BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-104G19
Chromosome15 (Build37)
Map Location 55,354,375 - 55,491,191
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMrpl13, Mtbp, Sntb1
Upstream geneMal2, Nov, LOC665302, LOC100039816, Enpp2, LOC100039911, LOC100039822, Taf2, 2600005O03Rik, Depdc6, Col14a1
Downstream geneLOC665348, LOC100039908, Hba-ps3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-104G19.bB6Ng01-104G19.g
ACCDH912729DH912730
length1,089971
definitionDH912729|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104G19, 5' end.DH912730|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104G19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(55,354,375 - 55,355,462)(55,490,220 - 55,491,191)
sequence
gaattcagacttatgagaagtgatgcggagacagaaaacgcgctgggata
gaagtgaggggggtgaggtagggacgactgcaaatgcttctaattgggtg
cacatagaatgcctctgaccaatcagtggagagatggagctaagcagaat
gctggaggagagtagaacaccctgagttcagtgcgctctttcaggagttg
cttgtcatgtgagaggagtcttcttgataagagagggaatggaagaggga
acaagataagccgggagaccaatgcaagcacttaatgacttagattttaa
atctaatttcacaggactcaatgaagacattataaaaagaggaaactcca
tagtctagtgtattttaagtttacatagggcaaataaaggcctaccacaa
gaaagttgatgcattgtcaagttgggctaggcacaaaaaaattagcaact
gaacacagagtgacagttcaaatctaggtgttctgccagagatagatgtt
cttagcctactaatgtgttttgtgtggctgatgaattttaatggcaaagg
agagccgagtggggacttggactgatgaacgattctttcttgctctctca
ctcagggcatctgcctggtatatctggatctagaattctgctctgcttca
atattagatatttctagtctcaacatgcacatctgtggttgttgtggcag
tagaaaatgacatttagactcctttctgagcttgtgtcagaagccacaca
cactgtttccattcatgtgttacagacttaagacaattaggtgacttttg
tttctttcaatgatggggagaagtgcaactatttgcccacaagcagaaga
gacccaggttggttggcaaggtgcgctaaagctgccacttcagctgtcac
tcatctcagccttatggagacacaaagccagttcacaagcatcttgattt
tcccaatgaagatgtagaagtgcagagaaactagctaacttacttcagga
cctacagataggaatttaagtccaggcattctggcagaagatatgatgcc
cttctaactttgttgaagggctactgtggaatatgtggg
gaattccagtttacaaggcacttccgatttacaagagcaactcaggacat
ctacaaacatgctgtaattttagctactttctcccctctagtttttatga
gtccctgggaaaacctagtttgcttagctgaagtttgtttgagattgcca
aatattttttttgaaaggtccgcttacccacatgaagtcagaatgttatg
gatatcataattgttggtggtggtagtattgccctcattgctaagtcatg
tgagtctacagagagtgaggattaaggtcacaatatttctagagttttag
agacgttttaatgaagaaattctgcttgcccagtcccagtggttgatgac
cgttctgaaactcaaagcttgcagagatgctacatgcatcttgcactgac
ttgaaggcctgaggagggcaggcagcagaggaaatgatgagtgtgcactt
ctctattttcatgccacctggcagccaggaacatggaacttttgatacct
agcgtgctggtgccttaggaaggaacctggtttctaaccgctaaaagtag
tcaaagcctcaggccaaccttccaaattttagactctctcgcccctggag
aatatgcccaatcaccaattgcacttgttaaatgttaaattagaagcaga
ctatggtgtttatactcagcccagaaggcattcgctttttgggaatttgg
gcctattccccaggcctgccctagggatcatgaaaactttctaggctcta
ggacagaggttgtactcagacaaatcatcatgtgaggtgtgtctcctccc
tgctgccattctatctcagcctggcactctctctttggttgctagctcct
gcccacctgcctactaaactatgagctcttcaggcaatcagaggtctatt
atttagctcaggttagcctccaactcctgatcccagctttgaaggtgcta
gttgcctttgtctttagacaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_55354375_55355462
seq2: B6Ng01-104G19.b_42_1130

seq1  GAATTCAGACTTATGAGAAGTGATGCGGAGACAGAAAACGCGCTGGGATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGACTTATGAGAAGTGATGCGGAGACAGAAAACGCGCTGGGATA  50

seq1  GAAGTGAGGGGGGTGAGGTAGGGACGACTGCAAATGCTTCTAATTGGGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGAGGGGGGTGAGGTAGGGACGACTGCAAATGCTTCTAATTGGGTG  100

seq1  CACATAGAATGCCTCTGACCAATCAGTGGAGAGATGGAGCTAAGCAGAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAGAATGCCTCTGACCAATCAGTGGAGAGATGGAGCTAAGCAGAAT  150

seq1  GCTGGAGGAGAGTAGAACACCCTGAGTTCAGTGCGCTCTTTCAGGAGTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAGGAGAGTAGAACACCCTGAGTTCAGTGCGCTCTTTCAGGAGTTG  200

seq1  CTTGTCATGTGAGAGGAGTCTTCTTGATAAGAGAGGGAATGGAAGAGGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCATGTGAGAGGAGTCTTCTTGATAAGAGAGGGAATGGAAGAGGGA  250

seq1  ACAAGATAAGCCGGGAGACCAATGCAAGCACTTAATGACTTAGATTTTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGATAAGCCGGGAGACCAATGCAAGCACTTAATGACTTAGATTTTAA  300

seq1  ATCTAATTTCACAGGACTCAATGAAGACATTATAAAAAGAGGAAACTCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAATTTCACAGGACTCAATGAAGACATTATAAAAAGAGGAAACTCCA  350

seq1  TAGTCTAGTGTATTTTAAGTTTACATAGGGCAAATAAAGGCCTACCACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTAGTGTATTTTAAGTTTACATAGGGCAAATAAAGGCCTACCACAA  400

seq1  GAAAGTTGATGCATTGTCAAGTTGGGCTAGGCACAAAAAAATTAGCAACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTTGATGCATTGTCAAGTTGGGCTAGGCACAAAAAAATTAGCAACT  450

seq1  GAACACAGAGTGACAGTTCAAATCTAGGTGTTCTGCCAGAGATAGATGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACACAGAGTGACAGTTCAAATCTAGGTGTTCTGCCAGAGATAGATGTT  500

seq1  CTTAGCCTACTAATGTGTTTTGTGTGGCTGATGAATTTTAATGGCAAAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCCTACTAATGTGTTTTGTGTGGCTGATGAATTTTAATGGCAAAGG  550

seq1  AGAGCCGAGTGGGGACTTGGACTGATGAACGATTCTTTCTTGCTCTCTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCGAGTGGGGACTTGGACTGATGAACGATTCTTTCTTGCTCTCTCA  600

seq1  CTCAGGGCATCTGCCTGGTATATCTGGATCTAGAATTCTGCTCTGCTTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGGCATCTGCCTGGTATATCTGGATCTAGAATTCTGCTCTGCTTCA  650

seq1  ATATTAGATATTTCTAGTCTCAACATGCACATCTGTGGTTGTTGTGGCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTAGATATTTCTAGTCTCAACATGCACATCTGTGGTTGTTGTGGCAG  700

seq1  TAGAAAATGACATTTAGACTCCTTTCTGAGCTTGTGTCAGAAGCCACACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAATGACATTTAGACTCCTTTCTGAGCTTGTGTCAGAAGCCACACA  750

seq1  CACTGTTTCCATTCATGTGTTACAGACTTAAGACAATTAGGTGACTTTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTTTCCATTCATGTGTTACAGACTTAAGACAATTAGGTGACTTTTG  800

seq1  TTTCTTTCAATGATGGGGAGAAGTGCAACTATTTGCCCACAAAGCAGAAG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTTCTTTCAATGATGGGGAGAAGTGCAACTATTTGCCCAC-AAGCAGAAG  849

seq1  AGACCCAGGTTGGTTGGCAAGGTGCGCTAAAAGCTGCCACTTCAGCTGTC  900
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCAGGTTGGTTGGCAAGGTGCGCT-AAAGCTGCCACTTCAGCTGTC  898

seq1  ACTCATCTCAGCCTTATGGAGACACAAAAGCCAGTTCACAAGCATCTTGA  950
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATCTCAGCCTTATGGAGACAC-AAAGCCAGTTCACAAGCATCTTGA  947

seq1  TTTTCCCAATGAAGATGTAGAAGTGCAGAGAAACTAGCTAACTTACTTCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCCAATGAAGATGTAGAAGTGCAGAGAAACTAGCTAACTTACTTCA  997

seq1  AGACCTACAGATA-GAATTTAAGTCCAGGCATTCTGGCAGAAGATATGAT  1049
       |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCTACAGATAGGAATTTAAGTCCAGGCATTCTGGCAGAAGATATGAT  1047

seq1  GCCCTTCTAAC-TTGTAGA--GGCTACTTGTGG-ATATGTGGG  1088
      ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| |||||||||
seq2  GCCCTTCTAACTTTGTTGAAGGGCTAC-TGTGGAATATGTGGG  1089

