BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-136M06
Chromosome15 (Build37)
Map Location 68,192,135 - 68,374,202
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneZfat1, LOC100041000
Downstream geneEG665945, EG633752, Khdrbs3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-136M06.bB6Ng01-136M06.g
ACCDH936452DH936453
length1,1631,147
definitionDH936452|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136M06, 5' end.DH936453|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136M06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,192,135 - 68,193,335)(68,373,044 - 68,374,202)
sequence
gaattcaactctgtccccaggtaatgtgtgatagccatattcaaggaaac
attcataagccatggagatgccagaattctcttactaaattgtccaacaa
acaaatttcataagtcaaacaacatttactaagtactatttaagcagact
tgaaggtaccctgctctgtaaaattctcattgaactaacaactacttaac
ttgttttgtaaccttaaactttaaaatatccaatttcttaaagtggagga
cagctgctttcctctccccctctacctcactgcagcattactgttttcct
atttcccctcaagcaagctcggaaaactgttagcccctaaccaactgttc
ttatatagtagaatatgcaagcaacaccagcaaatttgaaacataattaa
gtggttttaaagtataagcagaaatgtacttcataaaaaagtcactttat
ttttggcattgttcacaataaacactcaaataaaatgactttggaaaatg
gagacattattatctcaagtttcttccccatgggtcctcatcacctggag
taaaaggtccaagaactgttgagttccataaacacgtgacttctgtgaag
tcagcaaggtcaatgagcctataccagggggttatgttgaataagggcca
ctgcctctatctttagttccctttatgaagagtcaggaaaaccaaacaaa
caaaattccttatatgttacaggaactgtttggaggttgtgacaactaat
cacccaactacaggatagtatgcagatccttgtctgtaagggccagtgga
agcaagattaggaggaggtacaacactgactgctgaggaacaagtaacaa
gatggcctactaaccttcccttcttctccgagaacctccagggctgggct
catgccacaccacagggactcaatttcagagtgaggttctccactgagag
actttttgaaagtgacaatcatatatcagaattaaaggaaagcactcata
tatcagaaatgctcaagtgagaatcaaacttgatttactaagcctctact
tacatcaattacagaggtgtcttcctgcgttcctactataccactacctt
ccaatcgggagtctctaagttaaatacactgcacctgtggacggttttac
tgggggggggggg
gaattccatttcaattccccagtgtcaggattatgtgcccaagtcatgcc
tcaatgagggacaagatgtagctattcctaagaaaatatgatcttggatg
aagctaactctgaagaagctgatagctggaagctgccttctgacttcact
ttgaccagcttctgatcatattctggccctgtccgtgaagtattaccctg
cagttggagcagcctggtgtacctgcgaaccgggcaagggacttccatgg
taaatgtcctaacaatgaacaccagtgatattaaaacatttctgtacgtc
ccagaaaatcatggcaaagctagcactgtagacccagcttcctgaagctt
tccccaccaccacagtttgactctttagatagacaatgcttctttgcagg
acatggtgagatttctgagtgggtatgccagaagcaagcatggccactga
actcccatcaagacaaactttaaagggccttcaatatgtttcctgactca
aagcaatgaaccccacagaagtctcttccttatttctagcttgtgtctcc
aaccatctaactttgcactggaaatatactgcttcttcctgactgcgatc
cccagtgatttataaaggagatgaggaaactcattaggaaacccttgaaa
attaacaagtatgttacctcacagaaataacaaatagtgttctgtgtagg
tgaagtctccacatcaaggcaaaacaggccttttgatctcagcctgtgac
tatgctgcccattcctctctgttccctgcacctcccttcccccctcttct
aatgttaccacctgcactcttgatggttcagttcattttttaagtatatc
tacattcataccagcagtgctgtcttagttagagttttacttctgtgagc
agacacatgaccaaggcaagtcttttaaggacaacatttaattggggctg
gcttacaggttcagaggtccagtccattatcatcagggggaacaggggag
catctagcagcaccgctgcagcagagctgaaagttctacatctttcatct
gaaggctgttagtggaagactgaattcaggcaggctagggtgtggagggc
ttagccaccccagagtgtacacacctattccatcaggttacctttta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_68192135_68193335
seq2: B6Ng01-136M06.b_49_1211

seq1  GAATTCAACTCTGTCCCCAGGTAATGTGTGATAGCCATATTCAAGGAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTCTGTCCCCAGGTAATGTGTGATAGCCATATTCAAGGAAAC  50

seq1  ATTCATAAGCCATGGAGATGCCAGAATTCTCTTACTAAATTGTCCAACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATAAGCCATGGAGATGCCAGAATTCTCTTACTAAATTGTCCAACAA  100

seq1  ACAAATTTCATAAGTCAAACAACATTTACTAAGTACTATTTAAGCAGACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATTTCATAAGTCAAACAACATTTACTAAGTACTATTTAAGCAGACT  150

seq1  TGAAGGTACCCTGCTCTGTAAAATTCTCATTGAACTAACAACTACTTAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGTACCCTGCTCTGTAAAATTCTCATTGAACTAACAACTACTTAAC  200

seq1  TTGTTTTGTAACCTTAAACTTTAAAATATCCAATTTCTTAAAGTGGAGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTGTAACCTTAAACTTTAAAATATCCAATTTCTTAAAGTGGAGGA  250

seq1  CAGCTGCTTTCCTCTCCCCCTCTACCTCACTGCAGCATTACTGTTTTCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGCTTTCCTCTCCCCCTCTACCTCACTGCAGCATTACTGTTTTCCT  300

seq1  ATTTCCCCTCAAGCAAGCTCGGAAAACTGTTAGCCCCTAACCAACTGTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCCCTCAAGCAAGCTCGGAAAACTGTTAGCCCCTAACCAACTGTTC  350

seq1  TTATATAGTAGAATATGCAAGCAACACCAGCAAATTTGAAACATAATTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATAGTAGAATATGCAAGCAACACCAGCAAATTTGAAACATAATTAA  400

seq1  GTGGTTTTAAAGTATAAGCAGAAATGTACTTCATAAAAAAGTCACTTTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTTTAAAGTATAAGCAGAAATGTACTTCATAAAAAAGTCACTTTAT  450

seq1  TTTTGGCATTGTTCACAATAAACACTCAAATAAAATGACTTTGGAAAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGCATTGTTCACAATAAACACTCAAATAAAATGACTTTGGAAAATG  500

seq1  GAGACATTATTATCTCAAGTTTCTTCCCCATGGGTCCTCATCACCTGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACATTATTATCTCAAGTTTCTTCCCCATGGGTCCTCATCACCTGGAG  550

seq1  TAAAAGGTCCAAGAACTGTTGAGTTCCATAAACACGTGACTTCTGTGAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGGTCCAAGAACTGTTGAGTTCCATAAACACGTGACTTCTGTGAAG  600

seq1  TCAGCAAGGTCAATGAGCCTATACCAGGGGGTTATGTTGAATAAGGGCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAAGGTCAATGAGCCTATACCAGGGGGTTATGTTGAATAAGGGCCA  650

seq1  CTGCCTCTATCTTTAGTTCCCTTTATGAAGAGTCAGGAAAACCAAACAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCTATCTTTAGTTCCCTTTATGAAGAGTCAGGAAAACCAAACAAA  700

seq1  CAAAATTCCTTATATGTTACAGGAACTGTTTGGAGGTTGTGACAACTAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTCCTTATATGTTACAGGAACTGTTTGGAGGTTGTGACAACTAAT  750

seq1  CACCCAACTACAGGATAGTATGCAGATCCTTGTCTGTAAGGGCCAGTGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCAACTACAGGATAGTATGCAGATCCTTGTCTGTAAGGGCCAGTGGA  800

