BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-131G24
Chromosome15 (Build37)
Map Location 7,084,301 - 7,121,347
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLifr
Upstream geneDab2, C9, LOC100039396, LOC100039412, Fyb, LOC100039453, EG665511, 4921505C17Rik, Osmr
Downstream geneEgflam, Gdnf, Wdr70, LOC665556, LOC621001, Nup155, 2410089E03Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-131G24.bB6Ng01-131G24.g
ACCDH932494DH932495
length1,0541,001
definitionDH932494|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131G24, 5' end.DH932495|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131G24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,120,286 - 7,121,347)(7,084,301 - 7,085,298)
sequence
gaattccaggccaaccagagctacggagtgagaccatgtctccaaaaccc
ccaaacataaccaaactgacatcagagaacagcaagctgctaagactaaa
ctcaaccaaagacataggagatcgtgtactgccacaatagtctactaagc
gggttgtcgttgtcatgttgtaagaatgagagtcttccattgatctacat
ttgagtctgaatgtgttcagaggagtaaacaattttaaaggttttttttt
aataaatggagaattaacagtatacctttaagggagcaaaacagaacaac
aacaaaaacaaaacaagacaagacagcaaacttgatctggactttatact
agaacctgtcctggaagtttctgactcagtttgcctggtgggaaaggcta
ctgctgcaccgccctgagctgatgaacaccgagccatattccaagcttcc
gctgttgcacacaaaggttgaagcaagactttaaaggttctactccagtg
ccatgcatgataaaatattaaaatgctgtctgaaatcacagcgatggaaa
ccatgtgtctatagtgcataccctcaatttttaacttttctgttgttggg
agatggcgtctaatgtagaccaggtgggtctgggagtggctgaggaggag
ggtgagcttgaagtcctgagcctcctgcttgtactgaggagtggctaggg
atgtattacaggcctgtgtgcctgccactacctaacccatttgggcagtc
ctgggaaatgaccccaaggccagtgctttccccactgagttacttcagaa
caccatatcctcattttttaaaacatttttgctttttcacatgtgtgtgt
gtgcgtgtgtgtgatgtataaagctttattagttcttgttttatgtgtac
cagcgctttgatatatgctgcgtgtgtgcttgtgccggcaggtgccagaa
gaggactcagatcccaggagcctgagttacgaaggtgtgagccactcatg
ggtgccgggaaggaagctggatccttctggagagctgcaagctttctggg
atcc
gaattccagttgtcatacattgtcttgagtaatgctgcatgtgttccttc
tagacacttgcactgcccctgctgacgcaggctgaaggtggtgctcgcaa
gccttgcccactcagtgttgggaggtgaggaggaatttttggcgtatgtt
tttggtttctaatgtacttttgcacggtgggaagtttttggctctccttc
attcttttggcttctaaggctgaataagttggaattagcattcatgtcta
gaatcgagcataatcttgttatgtggtggtatcttgaagggccactaggg
ggcaatatttctttctgaaggtccgtgtgtgtctgggttaagccttcatc
cccgaagcacacacttctgtaagaagttcttagatccaaggacagttgac
acggtggtagcaggaacatctggtggaaaataacaagtgctgacagaagt
acttccctgcttctaacattagaaaacgctaacggggcagatgggttgta
attgtcctgtggacagaaccttgtgagttggctgagccctggtggtggta
ggatgaaggtgagaccgtggcccacacttacatgctgtaacctctggggc
tgtttgagggccactgtggacattagggcgtgatgacaagatgccagctg
ttttgcacgcagcaggcctggaggccccagtgtacttaaatataataaga
aataaatctttttaaaaaattgaggattcaaacaacctagccacagcgtg
gagcttgagagtcagagggccctttcggatccccaagtcagcttctggag
gcccttcttcgggcctttagagcattaaagtgagtaggcgtgaaccattt
gagaaacttctccaaagaaacagttaaagctggtatgtaagttatctgac
tggaactttactccatgcttactccttgaagtaccatgatcatgcagttt
tactgtggtaagaaacaaccaaacaaacatacaaccaaagacagttttag
g
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_7120286_7121347
seq2: B6Ng01-131G24.b_48_1101 (reverse)

seq1  GGAT-CCAGAATACTTGCAGCTCTTCCAGAGGGCT-CAGCTCCCTTCCCG  48
      |||| ||||||  |||||||||| |||||| || | ||||| ||||||||
seq2  GGATCCCAGAAAGCTTGCAGCTC-TCCAGAAGGATCCAGCTTCCTTCCCG  49

seq1  GCACCCATGTGGTGGCTCACAACCTTCCGTAACTCAGGCTCCTGGGGATC  98
      |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||
seq2  GCACCCATG-AGTGGCTCAC-ACCTT-CGTAACTCAGGCTCCT-GGGATC  95

