BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-131E14
Chromosome15 (Build37)
Map Location 40,007,616 - 40,144,932
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC670013
Upstream geneLOC671215, Rims2, Tm7sf4, Dpys, Lrp12, LOC100039130
Downstream geneLOC664872, Zfpm2, Ppia-ps25
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-131E14.bB6Ng01-131E14.g
ACCDH932381DH932382
length1,1281,002
definitionDH932381|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131E14, 5' end.DH932382|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131E14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(40,007,616 - 40,008,762)(40,143,927 - 40,144,932)
sequence
gaattccattccagattaatctacttttaaaaattataaaaattatgttt
tagagaattatttataggaaggagtcaggtgctactgtagcctggttacc
actggctgtaacccccctccctcttttaaattgcaacaagacagactctg
atatgatgcacagattttttttttctaacaacaaactgagttttagaatt
ataatttagagtgtagtggatgtatcaccgaaagacagggtggttctgca
attgtcaggcggcattgtgttgttgctagtctgagcaaatctaaatcttt
tcaagctttggttgagtgggttaattccaggacctgaattacaagtgcaa
tttgaattacattgcaaatgctgaattcagttcactttagcaaagtgctt
ctttctccctcctcagacttatgaattttagctgttttgatgtttttcga
cagttggaatatttcagttagctgtggaaaataattctacctagaactgc
aagaagaggacccccaacttctttgttgaacccctatgtttatttttttt
gtttgcctctgtgtgtgtgtgtgtgaaatatcttttaacatttatcacac
tgattcaagccttgaagatgttagcaaccctggaagctttccaggcagtg
tggcattggttcttgagttgtgtaataaaccttttgtaaaaacactgcca
caacactccaaacaacccagcgaatgaaggaacgagcaggtaagcaaaga
atggaaggcacagactggagttcctgattttgtgattaccgtcaacttta
tatttacaaaggatacaaaaataatactaactataacttcacaatactta
ttattcatttctacaaataccctatctattgtcacatacatttcccttaa
ccagacataaatccatagggagacactcatttctcttcttaatttttttt
tttttattttatcactgactttatggacaagaacaaacgggtcaactgga
ttgttcagacttcacactccaccctagctctgttcttaccgaacttgggt
ggggcgaagcaagcaatccttcaccgtggaagaccgtggtgggcttgctc
tgcttctttcggagaaatatgaagcatt
gaattcacttttgttctgttgagatcctggttatctttgagtaccacatg
tcagaggccatttcagaatcactgcagtgatatgtgagacctaaccacta
ttattgttcatcctcatgccatgaattgaagactcctgaatgttacaacc
atttacatttttggtcagtggcagtgacatgactccaagacctttggcac
aggacaggtaaaaattatcaagatcacttcaagtattagggctgtgattt
gtttttcccttaatttagtcttccttcaactatttatttatatgagattt
gagaatttctgaaagtaaaaagcaaatggaaaataccttagctcatgcaa
taagaactttgaacttatagggggaaaatgatatataaccaagaaaatat
ttctaggtacagattcctgtttaggatgggaattgcaagcttataaatga
tcactcaaaatggattatctttacataggatccattaagttaagtgccta
agaaaatatgtgtgtgtgttgtgtttaatatgtaaatacttacatattat
atacatgtctgtgtgtatgtgtgttacatgaagttatactaatatgtgtg
ccaaaacagtccctctgtatctcacactaagttatttctctaagccatgt
catggctcaggccacatgggtctcatttgcctttgagaagtatccagtat
tccaggtacactgaaatctgtgatccttaaagtatcaaagacatccttgt
attggaaaaacaaacaaacaaacaaataacaacaaaactttcatattact
tgcatgtctcctgttttctgttataatcacagctgttttcccagacacaa
aataaatggtggaaaagtgagccaaccaaataaacagacatatttgcaga
acactcaggatgctgcagcagagagattgctggctgggaacttacaagca
tggggtgctaacactcatagccaagattcttcaggtcagtttgcctctct
gg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_40007616_40008762
seq2: B6Ng01-131E14.b_41_1168

seq1  GAATTCCATTCCAGATTAATCTACTTTTAAAAATTATAAAAATTATGTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATTCCAGATTAATCTACTTTTAAAAATTATAAAAATTATGTTT  50

seq1  TAGAGAATTATTTATAGGAAGGAGTCAGGTGCTACTGTAGCCTGGTTACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAATTATTTATAGGAAGGAGTCAGGTGCTACTGTAGCCTGGTTACC  100

seq1  ACTGGCTGTAACCCCCCTCCCTCTTTTAAATTGCAACAAGACAGACTCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCTGTAACCCCCCTCCCTCTTTTAAATTGCAACAAGACAGACTCTG  150

seq1  ATATGATGCACAGATTTTTTTTTTCTAACAACAAACTGAGTTTTAGAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGATGCACAGATTTTTTTTTTCTAACAACAAACTGAGTTTTAGAATT  200

seq1  ATAATTTAGAGTGTAGTGGATGTATCACCGAAAGACAGGGTGGTTCTGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTTAGAGTGTAGTGGATGTATCACCGAAAGACAGGGTGGTTCTGCA  250

seq1  ATTGTCAGGCGGCATTGTGTTGTTGCTAGTCTGAGCAAATCTAAATCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCAGGCGGCATTGTGTTGTTGCTAGTCTGAGCAAATCTAAATCTTT  300

seq1  TCAAGCTTTGGTTGAGTGGGTTAATTCCAGGACCTGAATTACAAGTGCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGCTTTGGTTGAGTGGGTTAATTCCAGGACCTGAATTACAAGTGCAA  350

seq1  TTTGAATTACATTGCAAATGCTGAATTCAGTTCACTTTAGCAAAGTGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATTACATTGCAAATGCTGAATTCAGTTCACTTTAGCAAAGTGCTT  400

seq1  CTTTCTCCCTCCTCAGACTTATGAATTTTAGCTGTTTTGATGTTTTTCGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCCCTCCTCAGACTTATGAATTTTAGCTGTTTTGATGTTTTTCGA  450

seq1  CAGTTGGAATATTTCAGTTAGCTGTGGAAAATAATTCTACCTAGAACTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGGAATATTTCAGTTAGCTGTGGAAAATAATTCTACCTAGAACTGC  500

seq1  AAGAAGAGGACCCCCAACTTCTTTGTTGAACCCCTATGTTTATTTTTTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGAGGACCCCCAACTTCTTTGTTGAACCCCTATGTTTATTTTTTTT  550

seq1  GTTTGCCTCTGTGTGTGTGTGTGTGAAATATCTTTTAACATTTATCACAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCCTCTGTGTGTGTGTGTGTGAAATATCTTTTAACATTTATCACAC  600

seq1  TGATTCAAGCCTTGAAGATGTTAGCAACCCTGGAAGCTTTCCAGGCAGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCAAGCCTTGAAGATGTTAGCAACCCTGGAAGCTTTCCAGGCAGTG  650

seq1  TGGCATTGGTTCTTGAGTTGTGTAATAAACCTTTTGTAAAAACACTGCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATTGGTTCTTGAGTTGTGTAATAAACCTTTTGTAAAAACACTGCCA  700

seq1  CAACACTCCAAACAACCCAGCGAATGAAGGAACGAGCAGGTAAGCAAAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACACTCCAAACAACCCAGCGAATGAAGGAACGAGCAGGTAAGCAAAGA  750

seq1  ATGGAAGGCACAGACTGGAGTTCCTGATTTTGTGATTACCGTCAACTTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAGGCACAGACTGGAGTTCCTGATTTTGTGATTACCGTCAACTTTA  800

seq1  TATTTACAAAGGATACAAAAATAATACTAACTATAACTTCACAATACTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTACAAAGGATACAAAAATAATACTAACTATAACTTCACAATACTTA  850

seq1  TTATTCATTTCTACAAATACCCTATCTATTGTCACATACATTTCCCTTAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCATTTCTACAAATACCCTATCTATTGTCACATACATTTCCCTTAA  900

seq1  CCCAGACATAAATCCATAGGGAGACACTCATTTCTCTTCTTAATTTTTTT  950
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  -CCAGACATAAATCCATAGGGAGACACTCATTTCTCTTCTTAA-TTTTTT  948

seq1  TTTTTTTATTTTATCACTGACTTTATGGACAAAGAACAAACGGGTCAACT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTATTTTATCACTGACTTTATGGAC-AAGAACAAACGGGTCAACT  997

seq1  GGATTGTTCAGACTTCACACTCCACCCTAGCTCTGTTCTAACCGGACCTG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||
seq2  GGATTGTTCAGACTTCACACTCCACCCTAGCTCTGTTCTTACCGAACTTG  1047

seq1  TGGTGGTGCGGAGGCCAGGCCAGCCCTGCACCGTGGAAAGAACAGGTTGG  1100
       ||||| ||| ||  || | ||  ||| |||||||| |||| |     | 
seq2  -GGTGGGGCGAAG--CAAG-CAATCCTTCACCGTGG-AAGACC-----GT  1087

seq1  GGTGGGGCTGGGCCTCTGCTTCTTTCGGGGAGATAATATGAAGCATT  1147
      ||||||  ||   ||||||||||||||| ||   |||||||||||||
seq2  GGTGGGCTTG---CTCTGCTTCTTTCGGAGA---AATATGAAGCATT  1128