seq1  AGCAAGATTAGGAGGAGGTACAACACTGACTGCTGAGGAACAAGTAACAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGATTAGGAGGAGGTACAACACTGACTGCTGAGGAACAAGTAACAA  850

seq1  GATGGCCTACTAACCTTCCCTTCCTTCTCCGAGAACCTCCAGGGCTGGGC  900
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCCTACTAACCTTCCCTT-CTTCTCCGAGAACCTCCAGGGCTGGGC  899

seq1  TTCATGCCACACCACAGGGACTCAATTTCAGAGTGAGGGTTCTCCACTGA  950
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  -TCATGCCACACCACAGGGACTCAATTTCAGAGTGA-GGTTCTCCACTGA  947

seq1  GAGAACTTTTTGAAAGTGACAATCATATATTCAGAATTAAAAGGAAAAGC  1000
      ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||
seq2  GAG-ACTTTTTGAAAGTGACAATCATATA-TCAGAATTAAA--GGAAAGC  993

seq1  ACTCATATATCAGAAATGCTCAGGGTGAGAATCAAAACTTGAATTTACTA  1050
      ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||
seq2  ACTCATATATCAGAAATGCTCA-AGTGAGAATC-AAACTTG-ATTTACTA  1040

seq1  AGCCTTCTAACTTACATCAAATTTACAGAAGGGTGTCCTTCTGGCTGTTC  1100
      |||| ||| |||||||||||  |||||||  |||||| | |||   ||||
seq2  AGCC-TCT-ACTTACATCAA--TTACAGA--GGTGTCTTCCTG--CGTTC  1082

seq1  CTTCACTATAACCCACTACACCTTTCACAAACCGGGGAGTCTTCTAAAGT  1150
      ||  ||||||  |||||  |||||   | || | ||||||| ||| ||||
seq2  CT--ACTATA--CCACT--ACCTT---CCAATC-GGGAGTC-TCT-AAGT  1120

seq1  TTAATATACACCTGGCACCTGTTTAGACTGGTTTTTACTGGGGGGGGGGG  1200
      | |||| ||     |||||||  | |||  | ||||||||||||||||||
seq2  TAAATACAC----TGCACCTG--TGGAC--GGTTTTACTGGGGGGGGGGG  1162

seq1  G  1201
      |
seq2  G  1163

seq1: chr15_68373044_68374202
seq2: B6Ng01-136M06.g_69_1215 (reverse)

seq1  TAAAAGGTGTAACCTTGATGGAATAGGTGTGT-CACTCTGGGTGTGGGCT  49
      ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   
seq2  TAAAAG--GTAACC-TGATGGAATAGGTGTGTACACTCTGGG-GTGG--C  44

seq1  TAAGACCCTCACACCCTAG-CTGCCTGGAAATCAGTCTTCCACTAACAGC  98
      |||| ||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||
seq2  TAAGCCCTCCACACCCTAGCCTGCCT-GAATTCAGTCTTCCACTAACAGC  93

seq1  CTTCAGATG-AAGATGTAGAACTCTCAGCTCTGCCTGCAGCGTGGCTGCC  147
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |
seq2  CTTCAGATGAAAGATGTAGAACTTTCAGCTCTG-CTGCAGCGGTGCTG-C  141

seq1  TAGATGCTCCCCTGTTCCCACCTTGATGATAATGGACTGGACCTCTGAAC  197
      ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGCTCCCCTGTTCC--CCCTGATGATAATGGACTGGACCTCTGAAC  189

seq1  CTGTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTGTCCTTTATAAGACTTGCCTTGGT  247
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
seq2  CTGTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTGTCC-TTAAAAGACTTGCCTTGGT  238

seq1  CATGGTGTCTGCTCACAGAAGTAAAACTCTAACTAAGACAGCACTGCTGG  297
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAT-GTGTCTGCTCACAGAAGTAAAACTCTAACTAAGACAGCACTGCTGG  287

seq1  TATGAAATGTAGATATACTTAAAAAATGAACTGAACCATCAAGAGTGCAG  347
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATG-AATGTAGATATACTTAAAAAATGAACTGAACCATCAAGAGTGCAG  336

seq1  GTGGTAACATTAGAAGAGGGGGGAAGGGAGGTGCAGGGAACAGAGAGGAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTAACATTAGAAGAGGGGGGAAGGGAGGTGCAGGGAACAGAGAGGAA  386

seq1  TGGGCAGCATAGTCACAGGCCTGAGATCAAAAGGCCTGTTTTGCCTTGAT  447
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCAGCATAGTCACAGG-CTGAGATCAAAAGGCCTGTTTTGCCTTGAT  435

seq1  GTGGAGACTTCACCTACACAGAACACTATTTGTTATTTCTGTGAGGTAAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAGACTTCACCTACACAGAACACTATTTGTTATTTCTGTGAGGTAAC  485

seq1  ATACTTGTTAATTTTCAAGGGTTTCCTAATGAGTTTCCTCATCTCCTTTA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTGTTAATTTTCAAGGGTTTCCTAATGAGTTTCCTCATCTCCTTTA  535

seq1  TAAATCACTGGGGATCGCAGTCAGGAAGAAGCAGTATATTTCCAGTGCAA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATCACTGGGGATCGCAGTCAGGAAGAAGCAGTATATTTCCAGTGCAA  585

seq1  AGTTAGATGGTTGGAGACACAAGCTAGAAATAAGGAAGAGACTTCTGTGG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAGATGGTTGGAGACACAAGCTAGAAATAAGGAAGAGACTTCTGTGG  635

seq1  GGTTCATTGCTTTGAGTCAGGAAACATATTGAAGGCCCTTTAAAGTTTGT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCATTGCTTTGAGTCAGGAAACATATTGAAGGCCCTTTAAAGTTTGT  685

seq1  CTTGATGGGAGTTCAGTGGCCATGCTTGCTTCTGGCATACCCACTCAGAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATGGGAGTTCAGTGGCCATGCTTGCTTCTGGCATACCCACTCAGAA  735

seq1  ATCTCACCATGTCCTGCAAAGAAGCATTGTCTATCTAAAGAGTCAAACTG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCACCATGTCCTGCAAAGAAGCATTGTCTATCTAAAGAGTCAAACTG  785

seq1  TGGTGGTGGGGAAAGCTTCAGGAAGCTGGGTCTACAGTGCTAGCTTTGCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGTGGGGAAAGCTTCAGGAAGCTGGGTCTACAGTGCTAGCTTTGCC  835

seq1  ATGATTTTCTGGGACGTACAGAAATGTTTTAATATCACTGGTGTTCATTG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTTTCTGGGACGTACAGAAATGTTTTAATATCACTGGTGTTCATTG  885

seq1  TTAGGACATTTACCATGGAAGTCCCTTGCCCGGTTCGCAGGTACACCAGG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGACATTTACCATGGAAGTCCCTTGCCCGGTTCGCAGGTACACCAGG  935

seq1  CTGCTCCAACTGCAGGGTAATACTTCACGGACAGGGCCAGAATATGATCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCCAACTGCAGGGTAATACTTCACGGACAGGGCCAGAATATGATCA  985

seq1  GAAGCTGGTCAAAGTGAAGTCAGAAGGCAGCTTCCAGCTATCAGCTTCTT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTGGTCAAAGTGAAGTCAGAAGGCAGCTTCCAGCTATCAGCTTCTT  1035

seq1  CAGAGTTAGCTTCATCCAAGATCATATTTTCTTAGGAATAGCTACATCTT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTTAGCTTCATCCAAGATCATATTTTCTTAGGAATAGCTACATCTT  1085

seq1  GTCCCTCATTGAGGCATGACTTGGGCACATAATCCTGACACTGGGGAATT  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTCATTGAGGCATGACTTGGGCACATAATCCTGACACTGGGGAATT  1135

seq1  GAAATGGAATTC  1159
      ||||||||||||
seq2  GAAATGGAATTC  1147