BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-137K20
Chromosome15 (Build37)
Map Location 86,808,543 - 86,913,753
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCelsr1, BC021523, Cerk, LOC100042300, Tbc1d22a, LOC100042309
Downstream geneAW049604, LOC100042329, LOC100042340
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-137K20.bB6Ng01-137K20.g
ACCDH937133DH937134
length9941,085
definitionDH937133|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137K20, 5' end.DH937134|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137K20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,912,756 - 86,913,753)(86,808,543 - 86,809,624)
sequence
gaattcaaattgaggtgtaggcgaatcaaaagtttaaagctcaaatcaat
gaagttgtctcaaacttaattgcctcttggttatctaacacttcctcttc
tcgggcaggctacagggagagatcactcgacaagtcccagcgcactgtgc
agatgagtgatggcagagatagagtacaggaagggcagagggcaggctgc
ctataacctcattcagggaacgcaatggtgagtagacagacagaacacaa
gagggtcatgcagacatacagataaagacgtgctcttccgagttcttcct
accgtgcctggttgtctctgcccagcctggggctggttttggttattccg
cgcacagtaggtctttaccagttaatattcttgatcaaacaaaataccca
acacaagcaacttagggacctgcaatcatggatctgtacagcacatctca
gcccacagctctgcctgcctcctgggaggcctgctcccaccctggccaat
cggacagaagcctagcataactgtcctctgagagactccacccagcagct
gactgaaacagatggagagactcacagtctaacattgggcagaacttggg
aactcttatagaagaattgtgggaaagattgagggtcccaaagtggttag
gaacttcgcagaaagaccaacagagccaatgagtcccctttgggggctct
cagagactaagccatcaagcaaagatcactcacaggctgaggctcctggc
acatatgtagcagatgtacagttcagtcttcatgtggattctcccaacaa
ctggagcggaggctatccctaaagctgtagcctatctgtggaatccattc
ccctgactgggcttccttgtctggcctcagtgggagaagatgtgcctatg
ccagcagagacttgatgcagggggatactcagagagagcctccatcctct
cagagtagaggggaggaggcaggcattgcagagagggatggggc
gaattcctataatcaccctgggttgggtaacatgctcagcttgatcatcg
gaagaacccttacaaatccatggttgaaatgaaactacttagaaatcagg
ggagtgggttgggatggtgactgattctgttaagtattttccatgcaaca
tgagcgcctgcatatattccccagaatccacatttaaaaagcctggtata
gctgagtaggtttgtaatcccaatgttggggaaatggtagatccctgggc
ctggttggccagacagcctgactatttggtgagtttcaagacaaggagag
accctgtctcaaccaaaccaaaccaaaccaaaccaaaccaaaccaaacca
aaccaaaccaaaccaaaaaacaaaacaaaacaaaacaaccaaaaaaaaaa
aaaaaccaacccaaaacccaataaaaacaaggttgagacatttctgaggt
gggatatctctggactttgcatgcacagacatacttggagatgtacccgt
acatacatgtgaacccactagaacatggcactgctcccccattcacaaga
gagattaatttcttcaggtctagggagagtccacattttaggaaattttg
actttggatttacttttactttattatgatgtgaaaacatcatatagcag
acagatatcaggctgtaaaatttgttaacctttccccatgcttgcagtgt
acagcaagcagcatcctcccgcgcagctctgagtgacagtaacaagctgg
agtcttacatccagtcactaatatgaagacagagcactgtgctcagcacg
tgtggtgtgctgtgtggcgggccacgatgcttagtatgccagccctcttc
catgcattttgacacacacttaaagtccagggagcagctggtaccagcaa
taaagaatgcaccccagttgccacatgaccaccaagaagtgaactcagcc
tagtggggagttgatgtaactttggtacttcctgaacaaaagatgagact
ctcagggtggcatcaaggaagaagaacaggtggttatatggcggagacat
tttaaatgctacagcattcccagcgggtactgaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_86912756_86913753
seq2: B6Ng01-137K20.b_48_1041 (reverse)

seq1  GCCCCATCCCCTCTCCTGCAATGCCTGCCTCCTCCCCTTCTACTCTGAGA  50
      ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GCCCCAT-CCCTCT-CTGCAATGCCTGCCTCCTCCCC-TCTACTCTGAGA  47

seq1  GGGTGGAGGCTCTCTCTGGGTATCCCCCCTGCATCAAGTCTCTGCTGGCA  100
      || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGAGGCTCTCTCTGAGTAT-CCCCCTGCATCAAGTCTCTGCTGGCA  96

seq1  TAGGCACATCTTCTCCCACTGAGGCCAGACAAGGAAGCCCAGTCAGGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCACATCTTCTCCCACTGAGGCCAGACAAGGAAGCCCAGTCAGGGGA  146

seq1  ATGGATTCCACAGATAGGCTACAGCTTTAGGGATAGCCTCCGCTCCAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATTCCACAGATAGGCTACAGCTTTAGGGATAGCCTCCGCTCCAGTT  196

seq1  GTTGGGAGAATCCACATGAAGACTGAACTGTACATCTGCTACATATGTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGGAGAATCCACATGAAGACTGAACTGTACATCTGCTACATATGTGC  246

seq1  CAGGAGCCTCAGCCTGTGAGTGATCTTTGCTTGATGGCTTAGTCTCTGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGCCTCAGCCTGTGAGTGATCTTTGCTTGATGGCTTAGTCTCTGAG  296

seq1  AGCCCCCAAAGGGGACTCATTGGCTCTGTTGGTCTTTCTGCGAAGTTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCCAAAGGGGACTCATTGGCTCTGTTGGTCTTTCTGCGAAGTTCCT  346

seq1  AACCACTTTGGGACCCTCAATCTTTCCCACAATTCTTCTATAAGAGTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACTTTGGGACCCTCAATCTTTCCCACAATTCTTCTATAAGAGTTCC  396

seq1  CAAGTTCTGCCCAATGTTAGACTGTGAGTCTCTCCATCTGTTTCAGTCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTCTGCCCAATGTTAGACTGTGAGTCTCTCCATCTGTTTCAGTCAG  446

seq1  CTGCTGGGTGGAGTCTCTCAGAGGACAGTTATGCTAGGCTTCTGTCCGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGGGTGGAGTCTCTCAGAGGACAGTTATGCTAGGCTTCTGTCCGAT  496

seq1  TGGCCAGGGTGGGAGCAGGCCTCCCAGGAGGCAGGCAGAGCTGTGGGCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCAGGGTGGGAGCAGGCCTCCCAGGAGGCAGGCAGAGCTGTGGGCTG  546

seq1  AGATGTGCTGTACAGATCCATGATTGCAGGTCCCTAAGTTGCTTGTGTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTGCTGTACAGATCCATGATTGCAGGTCCCTAAGTTGCTTGTGTTG  596

seq1  GGTATTTTGTTTGATCAAGAATATTAACTGGTAAAGACCTACTGTGCGCG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTTTGTTTGATCAAGAATATTAACTGGTAAAGACCTACTGTGCGCG  646

seq1  GAATAACCAAAACCAGCCCCAGGCTGGGCAGAGACAACCAGGCACGGTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAACCAAAACCAGCCCCAGGCTGGGCAGAGACAACCAGGCACGGTAG  696

seq1  GAAGAACTCGGAAGAGCACGTCTTTATCTGTATGTCTGCATGACCCTCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACTCGGAAGAGCACGTCTTTATCTGTATGTCTGCATGACCCTCTT  746

seq1  GTGTTCTGTCTGTCTACTCACCATTGCGTTCCCTGAATGAGGTTATAGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCTGTCTGTCTACTCACCATTGCGTTCCCTGAATGAGGTTATAGGC  796

seq1  AGCCTGCCCTCTGCCCTTCCTGTACTCTATCTCTGCCATCACTCATCTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGCCCTCTGCCCTTCCTGTACTCTATCTCTGCCATCACTCATCTGC  846

seq1  ACAGTGCGCTGGGACTTGTCGAGTGATCTCTCCCTGTAGCCTGCCCGAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGCGCTGGGACTTGTCGAGTGATCTCTCCCTGTAGCCTGCCCGAGA  896

seq1  AGAGGAAGTGTTAGATAACCAAGAGGCAATTAAGTTTGAGACAACTTCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAAGTGTTAGATAACCAAGAGGCAATTAAGTTTGAGACAACTTCAT  946

seq1  TGATTTGAGCTTTAAACTTTTGATTCGCCTACACCTCAATTTGAATTC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTGAGCTTTAAACTTTTGATTCGCCTACACCTCAATTTGAATTC  994

seq1: chr15_86808543_86809624
seq2: B6Ng01-137K20.g_67_1151

seq1  GAATTCCTATAATCACCCTGGGTTGGGTAACATGCTCAGCTTGATCATCG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTATAATCACCCTGGGTTGGGTAACATGCTCAGCTTGATCATCG  50

seq1  GAAGAACCCTTACAAATCCATGGTTGAAATGAAACTACTTAGAAATCAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACCCTTACAAATCCATGGTTGAAATGAAACTACTTAGAAATCAGG  100