seq1: chr15_55490220_55491191
seq2: B6Ng01-104G19.g_66_1036 (reverse)

seq1  TTGTCTAATGACAAAGGCAACTAGCACCTTCAAAGCTGGGATCAGGAGTT  50
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTAAAGACAAAGGCAACTAGCACCTTCAAAGCTGGGATCAGGAGTT  50

seq1  GGAGGCTAACCTGAGCTAAATAATAGATCCTCTGATTGCCTGAAGAGCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCTAACCTGAGCTAAATAATAGA-CCTCTGATTGCCTGAAGAGCTC  99

seq1  ATAGTTTAGTAGGCAGGTGGGCAGGAGCTAGCAACCAAAGAGAGAGTGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTTAGTAGGCAGGTGGGCAGGAGCTAGCAACCAAAGAGAGAGTGCC  149

seq1  AGGCTGAGATAGAATGGCAGCAGGGAGGAGACACACCTCACATGATGATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGAGATAGAATGGCAGCAGGGAGGAGACACACCTCACATGATGATT  199

seq1  TGTCTGAGTACAACCTCTGTCCTAGAGCCTAGAAAGTTTTCATGATCCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGAGTACAACCTCTGTCCTAGAGCCTAGAAAGTTTTCATGATCCCT  249

seq1  AGGGCAGGCCTGGGGAATAGGCCCAAATTCCCAAAAAGCGAATGCCTTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCAGGCCTGGGGAATAGGCCCAAATTCCCAAAAAGCGAATGCCTTCT  299

seq1  GGGCTGAGTATAAACACCATAGTCTGCTTCTAATTTAACATTTAACAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGAGTATAAACACCATAGTCTGCTTCTAATTTAACATTTAACAAGT  349

seq1  GCAATTGGTGATTGGGCATATTCTCCAGGGGCGAGAGAGTCTAAAATTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTGGTGATTGGGCATATTCTCCAGGGGCGAGAGAGTCTAAAATTTG  399

seq1  GAAGGTTGGCCTGAGGCTTTGACTACTTTTAGCGGTTAGAAACCAGGTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTTGGCCTGAGGCTTTGACTACTTTTAGCGGTTAGAAACCAGGTTC  449

seq1  CTTCCTAAGGCACCAGCACGCTAGGTATCAAAAGTTCCATGTTCCTGGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTAAGGCACCAGCACGCTAGGTATCAAAAGTTCCATGTTCCTGGCT  499

seq1  GCCAGGTGGCATGAAAATAGAGAAGTGCACACTCATCATTTCCTCTGCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGGTGGCATGAAAATAGAGAAGTGCACACTCATCATTTCCTCTGCTG  549

seq1  CCTGCCCTCCTCAGGCCTTCAAGTCAGTGCAAGATGCATGTAGCATCTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCCTCCTCAGGCCTTCAAGTCAGTGCAAGATGCATGTAGCATCTCT  599

seq1  GCAAGCTTTGAGTTTCAGAACGGTCATCAACCACTGGGACTGGGCAAGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCTTTGAGTTTCAGAACGGTCATCAACCACTGGGACTGGGCAAGCA  649

seq1  GAATTTCTTCATTAAAACGTCTCTAAAACTCTAGAAATATTGTGACCTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTCTTCATTAAAACGTCTCTAAAACTCTAGAAATATTGTGACCTTA  699

seq1  ATCCTCACTCTCTGTAGACTCACATGACTTAGCAATGAGGGCAATACTAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTCACTCTCTGTAGACTCACATGACTTAGCAATGAGGGCAATACTAC  749

seq1  CACCACCAACAATTATGATATCCATAACATTCTGACTTCATGTGGGTAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACCAACAATTATGATATCCATAACATTCTGACTTCATGTGGGTAAG  799

seq1  CGGACCTTTCAAAAAAAATATTTGGCAATCTCAAACAAACTTCAGCTAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGACCTTTCAAAAAAAATATTTGGCAATCTCAAACAAACTTCAGCTAAG  849

seq1  CAAACTAGGTTTTCCCAGGGACTCATAAAAACTAGAGGGGAGAAAGTAGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTAGGTTTTCCCAGGGACTCATAAAAACTAGAGGGGAGAAAGTAGC  899

seq1  TAAAATTACAGCATGTTTGTAGATGTCCTGAGTTGCTCTTGTAAATCGGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTACAGCATGTTTGTAGATGTCCTGAGTTGCTCTTGTAAATCGGA  949

seq1  AGTGCCTTGTAAACTGGAATTC  972
      ||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCTTGTAAACTGGAATTC  971