BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-073E07
Chromosome15 (Build37)
Map Location 96,399,043 - 96,518,912
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc38a1, Slc38a2
Upstream geneDbx2, LOC100042684, LOC667849, EG629300, LOC667864, Tmem16f, LOC100043329, D030018L15Rik, LOC100043335, EG667869, LOC667874, LOC667894, Arid2, Sfrs2ip
Downstream geneLOC667941, LOC546651, Slc38a4, Amigo2, BC038822, LOC100043354, LOC100042774, D15Ertd682e
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-073E07.bB6Ng01-073E07.g
ACCDH890450DH890451
length1,1531,007
definitionDH890450|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073E07, 5' end.DH890451|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073E07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,517,765 - 96,518,912)(96,399,043 - 96,400,052)
sequence
gaattcataggcaaggtatgtctgccattaaagactcttgcagactggaa
gacgtctggtagtgctacatacattgggtacaaccaatggtcagttctgt
cccaagatgaaacccctggggactgtgtagacgcaaaggcagtgagaaga
cactcccccatgctgcttacttgtcatcaagtccagaacctcacctgctc
gtcaaagactctgcacctccgcttgaagtcctggaaagagtcctggctac
catatgccaggggatgctgagaggcaggcatcctgagaggtgccatgaca
accaggatcctgttcacagccgatcagtgtggagagacttcccaaacctc
ctgtgagggagcaaggttccaaatgaatttcaggccaaattccaaagctt
ggggctgttttacccgccttgaggttcctgaactgaattctcagccttga
gcagtcttcagtattaaaaccactgtcccgtcacctcaattcacatcgct
gtcttccatggaacgtttcaataactgtactgttatttatagagcagcat
taatccattaaagctaacctatttttcaatatttatgataaactgtacat
atattgtccatatgtatttgtaaatagattgtatatactgttggaattgg
gttcaagtgtatatattcccctaagtttcttaactgcattttgatgaatt
cacattatatatgtctccaaattacttgtacagagaattcaatcttaaga
aattgacattgtgtataatactaaaattgaaaataactttgtttaaattg
tatttgcaataaactggttggacatcaactttaagttcagataatctaaa
gctttaaatgaagtctaaattttcaaaatgcagtagctaccacatggcta
tctggtaacattgtcaagtgtgatctcaatgaaagaggactccttgtatg
tatattagtgtaaatgttcccactgtactgttagaggccaacttgccttc
tgtggcttgtggcagagagtaaatgcttcaccggtttcaatgaaacatgg
tattgttggtttaactggactaaaataatacatggataaatcatcctcat
aagatttttttgtttccttcttgggtaatgagttgagggccagaggttac
gtg
gaattctcttaaaaacatagacaggacaggcgaatgcaacatttcttagg
tttgcttcctagtcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaacttttaaagct
acgttctattgcaccagtagctacttagcactgcacaattctagactgaa
aaggaagcctttagggtcacctaacatcaaaccacacctacccagataca
caggccgaccatacggagaaccgccattttattacctccaataatctacg
agactttgattgtgtcaggacttctgactttgaaagaggtttaaaaaaaa
gtactgggcaagatttcagcgaacaaagtgtgcatcccttctcgatgatg
ctattctgtatatcctacaagttgcttttgtgccctacctttatttattt
atgcaatttatttttgtctttgagctgttttacaatcctgtaacttgtag
caaactgatgagagacagaaactgttattgcccagagataaggaaatgaa
ttctggttgagacattaatagccttgacctccttaagaaggacagtctta
catcagttgcttccgtgtcagctcttgaattcttctttgagcctcccatg
gaggctctgtgctaaaatattgaacccagagccttgtaaatatttaatgc
ttcaagttcttacaacatagtccaaggcttagcctccaactctccatgta
gtctagacagctctcccccttgcctcattctcgtgggtactgccatgtcc
aacactgtaaatcatctttaaacttcctgttccttagttattaaatgagt
taaagttgggaatggcggctcatgaccctgatcccagcactcgggaggct
gatgtaagaggattgctatgagtctgaggtcagcctggtctactagtgaa
ttacaggccagcctgggctacagagaccctgtcttaaataaataaatgca
aacagcaagacatgattttactccctgtctcagtatacagcttgatttta
ttgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_96517765_96518912
seq2: B6Ng01-073E07.b_44_1196 (reverse)

seq1  CACGT-ACCTCTGGCCCTCAACTCATTACCC-AGAAGGAAACAAAAAATC  48
      ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  
seq2  CACGTAACCTCTGGCCCTCAACTCATTACCCAAGAAGGAAACAAAAAAAT  50

seq1  CTACTGAGGATTGATTAAT-CATGTATTTATTTTAGTTCAGTTAAAACAA  97
      ||  |||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||
seq2  CTTATGAGGA-TGATTTATCCATGTA-TTATTTTAGTCCAGTTAAACCAA  98

