BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-147H12
Chromosome15 (Build37)
Map Location 94,848,528 - 94,968,082
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmem117, LOC100043315
Upstream geneD630010B17Rik, Adamts20, Pus7l, Irak4, Twf1
Downstream geneNell2, Dbx2, LOC100042684, LOC667849, EG629300, LOC667864, Tmem16f, LOC100043329, D030018L15Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-147H12.bB6Ng01-147H12.g
ACCDH944343DH944344
length1,081781
definitionDH944343|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147H12, 5' end.DH944344|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147H12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(94,848,528 - 94,849,615)(94,967,305 - 94,968,082)
sequence
gaattctccaaagaaggaatgatgagcagaattctccaatgtccatcagg
aacaataatgggtgaggtgggcaatggcagagaccattgggcctgatggt
gtatgtccattcttcagtactcatcactcagagatgctttacatctcttt
aactggactccggtgaattgctaagagagactattatagtgatgattaaa
ttgctaactagactgatgtaatctattggcagctgcttaacccaggaagc
agaggaaaaaatgggaagagatctgtgaatgtatacataggtgcacttat
acagcttagacactgtggaaccccaagctagcattgcttagttaaccatt
agctgtcatctgggtagtagagcaagatgatgaagagtctgggtactgaa
atccggcttccatgaatgcaaccccaggtgtggcctttcatagccgtgtg
atttggataccgggtacttactgaagctggccttatcctggttggttatg
gctcaagattccgtggaattctccttcaatattggtgctccgaaggatta
actgtacaatgagggagtgttcagacatccagaaatagtgcaaatatgca
tcacactgaagtcatatcattgacaggattcacaagataattgggggaaa
aatttgtatagcttcctaaggataaggatgagccaacttgagttctaagc
aatatgtgctttgaaaccaatgattgttctaagaaagtttcccttaaacc
ttgagaatgctttaggcatgagccagactaaaggaaggcaggcaagagac
taggcttatagctcagtggcagagttcctgttgagcatgtgtaggcccct
aggtttcatgcctagcaccatacacaaacagtaagatcccgtctctgtag
gaaaaggaggggggtaggtttacatgggtgactaattacgacatattagg
gtctcactaacatagcagtagtagaacccaccagaaaacatttcctgatt
agaaataaaaatacagatccctttaagagaggttggaagatgcctcagat
actttaaccgcattacagcttggatggttcc
gaattccatttggaccttcaacagattgcatgagatgcccacccacattg
ggatgggcgatctgctttattcagactgttggtgtaaaatgttaatcctg
ccaaagacaccttcagagaaacacttaaaatagttgttgactgaatgttt
ggcttaataaacagacataaaattaaccatcacagcaacaaacctgctga
gaaaattaagatagaaactggctacaagagacccaccaatgggattccca
cagccctttgtcgtctgacacaggctgggagcaagtgggaattcattatt
gtatccagcagctccttgtttctttatatgtaaggcttgtcacataacag
catgctcggcctgggggacgcaatggagagctgaacggctcttatcctgt
ggccattttccctgctgtagagatgccgtaatcagtggcttgcagacaca
gaatctgacacactgtacttggcaatggtgacagaaaagtacaaaagagc
cacagcctgggagccgagtagcagttacagaaggtctccttgaccgagtg
gggcatcagctgaggcttcagggaaaggggggtgggggggcaaaatacag
gagagaagaaaggaagctggcatttgctcagcaggcatgttttttggcaa
ttggactaattctctgaggtgaccagaaaaaaaaaatctaacctcgtgaa
tctttttagtccactgaggggcagaggtgaggtggagacacatacacatg
ataagctgcattatgactggggtacttgaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_94848528_94849615
seq2: B6Ng01-147H12.b_47_1127

seq1  GAATTCTCCAAAGAAGGAATGATGAGCAGAATTCTCCAATGTCCATCAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCAAAGAAGGAATGATGAGCAGAATTCTCCAATGTCCATCAGG  50

seq1  AACAATAATGGGTGAGGTGGGCAATGGCAGAGACCATTGGGCCTGATGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATAATGGGTGAGGTGGGCAATGGCAGAGACCATTGGGCCTGATGGT  100

