BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158O08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 69,218,159 - 69,382,085
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG665945, EG633752, Khdrbs3
Downstream geneLOC383050
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158O08.bB6Ng01-158O08.g
ACCDH952719DH952720
length1,0151,165
definitionDH952719|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158O08, 5' end.DH952720|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158O08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,381,072 - 69,382,085)(69,218,159 - 69,219,334)
sequence
gaattcatccctctactcaactcagtttttctactccatggtatgtctta
gagtttcttaaccatattagggcacagttttcttctctacaaaacaaaca
caggcctggccgggtgacatacatctttaagttcagaacctgggagacaa
atcactgtgactttgagaccaggctagccagggctatggggtatagcctt
gtttcaaccacacaaaataaaatataataataattaatggtgattatgga
ttttactgattacatattgtttgccaagtgcttttctctgtggctcacat
gcatttatatacttttaagtccttcagtatcttgaggtagatattagcta
catttcccatagagaggctcaagcacaggaatgttaaatgattagcctaa
gggcgctgcatgacttagtgcaggaaatagcatttcagatagaggcttaa
gatatgcttgtctgccagaagaatgctgaatctagactttgaaatgtcag
tgagtccaccacaatgctgggacttttagatgttcttgctggaaaaacaa
attgactaaaccactttggtaaatcaggatgtaacaaggaaggaaacaca
cactctgagacctaccagctctactcctgagtgtccatcaaagggacata
gtttcctgtatcaaactcagacatcagtacacacactgagactctattta
aaccacttgaaaactataaattccccacatttacggaaagtaagtataaa
tttttatgtctttcacactatcgaattaatactaagtgacctgatttaaa
aactggaaattccttcagtgtcattgaatgtcatagaagatatatgtgac
agctgtaagatgctaagagtatggggtatgcacattttttacaatacacc
tgaataaatttgtaaactgaaacatggtgtagtgagtcaggccagtggtt
cagttctgaagaaaagagtagtggaaagagttaaaaaaggcattctctac
atctgggtaatgatt
gaattctagacaaagcctgggtgaccctggacctggctacaaggacaaaa
gggtggatttttctttttccatttattcctctaccttgagccctcttgga
aaggaagtgccaaagacaggagtatttccttgggcctggttcagcactat
atttctattccttgttccttgtaaatgagaggaagatgcagaaagaagcc
tttcagagcttaagcaccagcctttggctgcctgctcaaacacctctgtt
ctcagaaagcctttgaagtagaagattcagacaccttctatggcaggcca
gggatactccttcatacagtggtgacttactccttcctctctctgctttt
atattctcctgttcagtataagcctgccaccccacacccccagcttctag
actcttcttgatattcagtgtccacccagacaattttacctatccaggac
ctgtcctctttgtgagatccttttggtgttgtgtgctcatctcctctcca
ctcaaacatcccctctcttttcttttctttttctttaaatgactggtttc
caatccttacagaagaaagcagatgctctgtgaggtttgtaagcttattc
atgccttgacagaaggaagggccacagagttgggactgctgaggaagtta
gctgattgatagacagagggtcagataacaaagatggggaaggaaaagga
agaagttgtatttgcttggatgggaagcactagatgaccccagtctaacc
tggcagcgttagtaaagatcatgctatcctgatttagattgagagatggt
gttctgactgttattcattcaggaagccaggatattatgataggcatatg
atagtctttctctaaggtctctactaataagctcttcctctgtgtgcctt
gcttgcatggataagacacataatctctattctctctacagaaattcact
gccaccagcagagctgtcagtatcatctttgtgctgacttactctaaatg
gctctctggtcctcttgccatgaaatatgtatcctcagaatggagttaca
gcagtatttgtatttagaaaatggtgagcttgaggtgtactgtctgcata
tagctatagtcatagcctgatgaacatgttgattccttcttaaagaatac
attatatgtctgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_69381072_69382085
seq2: B6Ng01-158O08.b_51_1065 (reverse)

seq1  AAACATTA-CCAGATGTAGAGAATGCCTTTTTTAACTCTTTCCACTTACT  49
      || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AATCATTACCCAGATGTAGAGAATGCCTTTTTTAACTCTTTCCAC-TACT  49

seq1  CTTTTCTTCAGAACTG-ACCACTGGCCTGACTCACTACACCATGTTTCAG  98
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCTTCAGAACTGAACCACTGGCCTGACTCACTACACCATGTTTCAG  99

seq1  TTTACAAATTTATTCAGGTGTATTGTAAAAAATGTGCATACCCCATACTC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTTACAAATTTATTCAGGTGTATTGTAAAAAATGTGCATACCCCATACT-  148

seq1  CTTAGCATCTTACAGCTGTCACATATATCTTCTATGACATTCAATGACAC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCATCTTACAGCTGTCACATATATCTTCTATGACATTCAATGACAC  198

seq1  TGAAGGAATTTCCAGTTTTTAAATCAGGTCACTTAGTATTAATTCGATAG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGAATTTCCAGTTTTTAAATCAGGTCACTTAGTATTAATTCGATAG  248

seq1  TGTG-AAGACATAAAAATTTATACTTACTTTCCGTAAATGTGGGGAATTT  297
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAAGACATAAAAATTTATACTTACTTTCCGTAAATGTGGGGAATTT  298

seq1  ATAGTTTTCAAGTGGTTTAAATAGAGTCTCAGTGTGTGTACTGATGTCTG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTTTCAAGTGGTTTAAATAGAGTCTCAGTGTGTGTACTGATGTCTG  348

seq1  AGTTTGATACAGGAAACTATGTCCCTTTGATGGACACTCAGGAGTAGAGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGATACAGGAAACTATGTCCCTTTGATGGACACTCAGGAGTAGAGC  398

seq1  TGGTAGGTCTCAGAGTGTGTGTTTCCTTCCTTGTTACATCCTGATTTACC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGGTCTCAGAGTGTGTGTTTCCTTCCTTGTTACATCCTGATTTACC  448

seq1  AAAGTGGTTTAGTCAATTTGTTTTTCCAGCAAGAACATCTAAAAGTCCCA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGGTTTAGTCAATTTGTTTTTCCAGCAAGAACATCTAAAAGTCCCA  498

seq1  GCATTGTGGTGGACTCACTGACATTTCAAAGTCTAGATTCAGCATTCTTC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGTGGTGGACTCACTGACATTTCAAAGTCTAGATTCAGCATTCTTC  548

seq1  TGGCAGACAAGCATATCTTAAGCCTCTATCTGAAATGCTATTTCCTGCAC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGACAAGCATATCTTAAGCCTCTATCTGAAATGCTATTTCCTGCAC  598

seq1  TAAGTCATGCAGCGCCCTTAGGCTAATCATTTAACATTCCTGTGCTTGAG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTCATGCAGCGCCCTTAGGCTAATCATTTAACATTCCTGTGCTTGAG  648

seq1  CCTCTCTATGGGAAATGTAGCTAATATCTACCTCAAGATACTGAAGGACT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCTATGGGAAATGTAGCTAATATCTACCTCAAGATACTGAAGGACT  698

seq1  TAAAAGTATATAAATGCATGTGAGCCACAGAGAAAAGCACTTGGCAAACA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGTATATAAATGCATGTGAGCCACAGAGAAAAGCACTTGGCAAACA  748

seq1  ATATGTAATCAGTAAAATCCATAATCACCATTAATTATTATTATATTTTA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTAATCAGTAAAATCCATAATCACCATTAATTATTATTATATTTTA  798

seq1  TTTTGTGTGGTTGAAACAAGGCTATACCCCATAGCCCTGGCTAGCCTGGT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTGTGGTTGAAACAAGGCTATACCCCATAGCCCTGGCTAGCCTGGT  848

seq1  CTCAAAGTCACAGTGATTTGTCTCCCAGGTTCTGAACTTAAAGATGTATG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAAGTCACAGTGATTTGTCTCCCAGGTTCTGAACTTAAAGATGTATG  898

seq1  TCACCCGGCCAGGCCTGTGTTTGTTTTGTAGAGAAGAAAACTGTGCCCTA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCGGCCAGGCCTGTGTTTGTTTTGTAGAGAAGAAAACTGTGCCCTA  948

seq1  ATATGGTTAAGAAACTCTAAGACATACCATGGAGTAGAAAAACTGAGTTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGTTAAGAAACTCTAAGACATACCATGGAGTAGAAAAACTGAGTTG  998

seq1  AGTAGAGGGATGAATTC  1014
      |||||||||||||||||
seq2  AGTAGAGGGATGAATTC  1015

seq1: chr15_69218159_69219334
seq2: B6Ng01-158O08.g_70_1234

seq1  GAATTCTAGACAAAGCCTGGGTGACCCTGGACCTGGCTACAAGGACAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGACAAAGCCTGGGTGACCCTGGACCTGGCTACAAGGACAAAA  50

seq1  GGGTGGATTTTTCTTTTTCCATTTATTCCTCTACCTTGAGCCCTCTTGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGGATTTTTCTTTTTCCATTTATTCCTCTACCTTGAGCCCTCTTGGA  100

seq1  AAGGAAGTGCCAAAGACAGGAGTATTTCCTTGGGCCTGGTTCAGCACTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGTGCCAAAGACAGGAGTATTTCCTTGGGCCTGGTTCAGCACTAT  150

seq1  ATTTCTATTCCTTGTTCCTTGTAAATGAGAGGAAGATGCAGAAAGAAGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTATTCCTTGTTCCTTGTAAATGAGAGGAAGATGCAGAAAGAAGCC  200

seq1  TTTCAGAGCTTAAGCACCAGCCTTTGGCTGCCTGCTCAAACACCTCTGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGAGCTTAAGCACCAGCCTTTGGCTGCCTGCTCAAACACCTCTGTT  250

seq1  CTCAGAAAGCCTTTGAAGTAGAAGATTCAGACACCTTCTATGGCAGGCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAAAGCCTTTGAAGTAGAAGATTCAGACACCTTCTATGGCAGGCCA  300

seq1  GGGATACTCCTTCATACAGTGGTGACTTACTCCTTCCTCTCTCTGCTTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATACTCCTTCATACAGTGGTGACTTACTCCTTCCTCTCTCTGCTTTT  350

seq1  ATATTCTCCTGTTCAGTATAAGCCTGCCACCCCACACCCCCAGCTTCTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCTCCTGTTCAGTATAAGCCTGCCACCCCACACCCCCAGCTTCTAG  400

seq1  ACTCTTCTTGATATTCAGTGTCCACCCAGACAATTTTACCTATCCAGGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTCTTGATATTCAGTGTCCACCCAGACAATTTTACCTATCCAGGAC  450

seq1  CTGTCCTCTTTGTGAGATCCTTTTGGTGTTGTGTGCTCATCTCCTCTCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTCTTTGTGAGATCCTTTTGGTGTTGTGTGCTCATCTCCTCTCCA  500

seq1  CTCAAACATCCCCTCTCTTTTCTTTTCTTTTTCTTTAAATGACTGGTTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAACATCCCCTCTCTTTTCTTTTCTTTTTCTTTAAATGACTGGTTTC  550

seq1  CAATCCTTACAGAAGAAAGCAGATGCTCTGTGAGGTTTGTAAGCTTATTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCCTTACAGAAGAAAGCAGATGCTCTGTGAGGTTTGTAAGCTTATTC  600

seq1  ATGCCTTGACAGAAGGAAGGGCCACAGAGTTGGGACTGCTGAGGAAGTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTTGACAGAAGGAAGGGCCACAGAGTTGGGACTGCTGAGGAAGTTA  650

seq1  GCTGATTGATAGACAGAGGGTCAGATAACAAAGATGGGGAAGGAAAAGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATTGATAGACAGAGGGTCAGATAACAAAGATGGGGAAGGAAAAGGA  700

seq1  AGAAGTTGTATTTGCTTGGATGGGAAGCACTAGATGACCCCAGTCTAACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTTGTATTTGCTTGGATGGGAAGCACTAGATGACCCCAGTCTAACC  750

seq1  TGGCAGCGTTAGTAAAGATCATGCTATCCTGATTTAGATTGAGAGATGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGCGTTAGTAAAGATCATGCTATCCTGATTTAGATTGAGAGATGGT  800

seq1  GTTCTGACTGTTATTCAATTCAGGGAAGCCAGGATATTATGATAGGCATA  850
      |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGACTGTTATTC-ATTCA-GGAAGCCAGGATATTATGATAGGCATA  848

seq1  TGATAGTCTTTCTCTAAAGGTCCTCTACTAATAAGCTCTTCCTCTGTGTG  900
      ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGTCTTTCTCT-AAGGT-CTCTACTAATAAGCTCTTCCTCTGTGTG  896

seq1  CCTTGCTTGCATGGATAAGACACAT-ATCCCTATTCTCTCTACAGAAATT  949
      ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
seq2  CCTTGCTTGCATGGATAAGACACATAATCTCTATTCTCTCTACAGAAA-T  945

seq1  TCACTGCCACCAGCAGAGCTGTCAAGTA-CATCTTTGTGCTGACTTACTC  998
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGCCACCAGCAGAGCTGTC-AGTATCATCTTTGTGCTGACTTACTC  994

seq1  TAAATGGCTCTCTGGTTCTCTTGCCATGAATTATGGTACCTCAGGAT-GA  1047
      |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||| || ||
seq2  TAAATGGCTCTCTGGTCCTCTTGCCATGAAATATGTATCCTCAGAATGGA  1044

seq1  GTTACAGCAGTATTTGTATTTTGAAAAT-GTGAGCCTTGGAGGTTGTTAC  1096
      ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||   |||
seq2  GTTACAGCAGTATTTGTATTTAGAAAATGGTGAGC--TTGAGGT--GTAC  1090

seq1  TGTCTGCATATAAGCATAAGTCATAGCCTTGAGTGAACATG-TGATCCCT  1145
      ||||||||||| |||   |||||||||| ||| |||||||| |||| |||
seq2  TGTCTGCATAT-AGCTATAGTCATAGCC-TGA-TGAACATGTTGATTCCT  1137

seq1  TCTTTAATGAATACATTTAGTATGTCTGGGG  1176
      || |||| |||||||||   |||||||||||
seq2  TC-TTAAAGAATACATT--ATATGTCTGGGG  1165