BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-097H17
Chromosome15 (Build37)
Map Location 95,751,225 - 95,935,147
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmem16f, D030018L15Rik
Upstream geneTmem117, LOC100043315, Nell2, Dbx2, LOC100042684, LOC667849, EG629300, LOC667864, LOC100043329
Downstream geneLOC100043335, EG667869, LOC667874, LOC667894, Arid2, Sfrs2ip, Slc38a1, Slc38a2, LOC667941, LOC546651, Slc38a4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-097H17.bB6Ng01-097H17.g
ACCDH907849DH907850
length167969
definitionDH907849|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097H17, 5' end.DH907850|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097H17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,934,981 - 95,935,147)(95,751,225 - 95,752,194)
sequence
gaattcagcagctccctacctaccacctggcatctctgtgtacggcctca
gagaagagctacagagatgggagtccatctatagagctaaagggagtctc
tcgtcctgctgagtgagactttccaggtaaggcatgtcttgagggaggtg
gagggggtttgagggtg
gaattcttagggtccccgtgagaaagctggtgcatttccatgtttagaaa
tgactttttcttaaattaagagatgtatgattgaaaactcaagtggcttt
gtggttttgttgtcttacttgtacgagcttatcccatataatgtcggaag
ggggaataacgcagtacctcataacctgtttgcgttgggtactggaattt
aaatgctagctgcatcttagatagtggttctcaacctgtgggtcgtgatc
ccttggggttaaatgacctttgcacaggggtcatttaagaccatcagaaa
acgtagatatttacattatgattcataactagcaaaattacagttatgag
gtagcaacaaaaatgattttatgactacactttttatcactacaacaaat
gaggaactgtattaaagggttatagtacaagggaagttgagaaccactga
tctaagggggggttgctgggtgctgggaacacttgcttttgaggtgctct
tgttaattgtattatcatgcatctgcttttggtgttctctgttgtctcct
gatggactggcctctgtccaggtgtaattgggtagatggtggctcacgga
cttcagtgctgaggtgatgacatttttcaagccctgagcatgtgagactg
gctctgaggctggatggttgtcggcctgatatagagaaacattgcctgtt
ccactgacaggccacagaacccgtgttgcctagattggctgttggaagtc
ttgtctctttatgcgaaaaagaatctgcaactgaggtctgaactctgctg
cctgctccctccattttgtcttctgcttcttcgttggctatgttgggcta
actcctacttggcatcccagaatagatcttcataatgacagggcttcact
tttgtagtgtccatttgtgtatgctatctgtatgcactggatggtgacga
tggtggtggtggtgtggtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_95934981_95935147
seq2: B6Ng01-097H17.b_41_207 (reverse)

seq1  CACCCTCAAACCCCCTCCACCTCCCTCAAGACATGCCTTACCTGGAAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTCAAACCCCCTCCACCTCCCTCAAGACATGCCTTACCTGGAAAGT  50

seq1  CTCACTCAGCAGGACGAGAGACTCCCTTTAGCTCTATAGATGGACTCCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTCAGCAGGACGAGAGACTCCCTTTAGCTCTATAGATGGACTCCCA  100

seq1  TCTCTGTAGCTCTTCTCTGAGGCCGTACACAGAGATGCCAGGTGGTAGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGTAGCTCTTCTCTGAGGCCGTACACAGAGATGCCAGGTGGTAGGT  150

seq1  AGGGAGCTGCTGAATTC  167
      |||||||||||||||||
seq2  AGGGAGCTGCTGAATTC  167

seq1: chr15_95751225_95752194
seq2: B6Ng01-097H17.g_67_1034

seq1  GAATTCTTAGGGTCCCCGTGAGAAAGCTGGTGCATTTCCATGTTTAGAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAGGGTCCCCGTGAGAAAGCTGGTGCATTTCCATGTTTAGAAA  50

seq1  TGACTTTTTCTTAAATTAAGAGATGTATGATTGAAAACTCAAGTGGCTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTTTTCTTAAATTAAGAGATGTATGATTGAAAACTCAAGTGGCTTT  100

seq1  GTGGTTTTGTTGTCTTACTTGTACGAGCTTATCCCATATAATGTCGGAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTTTGTTGTCTTACTTGTACGAGCTTATCCCATATAATGTCGGAAG  150

seq1  GGGGAATAACGCAGTACCTCATAACCTGTTTGCGTTGGGTACTGGAATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAATAACGCAGTACCTCATAACCTGTTTGCGTTGGGTACTGGAATTT  200

seq1  AAATGCTAGCTGCATCTTAGATAGTGGTTCTCAACCTGTGGGTCGTGATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCTAGCTGCATCTTAGATAGTGGTTCTCAACCTGTGGGTCGTGATC  250

seq1  CCTTGGGGTTAAATGACCTTTGCACAGGGGTCATTTAAGACCATCAGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGGGTTAAATGACCTTTGCACAGGGGTCATTTAAGACCATCAGAAA  300

seq1  ACGTAGATATTTACATTATGATTCATAACTAGCAAAATTACAGTTATGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTAGATATTTACATTATGATTCATAACTAGCAAAATTACAGTTATGAG  350

seq1  GTAGCAACAAAAATGATTTTATGACTACACTTTTTATCACTACAACAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAACAAAAATGATTTTATGACTACACTTTTTATCACTACAACAAAT  400

seq1  GAGGAACTGTATTAAAGGGTTATAGTACAAGGGAAGTTGAGAACCACTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAACTGTATTAAAGGGTTATAGTACAAGGGAAGTTGAGAACCACTGA  450

seq1  TCTAAGGGGGGGTTGCTGGGTGCTGGGAACACTTGCTTTTGAGGTGCTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGGGGGGGTTGCTGGGTGCTGGGAACACTTGCTTTTGAGGTGCTCT  500

seq1  TGTTAATTGTATTATCATGCATCTGCTTTTGGTGTTCTCTGTTGTCTCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATTGTATTATCATGCATCTGCTTTTGGTGTTCTCTGTTGTCTCCT  550

seq1  GATGGACTGGCCTCTGTCCAGGTGTAATTGGGTAGATGGTGGCTCACGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGACTGGCCTCTGTCCAGGTGTAATTGGGTAGATGGTGGCTCACGGA  600

seq1  CTTCAGTGCTGAGGTGATGACATTTTTCAAGCCCTGAGCATGTGAGACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGTGCTGAGGTGATGACATTTTTCAAGCCCTGAGCATGTGAGACTG  650

seq1  GCTCTGAGGCTGGATGGTTGTCGGCCTGATATAGAGAAACATTGCCTGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGAGGCTGGATGGTTGTCGGCCTGATATAGAGAAACATTGCCTGTT  700

seq1  CCACTGACAGGCCACAGAACCCGTGTGCCCAAGA-TGGCTGTTGGAAGTC  749
      ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||
seq2  CCACTGACAGGCCACAGAACCCGTGTTGCCTAGATTGGCTGTTGGAAGTC  750

seq1  TTGTCTCTTTATGCGAAAAAGAATCTGCAACTGAGGTCTGAACTCTGCTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTCTTTATGCGAAAAAGAATCTGCAACTGAGGTCTGAACTCTGCTG  800

seq1  CCTGCTCCCTCCA-TTTGTCTTCTGCTTCTTCGTTGGGCTAATGTTGGGC  848
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
seq2  CCTGCTCCCTCCATTTTGTCTTCTGCTTCTTCGTT-GGCT-ATGTTGGGC  848

seq1  TAACTCCTACTTGGCATCCCAGAATAGATCTTCAGAATGACAGGGCTTCA  898
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TAACTCCTACTTGGCATCCCAGAATAGATCTTCATAATGACAGGGCTTCA  898

seq1  CTTTTGTAGTGTCCATTTGTGTATGCATATCTGTATGCACTGGATGGTGA  948
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGTAGTGTCCATTTGTGTATGC-TATCTGTATGCACTGGATGGTGA  947

seq1  CGATGGTGGTGGTGGTGGTGGT  970
      |||||||||||||||| |||||
seq2  CGATGGTGGTGGTGGT-GTGGT  968