BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-080L03
Chromosome15 (Build37)
Map Location 63,879,040 - 64,015,148
singlet/doubletdoublet
Overlap gene0910001A06Rik, Ddef1
Upstream geneEG239502, EG432959, LOC672194, Mlze, AI987692, Gsdmdc2, 9930109F21Rik, LOC665769, 9030605I04Rik, 4933426G20Rik
Downstream geneAdcy8, LOC268812, LOC100040790
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-080L03.bB6Ng01-080L03.g
ACCDH895761DH895762
length1,1731,050
definitionDH895761|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-080L03, 5' end.DH895762|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-080L03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,013,972 - 64,015,148)(63,879,040 - 63,880,099)
sequence
gaattccatgaagctctggcctaaagtcactcctttgaccctttgcactc
tccttttcttgtccatttttctattacctagattttctcattctcagcct
tattttggattcctggcagggaatgtagtctctgtctttgcctcagataa
ggctggtgccctcttcacacttgaatgctgggagataatacagtcaagtc
aggtccccttcctgtgggctgatgtcagcaacactaggcacaggttgtcg
agaggaacatggctgtttcaggccccacttgtgtgttcagggtcggtgct
ttggctgtgcataccgtaccctacccaactttacacagcaaccatagcca
atgcattcgtctgctcctgcctaggaacaggagcatcaaatgagtgaaat
ggcaaacttagccccatgccttgttctttgatgagagttctttctaagga
gccttaatattactcagggagacttgcagtacacatttgtgtgttagaca
cttaggcacatgagaatgaagaaccttaaccaattcgatgctttcaaact
tttttgatcactgactttttcatgtaagaatcatgaactccccattgaac
aactttgagaagtgctaatctaaatgctaattttaaaatgttgttagttc
aggtgattcatttctttagctgtgtttattcttaatttcattctgcttct
gcccttgttgaatttatttctgattacatttaatacagagtgcatgattg
ttctccagccatttgtttcttatactctttttgtcttagactatgtcctt
tgctcctttggccctttatgactatacatgaagaactgcctttctaatcc
agtcttcaaatagcatctcactacatctgcccctagaaaatgaatagacc
gcccactgacgtactgtttgcactgtgcgtgctaagagagtgaaatggtg
gagaggcctgagagtcggcagaaatgctgtagcttcagagacagatgtac
tgggtccagacctctgctcttgcagcttcacatggctggtcacagagcag
atcttctcatgttctccccacccatcccgagtgcaggggggtcacgtctt
cacactactacgacccttgtctgattacagataggttaagtggctttttt
ttttctgagaaatttttaaaagc
gaattctccagtttgggcagggatgcagcgagctgctgggtgcctgctgt
atgctcctttgtcagtcatccgagtcttccttccaccttcttccttgaag
agtgaggagcttgcctgactcagctcagagagtcctgggaaggcaaccat
tcccccattcatttcaacacagcccagggaagcaagggacatgtcacttg
tctccaaggtgctgagggcagggagcacaaagccaggagagaccagcaag
ccgtgaggataacagcaggcagctcccacggtcaggaagtgagggcctga
gtgttggtactatgactgcttcctccttttacttaacctagcatctctgc
tcatagcacagggccgcctacatccagaagaggtcttccctctgctgtgg
aggtggcttcaaggacacgcccagagacatcacttcaagtgttatcaaat
tgatgatacaagggcaaactggagatttctctggacacttgataataact
aaataccaaacacaaggtcctaacatgggcgcgctacaacaaaaaacaca
tacatgtgaaaataataaatccatgggcagagatgagatgtagctgggtg
gtagagcagtcacgtagcatgtgtgtggccctatccatactacagggtgg
gggggaccaactaagtgtgtgtggtgtcccgcactgtggccccagcactg
aggagcctctggagagagtacaaggtcagctacatggtgaattccaggcc
agcctggaagacatagtgagactcaaaatgaatagaaggaaagaggaaat
aaagagaagagtgagtgaggatttcagggagggtgggatagatgtttaac
aggtcccagtttgaattgtccaccccaaggcagaaatgtaatgtgtacaa
cttgttccccagacataaactaggcacctagaacctagctgctctgtaca
cttcctttaaaaagaagaaagaaaaaggtcccacccagcaacacgaggcc
tctgacatcttcacactggaacggaatctgaatggtctgaggcattttca

