgaagctcttagcttaaaaaaatctatatga
ttaaaatgtaccctggcagcttacactccccataactaattgtaaggatc
actgtctacttactaagaaaggctgacaaaggtgattacaagagtgtgaa
tagcagaggctcatggagccagggcacctccctgcctgtgatttgcctgt
agagataaatggataatggatccggagtcatcttgcttgtcttccttcac
tatcgtgttcttgtagaataacactggcatttccagcctcgaaatgctac
tgtgaatatgttatgagtaaattctgtaagtactgtacagatgttaggtt
cttttaaattactagcacaaaacccataaaataaaaggacttatgtgaca
acacacacacacatctcgcacaacagtgtttgctgtgttggaaagttact
gagtactgatggtctggcattgtactccagctgtatcttaggaaataggg
ggagaatgtatgggatacatgcagctcacatggagaaatgattgttttag
tctcctgagagccacataaaacatatcataactgaatgatataaaacaaa
aagtgttactatctcagtgctcaggaggctagagtctgaatcaatagctg
tcagagcaagctgtctctgaggttctagaaaatttgatttttttgatgtc
ctgaagagag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_62727289_62728440
seq2: B6Ng01-059H08.b_46_1170

seq1  GAATTCTCCCACTTTGAGAAAGTAATAGAGATGAGGCTAGATCGACTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCCACTTTGAGAAAGTAATAGAGATGAGGCTAGATCGACTCAG  50

seq1  ACCATGTTTGTTTCCTGTAAGTGAGGCACTACAGAGGATTTCGTCTTTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGTTTGTTTCCTGTAAGTGAGGCACTACAGAGGATTTCGTCTTTAC  100

seq1  TGTGGTGTTATGTACAAACACCTCCCTCAGAATGAGTTCAGTACATGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGTTATGTACAAACACCTCCCTCAGAATGAGTTCAGTACATGTTT  150

seq1  TGGTTCTAACATCCAAACATTTCCATATGGTCATCTGGCTTGGATTACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCTAACATCCAAACATTTCCATATGGTCATCTGGCTTGGATTACCA  200

seq1  AGTGTTGACTCTTCTATCCCTTCTTGCCTGTGTTAGTTCTCAGGGTATGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTGACTCTTCTATCCCTTCTTGCCTGTGTTAGTTCTCAGGGTATGG  250

seq1  GGATGGGGACAGCAATGTTGAAGGGGAAAGTAGGTGAAAGTTTGTAGGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGGGACAGCAATGTTGAAGGGGAAAGTAGGTGAAAGTTTGTAGGTC  300

seq1  ATCTTCATAAAGACTGGGTGAGTCATTAGCAGAACCTACCAGCCACCTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCATAAAGACTGGGTGAGTCATTAGCAGAACCTACCAGCCACCTCT  350

seq1  TGAAGCTTTTGCATCAAAAAAATCTTTAGCCTGACTGTAGGAGCTAGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCTTTTGCATCAAAAAAATCTTTAGCCTGACTGTAGGAGCTAGGGA  400

seq1  CACACACAGCTTTCTTGGGCTAATGATGGTATCGTGAGAGCTAGATTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACAGCTTTCTTGGGCTAATGATGGTATCGTGAGAGCTAGATTGCT  450

seq1  TGTGACAAGTCCCATGATCAATATGTACTTCATATTAATTCAACAGAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACAAGTCCCATGATCAATATGTACTTCATATTAATTCAACAGAGCA  500

seq1  GAAGTCATAATGTCAGTTCAGAGAACAAGTTATCTACCCTTAAGTCTGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTCATAATGTCAGTTCAGAGAACAAGTTATCTACCCTTAAGTCTGTT  550

seq1  GATCCACTGCAGAGGCTACAGGAAATAATAGAAATAGCATTGGCTAGGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCACTGCAGAGGCTACAGGAAATAATAGAAATAGCATTGGCTAGGAT  600