seq1  GGAGTGGGTTGGGATGGTGACTGATTCTGTTAAGTATTTTCCATGCAACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGGGTTGGGATGGTGACTGATTCTGTTAAGTATTTTCCATGCAACA  150

seq1  TGAGCGCCTGCATATATTCCCCAGAATCCACATTTAAAAAGCCTGGTATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCGCCTGCATATATTCCCCAGAATCCACATTTAAAAAGCCTGGTATA  200

seq1  GCTGAGTAGGTTTGTAATCCCAATGTTGGGGAAATGGTAGATCCCTGGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGTAGGTTTGTAATCCCAATGTTGGGGAAATGGTAGATCCCTGGGC  250

seq1  CTGGTTGGCCAGACAGCCTGACTATTTGGTGAGTTTCAAGACAAGGAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTGGCCAGACAGCCTGACTATTTGGTGAGTTTCAAGACAAGGAGAG  300

seq1  ACCCTGTCTCAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGTCTCAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAACCA  350

seq1  AACCAAACCAAACCAAAAAACAAAACAAAACAAAACAACCAAAAAAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAAACCAAACCAAAAAACAAAACAAAACAAAACAACCAAAAAAAAAA  400

seq1  AAAAACCAACCCAAAACCCAATAAAAACAAGGTTGAGACATTTCTGAGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACCAACCCAAAACCCAATAAAAACAAGGTTGAGACATTTCTGAGGT  450

seq1  GGGATATCTCTGGACTTTGCATGCACAGACATACTTGGAGATGTACCCGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATATCTCTGGACTTTGCATGCACAGACATACTTGGAGATGTACCCGT  500

seq1  ACATACATGTGAACCCACTAGAACATGGCACTGCTCCCCCATTCACAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACATGTGAACCCACTAGAACATGGCACTGCTCCCCCATTCACAAGA  550

seq1  GAGATTAATTTCTTCAGGTCTAGGGAGAGTCCACATTTTAGGAAATTTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTAATTTCTTCAGGTCTAGGGAGAGTCCACATTTTAGGAAATTTTG  600

seq1  ACTTTGGATTTACTTTTACTTTATTATGATGTGAAAACATCATATAGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGGATTTACTTTTACTTTATTATGATGTGAAAACATCATATAGCAG  650

seq1  ACAGATATCAGGCTGTAAAATTTGTTAACCTTTCCCCATGCTTGCAGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATATCAGGCTGTAAAATTTGTTAACCTTTCCCCATGCTTGCAGTGT  700

seq1  ACAGCAAGCAGCATCCTCCCGCGCAGCTCTGAGTGACAGTAACAAGCTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAAGCAGCATCCTCCCGCGCAGCTCTGAGTGACAGTAACAAGCTGG  750

seq1  AGTCTTACATCCAGTCACTAATATGAAGACAGAGCACTGTGCTCAGCACG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTACATCCAGTCACTAATATGAAGACAGAGCACTGTGCTCAGCACG  800

seq1  TGTGGTGTGCTGTGTGGCGGGCCACGATGCTTAGTATGCCAGCCCTCTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGTGCTGTGTGGCGGGCCACGATGCTTAGTATGCCAGCCCTCTTC  850

seq1  AATGCATTTTGACACACACTT-AAGTCCA-GGAGCAGCT-GTACCAGCAA  897
       |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  CATGCATTTTGACACACACTTAAAGTCCAGGGAGCAGCTGGTACCAGCAA  900

seq1  TAAAG-ATGCA-CACAGTTGCCACATGA-CACCAAG-AGTGAACTCAGCC  943
      ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
seq2  TAAAGAATGCACCCCAGTTGCCACATGACCACCAAGAAGTGAACTCAGCC  950

seq1  TAGTTGGGAGTTGATGTAACTTT-GTACATCCTGAACAAAAAGAATGAGA  992
      |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||
seq2  TAGTGGGGAGTTGATGTAACTTTGGTACTTCCTGAACAAAA--GATGAGA  998

seq1  CTCCCA-GGTGCAATCAGGGAAGAGAAACAAGGGTGTTATAATGC-GAGA  1040
      ||| || ||||  |||| ||||||  ||| |||  ||||||  || ||||
seq2  CTCTCAGGGTGGCATCAAGGAAGAAGAAC-AGGTGGTTATATGGCGGAGA  1047

seq1  CATTTTAAATGCCAGCGAGCATTTCCCAGCCGGGTACTGAGA  1082
      |||||||||||| |   |||| ||||||| ||||||||||||
seq2  CATTTTAAATGCTA--CAGCA-TTCCCAG-CGGGTACTGAGA  1085