BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-124N18
Chromosome15 (Build37)
Map Location 61,658,130 - 61,783,429
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene9930014A18Rik, A1bg, LOC100040323
Downstream geneMyc, Pvt1, LOC100040584, H2afy3, LOC100040430
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-124N18.bB6Ng01-124N18.g
ACCDH927656DH927657
length9451,090
definitionDH927656|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124N18, 5' end.DH927657|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124N18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,782,696 - 61,783,429)(61,658,130 - 61,659,251)
sequence
gaattcttaaaacttttattattttttttaattttaatttttattgttgt
tgtttacctccctgcttaaggaacttcccaacaggatggaatgttttaat
caaatctcaccgaagactgttacataacatcactacccgtgtacctctac
gtacatctgtgcacaccagggttatatagacatacatacacaaagagatg
ggacacagacagacagacacacagggacacatagatccacacagacagac
acataccgacagatacacatacatacatacatacatacatacaaacacat
acatacacacatagatagatacacagggacacatagacacacactgacac
acaccacagggacacatagacacacactgacacacaccacagggacacat
agacacacactgacacacacatatacatcagacacacattcaaacacata
catacacacatacatacatacatacatacatacatacacacacacacaca
cagagacacacacacagacatacgcagacacataaacacaaatacagata
gacacacacacatacacactcacttgacatgagtcaggtattgaggaatg
agggaagacaggagtccagagcagcagcagcagcagcagcagcaacatcg
caagcttgaggccatctccagactctttgagtccttgtctcaaaaatgca
aaaagaaagaaagaaaaaaaaaccaatcccaacaacagtattgtcatgag
agacacagaagtggatgctcacattcgtctataggatggaatacagggtc
cccaatggagcagctagagaaagtacccaaaggagctaaagggatctgca
accctataggtggaacaacaatatgaactaaccagtacccccagagctcg
tgtctctagctgcatatgtatcagagatggcatagtcggccttca
gaattccaatttctcaaaaagaaaattgaagtgttacatacaaataggtt
ggattgcacaccaagcagaccctccttgcagagtgagaagagcaaagcac
cattccatccaaactgagagagactctggctttctatgacatgcttaaaa
atattggcagagagcagacaactggtagcttaacttactggtgaggagtg
gcataaaattccaggatattaaagacaatgtggataaagaaagtaaaaga
ttagaaacatgttgatttcttaatagtgaaaagggagggccaataaatag
gtagcctttctttgtttactgttatgtttttaggtcttcttccccttcct
ttcctaggttctgcaaagcagatagtcatatattctggaactggagactc
tatatcagagttctgagacaggtctatagttctctgctttttcccttatg
gaaattgaattgttccctcccctacccccacatctggtaatgtctccagg
tcttctttcagagttgtacccattctgtgttgagagtgtttttgtgtaac
ttcaggagggagtgaaatcttcatgtaactggatatgactgctcattgta
aataagccatgcatagtcattcactgaatgatgtgctatgtaagctgcac
atgtgctacatcaatgacttggacatgataaagcaagaaagttgggctag
aggtgtatactatatgcagcatgtgtgtgtttgaagttttaacacaccac
agtatgaagaaaaatagaaagagaaaaaaaacataaacagaaaaccaaaa
acaaaatggcaaagaatgcagtagagagagtcaggcataggaaatgaaat
atattgcaagattagaaggcatggccatggatatataagtttaattcaag
cttgaaagaagtgcatagctgtgcagtatgggacatccaaggcagagaaa
acagtcagcagaaaccataacctagggcatattagaagtccacagctgga
gcagatgacaagtggaaacaggttaccctgttcacttcattctattttta
agacaggcaggctgatatagatggtcagccagtaatgctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_61782696_61783429
seq2: B6Ng01-124N18.b_51_784 (reverse)

seq1  TGTTGGGATTGGTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTTTGCATTTTTGAGACAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGGATTGGTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTTTGCATTTTTGAGACAA  50

seq1  GGACTCAAAGAGTCTGGAGATGGCCTCAAGCTTGCGATGTTGCTGCTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCAAAGAGTCTGGAGATGGCCTCAAGCTTGCGATGTTGCTGCTGCT  100

