BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-121L13
Chromosome15 (Build37)
Map Location 90,574,985 - 90,670,900
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG667682
Upstream geneLOC676575, Syt10, Alg10b, Cpne8, EG627342, LOC100042462, LOC100042471
Downstream geneTcea1-ps1, Spn-ps, Kif21a, EG635871, Abcd2, LOC545126, Slc2a13, Lrrk2, Muc19, Smgc
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-121L13.bB6Ng01-121L13.g
ACCDH925334DH925335
length1,1501,067
definitionDH925334|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121L13, 5' end.DH925335|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121L13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,669,735 - 90,670,900)(90,574,985 - 90,576,051)
sequence
gaattccacacattttaacaactatgttattctatttgtacttttaattt
taaaagcctttgatgtgtacatttgtttcgccactgcatctcatattgca
cttggtacctgtcttagtcagggtttttatgcatgcacaatcatcatggc
caagaagcaagttgaggaggaaagggtttattcagcttacacttccacat
tgctgttcatcaccaaaggaagtcaggacaggaactcacagagggcagga
acttggaggcaggagccaaggcagaggcatggagggtgctgcttactgga
ctgcttcccctgggctttcttttagaacccaggacccagcaggacccagt
atatatataatttcttacattgctcagggatggtaccacccacaatgggc
tggttcaccccccccccacctcaatccctaattgggaaaatgccttacat
ctggatctcatggaggtatttcctcaagggaggctcctttctctgtgata
actacagcttgtgtcaagttgacacacaagcccagccagtgcagtaagga
agccagatctcagagctcattctagccttctagtttccactgtaaaatgc
ccactagccatacactattgtgggtgcctttctagtcatcaacattaata
cgtcaccagtgcacatgggaacacatgcggttcctaactgcagtgatttc
tcagtggttccgtttgctgtagaactcatgatagtcatcagtctcagact
ttctctcaccccatttctcttattgaccgttttctctctgtcttgcggcc
gtccacattcctagtgtccgatgactccatcgggacatcaagtttacccc
tgtttcccagctcttaacatagtcccttcaaagtcaaattcacatttgtc
tctttcctgtttaagtttcttcacccgattaggaaggaagtgccagatac
tgtttcttttggcttggggaacagcaactgaggacagaattaatgaaacc
cttcacatacacagaacagaagcaaatgtgaggaagtgggatagagttga
ggaaaataagatcatagctgaagaatttgcttatggctcagtctgtctcg
acaagaacaactctaaccacagtaacagctaatatatgttggacgattag

gaattctcagcaactctgattacctacctaaggccttcaagcacttgaac
tcatcaacaccctatcatggaggaggaagagctcagaagacctcttttct
ctctgaggacctatagttaatggttcttgacagagggggaaacatgtctt
ttagtggtggagccactgacaaggctatgtagcctatgcttctgtaaaca
gcctctcagagaagtccccataagcaaccctaatgaaactcattgggtca
agacataagagcctgaaaatgaaggagggacaagttggaaagaagatgga
ggaatcagcaggagtgggagggaagaagaagtagtggagggagaacatga
ccaggacgcatgagatatacatgtgaaaatgccataatgcaatccattat
tctgtataattaccatatgttatttccaatgggtaactacccaaaccaga
gcctgtcatgatgaattcttgttctgaattattgtacagtttagagctgc
ttatgggaaattctagaacataaaacacaaggcaaaacaatgacaacgct
taacccctaggcaaaccaaataaggctatcttgggctgggacccagtcag
tgttcaacacatccctctgatcccaaggcgatgttggaaatgctagttgt
tttcttcctgtaactatctacatgtccttagtgaaacatgcacgtgtaaa
aatattcatgtatgtttttgcaacattgttcttatctaaccagtacattt
aactatctttcagtgaaatctataaatcaagaaaagacaaattaggcata
ttcactcaagaaatcgaattaacctccatctgtctcctccatgcagagca
catgttaggtcacgttacttactaatataaaatggctgagttagttcctc
accgggtttaatttatacttcagaagtctgatactggcactagctagcat
attaacaagtaaatcttagctgaactctacatcagcttactgaaacaacc
ggagtctgttgtagcgttgctacccagaactcttgggactgagccatttt
tgttcatttggtgatcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_90669735_90670900
seq2: B6Ng01-121L13.b_49_1198 (reverse)

seq1  CTAATCGTCAAACATATAATAGCCTGTTACTGTGTGTAAGAGTTGGTTCT  50
      ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||||
seq2  CTAATCGTCCAACATATATTAG-CTGTTACTGTG-GTTAGAGTT-GTTCT  47

seq1  TGTCGAGACAGACTTGGAG-CATAAGGCAAATTTCCTTCAGCTATGGATC  99
      ||||||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||||||||| ||||
seq2  TGTCGAGACAGACT--GAGCCATAA-GCAAATT--CTTCAGCTAT-GATC  91

