BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-125P24
Chromosome15 (Build37)
Map Location 86,481,514 - 86,610,225
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genePpara, 2210021J22Rik, Pkdrej, AW124722, Gtse1, Trmu, Celsr1, BC021523, Cerk, LOC100042300, Tbc1d22a
Downstream geneLOC100042309, AW049604
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-125P24.bB6Ng01-125P24.g
ACCDH928482DH928483
length748898
definitionDH928482|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-125P24, 5' end.DH928483|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-125P24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,481,514 - 86,482,180)(86,609,338 - 86,610,225)
sequence
gaattcccctctgcagcagtctttattgcttatataccctttgggaagga
ggggcctgtgagcatgataaacttcaggaacttttttacacttatgagtt
gttttcatcttgaatcttaagaagccttcccttagaatttttgagtttta
aggtcccccccacaccatggaatttttttaatataatattttattaactg
aatttcatagaatgtattctgattgtattggccttcattcttctgctaac
ttctcccagatctgtcactattccccataactccttcttatgtgtatgtt
ttttccttttctgttttataacccactacatccaagttgtgctggctata
tatgcaagtgtgtggggccatccactgaagcatgtttggcctaccaggga
ctacatccttaaataaaactctcttcttccctttagaagtcatctgtagc
tacttaggggtggggttcatgagcccctctatgctggaatatgaactggt
ttaatctgtgtaggtcttgtgccggcagccatagctgccctgttaagccc
acctccctgacctctggctcttacagtctttctgcctcctctttcacaat
ggttttgtaagcctgggggatacaggtgtgatatagatgtcctctattga
actctactgaaacttattctctttgtttttgattggttgtgagtttctgc
atttaaccaccatgcactgcagaaagaaacttctctaaggaggtgtaa
gaattcaagccatagacccatggatgatgatctgaaggacagaggttcac
ttgggaacctaggtaaaattgtctgtgataagccatagtcatagacagtt
ttggtaactaacagaacatctcacaaaccatgtgagcagccctggagaga
gagagagtgaagacctgtgagtgttcctgatggctagagagcaagcatca
cataagaaaggagagaaaactgctctcagccctccagcccaggatggtct
ggctcaggtcctgcatcacccgggagccaggagcacatgtggcagtggct
tggacatgatctggggggaccagtggacacactaatgagtgctgggtccc
aataccgtaacttctgcctcctttcccaagagaaccaggaccttgtcagg
ggagagggctcctaccactcgccactcatcagagagcaaaaaaggaaagg
aagctgtatagggcacttgaggaataagaaggtcccagctttcggcacct
gagaccaccagtgggctcagccccaacctcataaggtcagagtttccctc
agagcctgcactgaagggggcctgaaccagcccacagagccaccatttcc
atataatcctataggtcactgactcttcccagagccctagtcccagggat
tacctcaattgatcacatcaagagcccgggggtgcagaaaagaaaacaag
caataaaaacaccataaaatgttagccggaccagagccagctgtgggtac
attgagggttctaaggtagttctcatcctgtggttgacccctttgggggt
tacattatatatcctgcatatcgaatatattttacatttggattcatcac
aatagcatgattacatgttatgaaatatttttatgggtgcggggatgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_86481514_86482180
seq2: B6Ng01-125P24.b_49_716

seq1  GAATTCCCCTCTGCAGCAGTCTTTATTGCTTATATACCCTTTGGGAAGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCCTCTGCAGCAGTCTTTATTGCTTATATACCCTTTGGGAAGGA  50

seq1  GGGGCCTGTGAGCATGATAAACTTCAGGAACTTTTTTACACTTATGAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCCTGTGAGCATGATAAACTTCAGGAACTTTTTTACACTTATGAGTT  100

seq1  GTTTTCATCTTGAATCTTAAGAAGCCTTCCCTTAGAATTTTTGAGTTTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCATCTTGAATCTTAAGAAGCCTTCCCTTAGAATTTTTGAGTTTTA  150

seq1  AGGTCCCCCCCACACCATGGAATTTTTTTAATATAATATTTTATTAACTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCCCCCCCACACCATGGAATTTTTTTAATATAATATTTTATTAACTG  200

seq1  AATTTCATAGAATGTATTCTGATTGTATTGGCCTTCATTCTTCTGCTAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCATAGAATGTATTCTGATTGTATTGGCCTTCATTCTTCTGCTAAC  250

seq1  TTCTCCCAGATCTGTCACTATTCCCCATAACTCCTTCTTATGTGTATGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCCAGATCTGTCACTATTCCCCATAACTCCTTCTTATGTGTATGTT  300

seq1  TTTTCCTTTTCTGTTTTATAACCCACTACATCCAAGTTGTGCTGGCTATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTTTTCTGTTTTATAACCCACTACATCCAAGTTGTGCTGGCTATA  350

seq1  TATGCAAGTGTGTGGGGCCATCCACTGAAGCATGTTTGGCCTACCAGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAAGTGTGTGGGGCCATCCACTGAAGCATGTTTGGCCTACCAGGGA  400

seq1  CTACATCCTTAAATAAAACTCTCTTCTTCCCTTTAGAAGTCATCTGTAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATCCTTAAATAAAACTCTCTTCTTCCCTTTAGAAGTCATCTGTAGC  450

seq1  TACTTAGGGGTGGGGTTCATGAGCCCCTCTATGCTGGAATATGAACTGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTAGGGGTGGGGTTCATGAGCCCCTCTATGCTGGAATATGAACTGGT  500

