BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-167K15
Chromosome15 (Build37)
Map Location 66,875,458 - 66,997,982
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSt3gal1
Upstream geneKcnq3, Lrrc6, LOC100040860, Tmem71, LOC100040881, Phf20l1, Tg, Sla, Wisp1, Ndrg1, LOC100040667
Downstream geneZfat1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-167K15.bB6Ng01-167K15.g
ACCDH959097DH959098
length1,140893
definitionDH959097|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167K15, 5' end.DH959098|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167K15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,875,458 - 66,876,615)(66,997,086 - 66,997,982)
sequence
gaattccaaccgaagtcttcatatttgtacagcaagccccttgctgtctg
agccatctcccccgcatcttaaatgcttttatgtcccagccacagttata
ctccctaacacacaaatgagccatcacaaccccatttctctttatatcag
tgcttctcagccttccaatgctgcaaccctttaatatggttccttagact
gtggtggccccaaccataacattatttcattattacttcgtacctgtgtc
ctgccatttgccccatagctagaatgactcctaccagtactgaaaaatgc
cctggtggcccgtcatcttcctggcaaccaggaggacagagagggtccaa
tcatgaaacccctggactcccagcaatgatacagttgtagtagatttcaa
tctcgaggttgccactttacagctgcgtgtctctgatgaaatgagttcac
ctcccttgagttcggatcaccaggaggacgggtgctgaggcaggagtact
cactgacttagtgtggtccagcatgagctgggaattgaagcacaccacca
aggtgataggatcccaaccctcagcttgttttgccccatccctggcctaa
gcaaacttctcaacccatcactcggaggctcagagacacagtgctccaga
aaatagttatgtggaagctgagccagggcccttgggtgcaggctttgttt
tggaaacaaccgccctcaggctgggaggaggggactgtgccccaagtctg
actctgcgccccagaactcaggtcctctgtgcctgcctctgtaaataaag
ggtagcgcagcttgataacctgcccctccccaaccctggctcgctctaag
ttgtttcccagaaaagctaaatgtcaggacctagagcaccaacccaaatt
cagcaccgtgtgtgtttttgtagctccagagagctaggaatgggttttat
acttctgaaaaataattaaaaaaaaaaaaagatcagaagaatatattttt
ctacatttgaaaatgacagaattcaaatgtagtgtccataatagcgttgt
actggatgcgccaggagcgctcactacatgttgtctaggcagcttctctg
ctccctactcctttgcttttctggaaaagcagcttgccct
gaattcctgatctttccaagacttttatcataaatgggtgttggatcttg
tcgaatgctttttgacttggagtgtttttgtctattcttctcttccttat
caccttgagacagggtccctcactgagccagaagctgttttgtcaagact
ttctggccagcaaactttccgggtctagctatctctgaaccccaatacag
aatttccaagcttatgcagtcatgcttggcttttacatgggtactgggga
ctcaactcaggtctttctctctgcaaagcaagtgttttgcccactaagcc
ttcgctctagctttttaaacgttgagtttttattcccgagaaggttaatt
ttggacaaattagtgtggagacaggtgatgccccaccatgacctttcaaa
ttcccatttaaagatcatagaactaagactggaaatatttatattaaaag
tgtcttctgtgaaaggatggaacatttagagactactatatctggggatc
catcccataatcagcttctaaacgctgacaccattgcatacactagcaag
attttactgaaagaacccagatatagctgtctcttgtgagactgtgtttg
ctatgctggggcctatcaaacacagaagtggatgctcacagtcagctatt
ggatggatcacaggacccccaatggaggagctagagaaagtacccaagga
gctaaagggatctgcatccctatagatggaacaacaatatgaactaacca
gtagccccctccccgagctcatgtctctagctgaatatgaatcagagatg
gcctagtcggcatcagtggaaagagaggccattggtcgtgcaaactttat
atgactcagtacagggtaatgccagggccaagaagtggagtgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_66875458_66876615
seq2: B6Ng01-167K15.b_44_1183

seq1  GAATTCCAACCGAAGTCTTCATATTTGTACAGCAAGCCCCTTGCTGTCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAACCGAAGTCTTCATATTTGTACAGCAAGCCCCTTGCTGTCTG  50

seq1  AGCCATCTCCCCCGCATCTTAAATGCTTTTATGTCCCAGCCACAGTTATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATCTCCCCCGCATCTTAAATGCTTTTATGTCCCAGCCACAGTTATA  100

seq1  CTCCCTAACACACAAATGAGCCATCACAACCCCATTTCTCTTTATATCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTAACACACAAATGAGCCATCACAACCCCATTTCTCTTTATATCAG  150

seq1  TGCTTCTCAGCCTTCCAATGCTGCAACCCTTTAATATGGTTCCTTAGACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCTCAGCCTTCCAATGCTGCAACCCTTTAATATGGTTCCTTAGACT  200

seq1  GTGGTGGCCCCAACCATAACATTATTTCATTATTACTTCGTACCTGTGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGGCCCCAACCATAACATTATTTCATTATTACTTCGTACCTGTGTC  250

seq1  CTGCCATTTGCCCCATAGCTAGAATGACTCCTACCAGTACTGAAAAATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCATTTGCCCCATAGCTAGAATGACTCCTACCAGTACTGAAAAATGC  300

seq1  CCTGGTGGCCCGTCATCTTCCTGGCAACCAGGAGGACAGAGAGGGTCCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTGGCCCGTCATCTTCCTGGCAACCAGGAGGACAGAGAGGGTCCAA  350

seq1  TCATGAAACCCCTGGACTCCCAGCAATGATACAGTTGTAGTAGATTTCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAAACCCCTGGACTCCCAGCAATGATACAGTTGTAGTAGATTTCAA  400

seq1  TCTCGAGGTTGCCACTTTACAGCTGCGTGTCTCTGATGAAATGAGTTCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCGAGGTTGCCACTTTACAGCTGCGTGTCTCTGATGAAATGAGTTCAC  450

seq1  CTCCCTTGAGTTCGGATCACCAGGAGGACGGGTGCTGAGGCAGGAGTACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTTGAGTTCGGATCACCAGGAGGACGGGTGCTGAGGCAGGAGTACT  500

seq1  CACTGACTTAGTGTGGTCCAGCATGAGCTGGGAATTGAAGCACACCACCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGACTTAGTGTGGTCCAGCATGAGCTGGGAATTGAAGCACACCACCA  550

seq1  AGGTGATAGGATCCCAACCCTCAGCTTGTTTTGCCCCATCCCTGGCCTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGATAGGATCCCAACCCTCAGCTTGTTTTGCCCCATCCCTGGCCTAA  600

seq1  GCAAACTTCTCAACCCATCACTCGGAGGCTCAGAGACACAGTGCTCCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACTTCTCAACCCATCACTCGGAGGCTCAGAGACACAGTGCTCCAGA  650

seq1  AAATAGTTATGTGGAAGCTGAGCCAGGGCCCTTGGGTGCAGGCTTTGTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGTTATGTGGAAGCTGAGCCAGGGCCCTTGGGTGCAGGCTTTGTTT  700

seq1  TGGAAACAACCGCCCTCAGGCTGGGAGGAGGGGACTGTGCCCCAAGTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAACAACCGCCCTCAGGCTGGGAGGAGGGGACTGTGCCCCAAGTCTG  750

seq1  ACTCTGCGCCCCAGAACTCAGGTCCTCTGTGCCTGCCTCTGTAAAT-AAG  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ACTCTGCGCCCCAGAACTCAGGTCCTCTGTGCCTGCCTCTGTAAATAAAG  800

seq1  GGTAGCGCAGGCTTGATAACCTGCCCCTCCCCAACCCTGGCTCGCTCTAA  849
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGCGCA-GCTTGATAACCTGCCCCTCCCCAACCCTGGCTCGCTCTAA  849

seq1  GTTGTTTCCCAGAAAAGCTAAATGTCAGGACCTAGAGCACCAACCCAAAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTTCCCAGAAAAGCTAAATGTCAGGACCTAGAGCACCAACCCAAAT  899

seq1  TCAGCACCGTGTGTGTTTTTGTAGCTCCAGAGAGCTAGGAATGGTTTTTA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TCAGCACCGTGTGTGTTTTTGTAGCTCCAGAGAGCTAGGAATGGGTTTTA  949

seq1  TACTTCTGAAAAAATAATTAAAAAAAAAAAAAGAATCAGAAGAATAATAT  999
      |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  TACTTCTG-AAAAATAATTAAAAAAAAAAAAAG-ATCAGAAGAAT-ATAT  996

seq1  TTTCTAACATTTGAAAAATGACAGAATTCAAATGTTAGTGTCCATAAATA  1049
      |||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  TTTTCTACATTTG-AAAATGACAGAATTCAAATG-TAGTGTCCAT-AATA  1043

seq1  GCGTTGTACTGGGATGCGGCCAGGAGCGCTCACTTACATGTTGTCTAGGG  1099
      |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||
seq2  GCGTTGTACT-GGATGC-GCCAGGAGCGCTCAC-TACATGTTGTCTA-GG  1089

seq1  CAGC-TCTCTGGCTCCCAACTCTCTGGCTTTTCCTGGAAAAAGCAGCTGC  1148
      |||| ||||| |||||| ||||  | |||||| |||| ||||||||    
seq2  CAGCTTCTCT-GCTCCCTACTCCTTTGCTTTT-CTGG-AAAAGCAG----  1132

seq1  CTCTTGCCCT  1158
        ||||||||
seq2  --CTTGCCCT  1140

seq1: chr15_66997086_66997982
seq2: B6Ng01-167K15.g_69_961 (reverse)

seq1  CCACTCCCACTTCTTGGCCCTGGCATTACCCTGTACTGAGTCATATAAAG  50
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACT-CCACTTCTTGGCCCTGGCATTACCCTGTACTGAGTCATATAAAG  49

seq1  TTTGCACGACCAATGGGCCTCTCTTTCCACTGATGGCCGACTAGGCCATC  100
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TTTGCACGACCAAT-GGCCTCTCTTTCCACTGAT-GCCGACTAGGCCATC  97

seq1  TTCTGATTCATATTCAGCTAGAGACATGAGCTCGGGGAGGGGGCTACTGG  150
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TCTGATTCATATTCAGCTAGAGACATGAGCTCGGGGAGGGGGCTACTGG  146

seq1  TTAGTTCATATTGTTGTTCCATCTATAGGGATGCAGATCCCTTTAGCTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTCATATTGTTGTTCCATCTATAGGGATGCAGATCCCTTTAGCTCC  196

seq1  TTGGGTACTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGTCCTGTGATCCATCCAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTACTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGTCCTGTGATCCATCCAAT  246

seq1  AGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGATAGGCCCCAGCATAGCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGATAGGCCCCAGCATAGCAA  296

seq1  ACACAGTCTCACAAGAGACAGCTATATCTGGGTTCTTTCAGTAAAATCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGTCTCACAAGAGACAGCTATATCTGGGTTCTTTCAGTAAAATCTT  346

seq1  GCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTAGAAGCTGATTATGGGATGGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTAGAAGCTGATTATGGGATGGAT  396

seq1  CCCCAGATATAGTAGTCTCTAAATGTTCCATCCTTTCACAGAAGACACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGATATAGTAGTCTCTAAATGTTCCATCCTTTCACAGAAGACACTT  446

seq1  TTAATATAAATATTTCCAGTCTTAGTTCTATGATCTTTAAATGGGAATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATAAATATTTCCAGTCTTAGTTCTATGATCTTTAAATGGGAATTT  496

seq1  GAAAGGTCATGGTGGGGCATCACCTGTCTCCACACTAATTTGTCCAAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGTCATGGTGGGGCATCACCTGTCTCCACACTAATTTGTCCAAAAT  546

seq1  TAACCTTCTCGGGAATAAAAACTCAACGTTTAAAAAGCTAGAGCGAAGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCTTCTCGGGAATAAAAACTCAACGTTTAAAAAGCTAGAGCGAAGGC  596

seq1  TTAGTGGGCAAAACACTTGCTTTGCAGAGAGAAAGACCTGAGTTGAGTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGGGCAAAACACTTGCTTTGCAGAGAGAAAGACCTGAGTTGAGTCC  646

seq1  CCAGTACCCATGTAAAAGCCAAGCATGACTGCATAAGCTTGGAAATTCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTACCCATGTAAAAGCCAAGCATGACTGCATAAGCTTGGAAATTCTG  696

seq1  TATTGGGGTTCAGAGATAGCTAGACCCGGAAAGTTTGCTGGCCAGAAAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGGGTTCAGAGATAGCTAGACCCGGAAAGTTTGCTGGCCAGAAAGT  746

seq1  CTTGACAAAACAGCTTCTGGCTCAGTGAGGGACCCTGTCTCAAGGTGATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGACAAAACAGCTTCTGGCTCAGTGAGGGACCCTGTCTCAAGGTGATA  796

seq1  AGGAAGAGAAGAATAGACAAAAACACTCCAAGTCAAAAAGCATTCGACAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGAGAAGAATAGACAAAAACACTCCAAGTCAAAAAGCATTCGACAA  846

seq1  GATCCAACACCCATTTATGATAAAAGTCTTGGAAAGATCAGGAATTC  897
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCAACACCCATTTATGATAAAAGTCTTGGAAAGATCAGGAATTC  893