seq1  GGAGGCCATACTCCAGTCTGTACACCTTCCTTAAGGGGTTTGTGGAATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCCATACTCCAGTCTGTACACCTTCCTTAAGGGGTTTGTGGAATAG  650

seq1  ATCTCAGATTTCTTCCCTCTCAATCATGGTGTCCATTCTGAACTATGAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAGATTTCTTCCCTCTCAATCATGGTGTCCATTCTGAACTATGAAC  700

seq1  CATCCCAGTTCAGCACATGTTAGTAAGCAGAGAACTAGACTCTCAAGTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCAGTTCAGCACATGTTAGTAAGCAGAGAACTAGACTCTCAAGTAA  750

seq1  TAAATGTTTTCTGATGTTTGCTATGAGCCAGACACTTTGCAACATTCTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGTTTTCTGATGTTTGCTATGAGCCAGACACTTTGCAACATTCTGC  800

seq1  TAGAATGCTAAGTAAACAGAAAGACATGGACAAAGAAAACAATTAAACAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATGCTAAGTAAACAGAAAGACATGGACAAAGAAAACAATTAAACAT  850

seq1  TTAGAATCTGTTATGGGATATTAAAACAACAAAAGAAAATATGTCAAAGG  900
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TTAGAATCTGTTATGGGATATTAAAACAAC-AAAGAAAATATGTCAAAGG  899

seq1  AAGGCTACAAGGAATTTCTTTGTAATTTATACAGAAAGTATGTGTCAAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
seq2  AAGGCTACAAGGAATTTCTTTGTAA-TTATACAGAAAGTATGTGTC-AAA  947

seq1  GAAGTCAGATTGAAAGCAAAGCAGGATACCTATAAGCCAACATCTCTAAG  1000
      ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||
seq2  GAAGTCAGATTGAAAGCAAAGCA-GATA-CTATAAGCC-ACATCTCT-AG  993

seq1  ATCTAAGGAGAAATGTTTGTACTTGTGGCATATAGGCTTTGGAGAGGCAA  1050
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |
seq2  ATCTAAGGAGAAATGTTTGTACTTGTGGCATATA-GCTTTGGAGAG--CA  1040

seq1  GGAGAAAACATAAAAACAAAAAAGGAATCCTGATTCTCTACCTCAAACTA  1100
      ||||||||||| ||||||||||    || |||| |||||| ||| |||||
seq2  GGAGAAAACAT-AAAACAAAAA---GATTCTGA-TCTCTA-CTC-AACTA  1083

seq1  GGCACCTGGTGATGGAAAGATTCTAGATATCTTAAGTCTTCCATTTCCTC  1150
       |||||||||||||  |||||||   | ||| ||     ||||||| |||
seq2  -GCACCTGGTGATG--AAGATTC---AAATCCTA---GCTCCATTT-CTC  1123

seq1  TT  1152
      ||
seq2  TT  1125

seq1: chr15_62851040_62852108
seq2: B6Ng01-059H08.g_67_1126 (reverse)

seq1  CTCTCTCAGGGACATCAAAAAAAATCAAAATCTTCTAGAACCCTCAGAGA  50
      ||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||
seq2  CTCTCTTCAGGACATC-AAAAAAATC-AAATTTTCTAGAA-CCTCAGAGA  47

seq1  CAGCTTGGCTCTGACAGCTTATTGATTTCAGACTTCTAGCCTCCTGAGCA  100
      |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||
seq2  CAGCTT-GCTCTGACAGC-TATTGA-TTCAGAC-TCTAGCCTCCTGAGCA  93

seq1  CTGAGATAGTAAACACTTTTTGTTTTATATCATTCAGTTATGATATGTTT  150
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGATAGT-AACACTTTTTGTTTTATATCATTCAGTTATGATATGTTT  142

seq1  TATGTGGCTCTCAGGAGACTAAAACAATCATTTCTCCATGTGAGCTGCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGGCTCTCAGGAGACTAAAACAATCATTTCTCCATGTGAGCTGCAT  192