seq1  ACATACATTGTTTCATTGAAACCGGTGTAGCATTTACTCTCTGCCAACAG  147
        ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| 
seq2  CAATACCATGTTTCATTGAAACCGGTGAAGCATTTACTCTCTGCC-ACAA  147

seq1  GCCACAG-AGGCATGTTGGCCTCTAACAGTACAGCTGGGACATTTACACT  196
      ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||
seq2  GCCACAGAAGGCAAGTTGGCCTCTAACAGTACAGTGGGAACATTTACACT  197

seq1  -ATATACATACAAGGAGTCCTCTTTCATTGAGATCACACTTGAC-ATGTT  244
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AATATACATACAAGGAGTCCTCTTTCATTGAGATCACACTTGACAATGTT  247

seq1  ACCAGATAGCCATGTGGTAGCTACTGCATTTTGAAAATTTAGACCTCATT  294
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ACCAGATAGCCATGTGGTAGCTACTGCATTTTGAAAATTTAGACTTCATT  297

seq1  TAAAGCTTTAGATTATCTGAACTT-AAGTTGATGTCCAACCAGTTTATTG  343
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCTTTAGATTATCTGAACTTAAAGTTGATGTCCAACCAGTTTATTG  347

seq1  CAAATACAATTTAAAC-AAGTTATTTTCAATTTTAGTATTATACACAATG  392
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATACAATTTAAACAAAGTTATTTTCAATTTTAGTATTATACACAATG  397

seq1  TCAATTTCTTAAGATTGAATTCTCTGTACAAGTAATTTGGAGACATATAT  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTTCTTAAGATTGAATTCTCTGTACAAGTAATTTGGAGACATATAT  447

seq1  AATGTGAATTCATCAAAATGCAGTTAAGAAACTTAGGGGAATATATACAC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGAATTCATCAAAATGCAGTTAAGAAACTTAGGGGAATATATACAC  497

seq1  TTGAACCCAATTCCAACAGTATATACAATCTATTTACAAATACATATGGA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACCCAATTCCAACAGTATATACAATCTATTTACAAATACATATGGA  547

seq1  CAATATATGTACAGTTTATCATAAATATTGAAAAATAGGTTAGCTTTAAT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATATGTACAGTTTATCATAAATATTGAAAAATAGGTTAGCTTTAAT  597

seq1  GGATTAATGCTGCTCTATAAATAACAGTACAGTTATTGAAACGTTCCATG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTAATGCTGCTCTATAAATAACAGTACAGTTATTGAAACGTTCCATG  647

seq1  GAAGACAGCGATGTGAATTGAGGTGACGGGACAGTGGTTTTAATACTGAA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACAGCGATGTGAATTGAGGTGACGGGACAGTGGTTTTAATACTGAA  697

seq1  GACTGCTCAAGGCTGAGAATTCAGTTCAGGAACCTCAAGGCGGGTAAAAC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCTCAAGGCTGAGAATTCAGTTCAGGAACCTCAAGGCGGGTAAAAC  747

seq1  AGCCCCAAGCTTTGGAATTTGGCCTGAAATTCATTTGGAACCTTGCTCCC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCAAGCTTTGGAATTTGGCCTGAAATTCATTTGGAACCTTGCTCCC  797

seq1  TCACAGGAGGTTTGGGAAGTCTCTCCACACTGATCGGCTGTGAACAGGAT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGGAGGTTTGGGAAGTCTCTCCACACTGATCGGCTGTGAACAGGAT  847

seq1  CCTGGTTGTCATGGCACCTCTCAGGATGCCTGCCTCTCAGCATCCCCTGG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTTGTCATGGCACCTCTCAGGATGCCTGCCTCTCAGCATCCCCTGG  897

seq1  CATATGGTAGCCAGGACTCTTTCCAGGACTTCAAGCGGAGGTGCAGAGTC  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGGTAGCCAGGACTCTTTCCAGGACTTCAAGCGGAGGTGCAGAGTC  947

seq1  TTTGACGAGCAGGTGAGGTTCTGGACTTGATGACAAGTAAGCAGCATGGG  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACGAGCAGGTGAGGTTCTGGACTTGATGACAAGTAAGCAGCATGGG  997

seq1  GGAGTGTCTTCTCACTGCCTTTGCGTCTACACAGTCCCCAGGGGTTTCAT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGTCTTCTCACTGCCTTTGCGTCTACACAGTCCCCAGGGGTTTCAT  1047

seq1  CTTGGGACAGAACTGACCATTGGTTGTACCCAATGTATGTAGCACTACCA  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGACAGAACTGACCATTGGTTGTACCCAATGTATGTAGCACTACCA  1097

seq1  GACGTCTTCCAGTCTGCAAGAGTCTTTAATGGCAGACATACCTTGCCTAT  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGTCTTCCAGTCTGCAAGAGTCTTTAATGGCAGACATACCTTGCCTAT  1147