seq1  GTATGTCCATTCTTCAGTACTCATCACTCAGAGATGCTTTACATCTCTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTCCATTCTTCAGTACTCATCACTCAGAGATGCTTTACATCTCTTT  150

seq1  AACTGGACTCCGGTGAATTGCTAAGAGAGACTATTATAGTGATGATTAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGACTCCGGTGAATTGCTAAGAGAGACTATTATAGTGATGATTAAA  200

seq1  TTGCTAACTAGACTGATGTAATCTATTGGCAGCTGCTTAACCCAGGAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTAACTAGACTGATGTAATCTATTGGCAGCTGCTTAACCCAGGAAGC  250

seq1  AGAGGAAAAAATGGGAAGAGATCTGTGAATGTATACATAGGTGCACTTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAAAAAATGGGAAGAGATCTGTGAATGTATACATAGGTGCACTTAT  300

seq1  ACAGCTTAGACACTGTGGAACCCCAAGCTAGCATTGCTTAGTTAACCATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTTAGACACTGTGGAACCCCAAGCTAGCATTGCTTAGTTAACCATT  350

seq1  AGCTGTCATCTGGGTAGTAGAGCAAGATGATGAAGAGTCTGGGTACTGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTCATCTGGGTAGTAGAGCAAGATGATGAAGAGTCTGGGTACTGAA  400

seq1  ATCCGGCTTCCATGAATGCAACCCCAGGTGTGGCCTTTCATAGCCGTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCGGCTTCCATGAATGCAACCCCAGGTGTGGCCTTTCATAGCCGTGTG  450

seq1  ATTTGGATACCGGGTACTTACTGAAGCTGGCCTTATCCTGGTTGGTTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGATACCGGGTACTTACTGAAGCTGGCCTTATCCTGGTTGGTTATG  500

seq1  GCTCAAGATTCCGTGGAATTCTCCTTCAATATTGGTGCTCCGAAGGATTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAAGATTCCGTGGAATTCTCCTTCAATATTGGTGCTCCGAAGGATTA  550

seq1  ACTGTACAATGAGGGAGTGTTCAGACATCCAGAAATAGTGCAAATATGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTACAATGAGGGAGTGTTCAGACATCCAGAAATAGTGCAAATATGCA  600

seq1  TCACACTGAAGTCATATCATTGACAGGATTCACAAGATAATTGGGGGAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACTGAAGTCATATCATTGACAGGATTCACAAGATAATTGGGGGAAA  650

seq1  AATTTGTATAGCTTCCTAAGGATAAGGATGAGCCAACTTGAGTTCTAAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGTATAGCTTCCTAAGGATAAGGATGAGCCAACTTGAGTTCTAAGC  700

seq1  AATATGTGC-TTGAAACCAATGATTGTTCTAAGAAAGTTTCCCTTAAACC  749
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGTGCTTTGAAACCAATGATTGTTCTAAGAAAGTTTCCCTTAAACC  750

seq1  TTGAGAATGCTTTAGGCATGAGCCAGACTAAAGGAAGGCAGGCAAGAGAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAATGCTTTAGGCATGAGCCAGACTAAAGGAAGGCAGGCAAGAGAC  800

seq1  TAGGCTTATAGCTCAGTGGCAGAGTTCCTGTTGAGCATGTGTAGGCCCCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTTATAGCTCAGTGGCAGAGTTCCTGTTGAGCATGTGTAGGCCCCT  850

seq1  AGGTTTCATGCCTAGCACCATACACAAACAGTAAGATCCCGTCTCTGTAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTCATGCCTAGCACCATACACAAACAGTAAGATCCCGTCTCTGTAG  900

seq1  GAAAAGGAGGGGGGTAGGTTTACAT-GGTGACATATATATGACATATTAA  948
      ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  || |||||||| |
seq2  GAAAAGGAGGGGGGTAGGTTTACATGGGTGAC-TAATTACGACATATT-A  948

seq1  GGGTCTCACTAACATAGCAGTAGTAGAAACACACAGAAAACATTTCCTGA  998
      |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||
seq2  GGGTCTCACTAACATAGCAGTAGTAGAACCCACCAGAAAACATTTCCTGA  998

seq1  TTAGAAATAAAAATAACAGTATCCCTTTAAGGAGAGGTTGGAAGAATGCC  1048
      |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||
seq2  TTAGAAATAAAAAT-ACAG-ATCCCTTTAA-GAGAGGTTGGAAG-ATGCC  1044

