BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-126K21
Chromosome15 (Build37)
Map Location 84,052,362 - 84,239,573
singlet/doubletdoublet
Overlap geneParvb, Parvg, LOC382988, 1810041L15Rik
Upstream geneA4galt, LOC100042119, Arfgap3, Pacsin2, LOC414359, Ttll1, Bik, Mcat, Tspo, Ttll12, Scube1, Mpped1, 4931407K02Rik, LOC667167, Sult4a1, Pnpla5, Pnpla3, Samm50
Downstream geneLdoc1l, Arhgap8, 3110043J09Rik, Phf21b, LOC100043084, 4930513L16Rik, Nup50, 5031439G07Rik, LOC628135, Upk3a, 3110048E14Rik, Smc1b, Ribc2, Fbln1, Atxn10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-126K21.bB6Ng01-126K21.g
ACCDH928984DH928985
length1,177369
definitionDH928984|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-126K21, 5' end.DH928985|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-126K21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,238,386 - 84,239,573)(84,052,362 - 84,052,736)
sequence
gaattcaaatccccatactgctgtcatggctggggaatcttagagaagac
tttggtccctcagaggtccctctctctgcccaatttccaccttagacacc
acaggtctgtttccttccatcttagcactgtgcagagcagaggggacctt
tagctgccccttgtcctgcgctggctttttggagtgtttctagctccagg
cagggccaccacccctcctgctctggatgccaaacagcatctggagagag
cggccctgctccctccccgcctcctcagcccccaggctgctgccatggga
accaccaggaacagcctggttctcagagccctgacatgggggctgcaaga
gagagagaaatctggggagagatgggtgcctgggaccagagcccacctag
acatctgtctcccatgagacttcagcctgtaagtgagttgggctcttggc
ctttttcctctggcatgaattctctgctgtgccctgacacttccaggcaa
agctagtgtccattaataaaaggctcagtgcttggctgtcagtcattcac
acctttgtgtggcagtagttggcaaagagatggagttgcagaaagaagct
gagacttctctgtttaggatttgctgggtactgagcccaagtactgactg
gtactgagttctaagcacctctcttgaggctgtcaagctccgtgtgcaca
gcacggcagagccttaccaagagccattcctccgcaaactcccactgccc
cgactcccaagagaagtcttccgtccaagaaattggccagctgagacaca
ttctcctgaatagaaagaggaagtgggcttattgactctgcttctgccct
ggccagccttggaagtcgaggagagacttaagacctggagatggacgggg
cttcccatagaccacgcaggaagcagacccaggagatcagccaagctcca
ttcccagcacagatagcagagggagctccagggccttctggagtggaggg
tttcctgcctgcctctctagctggtcagcagcctcttctcaacaccctgg
ctggccatgctcactcaagcgattcccatggcaggaacagactgaagtgg
ggtgtccacttgagcagttaataaacctagtccttggaaacggccaggcc
tggcaagttccaggcgcaccagctgtg
ttggcaccaagttgggctatgtcacacacttgtgattcaagagtgtctcc
tgctcacatagctgttcagcagtcagcctctaccaatggtccactgtggt
gtctgtgtgtccctgtgtgtgtgaatgtgcatgtttttgtgtgtctatgt
tgtctgtctgtgtgtgtctgtgagtgtgtgttgtgtgtttgtgtgtgtgt
gtctgtgtgtccatgtgtgtgtctatgtgtctgcgtgagtgtgtgtatct
gtataactgtgtgcatgtctgtgtagtatgtctctgtgtgttgtatatct
ctgtgtgtgtatctgtgttgtatgtctgtgtgtgtatctgtgttgtatgt
ctgtgtatatgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_84238386_84239573
seq2: B6Ng01-126K21.b_50_1226 (reverse)

seq1  CACAGCTGGGTTGCTGCCTGGAACTTGCCAGGGCCTGGGCCGTTTCAAGG  50
      |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |
seq2  CACAGCTGG--TGC-GCCTGGAACTTGCCA-GGCCT-GGCCGTTTCCAAG  45

seq1  GACTA-GTTTATTAACTGCTCAAGT-GACA-CCCACTTCAGTCTGTTCCC  97
      ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||
seq2  GACTAGGTTTATTAACTGCTCAAGTGGACACCCCACTTCAGTCTGTT-CC  94

seq1  TGCCATGGGCATCTGCTTGAGTGGGCATGGGCCAGCCAGGGTGTTGAGAA  147
      ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATGGGAATC-GCTTGAGTGAGCAT-GGCCAGCCAGGGTGTTGAGAA  142

seq1  GAGGCTGCTGACCAGCCTAGAAGAGGCAGGCAGGAAACCCTCCACTCCAG  197
      ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTGCTGACCAG-CTAG-AGAGGCAGGCAGGAAACCCTCCACTCCAG  190

seq1  AAGGCCCTGGAGCTCCCTCCTGCTTATCTGTGCTGGGAATGGAGCTTGGC  247
      |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AAGGCCCTGGAGCTCCCT-CTGC-TATCTGTGCTGGGAATGGAGCTTGG-  237

seq1  CTGATCTCCTGGGTCTGCTTCCCTGCGTGGTCTATGGGAAGCCCCGTCCA  297
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATCTCCTGGGTCTGCTT-CCTGCGTGGTCTATGGGAAGCCCCGTCCA  286

seq1  TCTCCAGGTCTTAAGTCTCTCCTCGACTTCCAAGGCTGGCCAGGGCAGAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAGGTCTTAAGTCTCTCCTCGACTTCCAAGGCTGGCCAGGGCAGAA  336

seq1  GCAGAGTCAATAAGCCCACTTCCTCTTTCTATTCAGGAGAATGTGTCTCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGTCAATAAGCCCACTTCCTCTTTCTATTCAGGAGAATGTGTCTCA  386