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_64013972_64015148
seq2: B6Ng01-080L03.b_48_1220 (reverse)

seq1  GCTTTTAAAAATACTCTCAAAAAAAAAAAAACCCACTAAACTATCTGTAA  50
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||
seq2  GCTTTTAAAAAT-TTCTCAGAAAAAAAAAAGCCACTTAACCTATCTGTAA  49

seq1  TCAGGACAAGGGTCGTAGTAGTGTGAAGACGTGACACCCCTGCACTCTGG  100
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
seq2  TCA-GACAAGGGTCGTAGTAGTGTGAAGACGTGACCCCCCTGCACTCGGG  98

seq1  ATGGGTGAGTGAGAACATGAG-AGATCTGCCTCTGGTGACCAGGCATGTG  149
      ||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||
seq2  ATGGGTG-GGGAGAACATGAGAAGATCTG-CTCT-GTGACCAGCCATGTG  145

seq1  AAGCTGC-AGAGCAGAGGTCTGGACCCAGTTACATCTGTCTCTGAAGCTA  198
      ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGCAAGAGCAGAGGTCTGGACCCAG-TACATCTGTCTCTGAAGCTA  194

seq1  CAGCATTTCTGCCGACTCTCAGGCCTCTCCACCATTTCACTCTCTTAGCA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATTTCTGCCGACTCTCAGGCCTCTCCACCATTTCACTCTCTTAGCA  244

seq1  CGCACAGTGCAAACAGTACGTCAGTGGGCGGTCTATTCATTTTCTAGGGG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCACAGTGCAAACAGTACGTCAGTGGGCGGTCTATTCATTTTCTAGGGG  294

seq1  CAGATGTAGTGAGATGCTATTTGAAGACTGGATTAGAAAGGCAGTTCTTC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGTAGTGAGATGCTATTTGAAGACTGGATTAGAAAGGCAGTTCTTC  344

seq1  ATGTATAGTCATAAAGGGCCAAAGGAGCAAAGGACATAGTCTAAGACAAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATAGTCATAAAGGGCCAAAGGAGCAAAGGACATAGTCTAAGACAAA  394

seq1  AAGAGTATAAGAAACAAATGGCTGGAGAACAATCATGCACTCTGTATTAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTATAAGAAACAAATGGCTGGAGAACAATCATGCACTCTGTATTAA  444

seq1  ATGTAATCAGAAATAAATTCAACAAGGGCAGAAGCAGAATGAAATTAAGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAATCAGAAATAAATTCAACAAGGGCAGAAGCAGAATGAAATTAAGA  494

seq1  ATAAACACAGCTAAAGAAATGAATCACCTGAACTAACAACATTTTAAAAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACACAGCTAAAGAAATGAATCACCTGAACTAACAACATTTTAAAAT  544

seq1  TAGCATTTAGATTAGCACTTCTCAAAGTTGTTCAATGGGGAGTTCATGAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATTTAGATTAGCACTTCTCAAAGTTGTTCAATGGGGAGTTCATGAT  594

seq1  TCTTACATGAAAAAGTCAGTGATCAAAAAAGTTTGAAAGCATCGAATTGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACATGAAAAAGTCAGTGATCAAAAAAGTTTGAAAGCATCGAATTGG  644

seq1  TTAAGGTTCTTCATTCTCATGTGCCTAAGTGTCTAACACACAAATGTGTA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGTTCTTCATTCTCATGTGCCTAAGTGTCTAACACACAAATGTGTA  694

seq1  CTGCAAGTCTCCCTGAGTAATATTAAGGCTCCTTAGAAAGAACTCTCATC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAAGTCTCCCTGAGTAATATTAAGGCTCCTTAGAAAGAACTCTCATC  744

seq1  AAAGAACAAGGCATGGGGCTAAGTTTGCCATTTCACTCATTTGATGCTCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAACAAGGCATGGGGCTAAGTTTGCCATTTCACTCATTTGATGCTCC  794

seq1  TGTTCCTAGGCAGGAGCAGACGAATGCATTGGCTATGGTTGCTGTGTAAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCTAGGCAGGAGCAGACGAATGCATTGGCTATGGTTGCTGTGTAAA  844

seq1  GTTGGGTAGGGTACGGTATGCACAGCCAAAGCACCGACCCTGAACACACA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGGTAGGGTACGGTATGCACAGCCAAAGCACCGACCCTGAACACACA  894

seq1  AGTGGGGCCTGAAACAGCCATGTTCCTCTCGACAACCTGTGCCTAGTGTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGGCCTGAAACAGCCATGTTCCTCTCGACAACCTGTGCCTAGTGTT  944

seq1  GCTGACATCAGCCCACAGGAAGGGGACCTGACTTGACTGTATTATCTCCC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACATCAGCCCACAGGAAGGGGACCTGACTTGACTGTATTATCTCCC  994

seq1  AGCATTCAAGTGTGAAGAGGGCACCAGCCTTATCTGAGGCAAAGACAGAG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTCAAGTGTGAAGAGGGCACCAGCCTTATCTGAGGCAAAGACAGAG  1044

seq1  ACTACATTCCCTGCCAGGAATCCAAAATAAGGCTGAGAATGAGAAAATCT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACATTCCCTGCCAGGAATCCAAAATAAGGCTGAGAATGAGAAAATCT  1094

seq1  AGGTAATAGAAAAATGGACAAGAAAAGGAGAGTGCAAAGGGTCAAAGGAG  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAATAGAAAAATGGACAAGAAAAGGAGAGTGCAAAGGGTCAAAGGAG  1144

seq1  TGACTTTAGGCCAGAGCTTCATGGAATTC  1177
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTTAGGCCAGAGCTTCATGGAATTC  1173

