BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-164G01
Chromosome15 (Build37)
Map Location 66,538,429 - 66,634,676
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTg, Sla
Upstream geneC920006C10Rik, Oc90, F930104E18Rik, LOC100040835, Kcnq3, Lrrc6, LOC100040860, Tmem71, LOC100040881, Phf20l1
Downstream geneWisp1, Ndrg1, LOC100040667, St3gal1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-164G01.bB6Ng01-164G01.g
ACCDH956721DH956722
length1,1411,030
definitionDH956721|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164G01, 5' end.DH956722|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164G01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,633,527 - 66,634,676)(66,538,429 - 66,539,455)
sequence
gaattccaactcctgtttccccttcttgaaaattaggatgtagagcagag
cccctctacctccttttagaggccttgctctcagagcagggttcttttca
gaatgtgtgcacgtaggacttgagatattgatcttaacagtggcacaaaa
gccatatgtactcagtagaggttgtcctctgaattttaaattctgatttt
ccccagtctcatatctgtgttcagccttttctcttaatgatgcacaccag
gctagagccaaggttcccgtaatctgcctggtcacaaggagaaatacctc
atattgtactggatgctgtgttgctgaacttttatggtctgggtttggtc
taaaatacaattttgacttatgatattctcagcatatgaggggcatttga
ggagctagctccatggctacagactggctttacacacagagtatagaaat
gtgatctgaagcgagagtcgcagactcatgtgatcttgtacactcagcac
aggtagaatgtttctgtttggagtatgtgcttccggtcagcctagagatt
ggccagtttcttcaacttgttcctggaaatgggaaaacctctatccatat
ttatggccatgttctctgtgcttccgttatcctggaagacacagcgtctg
taagactttcttttcaaagcacttgtccaaagtccctggatttgaatgtt
tgtcatgataatgtccagccagcctatgctctgtgttttacctgctttaa
ctcagctttgtggcaactacccaaaagcagtccaatgagcttcccttagc
aggcaagaagacatcgagagcttgtcaggggatatcagttcatgagggag
agctagcatagtagtctctgtgtggctcttggaggggcagcccaccatga
agcaaatgagatagcctctcctttacctgtatgtgtcatgggaccagtca
tttcctattttggctttgtttttcttaaggggttgcaatcatcaagggct
agagtagaggtgaatgtgtttgtcagccctggaagcaatagtcaaccaag
caagggtcagccatgaagctggctttgccagccttacatgggtgtgaaaa
atcgacaagaagaatcagcaaaagtccatcatggccggctc
gaattctcacatgaaagactggggcttcagcgtatgactcagaacagaca
caatgtcaagttcatagcaagcataggagaaatatttaaagtatactaac
accttcctacaaacacacacacacacacacacacacacacacacacacac
acacacacactacgtgaggtactgtgatgatatttctttgtagctgtaga
gggttgggcaacaacattaacattcctcattattcctcctgagtcaaaag
cactattggtggactgatctgtagactatgggccaggtgaagaaaggact
tccagggtgagaaagaaacttgaacacagggatagagaagtgttcatttc
tagatccacctcatactcaaattcctggatgttgagagggggggtttcca
tttagatactgggcaatgcaatgagatacaggtcctgccttcatagagct
tccatcaaataggatgcactaagtacctaatcacagggaaatagaaacac
tgaccaaacttacccttgtgaaggagaggtttcaattccaggaaaaactg
tagcattggacaagaccaagttgggggtttggagatgttgtagtctattc
aggcagctatttcaaactatcataagctgggtggattttacaggcaacag
aactctgtttctcactattctggaatctggaagctcaagatcaaattacc
atcaactgaaaataccacagatggtgactttctaagtgtccttatatctt
agaaggcctcacctcctactatgatcactgatgactccaaaatttgggtt
tgtgagccattatgaaaggtgctctatgggcgacatggggtctcagtggt
gttctttgctggaggtggttacactacaagctttcagccagatgtctgtg
ttacccatgtaacttagtcatcaccatagggatcctggggagttggaaga
gaaagaggaagtacagagaactgtactccattgcttgtgtccatctcttt
gtcctaagtggtcacttgactggcagaaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_66633527_66634676
seq2: B6Ng01-164G01.b_47_1187 (reverse)

seq1  GAGCAGGCCATGATAGGACATTTTGGCTTGATTCTTTCTTGTCCGAATTT  50
      |||| ||||||||| |||| |||||   |||||| ||||||| ||| |||
seq2  GAGCCGGCCATGAT-GGAC-TTTTG--CTGATTC-TTCTTGT-CGATTTT  44

seq1  TCACACCCATGTTAAAGGCTTGCAAAGCCAGCTTCATGGCTGAACCCTTG  100
      ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| 
seq2  TCACACCCATGT--AAGGCTGGCAAAGCCAGCTTCATGGCTG-ACCCTT-  90

seq1  GCTTGGTTGAACTA-TGCTTTCCAGGCTGACAAACACATTCACCTCTACT  149
      ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGTTG-ACTATTGCTTCCAGGGCTGACAAACACATTCACCTCTACT  139

seq1  CTAGCCC-TGATGATTGCAAACCCCTTAAG-AAAACAAAGCCAAAATAGG  197
      ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CTAGCCCTTGATGATTGC-AACCCCTTAAGAAAAACAAAGCCAAAATAGG  188

seq1  AAATGACTGGTCCCATGACACATACAGGTAAAGGAGAGGCTATCTCATTT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGACTGGTCCCATGACACATACAGGTAAAGGAGAGGCTATCTCATTT  238

seq1  GCTTCATGGTGGGCTGCCCCTCCAAGAGCCACACAGAGACTACTATGCTA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCATGGTGGGCTGCCCCTCCAAGAGCCACACAGAGACTACTATGCTA  288

seq1  GCTCTCCCTCATGAACTGATATCCCCTGACAAGCTCTCGATGTCTTCTTG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCCCTCATGAACTGATATCCCCTGACAAGCTCTCGATGTCTTCTTG  338

seq1  CCTGCTAAGGGAAGCTCATTGGACTGCTTTTGGGTAGTTGCCACAAAGCT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTAAGGGAAGCTCATTGGACTGCTTTTGGGTAGTTGCCACAAAGCT  388

seq1  GAGTTAAAGCAGGTAAAACACAGAGCATAGGCTGGCTGGACATTATCATG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTAAAGCAGGTAAAACACAGAGCATAGGCTGGCTGGACATTATCATG  438

seq1  ACAAACATTCAAATCCAGGGACTTTGGACAAGTGCTTTGAAAAGAAAGTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACATTCAAATCCAGGGACTTTGGACAAGTGCTTTGAAAAGAAAGTC  488

seq1  TTACAGACGCTGTGTCTTCCAGGATAACGGAAGCACAGAGAACATGGCCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGACGCTGTGTCTTCCAGGATAACGGAAGCACAGAGAACATGGCCA  538

seq1  TAAATATGGATAGAGGTTTTCCCATTTCCAGGAACAAGTTGAAGAAACTG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATATGGATAGAGGTTTTCCCATTTCCAGGAACAAGTTGAAGAAACTG  588

seq1  GCCAATCTCTAGGCTGACCGGAAGCACATACTCCAAACAGAAACATTCTA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATCTCTAGGCTGACCGGAAGCACATACTCCAAACAGAAACATTCTA  638

seq1  CCTGTGCTGAGTGTACAAGATCACATGAGTCTGCGACTCTCGCTTCAGAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGCTGAGTGTACAAGATCACATGAGTCTGCGACTCTCGCTTCAGAT  688

seq1  CACATTTCTATACTCTGTGTGTAAAGCCAGTCTGTAGCCATGGAGCTAGC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTTCTATACTCTGTGTGTAAAGCCAGTCTGTAGCCATGGAGCTAGC  738

seq1  TCCTCAAATGCCCCTCATATGCTGAGAATATCATAAGTCAAAATTGTATT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCAAATGCCCCTCATATGCTGAGAATATCATAAGTCAAAATTGTATT  788

seq1  TTAGACCAAACCCAGACCATAAAAGTTCAGCAACACAGCATCCAGTACAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGACCAAACCCAGACCATAAAAGTTCAGCAACACAGCATCCAGTACAA  838

seq1  TATGAGGTATTTCTCCTTGTGACCAGGCAGATTACGGGAACCTTGGCTCT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGGTATTTCTCCTTGTGACCAGGCAGATTACGGGAACCTTGGCTCT  888

seq1  AGCCTGGTGTGCATCATTAAGAGAAAAGGCTGAACACAGATATGAGACTG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGGTGTGCATCATTAAGAGAAAAGGCTGAACACAGATATGAGACTG  938

seq1  GGGAAAATCAGAATTTAAAATTCAGAGGACAACCTCTACTGAGTACATAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAAATCAGAATTTAAAATTCAGAGGACAACCTCTACTGAGTACATAT  988

seq1  GGCTTTTGTGCCACTGTTAAGATCAATATCTCAAGTCCTACGTGCACACA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTTGTGCCACTGTTAAGATCAATATCTCAAGTCCTACGTGCACACA  1038

seq1  TTCTGAAAAGAACCCTGCTCTGAGAGCAAGGCCTCTAAAAGGAGGTAGAG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAAAAGAACCCTGCTCTGAGAGCAAGGCCTCTAAAAGGAGGTAGAG  1088

seq1  GGGCTCTGCTCTACATCCTAATTTTCAAGAAGGGGAAACAGGAGTTGGAA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCTGCTCTACATCCTAATTTTCAAGAAGGGGAAACAGGAGTTGGAA  1138

seq1  TTC  1150
      |||
seq2  TTC  1141

seq1: chr15_66538429_66539455
seq2: B6Ng01-164G01.g_66_1095

seq1  GAATTCTCACATGAAAGACTGGGGCTTCAGCGTATGACTCAGAACAGACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACATGAAAGACTGGGGCTTCAGCGTATGACTCAGAACAGACA  50

seq1  CAATGTCAAGTTCATAGCAAGCATAGGAGAAATATTTAAAGTATACTAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTCAAGTTCATAGCAAGCATAGGAGAAATATTTAAAGTATACTAAC  100

seq1  ACCTTCCTACAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCCTACAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  150

seq1  ACACACACACTACGTGAGGTACTGTGATGATATTTCTTTGTAGCTGTAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACTACGTGAGGTACTGTGATGATATTTCTTTGTAGCTGTAGA  200

seq1  GGGTTGGGCAACAACATTAACATTCCTCATTATTCCTCCTGAGTCAAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGGGCAACAACATTAACATTCCTCATTATTCCTCCTGAGTCAAAAG  250

seq1  CACTATTGGTGGACTGATCTGTAGACTATGGGCCAGGTGAAGAAAGGACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATTGGTGGACTGATCTGTAGACTATGGGCCAGGTGAAGAAAGGACT  300

seq1  TCCAGGGTGAGAAAGAAACTTGAACACAGGGATAGAGAAGTGTTCATTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGGTGAGAAAGAAACTTGAACACAGGGATAGAGAAGTGTTCATTTC  350

seq1  TAGATCCACCTCATACTCAAATTCCTGGATGTTGAGAGGGGGGGTTTCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCCACCTCATACTCAAATTCCTGGATGTTGAGAGGGGGGGTTTCCA  400

seq1  TTTAGATACTGGGCAATGCAATGAGATACAGGTCCTGCCTTCATAGAGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGATACTGGGCAATGCAATGAGATACAGGTCCTGCCTTCATAGAGCT  450

seq1  TCCATCAAATAGGATGCACTAAGTACCTAATCACAGGGAAATAGAAACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCAAATAGGATGCACTAAGTACCTAATCACAGGGAAATAGAAACAC  500

seq1  TGACCAAACTTACCCTTGTGAAGGAGAGGTTTCAATTCCAGGAAAAACTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAAACTTACCCTTGTGAAGGAGAGGTTTCAATTCCAGGAAAAACTG  550

seq1  TAGCATTGGACAAGACCAAGTTGGGGGTTTGGAGATGTTGTAGTCTATTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATTGGACAAGACCAAGTTGGGGGTTTGGAGATGTTGTAGTCTATTC  600

seq1  AGGCAGCTATTTCAAACTATCATAAGCTGGGTGGATTTTACAGGCAACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGCTATTTCAAACTATCATAAGCTGGGTGGATTTTACAGGCAACAG  650

seq1  AACTCTGTTTCTCACTATTCTGGAATCTGGAAGCTCAAGATCAAATTACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTGTTTCTCACTATTCTGGAATCTGGAAGCTCAAGATCAAATTACC  700

seq1  ATCAACTGAAAATACCACAGATGGTGACTTTCTAAGTGTCCTTATATCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAACTGAAAATACCACAGATGGTGACTTTCTAAGTGTCCTTATATCTT  750

seq1  AGAAGGCCTCACCTCCTACTATGATCACTGATGACTCCAAAATTTGGGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGCCTCACCTCCTACTATGATCACTGATGACTCCAAAATTTGGGTT  800

seq1  TGTGAGCCATTATGAAAGGTGCTCTATGGGCGACATGGGGTCTCAGTGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCCATTATGAAAGGTGCTCTATGGGCGACATGGGGTCTCAGTGGT  850

seq1  GTTCTTTGCTGGAGGTGGTTACACTACAAGCTTTCAGCCAGAATGTCTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTTCTTTGCTGGAGGTGGTTACACTACAAGCTTTCAGCCAG-ATGTCTGT  899

seq1  GTTACCCATGTAACTTAGTCATCACCATAGGGATCCT-GGGAGTTGGAAG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GTTACCCATGTAACTTAGTCATCACCATAGGGATCCTGGGGAGTTGGAAG  949

seq1  AGAAAGAGGGAGTTACAGAGACCTGTAACTCATTGC-TGTGTCCATCTC-  997
      ||||||||| || |||||||| |||||   |||||| |||||||||||| 
seq2  AGAAAGAGGAAG-TACAGAGAACTGTACTCCATTGCTTGTGTCCATCTCT  998

seq1  TTGTCCTAGGT-GTCAC-TGACTGTCAGAAGA  1027
      |||||||| || ||||| |||||| |||||||
seq2  TTGTCCTAAGTGGTCACTTGACTGGCAGAAGA  1030