seq1  GCTGGCCAATTTCTTGGACGGAAGACTTCTCTTGGGAGTCGGGGCAGTGG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCCAATTTCTTGGACGGAAGACTTCTCTTGGGAGTCGGGGCAGTGG  436

seq1  GAGTTTGCGGAGGAATGGCTCTTGGTAAGGCTCTGCCGTGCTGTGCACAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTGCGGAGGAATGGCTCTTGGTAAGGCTCTGCCGTGCTGTGCACAC  486

seq1  GGAGCTTGACAGCCTCAAGAGAGGTGCTTAGAACTCAGTACCAGTCAGTA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTTGACAGCCTCAAGAGAGGTGCTTAGAACTCAGTACCAGTCAGTA  536

seq1  CTTGGGCTCAGTACCCAGCAAATCCTAAACAGAGAAGTCTCAGCTTCTTT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGCTCAGTACCCAGCAAATCCTAAACAGAGAAGTCTCAGCTTCTTT  586

seq1  CTGCAACTCCATCTCTTTGCCAACTACTGCCACACAAAGGTGTGAATGAC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAACTCCATCTCTTTGCCAACTACTGCCACACAAAGGTGTGAATGAC  636

seq1  TGACAGCCAAGCACTGAGCCTTTTATTAATGGACACTAGCTTTGCCTGGA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGCCAAGCACTGAGCCTTTTATTAATGGACACTAGCTTTGCCTGGA  686

seq1  AGTGTCAGGGCACAGCAGAGAATTCATGCCAGAGGAAAAAGGCCAAGAGC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCAGGGCACAGCAGAGAATTCATGCCAGAGGAAAAAGGCCAAGAGC  736

seq1  CCAACTCACTTACAGGCTGAAGTCTCATGGGAGACAGATGTCTAGGTGGG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTCACTTACAGGCTGAAGTCTCATGGGAGACAGATGTCTAGGTGGG  786

seq1  CTCTGGTCCCAGGCACCCATCTCTCCCCAGATTTCTCTCTCTCTTGCAGC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGTCCCAGGCACCCATCTCTCCCCAGATTTCTCTCTCTCTTGCAGC  836

seq1  CCCCATGTCAGGGCTCTGAGAACCAGGCTGTTCCTGGTGGTTCCCATGGC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATGTCAGGGCTCTGAGAACCAGGCTGTTCCTGGTGGTTCCCATGGC  886

seq1  AGCAGCCTGGGGGCTGAGGAGGCGGGGAGGGAGCAGGGCCGCTCTCTCCA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCCTGGGGGCTGAGGAGGCGGGGAGGGAGCAGGGCCGCTCTCTCCA  936

seq1  GATGCTGTTTGGCATCCAGAGCAGGAGGGGTGGTGGCCCTGCCTGGAGCT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTGTTTGGCATCCAGAGCAGGAGGGGTGGTGGCCCTGCCTGGAGCT  986

seq1  AGAAACACTCCAAAAAGCCAGCGCAGGACAAGGGGCAGCTAAAGGTCCCC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACACTCCAAAAAGCCAGCGCAGGACAAGGGGCAGCTAAAGGTCCCC  1036

seq1  TCTGCTCTGCACAGTGCTAAGATGGAAGGAAACAGACCTGTGGTGTCTAA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCTGCACAGTGCTAAGATGGAAGGAAACAGACCTGTGGTGTCTAA  1086

seq1  GGTGGAAATTGGGCAGAGAGAGGGACCTCTGAGGGACCAAAGTCTTCTCT  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGAAATTGGGCAGAGAGAGGGACCTCTGAGGGACCAAAGTCTTCTCT  1136

seq1  AAGATTCCCCAGCCATGACAGCAGTATGGGGATTTGAATTC  1188
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTCCCCAGCCATGACAGCAGTATGGGGATTTGAATTC  1177

seq1: chr15_84052362_84052736
seq2: B6Ng01-126K21.g_67_441

seq1  GAATTCTTGGCACCAAGTTGGGCTATGTCACACACTTGTGATTCAAGAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGGCACCAAGTTGGGCTATGTCACACACTTGTGATTCAAGAGT  50

seq1  GTCTCCTGCTCACATAGCTGTTCAGCAGTCAGCCTCTACCAATGGTCCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCTGCTCACATAGCTGTTCAGCAGTCAGCCTCTACCAATGGTCCAC  100

seq1  TGTGGTGTCTGTGTGTCCCTGTGTGTGTGAATGTGCATGTTTTTGTGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGTCTGTGTGTCCCTGTGTGTGTGAATGTGCATGTTTTTGTGTGT  150

seq1  CTATGTTGTCTGTCTGTGTGTGTCTGTGAGTGTGTGTTGTGTGTTTGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTTGTCTGTCTGTGTGTGTCTGTGAGTGTGTGTTGTGTGTTTGTGT  200

seq1  GTGTGTGTCTGTGTGTCCATGTGTGTGTCTATGTGTCTGCGTGAGTGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTCTGTGTGTCCATGTGTGTGTCTATGTGTCTGCGTGAGTGTGT  250

seq1  GTATCTGTATAACTGTGTGCATGTCTGTGTAGTATGTCTCTGTGTGTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCTGTATAACTGTGTGCATGTCTGTGTAGTATGTCTCTGTGTGTTGT  300

seq1  ATATCTCTGTGTGTGTATCTGTGTTGTATGTCTGTGTGTGTATCTGTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTCTGTGTGTGTATCTGTGTTGTATGTCTGTGTGTGTATCTGTGTT  350

seq1  GTATGTCTGTGTATATGTGTGTGTG  375
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTCTGTGTATATGTGTGTGTG  375