BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-162E01
Chromosome15 (Build37)
Map Location 14,513,051 - 14,700,532
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666708, LOC674819
Downstream geneLOC100040024, LOC100040033, LOC100040046
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-162E01.bB6Ng01-162E01.g
ACCDH955137DH955138
length1,0861,101
definitionDH955137|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-162E01, 5' end.DH955138|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-162E01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,513,051 - 14,514,155)(14,699,433 - 14,700,532)
sequence
gaattctagagtccgaagttaattattgtctacaatgtattttctatata
catccaattaaattgtatttggtgtgaaatataaaaacaaaagctaatat
ttcttatagaatttttctcagcctcttaattttgttattggagatacagc
aagttgaagctgggagcaagtatgtttagtctttggtttcatatttgttg
ttcaatctttcataaataaaaggacatgtgtaactttttgacttcctata
aatattccttaatttttgattttacgtcaaattgttaaattgacaatcat
agatacaaataatcaataaaggcacagaacattgcctacattctttctgg
ttaatgaacaagtaacataaacatggagggttgagaaatacagtggaaaa
tgtctccagggatttcagtacagtgtaggaaaatgtccactttattaaaa
aaagtaaatgtagaattagttaatcctactaaagtgggctttcaagcctg
cctttgaacctttagttcctggataaaaaaaaaacacacaaagcctttat
acttacaaaatttcttaaatggggcaagagctggacagacctagccacta
tgctcttagaatctgctttcctatcgataatagtaagttattatgtatta
tttactatgtttcacctgggttgttcttaacttaaactggccaactcttg
tttatggcgacttctccttgctcctcctgcacattatacttctcataggc
cttctctgaccctacctttgtctttcctgctcagccattgactactggca
tctttatttatcaataagaaacaacttgggggcagggtcacttagctaga
gtcacttagctagcttctacatgtggacgttctcatcttggggtattagt
cttaggagcccaaatttagcattggaatcagtatcagccacccactacag
gtaaacttcatggagaaacctgggacattatcatcagttattagacttag
tgccttctcatgtgggaacaagcagttataatatgatgtgacctttaaca
tactattcagtacccaagattgacagttccactatt
gaattcctgtccactgactaggtcttactttcagttacaaaaatgttgga
gatgccaaaatgaaattgctgttgttgcaccacttgagatatcttgctgg
tatactaattggcaagcaaaagctttacagatggataggactataaaatg
ttttcttccttcttagctggagtagcaacttacaacactaggagatcttc
tcttcagggcttgaaggacagttccaactcaactcctctaatcatctttt
caacaagtctgctatttttagcaacagaaactaaccttcactttgtgcaa
tagctgtaacatgtagaacttgagagtctctttgaaccctcatataaaac
ttttagttatttcaagactggcactggtggtgaacacctttattctcaac
acctgggaggcagaggcaagcggatttctgagttcgagacaagcctggtc
cacaaagtgagttccaggacagccagggctatacaaagaaaccctgtctc
acccccccccaccccacccccaaaaaaaagactggcactggagttgcact
ggagttttgttaggtagtacaggtccctataagaaagcattatcaactca
tttgggtaagttattttgaattatatatatatatacatatacatacatac
attttacattcctcagttaacattctcatggcattgaccctcatttttca
catttatagttcctggctctataatctctttctgtttttcctagttttct
gtaatttcattcagataataaaactttaatataaaaattcagaggtgata
tagagatcccagagataaaagagaatacccagattttgtatttccctata
ttatgtagctctgtacaatgatttaaaatttaaaatttgtttttcatacg
taatgaatagattttgatgtgcatgtataccaacttcatatataatcatc
tttttgaaggtaattagtttggttccaattcctaattattggtgaattga
gactcaggagcattgtcttgatatgattctattgctgaatctttccacat
ttcaaggatagtattaggttttaaaccttccacttttaaggttcttcacc
t
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_14513051_14514155
seq2: B6Ng01-162E01.b_47_1132

seq1  GAATTCTAGAGTCCGAAGTTAATTATTGTCTACAATGTATTTTCTATATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGAGTCCGAAGTTAATTATTGTCTACAATGTATTTTCTATATA  50

seq1  CATCCAATTAAATTGTATTTGGTGTGAAATATAAAAACAAAAGCTAATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCAATTAAATTGTATTTGGTGTGAAATATAAAAACAAAAGCTAATAT  100

seq1  TTCTTATAGAATTTTTCTCAGCCTCTTAATTTTGTTATTGGAGATACAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTATAGAATTTTTCTCAGCCTCTTAATTTTGTTATTGGAGATACAGC  150

seq1  AAGTTGAAGCTGGGAGCAAGTATGTTTAGTCTTTGGTTTCATATTTGTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGAAGCTGGGAGCAAGTATGTTTAGTCTTTGGTTTCATATTTGTTG  200

seq1  TTCAATCTTTCATAAATAAAAGGACATGTGTAACTTTTTGACTTCCTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATCTTTCATAAATAAAAGGACATGTGTAACTTTTTGACTTCCTATA  250

seq1  AATATTCCTTAATTTTTGATTTTACGTCAAATTGTTAAATTGACAATCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTCCTTAATTTTTGATTTTACGTCAAATTGTTAAATTGACAATCAT  300

seq1  AGATACAAATAATCAATAAAGGCACAGAACATTGCCTACATTCTTTCTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATACAAATAATCAATAAAGGCACAGAACATTGCCTACATTCTTTCTGG  350

seq1  TTAATGAACAAGTAACATAAACATGGAGGGTTGAGAAATACAGTGGAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGAACAAGTAACATAAACATGGAGGGTTGAGAAATACAGTGGAAAA  400

seq1  TGTCTCCAGGGATTTCAGTACAGTGTAGGAAAATGTCCACTTTATTAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCCAGGGATTTCAGTACAGTGTAGGAAAATGTCCACTTTATTAAAA  450

seq1  AAAGTAAATGTAGAATTAGTTAATCCTACTAAAGTGGGCTTTCAAGCCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAAATGTAGAATTAGTTAATCCTACTAAAGTGGGCTTTCAAGCCTG  500

seq1  CCTTTGAACCTTTAGTTCCTGGATAAAAAAAAAACACACAAAGCCTTTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGAACCTTTAGTTCCTGGATAAAAAAAAAACACACAAAGCCTTTAT  550

seq1  ACTTACAAAATTTCTTAAATGGGGCAAGAGCTGGACAGACCTAGCCACTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTACAAAATTTCTTAAATGGGGCAAGAGCTGGACAGACCTAGCCACTA  600

seq1  TGCTCTTAGAATCTGCTTTCCTATCGATAATAGTAAGTTATTATGTATTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTAGAATCTGCTTTCCTATCGATAATAGTAAGTTATTATGTATTA  650

seq1  TTTACTATGTTTCACCTGGGTTGTTCTTAACTTAAACTGGCCAACTCTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTATGTTTCACCTGGGTTGTTCTTAACTTAAACTGGCCAACTCTTG  700

seq1  TTTATGGCGACTTCTCCTTGCTCCTCCTGCACATTATACTTCTCATAGGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGGCGACTTCTCCTTGCTCCTCCTGCACATTATACTTCTCATAGGC  750

seq1  CTTCTCTGACCCTACCTTTGTCTTTCCTGCTCAGCCATTGACTACTGGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTGACCCTACCTTTGTCTTTCCTGCTCAGCCATTGACTACTGGCA  800

seq1  TCTTTATTTATCAATAAGAAACAACTTGGGGGCAGGGTCACTTAGCTAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATTTATCAATAAGAAACAACTTGGGGGCAGGGTCACTTAGCTAGA  850

seq1  GTCACTTAGCTAGCTTCTACATGTGGACGTTCTCATCTTTGGGGTATTAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GTCACTTAGCTAGCTTCTACATGTGGACGTTCTCATC-TTGGGGTATTAG  899

seq1  TCTTAGGAGCCCAAATTTAGCATTGGAATCAGTATCAGGCCAACCCACTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||
seq2  TCTTAGGAGCCCAAATTTAGCATTGGAATCAGTATCAG--CCACCCACTA  947

seq1  CAGGTAAACTTCATGGAGAAAACCTGGGACATTATCATTCAGGTAATTAG  1000
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||
seq2  CAGGTAAACTTCATGGAG-AAACCTGGGACATTATCA-TCA-GTTATTAG  994

seq1  ACTTAGTGCCTTCTCCATGTGTGAACAAAGCAGTTTATACATATGATGTG  1050
      |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||
seq2  ACTTAGTGCCTTCT-CATGTGGGAAC-AAGCAG-TTATA-ATATGATGTG  1040

seq1  ACCTTTTAACAAATACTAATCAGTTAACCAAAGATATGACAGTTTCAAAA  1100
      ||| ||||||  |||||| |||||  ||| ||||| |||||||| |   |
seq2  ACC-TTTAAC--ATACTATTCAGT--ACCCAAGAT-TGACAGTTCC---A  1081

seq1  CTATT  1105
      |||||
seq2  CTATT  1086

seq1: chr15_14699433_14700532
seq2: B6Ng01-162E01.g_67_1167 (reverse)

seq1  AGGTGAAGAACCTTAAATATTTGGAAGGTTAAAAACATAATACTATCCTT  50
      ||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||| |||||||||||||
seq2  AGGTGAAGAACCTTAA--AAGTGGAAGGTTTAAAACCTAATACTATCCTT  48

seq1  GAATATGTGGGAAGGATTCAGCATATGAATCATATTCAG-CCATGCTCCT  99
      ||| |||| |||| |||||||||   |||||||||  || | ||||||||
seq2  GAA-ATGT-GGAAAGATTCAGCAATAGAATCATATCAAGACAATGCTCCT  96

seq1  GAGTACTCTATTCA-CAATATTTAGGAATTGGAAACAAACTAATTAACCT  148
      |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  GAGT-CTCAATTCACCAATAATTAGGAATTGGAACCAAACTAATT-ACCT  144

seq1  TC-AAAAGATGAATATATAATGAAGTTGTAATACATGCACATCAAATTCT  197
      || ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||
seq2  TCAAAAAGATGATTATAT-ATGAAGTTGGTATACATGCACATCAAAATCT  193

seq1  A-TCATTACGTATGGAAAAACAAAATTTTAAATTTTAAATAAATGTACAG  246
      | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||
seq2  ATTCATTACGTAT-GAAAAAC-AAATTTTAAATTTTAAATCATTGTACAG  241

seq1  AGCTACATAATATAGGGAAATACAAAATCTGGGTATTCTCTTTTATCTCT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTACATAATATAGGGAAATACAAAATCTGGGTATTCTCTTTTATCTCT  291

seq1  -GGATCTCTATATCACCTCTGAATTTTTATATTAAAGTTTTATTATCTGA  345
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATCTCTATATCACCTCTGAATTTTTATATTAAAGTTTTATTATCTGA  341

seq1  ATG-AATTACAG-AAACTAGG-AAAACAGAAAGAGATTATAGAGCCAGGA  392
      ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAATTACAGAAAACTAGGAAAAACAGAAAGAGATTATAGAGCCAGGA  391

seq1  ACTATAAATGTG-AAAATGAGGGTCAATGCCATGAGAATGTTAACTGAGG  441
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATAAATGTGAAAAATGAGGGTCAATGCCATGAGAATGTTAACTGAGG  441

seq1  AATGT-AAATGTATGTATGTATATGTATATATATATATAATTCAAAATAA  490
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAAAATGTATGTATGTATATGTATATATATATATAATTCAAAATAA  491

seq1  CTTACCCAAATGAGTTGATAATGCTTTCTTATAGGGACCTGTACTACCTA  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACCCAAATGAGTTGATAATGCTTTCTTATAGGGACCTGTACTACCTA  541

seq1  ACAAAACTCCAGTGCAACTCCAGTGCCAGTCTTTTTTTTGGGGGTGGGGT  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACTCCAGTGCAACTCCAGTGCCAGTCTTTTTTTTGGGGGTGGGGT  591

seq1  GGGGGGGGGTGAGACAGGGTTTCTTTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAAC  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGGGGTGAGACAGGGTTTCTTTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAAC  641

seq1  TCACTTTGTGGACCAGGCTTGTCTCGAACTCAGAAATCCGCTTGCCTCTG  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTTGTGGACCAGGCTTGTCTCGAACTCAGAAATCCGCTTGCCTCTG  691

seq1  CCTCCCAGGTGTTGAGAATAAAGGTGTTCACCACCAGTGCCAGTCTTGAA  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCAGGTGTTGAGAATAAAGGTGTTCACCACCAGTGCCAGTCTTGAA  741

seq1  ATAACTAAAAGTTTTATATGAGGGTTCAAAGAGACTCTCAAGTTCTACAT  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTAAAAGTTTTATATGAGGGTTCAAAGAGACTCTCAAGTTCTACAT  791

seq1  GTTACAGCTATTGCACAAAGTGAAGGTTAGTTTCTGTTGCTAAAAATAGC  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACAGCTATTGCACAAAGTGAAGGTTAGTTTCTGTTGCTAAAAATAGC  841

seq1  AGACTTGTTGAAAAGATGATTAGAGGAGTTGAGTTGGAACTGTCCTTCAA  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTGTTGAAAAGATGATTAGAGGAGTTGAGTTGGAACTGTCCTTCAA  891

seq1  GCCCTGAAGAGAAGATCTCCTAGTGTTGTAAGTTGCTACTCCAGCTAAGA  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGAAGAGAAGATCTCCTAGTGTTGTAAGTTGCTACTCCAGCTAAGA  941

seq1  AGGAAGAAAACATTTTATAGTCCTATCCATCTGTAAAGCTTTTGCTTGCC  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGAAAACATTTTATAGTCCTATCCATCTGTAAAGCTTTTGCTTGCC  991

seq1  AATTAGTATACCAGCAAGATATCTCAAGTGGTGCAACAACAGCAATTTCA  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAGTATACCAGCAAGATATCTCAAGTGGTGCAACAACAGCAATTTCA  1041

seq1  TTTTGGCATCTCCAACATTTTTGTAACTGAAAGTAAGACCTAGTCAGTGG  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGCATCTCCAACATTTTTGTAACTGAAAGTAAGACCTAGTCAGTGG  1091

seq1  ACAGGAATTC  1100
      ||||||||||
seq2  ACAGGAATTC  1101