seq1  TTATTTTCCTTCCAACTCTTAATCCCACTTTCCTCACATTTGCCTTCTGT  149
      ||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2  TTATTTTCCT--CAACTCT--ATCCCAC-TTCCTCACATTTG-CTTCTGT  135

seq1  TCTGTGTATGTGAAGGGTTTCATTAATTCTGTCCTCAGTTGCTGGTTCCC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TCTGTGTATGTGAAGGGTTTCATTAATTCTGTCCTCAGTTGCT-GTTCCC  184

seq1  CAAGCCAAAAGAAACAGTATCTGGCACTTCCTTCCTAATCGGGTGAAGAA  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CAAGCCAAAAGAAACAGTATCTGGCACTTCCTTCCTAATCGGGTGAAG-A  233

seq1  AACTTAAACAGGAAAGAGACAAATGTGAATTTGACTTTGAAGGGACTATG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAAACAGGAAAGAGACAAATGTGAATTTGACTTTGAAGGGACTATG  283

seq1  TTAAGAGCTGGGAAACAGGGGTAAACTTGATGTCCCGATGGAGTCATCGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAGCTGGGAAACAGGGGTAAACTTGATGTCCCGATGGAGTCATCGG  333

seq1  ACACTAGGAATGTGGACGGCCGCAAGACAGAGAGAAAACGGTCAATAAGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTAGGAATGTGGACGGCCGCAAGACAGAGAGAAAACGGTCAATAAGA  383

seq1  GAAATGGGGTGAGAGAAAGTCTGAGACTGATGACTATCATGAGTTCTACA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGGGGTGAGAGAAAGTCTGAGACTGATGACTATCATGAGTTCTACA  433

seq1  GCAAACGGAACCACTGAGAAATCACTGCAGTTAGGAACCGCATGTGTTCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACGGAACCACTGAGAAATCACTGCAGTTAGGAACCGCATGTGTTCC  483

seq1  CATGTGCACTGGTGACGTATTAATGTTGATGACTAGAAAGGCACCCACAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGCACTGGTGACGTATTAATGTTGATGACTAGAAAGGCACCCACAA  533

seq1  TAGTGTATGGCTAGTGGGCATTTTACAGTGGAAACTAGAAGGCTAGAATG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTATGGCTAGTGGGCATTTTACAGTGGAAACTAGAAGGCTAGAATG  583

seq1  AGCTCTGAGATCTGGCTTCCTTACTGCACTGGCTGGGCTTGTGTGTCAAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTGAGATCTGGCTTCCTTACTGCACTGGCTGGGCTTGTGTGTCAAC  633

seq1  TTGACACAAGCTGTAGTTATCACAGAGAAAGGAGCCTCCCTTGAGGAAAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACACAAGCTGTAGTTATCACAGAGAAAGGAGCCTCCCTTGAGGAAAT  683

seq1  ACCTCCATGAGATCCAGATGTAAGGCATTTTCCCAATTAGGGATTGAGGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCATGAGATCCAGATGTAAGGCATTTTCCCAATTAGGGATTGAGGT  733

seq1  GGGGGGGGGGTGAACCAGCCCATTGTGGGTGGTACCATCCCTGAGCAATG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGGGGGTGAACCAGCCCATTGTGGGTGGTACCATCCCTGAGCAATG  783

seq1  TAAGAAATTATATATATACTGGGTCCTGCTGGGTCCTGGGTTCTAAAAGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAATTATATATATACTGGGTCCTGCTGGGTCCTGGGTTCTAAAAGA  833

seq1  AAGCCCAGGGGAAGCAGTCCAGTAAGCAGCACCCTCCATGCCTCTGCCTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCCAGGGGAAGCAGTCCAGTAAGCAGCACCCTCCATGCCTCTGCCTT  883

seq1  GGCTCCTGCCTCCAAGTTCCTGCCCTCTGTGAGTTCCTGTCCTGACTTCC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCTGCCTCCAAGTTCCTGCCCTCTGTGAGTTCCTGTCCTGACTTCC  933

seq1  TTTGGTGATGAACAGCAATGTGGAAGTGTAAGCTGAATAAACCCTTTCCT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTGATGAACAGCAATGTGGAAGTGTAAGCTGAATAAACCCTTTCCT  983

seq1  CCTCAACTTGCTTCTTGGCCATGATGATTGTGCATGCATAAAAACCCTGA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAACTTGCTTCTTGGCCATGATGATTGTGCATGCATAAAAACCCTGA  1033

seq1  CTAAGACAGGTACCAAGTGCAATATGAGATGCAGTGGCGAAACAAATGTA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGACAGGTACCAAGTGCAATATGAGATGCAGTGGCGAAACAAATGTA  1083

seq1  CACATCAAAGGCTTTTAAAATTAAAAGTACAAATAGAATAACATAGTTGT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCAAAGGCTTTTAAAATTAAAAGTACAAATAGAATAACATAGTTGT  1133

