BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-108C05
Chromosome15 (Build37)
Map Location 64,697,745 - 64,885,462
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdcy8, LOC268812
Upstream gene9930109F21Rik, LOC665769, 9030605I04Rik, 4933426G20Rik, 0910001A06Rik, Ddef1
Downstream geneLOC100040790, LOC665836, C920006C10Rik, Oc90, F930104E18Rik, LOC100040835, Kcnq3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-108C05.bB6Ng01-108C05.g
ACCDH915401DH915402
length1,1641,084
definitionDH915401|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-108C05, 5' end.DH915402|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-108C05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,884,278 - 64,885,462)(64,697,745 - 64,698,839)
sequence
gaattcttataaccctaagccttttgtgagccttgcaattattacaaaca
aattctttgaaagtctccaggatggaacatacactgtttgatgagtttgt
acaggtatcatatttcaagttaaacaactctgacttacaaagggaagtaa
gaccagagacagagcctcaagaaagttaaattccacactgtggacaccat
catgaacccaaactgctagcttaactcctctctgtcttggctgacttaga
gctgaggttattgacatttgaaaataggaaacttttcagggtatcctgaa
ctgagttgaacctagggatttgcacagtataggctacatgctaagcaata
ctacctctgtgccacagccccaaccctaaatacaaagtctcacagcattc
gccagtaacctggatgaatacatgtatcaaataatctctacaggatttta
gatttgagtccagctatacttagagaaaaatgaaataagttagtagaaaa
tcctgaaatctgttatggagcagcaatgataggctagagtatatattgac
atctctttgtccaggttgtcattcatcaagatgtagtcacttttaggctt
atatcacaacattggagaatcatagaaacaagtggatactcctgatgtga
ctgatagtctatataaatgctaggcctttaaacacttctgagcaccaata
ttgacaaatcccacaatttgaatatgacagttatgttttaaaagttaaat
gcaattaactttatcaagttaaagttaccaaaacctttattctacctaaa
attaacatgaatattgtcttagtcagggtttcttttcttgcacaaacatc
atgaccgagaagcaagttggggaggaaaggggtttattcagcttacactt
ccatattgctgctcatcaccaaggaagtcagactgtaactcaagcatgtc
agaagcaggagctgatgcagaggccatggagggatgttctttattggctt
gcctcccctagcttgtcagctgctctctatagagccagattaccagccag
agaaggacctccccactctttccctccccccccccctctgatcctaatga
gaaatgcttacgctgatctcatggggaccttttcccactgaagctccttt
cctgttactctagc
gaattctctgataattgtatacattctttgaattgaacatgctgagaaat
gactggttcaaaatcctcacaggattgtatttttcctattgttgtcattt
cagaaatcactttgtttcagttatgaactattcccactgtacatattaaa
aatgtacatattaaaaatgtaaggcatccatacttatctaagttttctgc
ccttgaaaataagcaggcttttctaatatccttttttctttttatataca
tttttctcgaaatataattatgttattttctcctttttttccctctattt
agctatctatcctatctctttccaaaccctccaggccctctcactctcag
actcaaattattacttattacacacacacacacacacacacacacacaca
tgtacaggttagttttatgtcaacttaacacaagctagagtcactgcaat
ggagtgaatttcacttgtgaaagtgcttctataagatcagactgaaagag
actttcttaagtagtgattgatgatagatggtccagcccattgtgggtgc
tgctatccttatattggtggtcctgggttccataagaaatcaggttgaag
gatcaatggggagcaagcaggtaatcatggtctctgaattagctcctgct
tccaggtttctgtcctggctttcttcattgatggactacaaagtggaagt
ggaagtcaaataaaccctccccatccccaacttgcttttggttttggtgt
tgcaccacaacaataaaatccctgactaagaaaatatgtatgggcaaata
tacaaatacagtcttctgacgctgctttatttttgttgttgttatttctg
tatatatggtttcagggctgagcactttgtactaaataaccataagggtt
catccctgggagatgatacttcttcctctctagcagtcattagttgccga
tagttcttatccatatgtgggaggccccatggaaatttccccttccacat
agcatgtccactagcatgtccactgaaatgctattattccaggcttgata
gtcagtgatggaagtaacagtattccactgaaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_64884278_64885462
seq2: B6Ng01-108C05.b_47_1210 (reverse)

seq1  GCTAGAGTTATCACAGAAAAAGGAGCTTCAGTTGGGGAAATGTCTCCATG  50
      |||||||   | ||||  ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||
seq2  GCTAGAG---TAACAG-GAAAGGAGCTTCAG-TGGGAAAAGGTCCCCATG  45

seq1  AGATCCAACCGTAAGGCATTTTCTCAATTAGTGATCACGAGGGGTGGGGG  100
      |||||  | ||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||||
seq2  AGATC--AGCGTAA-GCA-TTTCTC-ATTAG-GATCA-GAGGGGGGGGGG  88