seq1: chr15_63879040_63880099
seq2: B6Ng01-080L03.g_71_1120

seq1  GAATTCTCCAGTTTGGGCAGGGATGCAGCGAGCTGCTGGGTGCCTGCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCAGTTTGGGCAGGGATGCAGCGAGCTGCTGGGTGCCTGCTGT  50

seq1  ATGCTCCTTTGTCAGTCATCCGAGTCTTCCTTCCACCTTCTTCCTTGAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCCTTTGTCAGTCATCCGAGTCTTCCTTCCACCTTCTTCCTTGAAG  100

seq1  AGTGAGGAGCTTGCCTGACTCAGCTCAGAGAGTCCTGGGAAGGCAACCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGGAGCTTGCCTGACTCAGCTCAGAGAGTCCTGGGAAGGCAACCAT  150

seq1  TCCCCCATTCATTTCAACACAGCCCAGGGAAGCAAGGGACATGTCACTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCATTCATTTCAACACAGCCCAGGGAAGCAAGGGACATGTCACTTG  200

seq1  TCTCCAAGGTGCTGAGGGCAGGGAGCACAAAGCCAGGAGAGACCAGCAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAAGGTGCTGAGGGCAGGGAGCACAAAGCCAGGAGAGACCAGCAAG  250

seq1  CCGTGAGGATAACAGCAGGCAGCTCCCACGGTCAGGAAGTGAGGGCCTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTGAGGATAACAGCAGGCAGCTCCCACGGTCAGGAAGTGAGGGCCTGA  300

seq1  GTGTTGGTACTATGACTGCTTCCTCCTTTTACTTAACCTAGCATCTCTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGGTACTATGACTGCTTCCTCCTTTTACTTAACCTAGCATCTCTGC  350

seq1  TCATAGCACAGGGCCGCCTACATCCAGAAGAGGTCTTCCCTCTGCTGTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAGCACAGGGCCGCCTACATCCAGAAGAGGTCTTCCCTCTGCTGTGG  400

seq1  AGGTGGCTTCAAGGACACGCCCAGAGACATCACTTCAAGTGTTATCAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGCTTCAAGGACACGCCCAGAGACATCACTTCAAGTGTTATCAAAT  450

seq1  TGATGATACAAGGGCAAACTGGAGATTTCTCTGGACACTTGATAATAACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATACAAGGGCAAACTGGAGATTTCTCTGGACACTTGATAATAACT  500

seq1  AAATACCAAACACAAGGTCCTAACATGGGCGCGCTACAACAAAAAACACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACCAAACACAAGGTCCTAACATGGGCGCGCTACAACAAAAAACACA  550

seq1  TACATGTGAAAATAATAAATCCATGGGCAGAGATGAGATGTAGCTGGGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGTGAAAATAATAAATCCATGGGCAGAGATGAGATGTAGCTGGGTG  600

seq1  GTAGAGCAGTCACGTAGCATGTGTGTGGCCCTATCCATACTACAGGGTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGCAGTCACGTAGCATGTGTGTGGCCCTATCCATACTACAGGGTGG  650

seq1  GGGGGACCAACTAAGTGTGTGTGGTGTCCCGCACTGTGGCCCCAGCACTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGACCAACTAAGTGTGTGTGGTGTCCCGCACTGTGGCCCCAGCACTG  700

seq1  AGGAGCCTCTGGAGAGAGTACAAGGTCAGCTACATGGTGAATTCCAGGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCCTCTGGAGAGAGTACAAGGTCAGCTACATGGTGAATTCCAGGCC  750

seq1  AGCCTGGAAGACATAGTGAGACTCAAAATGAATAGAAGGAAAGAGGAAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGGAAGACATAGTGAGACTCAAAATGAATAGAAGGAAAGAGGAAAT  800

seq1  AAAGAGAAGAGTGAGTGAGGATTTCAGGGGAGGGTGGGATAGATGTTTAA  850
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGAAGAGTGAGTGAGGATTTCA-GGGAGGGTGGGATAGATGTTTAA  849

seq1  CAGGTCCCAGTTTGAATTGTCCA-CCCAAAGCAGAAATGTAATGTGTACA  899
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCCCAGTTTGAATTGTCCACCCCAAGGCAGAAATGTAATGTGTACA  899

seq1  ACTTGTTCCCCAGACATAAACTAGGCACCTAGAACCTAGGCTGCTCTGTA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ACTTGTTCCCCAGACATAAACTAGGCACCTAGAACCTA-GCTGCTCTGTA  948

seq1  CACTTCCTTTAAAAAAGAAGAAAGAAAAAAGTCCCACCCAGCAAACACAA  999
      |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
seq2  CACTTCCTTT-AAAAAGAAGAAAGAAAAAGGTCCCACCCAGC-AACACGA  996

seq1  GGCCCTCTGGACAATCTTCAACACTGGAAAACGGAAATCTGAAATGTCTG  1049
      || ||||| ||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||  |||||
seq2  GG-CCTCT-GAC-ATCTTC-ACACTGG--AACGG-AATCTGAATGGTCTG  1039

seq1  AGGCATTTTCA  1060
      |||||||||||
seq2  AGGCATTTTCA  1050