seq1: chr15_40143927_40144932
seq2: B6Ng01-131E14.g_70_1071 (reverse)

seq1  CCAGAGAGGCAAACTGCCCTGAGGATTCTTGGCTAATGAGTGTTAGCACC  50
      |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||
seq2  CCAGAGAGGCAAACTGACCTGAAGAATCTTGGCT-ATGAGTGTTAGCACC  49

seq1  CCATGCTTTGTAAGCTTCCAGCCAGCAATCTCTCTGCTGCAGCATCCTGA  100
      |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGC-TTGTAAGTTCCCAGCCAGCAATCTCTCTGCTGCAGCATCCTGA  98

seq1  GTGTTCTGC-AATATGTCTGTTTATTTTGGTTTGGCTCACTTTTCCACCA  149
      ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCTGCAAATATGTCTGTTTATTT--GGTTGGCTCACTTTTCCACCA  146

seq1  TTTATTTTGTGTCTGGG-AAACAGCTGTGATTTATAACAGAAAACAGGAG  198
      ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTTGTGTCTGGGAAAACAGCTGTGA-TTATAACAGAAAACAGGAG  195

seq1  ACATGCAAGTAATATGAAAGTTTTGTTGTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ACATGCAAGTAATATGAAAGTTTTGTTGTTATTTGTTTGTTTGTTTG-TT  244

seq1  TTTCCAATACAAGGATGTCTTTGATACTTTAAGGATCACAGATTTCAGTG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAATACAAGGATGTCTTTGATACTTTAAGGATCACAGATTTCAGTG  294

seq1  TACCTGGAATACTGGATACTTCTCAAAGGCAAATGAGACCCATGTGGCCT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGGAATACTGGATACTTCTCAAAGGCAAATGAGACCCATGTGGCCT  344

seq1  GAGCCATGACATGGCTTAGAGAAATAACTTAGTGTGAGATACAGAGGGAC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCATGACATGGCTTAGAGAAATAACTTAGTGTGAGATACAGAGGGAC  394

seq1  TGTTTTGGCACACATATTAGTATAACTTCATGTAACACACATACACACAG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTGGCACACATATTAGTATAACTTCATGTAACACACATACACACAG  444

seq1  ACATGTATATAATATGTAAGTATTTACATATTAAACACAACACACACACA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTATATAATATGTAAGTATTTACATATTAAACACAACACACACACA  494

seq1  TATTTTCTTAGGCACTTAACTTAATGGATCCTATGTAAAGATAATCCATT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCTTAGGCACTTAACTTAATGGATCCTATGTAAAGATAATCCATT  544

seq1  TTGAGTGATCATTTATAAGCTTGCAATTCCCATCCTAAACAGGAATCTGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTGATCATTTATAAGCTTGCAATTCCCATCCTAAACAGGAATCTGT  594

seq1  ACCTAGAAATATTTTCTTGGTTATATATCATTTTCCCCCTATAAGTTCAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAGAAATATTTTCTTGGTTATATATCATTTTCCCCCTATAAGTTCAA  644

seq1  AGTTCTTATTGCATGAGCTAAGGTATTTTCCATTTGCTTTTTACTTTCAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTTATTGCATGAGCTAAGGTATTTTCCATTTGCTTTTTACTTTCAG  694

seq1  AAATTCTCAAATCTCATATAAATAAATAGTTGAAGGAAGACTAAATTAAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCTCAAATCTCATATAAATAAATAGTTGAAGGAAGACTAAATTAAG  744

seq1  GGAAAAACAAATCACAGCCCTAATACTTGAAGTGATCTTGATAATTTTTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAACAAATCACAGCCCTAATACTTGAAGTGATCTTGATAATTTTTA  794

seq1  CCTGTCCTGTGCCAAAGGTCTTGGAGTCATGTCACTGCCACTGACCAAAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCCTGTGCCAAAGGTCTTGGAGTCATGTCACTGCCACTGACCAAAA  844

seq1  ATGTAAATGGTTGTAACATTCAGGAGTCTTCAATTCATGGCATGAGGATG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAAATGGTTGTAACATTCAGGAGTCTTCAATTCATGGCATGAGGATG  894

seq1  AACAATAATAGTGGTTAGGTCTCACATATCACTGCAGTGATTCTGAAATG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATAATAGTGGTTAGGTCTCACATATCACTGCAGTGATTCTGAAATG  944

seq1  GCCTCTGACATGTGGTACTCAAAGATAACCAGGATCTCAACAGAACAAAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTGACATGTGGTACTCAAAGATAACCAGGATCTCAACAGAACAAAA  994

seq1  GTGAATTC  1006
      ||||||||
seq2  GTGAATTC  1002