BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158C13
Chromosome15 (Build37)
Map Location 63,815,191 - 63,966,652
singlet/doubletdoublet
Overlap gene0910001A06Rik, Ddef1
Upstream geneEG239502, EG432959, LOC672194, Mlze, AI987692, Gsdmdc2, 9930109F21Rik, LOC665769, 9030605I04Rik, 4933426G20Rik
Downstream geneAdcy8, LOC268812
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158C13.bB6Ng01-158C13.g
ACCDH952189DH952190
length1,1811,117
definitionDH952189|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158C13, 5' end.DH952190|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158C13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,815,191 - 63,816,378)(63,965,531 - 63,966,652)
sequence
gaattctttgcagtgatggggctaaaactctacgcctcaaaaatgccagg
cgaggcctatgtccctgagctagccctaaagcaacctaaattttagtttt
gacaactgctacctgcaacacaaggtcacacagttctgaaacatacattt
tctgatatggaaaatggaattaatagttttcctgtagcactatgcaaaga
ttaatgagctttggtaaaaatgcacttttagcatttagcaaaaacaaaac
aaagaattcaatgaactgatgctatggttagcaatactgattaaacattt
acttttttcctgatgctggaacaggttccagaaacacacaggtcagaaat
agcccctccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatttaccctaaaagagt
tactgttgaaattttatatagacagacagaggtaagttcatgataatctg
tcaacactagtttcgtagtttgaataggaatgctggccaacccccatagg
ctcagatttgaatttttggtcattagagagtggcattacttgatagggac
tagaaggtatgaaggccttgttagaggaagtgtgttgtcaccagctttgg
ggtttcaagtgctcatgccaggcccaatttttgttttttgttttgggttt
ttttttaatgttttttttttcctcccatctctcttcctactgactacaga
tctaaatgtataactctcaactactctcaccatgtctacctgcaagctgt
tgtgcttcccaccatgatgacaatgaactaaacctctgaatgccaatcaa
gctccaatgaaatgttttcttacataacagctgccatagtcatagtgtct
cttcatagcaatggaacttttgactaagaacaactagattaacagaacag
actacagttataacaaacttagaaaacaagacagtactatagtaagtcaa
gaacacattcaaagtataggctgaggatccacttgttacatcactccatg
aaatgtccattctttctgatgaatgttgaaatcagaatccatttattgtt
attgcattcctaaagcacaatgcctctggtacctgcagacctcagatggt
acaattatgggaatcatgtactagcaacttgatagaagagacttgaagaa
attggcttattctatgtcttaagttcaaaga
gaattctgttcaggcctgtttgcctcactcacttctcctcccactcctgt
ttccctgagtactgtactctgtctgatctcagactctgataggaactctg
aaagagaacaagaaatggaccacaagtgagtcaagatgggacagcagagg
agctagggaaggcgagcgagctgccaagagttagaggaagcagtgagaac
cagacagagacagaacacaggacttggtgttggctcacagctcagggaca
gagcagagacccatgtgctggggcacccgactggctttcttaagaacagt
aaccctggcctgagctgaagaagctggtaaggtgttctctgccttcccag
cggagggagccttgagctgggtgactggagtaactgggaacaagaaatga
ggatgccaggaaagctatgcccccaccccactcagcatgtagagagctaa
ttcttactgacatcacattatgctgagtgtaccttgtgtcttgttaatgc
tgagcaagtgcaccggaaattcagtgcccaagtcacagtcttaggaatac
tactttgcatttcaactaccttgaaataccacttccattttcctaatttc
tctcttccccggtcctccaagaagtaagtgggagacaaatgagaaatctg
ggtgaagccaggaaggaacccacttgatctcattctcttctgtctcaagc
acaagccttgcatagcttagaccacacaaaggattcatccacatctggga
ggtacgggttttctgcccgtggagtgtgacgttcacagtaacaggctcca
gtcagccacttcccctcttcattacctccagctttacatagcaacaccgg
ctttcttcctcgtgtaaaaccgtgaaatgaaagaagatgtcttcttcacc
aaggaaggggcaggtatcatcagttgcatcatttgaagtctggagccctg
gatctagtgtcagtgctctgttttcttctgacagatgatctagcttcatc
taagaaatcttgcagtggatgggattgcagctcatttgtagaggtgctgg
cgtagcatctcaacactctgtgttcactcctagcatggtgtaagcatggg
gtcggattggggtggaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_63815191_63816378
seq2: B6Ng01-158C13.b_48_1228

