BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168H08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 62,158,141 - 62,289,583
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMyc, Pvt1, LOC100040584, H2afy3
Downstream geneLOC100040430, Tsg101-ps
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168H08.bB6Ng01-168H08.g
ACCDH959691DH959692
length1,227860
definitionDH959691|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168H08, 5' end.DH959692|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168H08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(62,158,141 - 62,159,369)(62,288,724 - 62,289,583)
sequence
gaattcacgtggcaagcagtttacaagcctgaactttccctgcagcctga
actttgttttctgagcttcaagatactacagttgggtgaacagattttag
tacatccatgtaagcacacatagggcagatatgggctcaactgagagact
ctgtctcaaaagataaggtggagagtgatcaagaaggactctcaacatta
acctagggcctaatcatgcagatggcaccgtttcttggctttagttccag
gcctgtttagcagcggagaagttgagttgaccaatcatacatgtattcat
tcccttcctgcccttgactagctgcttagaagttcctgctgccttgactg
gttcactggcctagaagtgaaagctggaatactaccatcctcctctgagt
ttctttggtgatcccatcaccaggagcaaagcagaatagtggggataaca
gtttcctaggaaatgctggagaggcatttcacacgggaggaacccaacat
ggaaaatctaagaagaaggacaagatcgtcccaggaggaagccttgactt
acccaaggtcatatatgatgggtatgagtgaactccagaagtgacacttc
ttctgttgacgccacattttgattcttccttaaatatagtgactatgtca
catagtctacaaccaacactgtgctgggatctgccaatgtcagtgggatt
atgagcctgtcttctgacctcatgcttctctacttcctccagagtttgag
actataaaggtcacctttacattctatgtctttcgtcttcctgagcttga
ccctctgcttcggaagacgcatgcttaagcttgcctagaaaccctcattg
cacagccctttagttgccccttctgtatgactctctttgtagacaaaacc
acaaaccccgatgggcaattagagatttcagtggcagcaatttgggatga
ttttggctaattgctgtcctgtgtgaaagaggtgacatcgtctttgacag
ctggcctgagcagtcagcagtgtgtgaggagagtttcttcttctgacttt
gaagtggtggtggggccaggtggcagtgacttgctgtagtcagtcagaaa
tgttgtggtctgcctttagtcctgtccttgccaacccttgagctctggcc
gaactgcacagaataatagctttagagatgctaggttatatttcctcact
ctctcaggtttagccagctaacaaggg
gaattccaggtgtttgtgtacttgaatcacaacacaatgcctccaaacct
cccattttctcactggatgtagaattaaatccaaggaaattatgtaggga
cataggtatcaggggtattaactgcttctccattttcttccccacctccc
tgtcttttgacagtactgggagctgaacccagtactgagaagggaactag
gagctaacctgtatgctgggcaagcactgccactgagctacagtcttgct
tatttgctctttttttttcttttcaagcaattttaatgcccttcagctaa
ctccttgaatgaaccagaggttcatatgcctaaggattatcccttggttt
agaaagagggaggtatgggaaaatgattaatggagcatggtgctctcaat
agaacgaggcgggtgcgacaccatgccacactttgagtaacaaaatgcca
ccaaatatgtacacattgaatcccatagacagacacaataaatgtgcaac
agcaggttgattctcaggggcagaattcaggggttgaggataggactggg
atagagaccttttactcatagtagtttacttttgtacaatgtgcattgca
ttcataatgcaaagaaacagacacaggatcctcacagcacatgaaaagat
agcaagcctccctcctcacaggttcaacctcctggaggtactatcaggat
gggggaggagacagggggaggagacagggggaggtgcatgcctctgttat
taccatttttggtactttttttttctaacacgatgtgtttgtgtgggtca
agcccaattctagaaattgagaaagttgtccttagagtacagccctcaat
ttcctggatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_62158141_62159369
seq2: B6Ng01-168H08.b_43_1269

seq1  GAATTCACGTGGCAAGCAGTTTACAAGCCTGAACTTTCCCTGCAGCCTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACGTGGCAAGCAGTTTACAAGCCTGAACTTTCCCTGCAGCCTGA  50

seq1  ACTTTGTTTTCTGAGCTTCAAGATACTACAGTTGGGTGAACAGATTTTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGTTTTCTGAGCTTCAAGATACTACAGTTGGGTGAACAGATTTTAG  100

seq1  TACATCCATGTAAGCACACATAGGGCAGATATGGGCTCAACTGAGAGACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCCATGTAAGCACACATAGGGCAGATATGGGCTCAACTGAGAGACT  150

seq1  CTGTCTCAAAAGATAAGGTGGAGAGTGATCAAGAAGGACTCTCAACATTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTCAAAAGATAAGGTGGAGAGTGATCAAGAAGGACTCTCAACATTA  200