seq1  TGAGGTCCTCTTCTGGCACCTGCCGGCACCAGGCACACACGCAGCATATA  148
      ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
seq2  TGA-GTCCTCTTCTGGCACCTGCCGGCA-CAAGCACACACGCAGCATATA  143

seq1  TTCAAAGCGCTGGTACACATAAAAACAAGAACTAATAAAGCTTTAATACA  198
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  -TCAAAGCGCTGGTACACAT-AAAACAAGAACTAATAAAGCTTT-ATACA  190

seq1  TCACACACACGCACACACACACATGTGAAAAAGCAAAAATGTTTTAAAAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACACACGCACACACACACATGTGAAAAAGCAAAAATGTTTTAAAAA  240

seq1  ATGAGGATATGGTGTTCTGAAGTAACTCAGTGGGGAAAGCACTGGCCTTG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGATATGGTGTTCTGAAGTAACTCAGTGGGGAAAGCACTGGCCTTG  290

seq1  GGGTCATTTCCCAGGACTGCCCAAATGGGTTAGGTAGTGGCAGGCACACA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCATTTCCCAGGACTGCCCAAATGGGTTAGGTAGTGGCAGGCACACA  340

seq1  GGCCTGTAATACATCCCTAGCCACTCCTCAGTACAAGCAGGAGGCTCAGG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGTAATACATCCCTAGCCACTCCTCAGTACAAGCAGGAGGCTCAGG  390

seq1  ACTTCAAGCTCACCCTCCTCCTCAGCCACTCCCAGACCCACCTGGTCTAC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAAGCTCACCCTCCTCCTCAGCCACTCCCAGACCCACCTGGTCTAC  440

seq1  ATTAGACGCCATCTCCCAACAACAGAAAAGTTAAAAATTGAGGGTATGCA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGACGCCATCTCCCAACAACAGAAAAGTTAAAAATTGAGGGTATGCA  490

seq1  CTATAGACACATGGTTTCCATCGCTGTGATTTCAGACAGCATTTTAATAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAGACACATGGTTTCCATCGCTGTGATTTCAGACAGCATTTTAATAT  540

seq1  TTTATCATGCATGGCACTGGAGTAGAACCTTTAAAGTCTTGCTTCAACCT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCATGCATGGCACTGGAGTAGAACCTTTAAAGTCTTGCTTCAACCT  590

seq1  TTGTGTGCAACAGCGGAAGCTTGGAATATGGCTCGGTGTTCATCAGCTCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTGCAACAGCGGAAGCTTGGAATATGGCTCGGTGTTCATCAGCTCA  640

seq1  GGGCGGTGCAGCAGTAGCCTTTCCCACCAGGCAAACTGAGTCAGAAACTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCGGTGCAGCAGTAGCCTTTCCCACCAGGCAAACTGAGTCAGAAACTT  690

seq1  CCAGGACAGGTTCTAGTATAAAGTCCAGATCAAGTTTGCTGTCTTGTCTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACAGGTTCTAGTATAAAGTCCAGATCAAGTTTGCTGTCTTGTCTT  740

seq1  GTTTTGTTTTTGTTGTTGTTCTGTTTTGCTCCCTTAAAGGTATACTGTTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGTTTTTGTTGTTGTTCTGTTTTGCTCCCTTAAAGGTATACTGTTA  790

seq1  ATTCTCCATTTATTAAAAAAAAACCTTTAAAATTGTTTACTCCTCTGAAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTCCATTTATTAAAAAAAAACCTTTAAAATTGTTTACTCCTCTGAAC  840

seq1  ACATTCAGACTCAAATGTAGATCAATGGAAGACTCTCATTCTTACAACAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCAGACTCAAATGTAGATCAATGGAAGACTCTCATTCTTACAACAT  890

seq1  GACAACGACAACCCGCTTAGTAGACTATTGTGGCAGTACACGATCTCCTA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAACGACAACCCGCTTAGTAGACTATTGTGGCAGTACACGATCTCCTA  940

seq1  TGTCTTTGGTTGAGTTTAGTCTTAGCAGCTTGCTGTTCTCTGATGTCAGT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTTGGTTGAGTTTAGTCTTAGCAGCTTGCTGTTCTCTGATGTCAGT  990

seq1  TTGGTTATGTTTGGGGGTTTTGGAGACATGGTCTCACTCCGTAGCTCTGG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTATGTTTGGGGGTTTTGGAGACATGGTCTCACTCCGTAGCTCTGG  1040

seq1  TTGGCCTGGAATTC  1062
      ||||||||||||||
seq2  TTGGCCTGGAATTC  1054

seq1: chr15_7084301_7085298
seq2: B6Ng01-131G24.g_67_1067

seq1  GAATTCCAGTTGTCATACATTGTCTTGAGTAATGCTGCATGTGTTCCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTTGTCATACATTGTCTTGAGTAATGCTGCATGTGTTCCTTC  50