seq1  GAATTCTTTGCAGTGATGGGGCTAAAACTCTACGCCTCAAAAATGCCAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGCAGTGATGGGGCTAAAACTCTACGCCTCAAAAATGCCAGG  50

seq1  CGAGGCCTATGTCCCTGAGCTAGCCCTAAAGCAACCTAAATTTTAGTTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGGCCTATGTCCCTGAGCTAGCCCTAAAGCAACCTAAATTTTAGTTTT  100

seq1  GACAACTGCTACCTGCAACACAAGGTCACACAGTTCTGAAACATACATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAACTGCTACCTGCAACACAAGGTCACACAGTTCTGAAACATACATTT  150

seq1  TCTGATATGGAAAATGGAATTAATAGTTTTCCTGTAGCACTATGCAAAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATATGGAAAATGGAATTAATAGTTTTCCTGTAGCACTATGCAAAGA  200

seq1  TTAATGAGCTTTGGTAAAAATGCACTTTTAGCATTTAGCAAAAACAAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGAGCTTTGGTAAAAATGCACTTTTAGCATTTAGCAAAAACAAAAC  250

seq1  AAAGAATTCAATGAACTGATGCTATGGTTAGCAATACTGATTAAACATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAATTCAATGAACTGATGCTATGGTTAGCAATACTGATTAAACATTT  300

seq1  ACTTTTTTCCTGATGCTGGAACAGGTTCCAGAAACACACAGGTCAGAAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTTTCCTGATGCTGGAACAGGTTCCAGAAACACACAGGTCAGAAAT  350

seq1  AGCCCCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTACCCTAAAAGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTACCCTAAAAGAGT  400

seq1  TACTGTTGAAATTTTATATAGACAGACAGAGGTAAGTTCATGATAATCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTTGAAATTTTATATAGACAGACAGAGGTAAGTTCATGATAATCTG  450

seq1  TCAACACTAGTTTCGTAGTTTGAATAGGAATGCTGGCCAACCCCCATAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACACTAGTTTCGTAGTTTGAATAGGAATGCTGGCCAACCCCCATAGG  500

seq1  CTCAGATTTGAATTTTTGGTCATTAGAGAGTGGCATTACTTGATAGGGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGATTTGAATTTTTGGTCATTAGAGAGTGGCATTACTTGATAGGGAC  550

seq1  TAGAAGGTATGAAGGCCTTGTTAGAGGAAGTGTGTTGTCACCAGCTTTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGGTATGAAGGCCTTGTTAGAGGAAGTGTGTTGTCACCAGCTTTGG  600

seq1  GGTTTCAAGTGCTCATGCCAGGCCCAATTTTTGTTTTTTGTTTTGGGTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTCAAGTGCTCATGCCAGGCCCAATTTTTGTTTTTTGTTTTGGGTTT  650

seq1  TTTTTTAATGTTTTTTTTTTCCTCCCATCTCTCTTCCTACTGACTACAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTAATGTTTTTTTTTTCCTCCCATCTCTCTTCCTACTGACTACAGA  700

seq1  TCTAAATGTATAACTCTCAACTACTCTCACCATGTCTACCTGCAAGCTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAATGTATAACTCTCAACTACTCTCACCATGTCTACCTGCAAGCTGT  750