seq1  ACCTAGGGCCTAATCATGCAGATGGCACCGTTTCTTGGCTTTAGTTCCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAGGGCCTAATCATGCAGATGGCACCGTTTCTTGGCTTTAGTTCCAG  250

seq1  GCCTGTTTAGCAGCGGAGAAGTTGAGTTGACCAATCATACATGTATTCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTTTAGCAGCGGAGAAGTTGAGTTGACCAATCATACATGTATTCAT  300

seq1  TCCCTTCCTGCCCTTGACTAGCTGCTTAGAAGTTCCTGCTGCCTTGACTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTCCTGCCCTTGACTAGCTGCTTAGAAGTTCCTGCTGCCTTGACTG  350

seq1  GTTCACTGGCCTAGAAGTGAAAGCTGGAATACTACCATCCTCCTCTGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCACTGGCCTAGAAGTGAAAGCTGGAATACTACCATCCTCCTCTGAGT  400

seq1  TTCTTTGGTGATCCCATCACCAGGAGCAAAGCAGAATAGTGGGGATAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTGGTGATCCCATCACCAGGAGCAAAGCAGAATAGTGGGGATAACA  450

seq1  GTTTCCTAGGAAATGCTGGAGAGGCATTTCACACGGGAGGAACCCAACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCTAGGAAATGCTGGAGAGGCATTTCACACGGGAGGAACCCAACAT  500

seq1  GGAAAATCTAAGAAGAAGGACAAGATCGTCCCAGGAGGAAGCCTTGACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAATCTAAGAAGAAGGACAAGATCGTCCCAGGAGGAAGCCTTGACTT  550

seq1  ACCCAAGGTCATATATGATGGGTATGAGTGAACTCCAGAAGTGACACTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAGGTCATATATGATGGGTATGAGTGAACTCCAGAAGTGACACTTC  600

seq1  TTCTGTTGACGCCACATTTTGATTCTTCCTTAAATATAGTGACTATGTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTTGACGCCACATTTTGATTCTTCCTTAAATATAGTGACTATGTCA  650

seq1  CATAGTCTACAACCAACACTGTGCTGGGATCTGCCAATGTCAGTGGGATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTCTACAACCAACACTGTGCTGGGATCTGCCAATGTCAGTGGGATT  700

seq1  ATGAGCCTGTCTTCTGACCTCATGCTTCTCTACTTCCTCCAGAGTTTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCCTGTCTTCTGACCTCATGCTTCTCTACTTCCTCCAGAGTTTGAG  750

seq1  ACTATAAAGGTCACCTTTACATTCTATGTCTTTCGTCTTCCTGAGCTTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATAAAGGTCACCTTTACATTCTATGTCTTTCGTCTTCCTGAGCTTGA  800

seq1  CCCTCTGCTTCGGAAGACGCATGCTTAAGCTTGCCTAGAAACCCTCATTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGCTTCGGAAGACGCATGCTTAAGCTTGCCTAGAAACCCTCATTG  850

seq1  CACAGCCCTTTAGTTGCCCCTTCTGTATGACTCTCTTTGTAGACAAAACC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCCCTTTAGTTGCCCCTTCTGTATGACTCTCTTTGTAGACAAAACC  900

seq1  ACAAACCCCGATGGGCAATTAGAGATTTTCAGTGGCAGCAATTTGGGATG  950
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACCCCGATGGGCAATTAGAGA-TTTCAGTGGCAGCAATTTGGGATG  949

seq1  ATTTTGGCTAATTGCTGTCCTGTGTGAAAGAGTGGACATCGTCTTTGACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||
seq2  ATTTTGGCTAATTGCTGTCCTGTGTGAAAGAGGTGACATCGTCTTTGACA  999

seq1  GCTGGCCTGAGCAGTCAGCAGTGTGTGAGGAGAGTTTC-TCTTCTGACTT  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GCTGGCCTGAGCAGTCAGCAGTGTGTGAGGAGAGTTTCTTCTTCTGACTT  1049

seq1  TGAAAGTGGTGGTGGGGGCAGGGTGGGCAGTGACCTGCTGTAGTCAGTCA  1099
      || |||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||
seq2  TG-AAGTGGTGGTGGGGCCAGG--TGGCAGTGACTTGCTGTAGTCAGTCA  1096

seq1  GAAATGTTGT-GTCTGCCTTTAGCCCTGCACTGGCAAACCCCTGAGCTCT  1148
      |||||||||| |||||||||||| ||||  || || ||||| ||||||||
seq2  GAAATGTTGTGGTCTGCCTTTAGTCCTGTCCTTGCCAACCCTTGAGCTCT  1146

seq1  GGCAGACACTGCACAGATTAAATAGGCTTTAGAGTATGCAGAGTTATATT  1198
      ||| || |||||||||| | |||| ||||||||| ||||   ||||||||
seq2  GGCCGA-ACTGCACAGAAT-AATA-GCTTTAGAG-ATGCTAGGTTATATT  1192

seq1  --CTCACTCAC---AGTTTAGCAAGTTTAACAAGGG  1229
        ||||||| |    ||||||| ||  |||||||||
seq2  TCCTCACTCTCTCAGGTTTAGCCAG-CTAACAAGGG  1227

seq1: chr15_62288724_62289583
seq2: B6Ng01-168H08.g_68_927 (reverse)

seq1  ATTCCAGGAACTCG-GGGCTGTACTCTAAAGAGCAGCTTTTCTC-ACTTC  48
      | |||||||| | | |||||||||||||| || || | |||||| | |||
seq2  AATCCAGGAAATTGAGGGCTGTACTCTAAGGA-CAAC-TTTCTCAATTTC  48

seq1  TGGCTCTGGGCTTTGACCCACAC-AACACATCCTGTTAGAAAAAAAAAGT  97
      | |   ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
seq2  TAGAATTGGGC-TTGACCCACACAAACACATCGTGTTAGAAAAAAAAAGT  97

seq1  ACCAAAAATGGTAATGACAGAGGCATGCACCTCCCCCTGTCTCCTCCCCC  147
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAAAATGGTAATAACAGAGGCATGCACCTCCCCCTGTCTCCTCCCCC  147

seq1  TGTCTCCTCCCCCATCCTGATAGTACCTCCAGGAGGTTGAACCTGTGAGG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCCTCCCCCATCCTGATAGTACCTCCAGGAGGTTGAACCTGTGAGG  197

seq1  AGGGAGGCTTGCTATCTTTTCATGTGCTGTGAGGATCCTGTGTCTGTTTC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGGCTTGCTATCTTTTCATGTGCTGTGAGGATCCTGTGTCTGTTTC  247

seq1  TTTGCATTATGAATGCAATGCACATTGTACAAAAGTAAACTACTATGAGT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCATTATGAATGCAATGCACATTGTACAAAAGTAAACTACTATGAGT  297

seq1  AAAAGGTCTCTATCCCAGTCCTATCCTCAACCCCTGAATTCTGCCCCTGA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGTCTCTATCCCAGTCCTATCCTCAACCCCTGAATTCTGCCCCTGA  347

seq1  GAATCAACCTGCTGTTGCACATTTATTGTGTCTGTCTATGGGATTCAATG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCAACCTGCTGTTGCACATTTATTGTGTCTGTCTATGGGATTCAATG  397

seq1  TGTACATATTTGGTGGCATTTTGTTACTCAAAGTGTGGCATGGTGTCGCA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACATATTTGGTGGCATTTTGTTACTCAAAGTGTGGCATGGTGTCGCA  447

seq1  CCCGCCTCGTTCTATTGAGAGCACCATGCTCCATTAATCATTTTCCCATA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGCCTCGTTCTATTGAGAGCACCATGCTCCATTAATCATTTTCCCATA  497

seq1  CCTCCCTCTTTCTAAACCAAGGGATAATCCTTAGGCATATGAACCTCTGG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCTCTTTCTAAACCAAGGGATAATCCTTAGGCATATGAACCTCTGG  547

seq1  TTCATTCAAGGAGTTAGCTGAAGGGCATTAAAATTGCTTGAAAAGAAAAA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTCAAGGAGTTAGCTGAAGGGCATTAAAATTGCTTGAAAAGAAAAA  597

seq1  AAAAGAGCAAATAAGCAAGACTGTAGCTCAGTGGCAGTGCTTGCCCAGCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAGCAAATAAGCAAGACTGTAGCTCAGTGGCAGTGCTTGCCCAGCA  647

seq1  TACAGGTTAGCTCCTAGTTCCCTTCTCAGTACTGGGTTCAGCTCCCAGTA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGTTAGCTCCTAGTTCCCTTCTCAGTACTGGGTTCAGCTCCCAGTA  697

seq1  CTGTCAAAAGACAGGGAGGTGGGGAAGAAAATGGAGAAGCAGTTAATACC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCAAAAGACAGGGAGGTGGGGAAGAAAATGGAGAAGCAGTTAATACC  747

seq1  CCTGATACCTATGTCCCTACATAATTTCCTTGGATTTAATTCTACATCCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATACCTATGTCCCTACATAATTTCCTTGGATTTAATTCTACATCCA  797

seq1  GTGAGAAAATGGGAGGTTTGGAGGCATTGTGTTGTGATTCAAGTACACAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAAAATGGGAGGTTTGGAGGCATTGTGTTGTGATTCAAGTACACAA  847

seq1  ACACCTGGAATTC  860
      |||||||||||||
seq2  ACACCTGGAATTC  860