BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-082B08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 27,445,089 - 27,636,234
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnk, BC087945, LOC100040622, BC052328
Upstream geneFbxl7, LOC622531, LOC625311
Downstream geneTrio, LOC667126, Dnahc5, EG382974, LOC100040675, LOC100040689, LOC100040702
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-082B08.bB6Ng01-082B08.g
ACCDH896744DH896745
length931827
definitionDH896744|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-082B08, 5' end.DH896745|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-082B08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(27,635,305 - 27,636,234)(27,445,089 - 27,445,911)
sequence
gaattccatctactgttccagagaaaaccctgatcctggagaatctaaag
acaaaacttgagagcaagcagctaagccgtgttatccttcaagtggagca
tagacattcagcaagaccggtaaccacactgcagagcaggggagagtcct
aagaaggggacaaagtgatctaggacacctctggcggtcggctgcatgtg
caggtacaggtagcggaaagctttctcggtctgatgtggacttcgtgaat
atggaagctgagaaatgggccgtgctttcccgacagacactgaggaagag
gcagggtcagtcacgccttgagtgcctgatgaagacgctaggtctcagtt
actccttagacactactgtgcacaatgtcttgtgtctgtcactattctga
gagacaccagctgaggggggattccagtgcagaggtgctggcaaccctgc
cttcctggagtgtgaaggggctgccaggcagtcagagtgcaggggtggca
tccagtagacagcactctaagggagcaggaggagtcactttaagctcttc
agtaggttggaaggatgagaaagcaagaaatgaacctctaggtgaagaaa
ctgggtgtctctgggtcgtcagcaaggaaaacccttacgttctctgcttg
ggccactgactggagccgtgtgagtgtgagacagaactgagaggtgtggc
ttggtagcatgaggaaatctttgcttagagtggatgctgagacaaccttc
atggtaccagggctgaggacagtgccttgtagaggagatcaggcagccaa
agtgataggtatgtcgttggcactacatttccagtgctttatgtgactta
cgacagctttaaagttattttattatctacttgttaattgtgtgtgtgtg
tgagtgtgtaagtgtgtatatgtaagtgtgt
gaattctcttttgtatcactctaaattatacctatgcactgaaaagtggg
ctgtgctaataaggacctatgtaatcccatacaaataggaccaggatgac
tatgctgaataaaaaccagatcagtacaatgctgattctgttcctgtagg
cagcccttggtcttggtggtttcgtagttatgtcgctttgtcgcagcaag
tctctttcttggtagactgccagttacttgagaatagagttgtactttct
tcatgtggaaataaagaagagttcagggggaaaaaatggctatggtactt
aagggtgaccccattcaggactattgtggagttgcccgggtaattccagg
gggatgtttaacttgtccgaaggcaaaagagaaggaaggactcagatcaa
ggagcagagtgatgggtagatggcctggacttgctgggagaaaggttctg
taagcaggagctgcttgctaagccagcctgggtgccctgaaggtgaccat
tgccggaagggtaagcggtgaggaacttgatccaatgatgtcacaagtac
tcctatgttggcttcagggttccatcaggattcttgttacaactagagta
gccaggctgaaggtggcactctggaacatgtaggcaagagggcctcgaaa
tttggtcaatgagtctttgtctcctgaagaccaccgtgtggtcagcattt
taaaataaccatttgggcaggttctgcagacacctgtgtgtagcatttcg
agagcaggaagcactactggactctatggttgtaggcaaggaaacccagg
ggatgttgaattcaatgagggcagtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_27635305_27636234
seq2: B6Ng01-082B08.b_47_977 (reverse)

seq1  ACACACTTACATATACACACTTACACACTCACACACACACACAATTAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTTACATATACACACTTACACACTCACACACACACACAATTAACA  50

seq1  AGTAGATAATAAAATAACTTTAAAGCTGTCGTAAGTCACATAAAGCACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGATAATAAAATAACTTTAAAGCTGTCGTAAGTCACATAAAGCACTG  100

seq1  G-AATGTAGTGCCAACGACATACCTATCACTTTGGCTGCCTGATCTCCTC  149
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGTAGTGCCAACGACATACCTATCACTTTGGCTGCCTGATCTCCTC  150

seq1  TACAAGGCACTGTCCTCAGCCCTGGTACCATGAAGGTTGTCTCAGCATCC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGGCACTGTCCTCAGCCCTGGTACCATGAAGGTTGTCTCAGCATCC  200

seq1  ACTCTAAGCAAAGATTTCCTCATGCTACCAAGCCACACCTCTCAGTTCTG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTAAGCAAAGATTTCCTCATGCTACCAAGCCACACCTCTCAGTTCTG  250

seq1  TCTCACACTCACACGGCTCCAGTCAGTGGCCCAAGCAGAGAACGTAAGGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACACTCACACGGCTCCAGTCAGTGGCCCAAGCAGAGAACGTAAGGG  300

seq1  TTTTCCTTGCTGACGACCCAGAGACACCCAGTTTCTTCACCTAGAGGTTC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTTGCTGACGACCCAGAGACACCCAGTTTCTTCACCTAGAGGTTC  350

seq1  ATTTCTTGCTTTCTCATCCTTCCAACCTACTGAAGAGCTTAAAGTGACTC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTTGCTTTCTCATCCTTCCAACCTACTGAAGAGCTTAAAGTGACTC  400

seq1  CTCCTGCTCCCTTAGAGTGCTGTCTACTGGATGCCACCCCTGCACTCTGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCTCCCTTAGAGTGCTGTCTACTGGATGCCACCCCTGCACTCTGA  450

seq1  CTGCCTGGCAGCCCCTTCACACTCCAGGAAGGCAGGGTTGCCAGCACCTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTGGCAGCCCCTTCACACTCCAGGAAGGCAGGGTTGCCAGCACCTC  500

seq1  TGCACTGGAATCCCCCCTCAGCTGGTGTCTCTCAGAATAGTGACAGACAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTGGAATCCCCCCTCAGCTGGTGTCTCTCAGAATAGTGACAGACAC  550

seq1  AAGACATTGTGCACAGTAGTGTCTAAGGAGTAACTGAGACCTAGCGTCTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACATTGTGCACAGTAGTGTCTAAGGAGTAACTGAGACCTAGCGTCTT  600

seq1  CATCAGGCACTCAAGGCGTGACTGACCCTGCCTCTTCCTCAGTGTCTGTC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGGCACTCAAGGCGTGACTGACCCTGCCTCTTCCTCAGTGTCTGTC  650

seq1  GGGAAAGCACGGCCCATTTCTCAGCTTCCATATTCACGAAGTCCACATCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAAGCACGGCCCATTTCTCAGCTTCCATATTCACGAAGTCCACATCA  700

seq1  GACCGAGAAAGCTTTCCGCTACCTGTACCTGCACATGCAGCCGACCGCCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCGAGAAAGCTTTCCGCTACCTGTACCTGCACATGCAGCCGACCGCCA  750

seq1  GAGGTGTCCTAGATCACTTTGTCCCCTTCTTAGGACTCTCCCCTGCTCTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGTCCTAGATCACTTTGTCCCCTTCTTAGGACTCTCCCCTGCTCTG  800

seq1  CAGTGTGGTTACCGGTCTTGCTGAATGTCTATGCTCCACTTGAAGGATAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTGGTTACCGGTCTTGCTGAATGTCTATGCTCCACTTGAAGGATAA  850

seq1  CACGGCTTAGCTGCTTGCTCTCAAGTTTTGTCTTTAGATTCTCCAGGATC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGCTTAGCTGCTTGCTCTCAAGTTTTGTCTTTAGATTCTCCAGGATC  900

seq1  AGGGTTTTCTCTGGAACAGTAGATGGAATTC  930
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTTTCTCTGGAACAGTAGATGGAATTC  931

seq1: chr15_27445089_27445911
seq2: B6Ng01-082B08.g_60_885

seq1  GAATTCTCTTTTGTATCACTCTAAATTATACCTATGCACTGAAAAGTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTTTGTATCACTCTAAATTATACCTATGCACTGAAAAGTGGG  50

seq1  CTGTGCTAATAAGGACCTATGTAATCCCATACAAATAGGACCAGGATGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCTAATAAGGACCTATGTAATCCCATACAAATAGGACCAGGATGAC  100

seq1  TATGCTGAATAAAAACCAGATCAGTACAATGCTGATTCTGTTCCTGTAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTGAATAAAAACCAGATCAGTACAATGCTGATTCTGTTCCTGTAGG  150

seq1  CAGCCCTTGGTCTTGGTGGTTTCGTAGTTATGTCGCTTTGTCGCAGCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCTTGGTCTTGGTGGTTTCGTAGTTATGTCGCTTTGTCGCAGCAAG  200

seq1  TCTCTTTCTTGGTAGACTGCCAGTTACTTGAGAATAGAGTTGTACTTTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTCTTGGTAGACTGCCAGTTACTTGAGAATAGAGTTGTACTTTCT  250

seq1  TCATGTGGAAATAAAGAAGAGTTCAGGGGGAAAAAATGGCTATGGTACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTGGAAATAAAGAAGAGTTCAGGGGGAAAAAATGGCTATGGTACTT  300

seq1  AAGGGTGACCCCATTCAGGACTATTGTGGAGTTGCCCGGGTAATTCCAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTGACCCCATTCAGGACTATTGTGGAGTTGCCCGGGTAATTCCAGG  350

seq1  GGGATGTTTAACTTGTCCGAAGGCAAAAGAGAAGGAAGGACTCAGATCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGTTTAACTTGTCCGAAGGCAAAAGAGAAGGAAGGACTCAGATCAA  400

seq1  GGAGCAGAGTGATGGGTAGATGGCCTGGACTTGCTGGGAGAAAGGTTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCAGAGTGATGGGTAGATGGCCTGGACTTGCTGGGAGAAAGGTTCTG  450

seq1  TAAGCAGGAGCTGCTTGCTAAGCCAGCCTGGGTGCCCTGAAGGTGACCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAGGAGCTGCTTGCTAAGCCAGCCTGGGTGCCCTGAAGGTGACCAT  500

seq1  TGCCGGAAGGGTAAGCGGTGAGGAACTTGATCCAATGATGTCACAAGTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCGGAAGGGTAAGCGGTGAGGAACTTGATCCAATGATGTCACAAGTAC  550

seq1  TCCTATGTTGGCTTCAGGGTTCCATCAGGATTCTTGTTACAACTAGAGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATGTTGGCTTCAGGGTTCCATCAGGATTCTTGTTACAACTAGAGTA  600

seq1  GCCAGGCTGAAGGTGGCACTCTGGAACATGTAGGCAAGAGGGCCTCG-AA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GCCAGGCTGAAGGTGGCACTCTGGAACATGTAGGCAAGAGGGCCTCGAAA  650

seq1  TTTGGTCAATGAGTCTTTGTCTCCTGAAGACCACCGTGTGGTCAGCA-TT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTTGGTCAATGAGTCTTTGTCTCCTGAAGACCACCGTGTGGTCAGCATTT  700

seq1  TAAAATAACCATTTGGGCAGGTTCTGCAGACACCTGTGTGTAGCATTTCG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATAACCATTTGGGCAGGTTCTGCAGACACCTGTGTGTAGCATTTCG  750

seq1  AGAGCAGGAAGCACTACTGGACTCTATGGTTGTAGGCAAGG-AACCCAGG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AGAGCAGGAAGCACTACTGGACTCTATGGTTGTAGGCAAGGAAACCCAGG  800

seq1  GGATGTGAAATACAATGAGGGCAGTG  823
      ||||||  ||| ||||||||||||||
seq2  GGATGTTGAATTCAATGAGGGCAGTG  826