seq1  TAAAATGTGTGGAATTC  1166
      |||||||||||||||||
seq2  TAAAATGTGTGGAATTC  1150

seq1: chr15_90574985_90576051
seq2: B6Ng01-121L13.g_65_1131

seq1  GAATTCTCAGCAACTCTGATTACCTACCTAAGGCCTTCAAGCACTTGAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGCAACTCTGATTACCTACCTAAGGCCTTCAAGCACTTGAAC  50

seq1  TCATCAACACCCTATCATGGAGGAGGAAGAGCTCAGAAGACCTCTTTTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCAACACCCTATCATGGAGGAGGAAGAGCTCAGAAGACCTCTTTTCT  100

seq1  CTCTGAGGACCTATAGTTAATGGTTCTTGACAGAGGGGGAAACATGTCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAGGACCTATAGTTAATGGTTCTTGACAGAGGGGGAAACATGTCTT  150

seq1  TTAGTGGTGGAGCCACTGACAAGGCTATGTAGCCTATGCTTCTGTAAACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGGTGGAGCCACTGACAAGGCTATGTAGCCTATGCTTCTGTAAACA  200

seq1  GCCTCTCAGAGAAGTCCCCATAAGCAACCCTAATGAAACTCATTGGGTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTCAGAGAAGTCCCCATAAGCAACCCTAATGAAACTCATTGGGTCA  250

seq1  AGACATAAGAGCCTGAAAATGAAGGAGGGACAAGTTGGAAAGAAGATGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATAAGAGCCTGAAAATGAAGGAGGGACAAGTTGGAAAGAAGATGGA  300

seq1  GGAATCAGCAGGAGTGGGAGGGAAGAAGAAGTAGTGGAGGGAGAACATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATCAGCAGGAGTGGGAGGGAAGAAGAAGTAGTGGAGGGAGAACATGA  350

seq1  CCAGGACGCATGAGATATACATGTGAAAATGCCATAATGCAATCCATTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACGCATGAGATATACATGTGAAAATGCCATAATGCAATCCATTAT  400

seq1  TCTGTATAATTACCATATGTTATTTCCAATGGGTAACTACCCAAACCAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTATAATTACCATATGTTATTTCCAATGGGTAACTACCCAAACCAGA  450

seq1  GCCTGTCATGATGAATTCTTGTTCTGAATTATTGTACAGTTTAGAGCTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTCATGATGAATTCTTGTTCTGAATTATTGTACAGTTTAGAGCTGC  500

seq1  TTATGGGAAATTCTAGAACATAAAACACAAGGCAAAACAATGACAACGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGGAAATTCTAGAACATAAAACACAAGGCAAAACAATGACAACGCT  550

seq1  TAACCCCTAGGCAAACCAAATAAGGCTATCTTGGGCTGGGACCCAGTCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCCTAGGCAAACCAAATAAGGCTATCTTGGGCTGGGACCCAGTCAG  600

seq1  TGTTCAACACATCCCTCTGATCCCAAGGCGATGTTGGAAATGCTAGTTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCAACACATCCCTCTGATCCCAAGGCGATGTTGGAAATGCTAGTTGT  650

seq1  TTTCTTCCTGTAACTATCTACATGTCCTTAGTGAAACATGCACGTGTAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCCTGTAACTATCTACATGTCCTTAGTGAAACATGCACGTGTAAA  700

seq1  AATATTCATGTATGTTTTTGCAACATTGTTCTTATCTAACCAGTACATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTCATGTATGTTTTTGCAACATTGTTCTTATCTAACCAGTACATTT  750

seq1  AACTATCTTTCAGTGAAATCTATAAATCAAGAAAAGACAAATTAGGCATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATCTTTCAGTGAAATCTATAAATCAAGAAAAGACAAATTAGGCATA  800

seq1  TTCACTCAAAGAAATCGAATTAACCTCCATCTGTCTCCTCCATGCAGAGC  850
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACTC-AAGAAATCGAATTAACCTCCATCTGTCTCCTCCATGCAGAGC  849

seq1  ACATGTTAGGTTCACGTTACTTAACTAATATAAAATGGCTGAGTTAGTTC  900
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTTAGG-TCACGTTACTT-ACTAATATAAAATGGCTGAGTTAGTTC  897

seq1  CTCACCGGGTTTTAATTTATACTTCAGAAGTCTGATACTGGCACTAGCTA  950
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCGGG-TTTAATTTATACTTCAGAAGTCTGATACTGGCACTAGCTA  946

seq1  GCATA-TAACAAGTAAATC-TAGCTTGAACTCTACATCAGCTTACTGAAA  998
      ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATTAACAAGTAAATCTTAGC-TGAACTCTACATCAGCTTACTGAAA  995

seq1  CAACC-GAGTCTGTTGTAGCCGTTGCTTACCCAGAACTC-TGGGACTGAG  1046
      ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||
seq2  CAACCGGAGTCTGTTGTAG-CGTTGC-TACCCAGAACTCTTGGGACTGAG  1043

seq1  -CATTTT--GTCATTTGGTGATCC  1067
       ||||||   ||||||||||||||
seq2  CCATTTTTGTTCATTTGGTGATCC  1067