seq1  TTAATCTGTGTAGGTCTTGTGCCGGCAGCCATAGCTGCCCTGTTAAGCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCTGTGTAGGTCTTGTGCCGGCAGCCATAGCTGCCCTGTTAAGCCC  550

seq1  ACCTCCCTGACCTCTGGCTCTTACAGTCTTTCTGCCTCCTCTTTCACAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCCTGACCTCTGGCTCTTACAGTCTTTCTGCCTCCTCTTTCACAAT  600

seq1  GG-TTTGTAAGCCTGGGGGATACAGGTGTGATATAGATGTCCTCTATTGA  649
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTGTAAGCCTGGGGGATACAGGTGTGATATAGATGTCCTCTATTGA  650

seq1  ACTCTACTGAAACTTATT  667
      ||||||||||||||||||
seq2  ACTCTACTGAAACTTATT  668

seq1: chr15_86609338_86610225
seq2: B6Ng01-125P24.g_69_966 (reverse)

seq1  CCATCCCCGCAACCATAAAAATATTTCATAAC-TGTAATCCTGCTATTGT  49
      ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
seq2  CCATCCCCGCACCCATAAAAATATTTCATAACATGTAATCATGCTATTGT  50

seq1  GATGAATCCAAATGT-AAATATATTCGATATGCAGGATATATAATGTAA-  97
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GATGAATCCAAATGTAAAATATATTCGATATGCAGGATATATAATGTAAC  100

seq1  CCCCAAAGGGGTC-ACCACAGGATGAGAACTACCTTAGAACCTCCATTGT  146
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||
seq2  CCCCAAAGGGGTCAACCACAGGATGAGAACTACCTTAGAACCCTCAATGT  150

seq1  A-CCACAGCTGGCTCTGGTCCGGCTAACATTTTCTGGTGTTTTTATTGCT  195
      | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ACCCACAGCTGGCTCTGGTCCGGCTAACATTTTATGGTGTTTTTATTGCT  200

seq1  TGTTTTCTTTTCTGCA-CCCCGGGCTCTTGATGTGATCAA-TGAGGTAAT  243
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TGTTTTCTTTTCTGCACCCCCGGGCTCTTGATGTGATCAATTGAGGTAAT  250

seq1  -CCTGGGACTAGGGCTCTGGGAAGAGTCAGTGACCTATAGGATTATATGG  292
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGGACTAGGGCTCTGGGAAGAGTCAGTGACCTATAGGATTATATGG  300

seq1  -AATGGTGGCTCTGTGGGCTGGTTCAGG-CCCCTTCAGTGCAGGCTCTGA  340
       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGTGGCTCTGTGGGCTGGTTCAGGCCCCCTTCAGTGCAGGCTCTGA  350

seq1  GGGAAACTCTGACCTTATGAGGTTGGGGCTGAGCCCACTGGTGGTCTCAG  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAACTCTGACCTTATGAGGTTGGGGCTGAGCCCACTGGTGGTCTCAG  400

seq1  GTGCCGAAAGCTGGGACCTTCTTATTCCTCAAGTGCCCTATACAGCTTCC  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCGAAAGCTGGGACCTTCTTATTCCTCAAGTGCCCTATACAGCTTCC  450

seq1  TTTCCTTTTTTGCTCTCTGATGAGTGGCGAGTGGTAGGAGCCCTCTCCCC  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTTTTTGCTCTCTGATGAGTGGCGAGTGGTAGGAGCCCTCTCCCC  500

seq1  TGACAAGGTCCTGGTTCTCTTGGGAAAGGAGGCAGAAGTTACGGTATTGG  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAGGTCCTGGTTCTCTTGGGAAAGGAGGCAGAAGTTACGGTATTGG  550

seq1  GACCCAGCACTCATTAGTGTGTCCACTGGTCCCCCCAGATCATGTCCAAG  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCAGCACTCATTAGTGTGTCCACTGGTCCCCCCAGATCATGTCCAAG  600

seq1  CCACTGCCACATGTGCTCCTGGCTCCCGGGTGATGCAGGACCTGAGCCAG  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGCCACATGTGCTCCTGGCTCCCGGGTGATGCAGGACCTGAGCCAG  650

seq1  ACCATCCTGGGCTGGAGGGCTGAGAGCAGTTTTCTCTCCTTTCTTATGTG  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATCCTGGGCTGGAGGGCTGAGAGCAGTTTTCTCTCCTTTCTTATGTG  700

seq1  ATGCTTGCTCTCTAGCCATCAGGAACACTCACAGGTCTTCACTCTCTCTC  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTGCTCTCTAGCCATCAGGAACACTCACAGGTCTTCACTCTCTCTC  750

seq1  TCTCCAGGGCTGCTCACATGGTTTGTGAGATGTTCTGTTAGTTACCAAAA  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAGGGCTGCTCACATGGTTTGTGAGATGTTCTGTTAGTTACCAAAA  800

seq1  CTGTCTATGACTATGGCTTATCACAGACAATTTTACCTAGGTTCCCAAGT  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTATGACTATGGCTTATCACAGACAATTTTACCTAGGTTCCCAAGT  850

seq1  GAACCTCTGTCCTTCAGATCATCATCCATGGGTCTATGGCTTGAATTC  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTCTGTCCTTCAGATCATCATCCATGGGTCTATGGCTTGAATTC  898