seq1  TGTGCTTCCCACCATGATGACAATGAACTAAACCTCTGAATGCCAATCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTTCCCACCATGATGACAATGAACTAAACCTCTGAATGCCAATCAA  800

seq1  GCTCCAATGAAATGTTTTCTTACATAACAGCTGCCATAGTCATAGTGTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCAATGAAATGTTTTCTTACATAACAGCTGCCATAGTCATAGTGTCT  850

seq1  CTTCATAGCAATGGAACTTTTGACTAAG-ACAACTAGATTAACAGAACAG  899
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATAGCAATGGAACTTTTGACTAAGAACAACTAGATTAACAGAACAG  900

seq1  ACTACAGTTATAACAAACTTAGAAAACAAGACAGTACTATAGTAAGTCAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACAGTTATAACAAACTTAGAAAACAAGACAGTACTATAGTAAGTCAA  950

seq1  GAACACATTCAAAGTATAGGCTGAGGATCCAC-TGTTACATCACT-CATG  997
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
seq2  GAACACATTCAAAGTATAGGCTGAGGATCCACTTGTTACATCACTCCATG  1000

seq1  AAAATGTTCCATTCTTTCTGATGAATGTTGAAATCAGAATCCATTTATTG  1047
       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -AAATG-TCCATTCTTTCTGATGAATGTTGAAATCAGAATCCATTTATTG  1048

seq1  TTACTGCATTCCCTAAAGCACAATGCCTCTGGTACACTGCAGACCCCAGT  1097
      ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| 
seq2  TTATTGCATT-CCTAAAGCACAATGCCTCTGGTAC-CTGCAGACCTCAG-  1095

seq1  ATGTGTACATATATGGTGAATCAATGACTAAGCAAACATGATAGAAGAGA  1147
      ||| |||||  ||||| ||||||   ||| ||| ||| ||||||||||||
seq2  ATG-GTACAATTATGG-GAATCATGTACT-AGC-AACTTGATAGAAGAGA  1141

seq1  CTTGAAGAAATGTGGCTTA-TCTATG-CTTAAGGCCACAAAGA  1188
      ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    ||||||
seq2  CTTGAAGAAAT-TGGCTTATTCTATGTCTTAAG--TTCAAAGA  1181

seq1: chr15_63965531_63966652
seq2: B6Ng01-158C13.g_70_1186 (reverse)

seq1  TTCCACCCCACTCCGACCCCAGTGCTTACACCATGCTGGGGGTTGAACAC  50
      |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||
seq2  TTCCACCCCAATCCGACCCCA-TGCTTACACCATGCTAGGAG-TGAACAC  48

seq1  AGGGTGTTGTGAATGCTACGCCAGCA-CTCTAACAAATGAGCTGCAATCC  99
      || |||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGTTGAG-ATGCTACGCCAGCACCTCT-ACAAATGAGCTGCAATCC  96

seq1  CATCCCACTGCAAGATGTCTTAGATGGAAGCTAGATCATCTGTCAGAAG-  148
      ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| 
seq2  CAT-CCACTGCAAGATTTCTTAGAT-GAAGCTAGATCATCTGTCAGAAGA  144

seq1  AAACAGAGCCACTGACACTAGATCCAGGGCTCCAGACTTCAAATG-TGCA  197
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AAACAGAG-CACTGACACTAGATCCAGGGCTCCAGACTTCAAATGATGCA  193

seq1  ACTGATGATACCTGCCCCTTCCTTGGTG-AGGAGACATCTTTCTTTCATT  246
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||
seq2  ACTGATGATACCTGCCCCTTCCTTGGTGAAGAAGACATC-TTCTTTCATT  242

seq1  TCACGGTTTTACACGAGGAAGGAAAGCCGGTGTTGCTATGTAAAGCTGGA  296
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACGGTTTTACACGAGGAA-GAAAGCCGGTGTTGCTATGTAAAGCTGGA  291

seq1  GGTAATGAAGAGGGGAAGTGGCTGACTGGAGCCTGTTACTGTGAACGTCA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATGAAGAGGGGAAGTGGCTGACTGGAGCCTGTTACTGTGAACGTCA  341

seq1  CACTCCACGGGCAGAAAACCCGTACCTCCCAGATGTGGATGAATCCTTTG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCACGGGCAGAAAACCCGTACCTCCCAGATGTGGATGAATCCTTTG  391

seq1  TGTGGTCTAAGCTATGCAAGGCTTGTGCTTGAGACAGAAGAGAATGAGAT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTCTAAGCTATGCAAGGCTTGTGCTTGAGACAGAAGAGAATGAGAT  441

seq1  CAAGTGGGTTCCTTCCTGGCTTCACCCAGATTTCTCATTTGTCTCCCACT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGGGTTCCTTCCTGGCTTCACCCAGATTTCTCATTTGTCTCCCACT  491

seq1  TACTTCTTGGAGGACCGGGGAAGAGAGAAATTAGGAAAATGGAAGTGGTA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCTTGGAGGACCGGGGAAGAGAGAAATTAGGAAAATGGAAGTGGTA  541

seq1  TTTCAAGGTAGTTGAAATGCAAAGTAGTATTCCTAAGACTGTGACTTGGG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAGGTAGTTGAAATGCAAAGTAGTATTCCTAAGACTGTGACTTGGG  591

seq1  CACTGAATTTCCGGTGCACTTGCTCAGCATTAACAAGACACAAGGTACAC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGAATTTCCGGTGCACTTGCTCAGCATTAACAAGACACAAGGTACAC  641

seq1  TCAGCATAATGTGATGTCAGTAAGAATTAGCTCTCTACATGCTGAGTGGG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATAATGTGATGTCAGTAAGAATTAGCTCTCTACATGCTGAGTGGG  691

seq1  GTGGGGGCATAGCTTTCCTGGCATCCTCATTTCTTGTTCCCAGTTACTCC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGGCATAGCTTTCCTGGCATCCTCATTTCTTGTTCCCAGTTACTCC  741

seq1  AGTCACCCAGCTCAAGGCTCCCTCCGCTGGGAAGGCAGAGAACACCTTAC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACCCAGCTCAAGGCTCCCTCCGCTGGGAAGGCAGAGAACACCTTAC  791

seq1  CAGCTTCTTCAGCTCAGGCCAGGGTTACTGTTCTTAAGAAAGCCAGTCGG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTCTTCAGCTCAGGCCAGGGTTACTGTTCTTAAGAAAGCCAGTCGG  841

seq1  GTGCCCCAGCACATGGGTCTCTGCTCTGTCCCTGAGCTGTGAGCCAACAC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCCAGCACATGGGTCTCTGCTCTGTCCCTGAGCTGTGAGCCAACAC  891

seq1  CAAGTCCTGTGTTCTGTCTCTGTCTGGTTCTCACTGCTTCCTCTAACTCT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCCTGTGTTCTGTCTCTGTCTGGTTCTCACTGCTTCCTCTAACTCT  941

seq1  TGGCAGCTCGCTCGCCTTCCCTAGCTCCTCTGCTGTCCCATCTTGACTCA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGCTCGCTCGCCTTCCCTAGCTCCTCTGCTGTCCCATCTTGACTCA  991

seq1  CTTGTGGTCCATTTCTTGTTCTCTTTCAGAGTTCCTATCAGAGTCTGAGA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGGTCCATTTCTTGTTCTCTTTCAGAGTTCCTATCAGAGTCTGAGA  1041

seq1  TCAGACAGAGTACAGTACTCAGGGAAACAGGAGTGGGAGGAGAAGTGAGT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACAGAGTACAGTACTCAGGGAAACAGGAGTGGGAGGAGAAGTGAGT  1091

seq1  GAGGCAAACAGGCCTGAACAGAATTC  1122
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCAAACAGGCCTGAACAGAATTC  1117