seq1  TCAGGATGACTTTAACAGCATTTCCAGCTGTGATGGTTCC  1088
      ||| ||| |||||||| ||| || |||||  |||||||||
seq2  TCA-GAT-ACTTTAACCGCA-TTACAGCTTGGATGGTTCC  1081

seq1: chr15_94967305_94968082
seq2: B6Ng01-147H12.g_68_848 (reverse)

seq1  TTTC-AGTA-CCCAGTCATAATGCAGCTTATCATGTGTATGTGTCTCCAC  48
      |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAGTACCCCAGTCATAATGCAGCTTATCATGTGTATGTGTCTCCAC  50

seq1  CTCACCTCTGCCCCTCAGTGGACT-ACAAGATTCACGAGGTTAGATTTTT  97
      |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCTCTGCCCCTCAGTGGACTAAAAAGATTCACGAGGTTAGATTTTT  100

seq1  TTTTTCTGGTCACCTCAGAGAATTAGTCCAATTGCCAAAAAACATGCCTG  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTGGTCACCTCAGAGAATTAGTCCAATTGCCAAAAAACATGCCTG  150

seq1  CTGAGCAAATGCCAGCTTCCTTTCTTCTCTCCTGTATTTTGCCCCCCCAC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCAAATGCCAGCTTCCTTTCTTCTCTCCTGTATTTTGCCCCCCCAC  200

seq1  CCCCCTTTCCCTGAAGCCTCAGCTGATGCCCCACTCGGTCAAGGAGACCT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTTTCCCTGAAGCCTCAGCTGATGCCCCACTCGGTCAAGGAGACCT  250

seq1  TCTGTAACTGCTACTCGGCTCCCAGGCTGTGGCTCTTTTGTACTTTTCTG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTAACTGCTACTCGGCTCCCAGGCTGTGGCTCTTTTGTACTTTTCTG  300

seq1  TCACCATTGCCAAGTACAGTGTGTCAGATTCTGTGTCTGCAAGCCACTGA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCATTGCCAAGTACAGTGTGTCAGATTCTGTGTCTGCAAGCCACTGA  350

seq1  TTACGGCATCTCTACAGCAGGGAAAATGGCCACAGGATAAGAGCCGTTCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACGGCATCTCTACAGCAGGGAAAATGGCCACAGGATAAGAGCCGTTCA  400

seq1  GCTCTCCATTGCGTCCCCCAGGCCGAGCATGCTGTTATGTGACAAGCCTT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCCATTGCGTCCCCCAGGCCGAGCATGCTGTTATGTGACAAGCCTT  450

seq1  ACATATAAAGAAACAAGGAGCTGCTGGATACAATAATGAATTCCCACTTG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATAAAGAAACAAGGAGCTGCTGGATACAATAATGAATTCCCACTTG  500

seq1  CTCCCAGCCTGTGTCAGACGACAAAGGGCTGTGGGAATCCCATTGGTGGG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAGCCTGTGTCAGACGACAAAGGGCTGTGGGAATCCCATTGGTGGG  550

seq1  TCTCTTGTAGCCAGTTTCTATCTTAATTTTCTCAGCAGGTTTGTTGCTGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTGTAGCCAGTTTCTATCTTAATTTTCTCAGCAGGTTTGTTGCTGT  600

seq1  GATGGTTAATTTTATGTCTGTTTATTAAGCCAAACATTCAGTCAACAACT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTTAATTTTATGTCTGTTTATTAAGCCAAACATTCAGTCAACAACT  650

seq1  ATTTTAAGTGTTTCTCTGAAGGTGTCTTTGGCAGGATTAACATTTTACAC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAAGTGTTTCTCTGAAGGTGTCTTTGGCAGGATTAACATTTTACAC  700

seq1  CAACAGTCTGAATAAAGCAGATCGCCCATCCCAATGTGGGTGGGCATCTC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGTCTGAATAAAGCAGATCGCCCATCCCAATGTGGGTGGGCATCTC  750

seq1  ATGCAATCTGTTGAAGGTCCAAATGGAATTC  778
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATCTGTTGAAGGTCCAAATGGAATTC  781