BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-129B03
Chromosome15 (Build37)
Map Location 66,613,335 - 66,760,579
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTg, Sla, Wisp1
Upstream geneC920006C10Rik, Oc90, F930104E18Rik, LOC100040835, Kcnq3, Lrrc6, LOC100040860, Tmem71, LOC100040881, Phf20l1
Downstream geneNdrg1, LOC100040667, St3gal1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-129B03.bB6Ng01-129B03.g
ACCDH930754DH930755
length1,0761,039
definitionDH930754|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129B03, 5' end.DH930755|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129B03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,613,335 - 66,614,415)(66,759,529 - 66,760,579)
sequence
gaattccactcatacctcatttattcccatttgacctcagcacagtattt
cacccaggcatcttcctatgggcatgaggaatgggggttctaaaacatag
aaccccaacaactggatgagtcaaaactgtctatctgagaagtttttcca
gtagagctgcctcctccctctcctgttttctccctcactaccctatactt
tcctgtggcttagcatggccatctaatgcccacgtgacttcaatacccct
gagtgctaaagattccattcggctcagagatttaatcccttcggaatatt
tttttagtgtcactggtcctttagaaagagaagagacataacccaaaagt
ctcactggacctataaaggtagtttggctccaggtagaggtcattctgga
gctaggaagtcatcttccccatgttctttctcagatggatgctttccaca
tggtctcagagaagggccatttggatttcgagttggagtcagtctccaag
tactcttgcaaaagtgttctgttctacatacacacacagttctttgacgc
actgccccatttcatcatgatttaaacatgatgtgactccacaatactga
tcagacatcagggaagagttcctctgatcagtgtgtaaaggcagtctctg
tgtggtttcccttgattcctggaagacctgaggtaaccaaggaggaatgc
tggcctccgtaagaccccaggtgacagtcaaagcctttgtttttttgtgt
gtgtgtacaagccaggtcattaatcttcaaagtactggggtgctgaaaaa
aggaacttttgcgtttgctgccagtgtacattatggagagactctttctt
cttccggtcgaaggagctgctgtcatcccctgtcagggacaggtaagagc
aatgctttcccgaagaccatagctgaaaagggattcgtccactctgagtg
gttctctgctcctctgaaccttcttgcatctgtgtgtcaaagattcagac
gagaagtggagagaaggggatgttgggacatagtaggttgtgggagacga
ggaatgaatggatgggaacagacaga
gaattcagtgtgcaggcagccttgccacacaccaggcacctagtagcagg
tcaccatagtgatgagagaacacttttcaagctggaagaagagggaagca
tataggttaaaagtgactcctgttctcacgttccatgggagatgtttgct
ttgtatgtttggtatatatgtgtgttgtatgcattgttgcacttgcgtgt
acgtttcatggcctgaggttggcattgggtgtctctctctctctgtattg
ctctccattttactgtttttgagacagacacagctgcatgtttgcatacc
tggtgctacccagggttagtttgtctgaaggtacctctccatctgaagaa
tctatttcccacccggatgattgtttatgggaggccacacagtaatggtt
gggagcctgtagagggtgagtgttgtctgctaagtaactgcttccaagaa
agtgaggaggacagggagaggagctcctgggcaccccagcatatatgatg
actctggctggggaccaaggtcatctcacctctgagagcccatgctgtga
tgtggcccttgacaacatgcaacaaagacacttgacttggaagatggctc
agttggtaaaatacttcccttgcaagtgtgataacctgaattcaattccc
catagctcacattaaaaaaaaaaaagctagggtagcatgctctgtgttta
acaacattggctgttgttctagagcacccagttcaacttgaagcacccac
atagtggtttataagtgtctgtaactccatttcctgggatcagtaccctc
tctacataggcacagaacacacatgtggtacagactaaattgcagggcaa
acatctacaacataaatacttctggtggtacatgcttgtcatcccagtgc
tggaaaggtgagatgaagacacctgagggtactcctggccagttaggtta
gcctattgatgattccaggccaagagagctgtgtctccagcatagtaaga
cgagcaaaggacgattatctctctagcccaaagcacaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_66613335_66614415
seq2: B6Ng01-129B03.b_48_1123

seq1  GAATTCCACTCATACCTCATTTATTCCCATTTGACCTCAGCACAGTATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACTCATACCTCATTTATTCCCATTTGACCTCAGCACAGTATTT  50

seq1  CACCCAGGCATCTTCCTATGGGCATGAGGAATGGGGGTTCTAAAACATAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCAGGCATCTTCCTATGGGCATGAGGAATGGGGGTTCTAAAACATAG  100

seq1  AACCCCAACAACTGGATGAGTCAAAACTGTCTATCTGAGAAGTTTTTCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCCAACAACTGGATGAGTCAAAACTGTCTATCTGAGAAGTTTTTCCA  150

seq1  GTAGAGCTGCCTCCTCCCTCTCCTGTTTTCTCCCTCACTACCCTATACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGCTGCCTCCTCCCTCTCCTGTTTTCTCCCTCACTACCCTATACTT  200

seq1  TCCTGTGGCTTAGCATGGCCATCTAATGCCCACGTGACTTCAATACCCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTGGCTTAGCATGGCCATCTAATGCCCACGTGACTTCAATACCCCT  250

seq1  GAGTGCTAAAGATTCCATTCGGCTCAGAGATTTAATCCCTTCGGAATATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGCTAAAGATTCCATTCGGCTCAGAGATTTAATCCCTTCGGAATATT  300

seq1  TTTTTAGTGTCACTGGTCCTTTAGAAAGAGAAGAGACATAACCCAAAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAGTGTCACTGGTCCTTTAGAAAGAGAAGAGACATAACCCAAAAGT  350

seq1  CTCACTGGACCTATAAAGGTAGTTTGGCTCCAGGTAGAGGTCATTCTGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTGGACCTATAAAGGTAGTTTGGCTCCAGGTAGAGGTCATTCTGGA  400

seq1  GCTAGGAAGTCATCTTCCCCATGTTCTTTCTCAGATGGATGCTTTCCACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGAAGTCATCTTCCCCATGTTCTTTCTCAGATGGATGCTTTCCACA  450

seq1  TGGTCTCAGAGAAGGGCCATTTGGATTTCGAGTTGGAGTCAGTCTCCAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTCAGAGAAGGGCCATTTGGATTTCGAGTTGGAGTCAGTCTCCAAG  500

seq1  TACTCTTGCAAAAGTGTTCTGTTCTACATACACACACAGTTCTTTGACGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTTGCAAAAGTGTTCTGTTCTACATACACACACAGTTCTTTGACGC  550

seq1  ACTGCCCCATTTCATCATGATTTAAACATGATGTGACTCCACAATACTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCCCATTTCATCATGATTTAAACATGATGTGACTCCACAATACTGA  600

seq1  TCAGACATCAGGGAAGAGTTCCTCTGATCAGTGTGTAAAGGCAGTCTCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACATCAGGGAAGAGTTCCTCTGATCAGTGTGTAAAGGCAGTCTCTG  650

seq1  TGTGGTTTCCCTTGATTCCTGGAAGACCTGAGGTAACCAAGGAGGAATGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTTTCCCTTGATTCCTGGAAGACCTGAGGTAACCAAGGAGGAATGC  700

seq1  TGGCCTCCGTAAGACCCCAGGTGACAGTCAAAGCCTTTGTTTTTTTGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTCCGTAAGACCCCAGGTGACAGTCAAAGCCTTTGTTTTTTTGTGT  750

seq1  GTGTGTACAAGCCAGGTCATTAATCTTCAAAGTACTGGGGTGCTGAAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GTGTGTACAAGCCAGGTCATTAATCTTCAAAGTACTGGGGTGCTG-AAAA  799

seq1  AAGGAACTCTTGCGTTTGCTGCCAGTGTACATTAGGGAGAGACTC-TTCT  849
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  AAGGAACTTTTGCGTTTGCTGCCAGTGTACATTATGGAGAGACTCTTTCT  849

seq1  TCTTCCGGTCGAAGGAGCTGCTGTCATCCCCTGTCAGGGACAGGTAAGAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TCTTCCGGTCGAAGGAGCTGCTGTCATCCCCTGTCAGGGACAGGTAAGA-  898

seq1  GCAATGCTTTCCCGAAGACCATAGCTGAAAAGGGATTCGTCCACTCTGAG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGCTTTCCCGAAGACCATAGCTGAAAAGGGATTCGTCCACTCTGAG  948

seq1  TGGGTTCTCTGCTCCCTCTGAACCTTCTTGCAATCTGTGTGTCAAAAGAT  999
      | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
seq2  T-GGTTCTCTGCT-CCTCTGAACCTTCTTGC-ATCTGTGTGTC-AAAGAT  994

seq1  TCAGACAGAGAAAGTGGAGAAGAGAGGGATGTT-GGACATAGTAGGTTGT  1048
      |||||| ||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCAGAC-GAG-AAGTGGAG-AGAAGGGGATGTTGGGACATAGTAGGTTGT  1041

seq1  -GGAGACGAGGAATGAAAGGATGGGAA-AGACAGA  1081
       |||||||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  GGGAGACGAGGAATGAATGGATGGGAACAGACAGA  1076

seq1: chr15_66759529_66760579
seq2: B6Ng01-129B03.g_68_1106 (reverse)

seq1  TTTGTGCTCTTGGGCTAGAG-GATAATCTGTCCTTTTGCTCTGTCTTACT  49
      |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| 
seq2  TTTGTGCT-TTGGGCTAGAGAGATAATC-GTCC-TTTGCTC-GTCTTAC-  45

seq1  TATGCTGGAGACACAGCCTCTCTTTGGCCTGGAATTCATCAAGTGGGCTA  99
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||
seq2  TATGCTGGAGACACAG-CTCTC-TTGGCCTGGAA-TCATCAA-TAGGCTA  91

seq1  ACCTAACTGGCCA-GAGTACCCTCAGTGATCTTTCTATCTCTACCTTTCC  148
      ||||||||||||| ||||||||||||   ||||   ||||| ||||||||
seq2  ACCTAACTGGCCAGGAGTACCCTCAGGTGTCTT--CATCTC-ACCTTTCC  138

seq1  AGCACTGGGATGACAAGCATGTACCACCAGAAGTATTTTATGTGTGTAGA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
seq2  AGCACTGGGATGACAAGCATGTACCACCAGAAGTA-TTTATGT-TGTAGA  186

seq1  TGTTTTGCCTGCATTTAAGTCTGTACCACATGTGTGTTCTGTGCCTATGT  248
      |||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGCCCTGCAATTTAGTCTGTACCACATGTGTGTTCTGTGCCTATGT  236

seq1  AGAGAGGGTACTGATCCCAGGAAATGGAGTTACAGACACTTATAAACCAC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGGGTACTGATCCCAGGAAATGGAGTTACAGACACTTATAAACCAC  286

seq1  TATGTGGGTGCTTCAAGTTGAACTGGGTGCTCTAGAACAACAGCCAATGT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGGGTGCTTCAAGTTGAACTGGGTGCTCTAGAACAACAGCCAATGT  336

seq1  TGTTAAACACAGAGCCTGCTACCCTAGCTTTTTTTTTTTTAATGTGAGCT  398
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAAACACAGAGCATGCTACCCTAGCTTTTTTTTTTTTAATGTGAGCT  386

seq1  ATGGGGAATTGAATTCAGGTTATCACACTTGCAAGGGAAGTATTTTACCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGAATTGAATTCAGGTTATCACACTTGCAAGGGAAGTATTTTACCA  436

seq1  ACTGAGCCATCTTCCAAGTCAAGTGTCTTTGTTGCATGTTGTCAAGGGCC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGCCATCTTCCAAGTCAAGTGTCTTTGTTGCATGTTGTCAAGGGCC  486

seq1  ACATCACAGCATGGGCTCTCAGAGGTGAGATGACCTTGGTCCCCAGCCAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCACAGCATGGGCTCTCAGAGGTGAGATGACCTTGGTCCCCAGCCAG  536

seq1  AGTCATCATATATGCTGGGGTGCCCAGGAGCTCCTCTCCCTGTCCTCCTC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATCATATATGCTGGGGTGCCCAGGAGCTCCTCTCCCTGTCCTCCTC  586

seq1  ACTTTCTTGGAAGCAGTTACTTAGCAGACAACACTCACCCTCTACAGGCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCTTGGAAGCAGTTACTTAGCAGACAACACTCACCCTCTACAGGCT  636

seq1  CCCAACCATTACTGTGTGGCCTCCCATAAACAATCATCCGGGTGGGAAAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACCATTACTGTGTGGCCTCCCATAAACAATCATCCGGGTGGGAAAT  686

seq1  AGATTCTTCAGATGGAGAGGTACCTTCAGACAAACTAACCCTGGGTAGCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCTTCAGATGGAGAGGTACCTTCAGACAAACTAACCCTGGGTAGCA  736

seq1  CCAGGTATGCAAACATGCAGCTGTGTCTGTCTCAAAAACAGTAAAATGGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTATGCAAACATGCAGCTGTGTCTGTCTCAAAAACAGTAAAATGGA  786

seq1  GAGCAATACAGAGAGAGAGAGACACCCAATGCCAACCTCAGGCCATGAAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAATACAGAGAGAGAGAGACACCCAATGCCAACCTCAGGCCATGAAA  836

seq1  CGTACACGCAAGTGCAACAATGCATACAACACACATATATACCAAACATA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTACACGCAAGTGCAACAATGCATACAACACACATATATACCAAACATA  886

seq1  CAAAGCAAACATCTCCCATGGAACGTGAGAACAGGAGTCACTTTTAACCT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCAAACATCTCCCATGGAACGTGAGAACAGGAGTCACTTTTAACCT  936

seq1  ATATGCTTCCCTCTTCTTCCAGCTTGAAAAGTGTTCTCTCATCACTATGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCTTCCCTCTTCTTCCAGCTTGAAAAGTGTTCTCTCATCACTATGG  986

seq1  TGACCTGCTACTAGGTGCCTGGTGTGTGGCAAGGCTGCCTGCACACTGAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTGCTACTAGGTGCCTGGTGTGTGGCAAGGCTGCCTGCACACTGAA  1036

seq1  TTC  1051
      |||
seq2  TTC  1039