seq1  GCTGCTGCTGCTGCTCTGGACTCCTGTCTTCCCTCATTCCTCAATACCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTGCTGCTGCTCTGGACTCCTGTCTTCCCTCATTCCTCAATACCTG  150

seq1  ACTCATGTCAAGTGAGTGTGTATGTGTGTGTGTCTATCTGTATTTGTGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATGTCAAGTGAGTGTGTATGTGTGTGTGTCTATCTGTATTTGTGTT  200

seq1  TATGTGTCTGCGTATGTCTGTGTGTGTGTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTCTGCGTATGTCTGTGTGTGTGTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTA  250

seq1  TGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTGTATGTATGTGTTTGAATGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTGTATGTATGTGTTTGAATGTG  300

seq1  TGTCTGATGTATATGTGTGTGTCAGTGTGTGTCTATGTGTCCCTGTGGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGATGTATATGTGTGTGTCAGTGTGTGTCTATGTGTCCCTGTGGTG  350

seq1  TGTGTCAGTGTGTGTCTATGTGTCCCTGTGGTGTGTGTCAGTGTGTGTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCAGTGTGTGTCTATGTGTCCCTGTGGTGTGTGTCAGTGTGTGTCT  400

seq1  ATGTGTCCCTGTGTATCTATCTATGTGTGTATGTATGTGTTTGTATGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTCCCTGTGTATCTATCTATGTGTGTATGTATGTGTTTGTATGTAT  450

seq1  GTATGTATGTATGTATGTGTATCTGTCGGTATGTGTCTGTCTGTGTGGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTATGTATGTATGTGTATCTGTCGGTATGTGTCTGTCTGTGTGGAT  500

seq1  CTATGTGTCCCTGTGTGTCTGTCTGTCTGTGTCCCATCTCTTTGTGTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTGTCCCTGTGTGTCTGTCTGTCTGTGTCCCATCTCTTTGTGTATG  550

seq1  TATGTCTATATAACCCTGGTGTGCACAGATGTACGTAGAGGTACACGGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCTATATAACCCTGGTGTGCACAGATGTACGTAGAGGTACACGGGT  600

seq1  AGTGATGTTATGTAACAGTCTTCGGTGAGATTTGATTAAAACATTCCATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATGTTATGTAACAGTCTTCGGTGAGATTTGATTAAAACATTCCATC  650

seq1  CTGTTGGGAAGTTCCTTAAGCAGGGAGGTAAACAACAACAATAAAAATTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTGGGAAGTTCCTTAAGCAGGGAGGTAAACAACAACAATAAAAATTA  700

seq1  AAATTAAAAAAAATAATAAAAGTTTTAAGAATTC  734
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAAAAAAAATAATAAAAGTTTTAAGAATTC  734

seq1: chr15_61658130_61659251
seq2: B6Ng01-124N18.g_69_1158

seq1  GAATTCCAATTTCTCAAAAAGAAAATTGAAGTGTTACATACAAATAGGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAATTTCTCAAAAAGAAAATTGAAGTGTTACATACAAATAGGTT  50

seq1  GGATTGCACACCAAGCAGACCCTCCTTGCAGAGTGAGAAGAGCAAAGCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTGCACACCAAGCAGACCCTCCTTGCAGAGTGAGAAGAGCAAAGCAC  100

seq1  CATTCCATCCAAACTGAGAGAGACTCTGGCTTTCTATGACATGCTTAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCATCCAAACTGAGAGAGACTCTGGCTTTCTATGACATGCTTAAAA  150

seq1  ATATTGGCAGAGAGCAGACAACTGGTAGCTTAACTTACTGGTGAGGAGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGGCAGAGAGCAGACAACTGGTAGCTTAACTTACTGGTGAGGAGTG  200

seq1  GCATAAAATTCCAGGATATTAAAGACAATGTGGATAAAGAAAGTAAAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAAAATTCCAGGATATTAAAGACAATGTGGATAAAGAAAGTAAAAGA  250

seq1  TTAGAAACATGTTGATTTCTTAATAGTGAAAAGGGAGGGCCAATAAATAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAAACATGTTGATTTCTTAATAGTGAAAAGGGAGGGCCAATAAATAG  300

seq1  GTAGCCTTTCTTTGTTTACTGTTATGTTTTTAGGTCTTCTTCCCCTTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCCTTTCTTTGTTTACTGTTATGTTTTTAGGTCTTCTTCCCCTTCCT  350

seq1  TTCCTAGGTTCTGCAAAGCAGATAGTCATATATTCTGGAACTGGAGACTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTAGGTTCTGCAAAGCAGATAGTCATATATTCTGGAACTGGAGACTC  400

seq1  TATATCAGAGTTCTGAGACAGGTCTATAGTTCTCTGCTTTTTCCCTTATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCAGAGTTCTGAGACAGGTCTATAGTTCTCTGCTTTTTCCCTTATG  450

seq1  GAAATTGAATTGTTCCCTCCCCTACCCCCACATCTGGTAATGTCTCCAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTGAATTGTTCCCTCCCCTACCCCCACATCTGGTAATGTCTCCAGG  500

seq1  TCTTCTTTCAGAGTTGTACCCATTCTGTGTTGAGAGTGTTTTTGTGTAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTTCAGAGTTGTACCCATTCTGTGTTGAGAGTGTTTTTGTGTAAC  550

seq1  TTCAGGAGGGAGTGAAATCTTCATGTAACTGGATATGACTGCTCATTGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGAGGGAGTGAAATCTTCATGTAACTGGATATGACTGCTCATTGTA  600

seq1  AATAAGCCATGCATAGTCATTCACTGAATGATGTGCTATGTAAGCTGCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGCCATGCATAGTCATTCACTGAATGATGTGCTATGTAAGCTGCAC  650

seq1  ATGTGCTACATCAATGACTTGGACATGATAAAGCAAGAAAGTTGGGCTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCTACATCAATGACTTGGACATGATAAAGCAAGAAAGTTGGGCTAG  700

seq1  AGGTGTATACTATATGCAGCATGTGTGTG-TTGAAGTTTTAACACACCAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTATACTATATGCAGCATGTGTGTGTTTGAAGTTTTAACACACCAC  750

seq1  AGTATGAAGAAAAATAGAAAGAGAAAAAAAACAATAAAACAGAAAAACAA  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||
seq2  AGTATGAAGAAAAATAGAAAGAGAAAAAAAACA--TAAACAGAAAACCAA  798

seq1  AAAACAAAAATGGCAAAAGAATGCAGTAGAGAGAGTCAGGCATAGGAAAT  849
      |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAA--CAAAATGGC-AAAGAATGCAGTAGAGAGAGTCAGGCATAGGAAAT  845

seq1  GAAATATATTGCAAGATTAGAAGGGGCATGGCCAATGGATAATATAAGGT  899
      ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||
seq2  GAAATATATTGCAAGATTAGAA--GGCATGGCC-ATGGAT-ATATAA-GT  890

seq1  TTAACTCAAGCTTGAAAGAGAAGGCATTAGCTGTGCAGTTATGGGACCAT  949
      |||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| |||
seq2  TTAATTCAAGCTTGAAAGA-AGTGCA-TAGCTGTGCAG-TATGGGA-CAT  936

seq1  CCAAGGCAGAGAAAACAGTCAGCAGAAAACCCATAAGCTAGGGCATATTA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| 
seq2  CCAAGGCAGAGAAAACAGTCAGCAGAAA--CCATAACCTAGGGCATATT-  983

seq1  AGAAGGTCACACAGCTGGAGCAGATGGACAAGGTGGGAAACAGGGGTTAC  1049
      |||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||  ||||||
seq2  AGAA-GTC-CACAGCTGGAGCAGAT-GACAAG--TGGAAACA--GGTTAC  1026

seq1  ACCTG-TCACTTTCCATTCTATTTTTATAAGACAGGCAAGGGCTGAT-GA  1097
       |||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||  |||||||  |
seq2  -CCTGTTCACTT--CATTCTATTTT--TAAGACAGGCA--GGCTGATATA  1069

seq1  GATGGGTCAGCAGGTAAAAATGCTT  1122
      ||| |||||||  ||   |||||||
seq2  GAT-GGTCAGCCAGT---AATGCTT  1090