seq1  GTATCCCATACATTTCTCCCCTATTTTCCTAAGATACAGCTGGAGTACAA  250
      |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCCATACA-TTCTCCCCCTATTTCCTAAGATACAGCTGGAGTACAA  241

seq1  TGCCAGACCATCAGTACTCAGTAACTTTCCAACACAGCAAACACTGTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGACCATCAGTACTCAGTAACTTTCCAACACAGCAAACACTGTTGT  291

seq1  GCGAGATGTGTGTGTGTGTTGTCACATAAGTCCTTTTATTTTATGGGTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGAGATGTGTGTGTGTGTTGTCACATAAGTCCTTTTATTTTATGGGTTT  341

seq1  TGTGCTAGTAATTTAAAAGAACCTAACATCTGTACAGTACTTACAGAATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTAGTAATTTAAAAGAACCTAACATCTGTACAGTACTTACAGAATT  391

seq1  TACTCATAACATATTCACAGTAGCATTTCGAGGCTGGAAATGCCAGTGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCATAACATATTCACAGTAGCATTTCGAGGCTGGAAATGCCAGTGTT  441

seq1  ATTCTACAAGAACACGATAGTGAAGGAAGACAAGCAAGATGACTCCGGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTACAAGAACACGATAGTGAAGGAAGACAAGCAAGATGACTCCGGAT  491

seq1  CCATTATCCATTTATCTCTACAGGCAAATCACAGGCAGGGAGGTGCCCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTATCCATTTATCTCTACAGGCAAATCACAGGCAGGGAGGTGCCCTG  541

seq1  GCTCCATGAGCCTCTGCTATTCACACTCTTGTAATCACCTTTGTCAGCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCATGAGCCTCTGCTATTCACACTCTTGTAATCACCTTTGTCAGCCT  591

seq1  TTCTTAGTAAGTAGACAGTGATCCTTACAATTAGTTATGGGGAGTGTAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTAGTAAGTAGACAGTGATCCTTACAATTAGTTATGGGGAGTGTAAG  641

seq1  CTGCCAGGGTACATTTTAATCATATAGATTTTTTTAAGCTAAGAGCTTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCAGGGTACATTTTAATCATATAGATTTTTTTAAGCTAAGAGCTTCA  691

seq1  ACCCAAGTTCCAAAACAGATGGAGAATCTCAGATTCATGACTGCCAGGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAGTTCCAAAACAGATGGAGAATCTCAGATTCATGACTGCCAGGCC  741

seq1  TGAGAAAGGCTATAGCAAATATGTTTTGGTGGGTGTATTGAACTCTTTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAAGGCTATAGCAAATATGTTTTGGTGGGTGTATTGAACTCTTTGT  791

seq1  CATCCCATGCTAACTGCCTGAGCCTTCTTTTCCCAAAAATACCTGCACAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCATGCTAACTGCCTGAGCCTTCTTTTCCCAAAAATACCTGCACAG  841

seq1  ACTAGTACTACAGAATTATTTCCGCCCTGAGTCCTCATTAAATACCTATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGTACTACAGAATTATTTCCGCCCTGAGTCCTCATTAAATACCTATA  891

seq1  CCAGCAGAGACAACGAGAGATGGAGTTTCATTTACACCCTGCATACCTGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCAGAGACAACGAGAGATGGAGTTTCATTTACACCCTGCATACCTGA  941

seq1  GTGAAAACCTGCATTCAAGTAAAATCCCATTGTCTTTGAGAGGTGACTAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAACCTGCATTCAAGTAAAATCCCATTGTCTTTGAGAGGTGACTAA  991

seq1  GTAAGCAACAGTTGCGGTCAGACTTCCATGTACCAAAATTTAAAGGAGAT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGCAACAGTTGCGGTCAGACTTCCATGTACCAAAATTTAAAGGAGAT  1041

seq1  TGGAGTTTGAGAAGAATTC  1069
      |||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTTTGAGAAGAATTC  1060