BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-074O21
Chromosome15 (Build37)
Map Location 72,146,551 - 72,252,867
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene1700010C24Rik, LOC100040847, Col22a1
Downstream geneKcnk9, 1810044A24Rik, LOC665621, Peg13, LOC100041120, Chrac1, Eif2c2, Ptk2, LOC666053
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-074O21.bB6Ng01-074O21.g
ACCDH891642DH891643
length1,0821,082
definitionDH891642|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074O21, 5' end.DH891643|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074O21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,146,551 - 72,147,626)(72,251,786 - 72,252,867)
sequence
gaattccagcatcacctctccccttcccagcctccatttttactttgtct
cacttggtcttattcatgggattctgcttatcactgcagaggcaagtgtg
aggatgggttgggacagagggataaaagaccttgaagatggaatgcttct
tcctcatcgtggctccttggggctccttcaaagccctgtgagtgaggaca
gaaaggagcacacacctctatatacctccaggtcggtgcctaaagaacac
acaaggagaaaataatattatgcacaatattgtagtagtaaattatttaa
atcttgtcccagggcttctatcctgctttgttcattggatttccagatga
aagacacagtcacagcctttatatttacaataagccttaaacaatacaag
agctgggcagatacctatccctcatgctgttaacctctactttcctattg
ataagcccaagttattatttactatttactatgttctatctgggctgctc
ttaactccaattgggcagccctcggggccatgttctcttgacctttaact
catggtggcttctccttcctcctcccctgtaccttcttctttctcatagt
cccaggccctggaaacctaaatcccacctatgtctgcccagctattagct
gttgtcatctttatttaccaatcacaattaacttagctagtgtctacaag
cagactctcttctcatctcgagggcaaccagtttgggggaagcaaattag
tttagaatataaggagcatcaggccaacccacattgttagttgagaagca
ttttggcagttttaaccctaataaatcagttttcatttatcattttggaa
gaagtactttaaaatcatttgaaaatctgttcatcaaatgtgtgtgtaaa
aggagtgttctgaatataagcacacagtggggatctctctcagcctccag
tgttactgggatacctacagatggcttggggtggatgtggtcagatgtgg
gaaacaggaccttcaactagaagaacggagagacctcgggcgggggcaga
agggggtggaaatcaacaattttctccttcca
gaattcagaactggaatctctcttgtaaacttcaaaattttcagaactga
taaaaagactggagatgggaagattattcaaagaagtaagatattaatag
aaatgccaaagtctgcagagaggggaagtagaaataacaaatgcaggcag
gtgttagtcaggatctgccttctagctaacaacttgcttgtgactccaca
ataggaagaaacataggtttcctttgagtttctagagtctgttctcacta
ccatttccatgtttaacatctcatatttaaggagtagggcagctagatct
gcttccccaggatactcctaggaccatcggcatcaagaggagtcaagttg
ggaaacaatcccactggacagatcactaatgtggaggtgtgtcatggctc
catttcgggccacccctgaaatgaagtcattttttctaatccattgctgt
ccctctaagggacactgaaacatgtagaccagccacattcttaagaggta
aacttatgtttggaggccttctatttcccacagtttaggaaggtagcttg
tttccacgaagtttctgctcatggggatggtatctctaagcagaaagggc
agctgtaagagtgaatcgctgagcagtccagacacatctgatgcattcag
ttctatgttcaggtaaccgttcctagtcacattcatgtttgttcatgttg
agaagtcagaagaacatcttgcttctaggaccagaaagaccaagaacctg
gatataattttggaacacaaaatggggtttcctagagagaggggctcaga
gcctttacagtaagcagtggtctgaatccctttaggacagtcacataatg
aaggcaagtgacttccttcattacccttagtaataagctggtgattcacc
actgggcttggacttagagtcataagctgaacatgtatggggcactgctc
tgagcacacatgtactgcactggttcacagagctggagaagggtctgttc
catgctctgggctatgatgagtgtcatgtcattacagacatgtcctcaga
aagataccatgctgttgaagttaggacgaatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_72146551_72147626
seq2: B6Ng01-074O21.b_47_1128

seq1  GAATTCCAGCATCACCTCTCCCCTTCCCAGCCTCCATTTTTACTTTGTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGCATCACCTCTCCCCTTCCCAGCCTCCATTTTTACTTTGTCT  50

seq1  CACTTGGTCTTATTCATGGGATTCTGCTTATCACTGCAGAGGCAAGTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGTCTTATTCATGGGATTCTGCTTATCACTGCAGAGGCAAGTGTG  100

seq1  AGGATGGGTTGGGACAGAGGGATAAAAGACCTTGAAGATGGAATGCTTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGGGTTGGGACAGAGGGATAAAAGACCTTGAAGATGGAATGCTTCT  150

seq1  TCCTCATCGTGGCTCCTTGGGGCTCCTTCAAAGCCCTGTGAGTGAGGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCATCGTGGCTCCTTGGGGCTCCTTCAAAGCCCTGTGAGTGAGGACA  200

seq1  GAAAGGAGCACACACCTCTATATACCTCCAGGTCGGTGCCTAAAGAACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGAGCACACACCTCTATATACCTCCAGGTCGGTGCCTAAAGAACAC  250

seq1  ACAAGGAGAAAATAATATTATGCACAATATTGTAGTAGTAAATTATTTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGAGAAAATAATATTATGCACAATATTGTAGTAGTAAATTATTTAA  300

seq1  ATCTTGTCCCAGGGCTTCTATCCTGCTTTGTTCATTGGATTTCCAGATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGTCCCAGGGCTTCTATCCTGCTTTGTTCATTGGATTTCCAGATGA  350

seq1  AAGACACAGTCACAGCCTTTATATTTACAATAAGCCTTAAACAATACAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACACAGTCACAGCCTTTATATTTACAATAAGCCTTAAACAATACAAG  400

seq1  AGCTGGGCAGATACCTATCCCTCATGCTGTTAACCTCTACTTTCCTATTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGCAGATACCTATCCCTCATGCTGTTAACCTCTACTTTCCTATTG  450

seq1  ATAAGCCCAAGTTATTATTTACTATTTACTATGTTCTATCTGGGCTGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCCCAAGTTATTATTTACTATTTACTATGTTCTATCTGGGCTGCTC  500

seq1  TTAACTCCAATTGGGCAGCCCTCGGGGCCATGTTCTCTTGACCTTTAACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTCCAATTGGGCAGCCCTCGGGGCCATGTTCTCTTGACCTTTAACT  550

seq1  CATGGTGGCTTCTCCTTCCTCCTCCCCTGTACCTTCTTCTTTCTCATAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTGGCTTCTCCTTCCTCCTCCCCTGTACCTTCTTCTTTCTCATAGT  600

seq1  CCCAGGCCCTGGAAACCTAAATCCCACCTATGTCTGCCCAGCTATTAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGCCCTGGAAACCTAAATCCCACCTATGTCTGCCCAGCTATTAGCT  650

seq1  GTTGTCATCTTTATTTACCAATCACAATTAACTTAGCTAGTGTCTACAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCATCTTTATTTACCAATCACAATTAACTTAGCTAGTGTCTACAAG  700

seq1  CAGACTCTCTTCTCATCTCGAGGGCAACCAGTTTGGGGGAAGCAAATTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTCTCTTCTCATCTCGAGGGCAACCAGTTTGGGGGAAGCAAATTAG  750

seq1  TTTAGAATATAAGGAGCATCAGGCCAACCCACATTGTTAGTTGAGAAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAATATAAGGAGCATCAGGCCAACCCACATTGTTAGTTGAGAAGCA  800

seq1  TTTTGGCAGTTTTAACCCTAATAAATCAGTTTTCATTTATCATTTTGGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGCAGTTTTAACCCTAATAAATCAGTTTTCATTTATCATTTTGGAA  850

seq1  GAAGTACTTTAAAATCATTTGAAAATCTGTTCATCAAATGTGTGTGTAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTACTTTAAAATCATTTGAAAATCTGTTCATCAAATGTGTGTGTAAA  900

seq1  AGGAGTGTTCTGAATATAAGCACACAGTGGGGATCTCTCTCAGCCTCCAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTGTTCTGAATATAAGCACACAGTGGGGATCTCTCTCAGCCTCCAG  950

seq1  TGTTACTGGGATACCTACAGATGGCTTGGGTGGAATGTGGTCCAGATGTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||
seq2  TGTTACTGGGATACCTACAGATGGCTTGGGGTGGATGTGGT-CAGATGTG  999

seq1  GGAAACAAGGACCTTCAAACTAG-AGAACGGAGA---CTCGGGGCGGGGG  1046
      |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||   ||| |||||||||
seq2  GGAAAC-AGGACCTTC-AACTAGAAGAACGGAGAGACCTC-GGGCGGGGG  1046

seq1  CAGA--GGGGT-GAAATCAACA--TTTCT-CTTCCA  1076
      ||||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||
seq2  CAGAAGGGGGTGGAAATCAACAATTTTCTCCTTCCA  1082

seq1: chr15_72251786_72252867
seq2: B6Ng01-074O21.g_68_1149 (reverse)

seq1  AATTCTGTCCTAACTTCAACCAGCATTGTATC-TTCTGA-GACATGTCTG  48
      ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||
seq2  AATTC-GTCCTAACTTCAA-CAGCATGGTATCTTTCTGAGGACATGTCTG  48

seq1  T-ATGACATGACAACTCATCATAG-CCAGAGCATGGAACAGACCCTTCTC  96
      | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGACATGAC-ACTCATCATAGCCCAGAGCATGGAACAGACCCTTCTC  97

seq1  CAGCTCTGTG-ACCAGTGCAGTACATGTGGTGCCTCAGAGCAGTGCCCCA  145
      |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
seq2  CAGCTCTGTGAACCAGTGCAGTACATGT-GTG-CTCAGAGCAGTGCCCCA  145

seq1  TACATGTTCAGCTTATGACTCCTAAGTCCAAG-CCAGTGGTGAATCACCA  194
      |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TACATGTTCAGCTTATGACT-CTAAGTCCAAGCCCAGTGGTGAATCACCA  194

seq1  GCTTATTACTAAGGGTAATGAAGGAAGTCACTTGCCTTCATTATGTGACT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTATTACTAAGGGTAATGAAGGAAGTCACTTGCCTTCATTATGTGACT  244

seq1  GTCCTAAAGGGATTCAGACCACTGCTTACTGTAAAGGCTCTGAGCCCCTC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTAAAGGGATTCAGACCACTGCTTACTGTAAAGGCTCTGAGCCCCTC  294

seq1  TCTCTAGGAAACCCCATTTTGTGTTCCAAAATTATATCCAGGTTCTTGGT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAGGAAACCCCATTTTGTGTTCCAAAATTATATCCAGGTTCTTGGT  344

seq1  CTTTCTGGTCCTAGAAGCAAGATGTTCTTCTGACTTCTCAACATGAACAA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTGGTCCTAGAAGCAAGATGTTCTTCTGACTTCTCAACATGAACAA  394

seq1  ACATGAATGTGACTAGGAACGGTTACCTGAACATAGAACTGAATGCATCA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAATGTGACTAGGAACGGTTACCTGAACATAGAACTGAATGCATCA  444

seq1  GATGTGTCTGGACTGCTCAGCGATTCACTCTTACAGCTGCCCTTTCTGCT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGTCTGGACTGCTCAGCGATTCACTCTTACAGCTGCCCTTTCTGCT  494

seq1  TAGAGATACCATCCCCATGAGCAGAAACTTCGTGGAAACAAGCTACCTTC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGATACCATCCCCATGAGCAGAAACTTCGTGGAAACAAGCTACCTTC  544

seq1  CTAAACTGTGGGAAATAGAAGGCCTCCAAACATAAGTTTACCTCTTAAGA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACTGTGGGAAATAGAAGGCCTCCAAACATAAGTTTACCTCTTAAGA  594

seq1  ATGTGGCTGGTCTACATGTTTCAGTGTCCCTTAGAGGGACAGCAATGGAT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGCTGGTCTACATGTTTCAGTGTCCCTTAGAGGGACAGCAATGGAT  644

seq1  TAGAAAAAATGACTTCATTTCAGGGGTGGCCCGAAATGGAGCCATGACAC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAAAATGACTTCATTTCAGGGGTGGCCCGAAATGGAGCCATGACAC  694

seq1  ACCTCCACATTAGTGATCTGTCCAGTGGGATTGTTTCCCAACTTGACTCC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCACATTAGTGATCTGTCCAGTGGGATTGTTTCCCAACTTGACTCC  744

seq1  TCTTGATGCCGATGGTCCTAGGAGTATCCTGGGGAAGCAGATCTAGCTGC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGATGCCGATGGTCCTAGGAGTATCCTGGGGAAGCAGATCTAGCTGC  794

seq1  CCTACTCCTTAAATATGAGATGTTAAACATGGAAATGGTAGTGAGAACAG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTCCTTAAATATGAGATGTTAAACATGGAAATGGTAGTGAGAACAG  844

seq1  ACTCTAGAAACTCAAAGGAAACCTATGTTTCTTCCTATTGTGGAGTCACA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTAGAAACTCAAAGGAAACCTATGTTTCTTCCTATTGTGGAGTCACA  894

seq1  AGCAAGTTGTTAGCTAGAAGGCAGATCCTGACTAACACCTGCCTGCATTT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGTTGTTAGCTAGAAGGCAGATCCTGACTAACACCTGCCTGCATTT  944

seq1  GTTATTTCTACTTCCCCTCTCTGCAGACTTTGGCATTTCTATTAATATCT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTTCTACTTCCCCTCTCTGCAGACTTTGGCATTTCTATTAATATCT  994

seq1  TACTTCTTTGAATAATCTTCCCATCTCCAGTCTTTTTATCAGTTCTGAAA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCTTTGAATAATCTTCCCATCTCCAGTCTTTTTATCAGTTCTGAAA  1044

seq1  ATTTTGAAGTTTACAAGAGAGATTCCAGTTCTGAATTC  1082
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGAAGTTTACAAGAGAGATTCCAGTTCTGAATTC  1082