seq1  GGGGGGAAGAGTGGGGAGGTCCCCTTCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGCTCT  150
      | ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||
seq2  GAGGGAAAGAGTGGGGAGGT--CCTTCTCT-GGCTGGTAATC-TGGCTCT  134

seq1  ATAAGAGAGCAGGCTGAACAAGCTAGGGGAGGCAAGCCAATAAAGAACAT  200
      || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AT-AGAGAGCA-GCTG-ACAAGCTAGGGGAGGCAAGCCAATAAAGAACAT  181

seq1  CCCTCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTTCCTGACCTGCTTGAGTTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
seq2  CCCTCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTT-CTGACATGCTTGAGTTAC  230

seq1  AGTCCTGACTTCCTTGGTGATGAGCAGCAATATGGAAGTGTAAGCTGAAT  300
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGT-CTGACTTCCTTGGTGATGAGCAGCAATATGGAAGTGTAAGCTGAAT  279

seq1  AAACCCCTTTCCTCCCCAACTTGCTTCTCGGTCATGATGTTTGTGCAAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCCTTTCCTCCCCAACTTGCTTCTCGGTCATGATGTTTGTGCAAGA  329

seq1  AAAGAAACCCTGACTAAGACAATATTCATGTTAATTTTAGGTAGAATAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAACCCTGACTAAGACAATATTCATGTTAATTTTAGGTAGAATAAA  379

seq1  GGTTTTGGTAACTTTAACTTGATAAAGTTAATTGCATTTAACTTTTAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTGGTAACTTTAACTTGATAAAGTTAATTGCATTTAACTTTTAAAA  429

seq1  CATAACTGTCATATTCAAATTGTGGGATTTGTCAATATTGGTGCTCAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACTGTCATATTCAAATTGTGGGATTTGTCAATATTGGTGCTCAGAA  479

seq1  GTGTTTAAAGGCCTAGCATTTATATAGACTATCAGTCACATCAGGAGTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTAAAGGCCTAGCATTTATATAGACTATCAGTCACATCAGGAGTAT  529

seq1  CCACTTGTTTCTATGATTCTCCAATGTTGTGATATAAGCCTAAAAGTGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTGTTTCTATGATTCTCCAATGTTGTGATATAAGCCTAAAAGTGAC  579

seq1  TACATCTTGATGAATGACAACCTGGACAAAGAGATGTCAATATATACTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCTTGATGAATGACAACCTGGACAAAGAGATGTCAATATATACTCT  629

seq1  AGCCTATCATTGCTGCTCCATAACAGATTTCAGGATTTTCTACTAACTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTATCATTGCTGCTCCATAACAGATTTCAGGATTTTCTACTAACTTA  679

seq1  TTTCATTTTTCTCTAAGTATAGCTGGACTCAAATCTAAAATCCTGTAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTTTTCTCTAAGTATAGCTGGACTCAAATCTAAAATCCTGTAGAG  729

seq1  ATTATTTGATACATGTATTCATCCAGGTTACTGGCGAATGCTGTGAGACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTTGATACATGTATTCATCCAGGTTACTGGCGAATGCTGTGAGACT  779

seq1  TTGTATTTAGGGTTGGGGCTGTGGCACAGAGGTAGTATTGCTTAGCATGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATTTAGGGTTGGGGCTGTGGCACAGAGGTAGTATTGCTTAGCATGT  829

seq1  AGCCTATACTGTGCAAATCCCTAGGTTCAACTCAGTTCAGGATACCCTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTATACTGTGCAAATCCCTAGGTTCAACTCAGTTCAGGATACCCTGA  879

seq1  AAAGTTTCCTATTTTCAAATGTCAATAACCTCAGCTCTAAGTCAGCCAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTTCCTATTTTCAAATGTCAATAACCTCAGCTCTAAGTCAGCCAAG  929

seq1  ACAGAGAGGAGTTAAGCTAGCAGTTTGGGTTCATGATGGTGTCCACAGTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGAGGAGTTAAGCTAGCAGTTTGGGTTCATGATGGTGTCCACAGTG  979

seq1  TGGAATTTAACTTTCTTGAGGCTCTGTCTCTGGTCTTACTTCCCTTTGTA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATTTAACTTTCTTGAGGCTCTGTCTCTGGTCTTACTTCCCTTTGTA  1029

seq1  AGTCAGAGTTGTTTAACTTGAAATATGATACCTGTACAAACTCATCAAAC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGAGTTGTTTAACTTGAAATATGATACCTGTACAAACTCATCAAAC  1079

seq1  AGTGTATGTTCCATCCTGGAGACTTTCAAAGAATTTGTTTGTAATAATTG  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTATGTTCCATCCTGGAGACTTTCAAAGAATTTGTTTGTAATAATTG  1129

seq1  CAAGGCTCACAAAAGGCTTAGGGTTATAAGAATTC  1185
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGCTCACAAAAGGCTTAGGGTTATAAGAATTC  1164

seq1: chr15_64697745_64698839
seq2: B6Ng01-108C05.g_67_1150

seq1  GAATTCTCTGATAATTGTATACATTCTTTGAATTGAACATGCTGAGAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGATAATTGTATACATTCTTTGAATTGAACATGCTGAGAAAT  50

seq1  GACTGGTTCAAAATCCTCACAGGATTGTATTTTTCCTATTGTTGTCATTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGTTCAAAATCCTCACAGGATTGTATTTTTCCTATTGTTGTCATTT  100

seq1  CAGAAATCACTTTGTTTCAGTTATGAACTATTCCCACTGTACATATTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAATCACTTTGTTTCAGTTATGAACTATTCCCACTGTACATATTAAA  150

seq1  AATGTACATATTAAAAATGTAAGGCATCCATACTTATCTAAGTTTTCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTACATATTAAAAATGTAAGGCATCCATACTTATCTAAGTTTTCTGC  200

seq1  CCTTGAAAATAAGCAGGCTTTTCTAATATCCTTTTTTCTTTTTATATACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAAAATAAGCAGGCTTTTCTAATATCCTTTTTTCTTTTTATATACA  250

seq1  TTTTTCTCGAAATATAATTATGTTATTTTCTCCTTTTTTTCCCTCTATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTCGAAATATAATTATGTTATTTTCTCCTTTTTTTCCCTCTATTT  300

seq1  AGCTATCTATCCTATCTCTTTCCAAACCCTCCAGGCCCTCTCACTCTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATCTATCCTATCTCTTTCCAAACCCTCCAGGCCCTCTCACTCTCAG  350

seq1  ACTCAAATTATTACTTATTACACACACACACACACACACACACACACACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAATTATTACTTATTACACACACACACACACACACACACACACACA  400

seq1  TGTACAGGTTAGTTTTATGTCAACTTAACACAAGCTAGAGTCACTGCAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACAGGTTAGTTTTATGTCAACTTAACACAAGCTAGAGTCACTGCAAT  450

seq1  GGAGTGAATTTCACTTGTGAAAGTGCTTCTATAAGATCAGACTGAAAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGAATTTCACTTGTGAAAGTGCTTCTATAAGATCAGACTGAAAGAG  500

seq1  ACTTTCTTAAGTAGTGATTGATGATAGATGGTCCAGCCCATTGTGGGTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCTTAAGTAGTGATTGATGATAGATGGTCCAGCCCATTGTGGGTGC  550

seq1  TGCTATCCTTATATTGGTGGTCCTGGGTTCCATAAGAAATCAGGTTGAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATCCTTATATTGGTGGTCCTGGGTTCCATAAGAAATCAGGTTGAAG  600

seq1  GATCAATGGGGAGCAAGCAGGTAATCATGGTCTCTGAATTAGCTCCTGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAATGGGGAGCAAGCAGGTAATCATGGTCTCTGAATTAGCTCCTGCT  650

seq1  TCCAGGTTTCTGTCCTGGCTTTCTTCATTGATGGACTACAAAGTGGAAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGTTTCTGTCCTGGCTTTCTTCATTGATGGACTACAAAGTGGAAGT  700

seq1  GGAAGTCAAATAAACCCTCCCCATCCCCAACTTGCTTTTGGTTTTGGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTCAAATAAACCCTCCCCATCCCCAACTTGCTTTTGGTTTTGGTGT  750

seq1  TGCACCACAACAATAAAATCCCTGACTAAGAAAATATGTATGGGCAAATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACCACAACAATAAAATCCCTGACTAAGAAAATATGTATGGGCAAATA  800

seq1  TACAAATACAGTCTTCTGACGCTGCTTTATTTTTGTTGTTGTTATTTCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAATACAGTCTTCTGACGCTGCTTTATTTTTGTTGTTGTTATTTCTG  850

seq1  TATATATGGTTTCAGGGCTGAGCACTTTGTACTAAATAACCAATAAGGGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
seq2  TATATATGGTTTCAGGGCTGAGCACTTTGTACTAAATAACC-ATAA-GGG  898

seq1  TTCATCCCTGGGAGATGATACTTCTTCCTCTCCTAGCAGTCATTAGTTGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTCATCCCTGGGAGATGATACTTCTTCCTCT-CTAGCAGTCATTAGTTGC  947

seq1  CGATAGTTCTTATCCATATGTGGGAGGCCCCCATGGAAATTTCCCCTTCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CGATAGTTCTTATCCATATGTGGGAGG-CCCCATGGAAATTTCCCCTTCC  996

seq1  ACATTAGCATGTCCACTTAGCATGTCCACTGATATTGCTATTATTCCAGG  1050
      ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||
seq2  ACA-TAGCATGTCCAC-TAGCATGTCCACTGA-AATGCTATTATTCCAGG  1043

seq1  CTTGTATAGTTCAGTGAATGGAAAGTAACAGTATTCCACTGAAGA  1095
      |||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTTG-ATAG-TCAGTG-ATGG-AAGTAACAGTATTCCACTGAAGA  1084