seq1  TAGACACTTGCACTGCCCCTGCTGACGCAGGCTGAAGGTGGTGCTCGCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACACTTGCACTGCCCCTGCTGACGCAGGCTGAAGGTGGTGCTCGCAA  100

seq1  GCCTTGCCCACTCAGTGTTGGGAGGTGAGGAGGAATTTTTGGCGTATGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGCCCACTCAGTGTTGGGAGGTGAGGAGGAATTTTTGGCGTATGTT  150

seq1  TTTGGTTTCTAATGTACTTTTGCACGGTGGGAAGTTTTTGGCTCTCCTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTTTCTAATGTACTTTTGCACGGTGGGAAGTTTTTGGCTCTCCTTC  200

seq1  ATTCTTTTGGCTTCTAAGGCTGAATAAGTTGGAATTAGCATTCATGTCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTTTGGCTTCTAAGGCTGAATAAGTTGGAATTAGCATTCATGTCTA  250

seq1  GAATCGAGCATAATCTTGTTATGTGGTGGTATCTTGAAGGGCCACTAGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCGAGCATAATCTTGTTATGTGGTGGTATCTTGAAGGGCCACTAGGG  300

seq1  GGCAATATTTCTTTCTGAAGGTCCGTGTGTGTCTGGGTTAAGCCTTCATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAATATTTCTTTCTGAAGGTCCGTGTGTGTCTGGGTTAAGCCTTCATC  350

seq1  CCCGAAGCACACACTTCTGTAAGAAGTTCTTAGATCCAAGGACAGTTGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGAAGCACACACTTCTGTAAGAAGTTCTTAGATCCAAGGACAGTTGAC  400

seq1  ACGGTGGTAGCAGGAACATCTGGTGGAAAATAACAAGTGCTGACAGAAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGTGGTAGCAGGAACATCTGGTGGAAAATAACAAGTGCTGACAGAAGT  450

seq1  ACTTCCCTGCTTCTAACATTAGAAAACGCTAACGGGGCAGATGGGTTGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCCTGCTTCTAACATTAGAAAACGCTAACGGGGCAGATGGGTTGTA  500

seq1  ATTGTCCTGTGGACAGAACCTTGTGAGTTGGCTGAGCCCTGGTGGTGGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCCTGTGGACAGAACCTTGTGAGTTGGCTGAGCCCTGGTGGTGGTA  550

seq1  GGATGAAGGTGAGACCGTGGCCCACACTTACATGCTGTAACCTCTGGGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGAAGGTGAGACCGTGGCCCACACTTACATGCTGTAACCTCTGGGGC  600

seq1  TGTTTGAGGGCCACTGTGGACATTAGGGCGTGATGACAAGATGCCAGCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGAGGGCCACTGTGGACATTAGGGCGTGATGACAAGATGCCAGCTG  650

seq1  -TTTGCACGCAGCAGGCCTGGAGGCCCCAGTGTACTTAAATATAATAAGA  699
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCACGCAGCAGGCCTGGAGGCCCCAGTGTACTTAAATATAATAAGA  700

seq1  AATAAATCTTTTTAAAAAATTGAGGATTCAAACAACCTAGCCACAGCGTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATCTTTTTAAAAAATTGAGGATTCAAACAACCTAGCCACAGCGTG  750

seq1  GAGCTTGAGAGTCAGAGGGCCCTTTCGGATCCCCAAGTCAGCTTCTGGAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTGAGAGTCAGAGGGCCCTTTCGGATCCCCAAGTCAGCTTCTGGAG  800

seq1  GCCCTTCTTCGGGCCTTTAGAGCATAAAAGTGAGTAAGGCGTGAA-CATT  848
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||
seq2  GCCCTTCTTCGGGCCTTTAGAGCATTAAAGTGAGT-AGGCGTGAACCATT  849

seq1  TGAGAAACTTCTCCAAAGAAACAGTTAAAGCGGGAATGTAAGTTATCTGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
seq2  TGAGAAACTTCTCCAAAGAAACAGTTAAAGCTGGTATGTAAGTTATCTGA  899

seq1  CTGGAACTTTACCCCATGCTTACTCCTTGAAGGTACCATGATCA-GCAGT  947
      |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
seq2  CTGGAACTTTACTCCATGCTTACTCCTTGAA-GTACCATGATCATGCAGT  948

seq1  TTTACTGTGGTAA-AAACAA-CAAACAAACAAACAAACAAAAACAGTTTT  995
      ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||
seq2  TTTACTGTGGTAAGAAACAACCAAACAAACATACAACCAAAGACAGTTTT  998

seq1  AGG  998
      |||
seq2  AGG  1001