seq1  GAATTC  1148
      ||||||
seq2  GAATTC  1153

seq1: chr15_96399043_96400052
seq2: B6Ng01-073E07.g_71_1077

seq1  GAATTCTCTTAAATACATAGACAGGACAGGCGAATGCAACATTTCTTAGG  50
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTAAAAACATAGACAGGACAGGCGAATGCAACATTTCTTAGG  50

seq1  TTTGCTTCCTAGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACTTTTAAAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTTCCTAGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACTTTTAAAGCT  100

seq1  ACGTTCTATTGCACCAGTAGCTACTTAGCACTGCACAATTCTAGACTGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTCTATTGCACCAGTAGCTACTTAGCACTGCACAATTCTAGACTGAA  150

seq1  AAGGAAGCCTTTAGGGTCACCTAACATCAAACCACACCTACCCAGATACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGCCTTTAGGGTCACCTAACATCAAACCACACCTACCCAGATACA  200

seq1  CAGGCCGACCATACGGAGAACCGCCATTTTATTACCTCCAATAATCTACG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCCGACCATACGGAGAACCGCCATTTTATTACCTCCAATAATCTACG  250

seq1  AGACTTTGATTGTGTCAGGACTTCTGACTTTGAAAGAGGTTTAAAAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTTGATTGTGTCAGGACTTCTGACTTTGAAAGAGGTTTAAAAAAAA  300

seq1  GTACTGGGCAAGATTTCAGCGAACAAAGTGTGCATCCCTTCTCGATGATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTGGGCAAGATTTCAGCGAACAAAGTGTGCATCCCTTCTCGATGATG  350

seq1  CTATTCTGTATATCCTACAAGTTGCTTTTGTGCCCTACCTTTATTTATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCTGTATATCCTACAAGTTGCTTTTGTGCCCTACCTTTATTTATTT  400

seq1  ATGCAATTTATTTTTGTCTTTGAGCTGTTTTACAATCCTGTAACTTGTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATTTATTTTTGTCTTTGAGCTGTTTTACAATCCTGTAACTTGTAG  450

seq1  CAAACTGATGAGAGACAGAAACTGTTATTGCCCAGAGATAAGGAAATGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTGATGAGAGACAGAAACTGTTATTGCCCAGAGATAAGGAAATGAA  500

seq1  TTCTGGTTGAGACATTAATAGCCTTGACCTCCTTAAGAAGGACAGTCTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGTTGAGACATTAATAGCCTTGACCTCCTTAAGAAGGACAGTCTTA  550

seq1  CATCAGTTGCTTCCGTGTCAGCTCTTGAATTCTTCTTTGAGCCTCCCATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGTTGCTTCCGTGTCAGCTCTTGAATTCTTCTTTGAGCCTCCCATG  600

seq1  GAGGCTCTGTGCTAAAATATTGAACCCAGAGCCTTGTAAATATTTAATGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTCTGTGCTAAAATATTGAACCCAGAGCCTTGTAAATATTTAATGC  650

seq1  TTCAAGTTCTTACAACATAGTCCAAGGCTTAGCCTCCAACTCTCCATGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGTTCTTACAACATAGTCCAAGGCTTAGCCTCCAACTCTCCATGTA  700

seq1  GTCTAGACAGCTCTCCCCC-TGCCTCATTCTCGTGGGTACTGCCATGTCC  749
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAGACAGCTCTCCCCCTTGCCTCATTCTCGTGGGTACTGCCATGTCC  750

seq1  AACACTGTAAATCATCTTTAAACTTCCTGTTCCTTAGTTATTAAATGAGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTGTAAATCATCTTTAAACTTCCTGTTCCTTAGTTATTAAATGAGT  800

seq1  TAAAGTTGGGAATGGCGGCTCATGACCCTGATCCCAGCACTCGGGAGGCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTTGGGAATGGCGGCTCATGACCCTGATCCCAGCACTCGGGAGGCT  850

seq1  GATGTAAGAGGATTGCTATGAGTCTGAGGTCAGCCTGGTCTACGTAGTGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GATGTAAGAGGATTGCTATGAGTCTGAGGTCAGCCTGGTCTAC-TAGTGA  899

seq1  ATTACAGGCCAGCCTGGGCTACAGAGACCCTGTCTTAAATAAATAAATGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAGGCCAGCCTGGGCTACAGAGACCCTGTCTTAAATAAATAAATGC  949

seq1  AAACAGCAAGACATGATTTTACATCCTGTCTCAAGTATACAGCTTGTATT  999
      ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||
seq2  AAACAGCAAGACATGATTTTACTCCCTGTCTC-AGTATACAGCTTG-ATT  997

seq1  TTATGTGTGTG  1010
      |||| ||||||
seq2  TTAT-TGTGTG  1007