BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-191P10
Chromosome15 (Build37)
Map Location 87,255,959 - 87,379,067
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneTbc1d22a, LOC100042309
Downstream geneAW049604, LOC100042329, LOC100042340
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-191P10.bB6Ng01-191P10.g
ACCGA015328GA015329
length8361,164
definitionB6Ng01-191P10.b B6Ng01-191P10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(87,378,240 - 87,379,067)(87,255,959 - 87,257,124)
sequence
gaattcagcagggaggagtcttgtgtagtcaagctcttttactggttcca
accgcctgtggcatcagtggggtctggatagctcataactaacgggagca
agaatccagcccagtatggaagtgtaaagtaggcagtagactctgataaa
aaaatggccccaccgggaggttggggggaagggcaggggtagtctagaca
ctctgtccaggagcagccctagctctgaacgagagcaagggatagtcaag
tccaagttgattcctgcaggtttctaaacagaaaaccctcaaaggatgca
aaatgcctgtctccatgtgtaccccgcccccttcccggctctgagtccag
ctagggaatacagcctatagttactttatgtggctgaaagaaacagtgta
tttcccgctagatgttcatcaaataaaaacatagggcacaggaggcagga
agtgaaagggagcgctacttccagaaaggcatcactttgtgaagcctgtg
gtcttttcaattttacctccttgagaacttcagaaatcacatttgatcag
caggagtacagcacattgctgtccgcactaagtatgccacaaattgtatt
tgtaaaggaaatgcgtgttggggaccatcaaagtgcctacgctcggttag
tattctaatggattaaaaacaattcaaaaacttgttttgtaatttctttc
tactcgcagctgtggacatgagattttaactgaacggcacaattcaattc
taacaggatttatttgaggggggaaaaaaacaactctattgttaaagagg
cgggcccactgtctctcctccactggaactccccgg
gaattctcactgcccaccacagaccacaacaatatgtaatgatcaagatg
gaaatgtccagaataagccaacaaactgaggatagtctgacatagaagtt
aaggtctgggggcaggatttggggagggagcttttggtagtctaggtatc
tgagcaagagaaactccttccacatcacagtccaagagacaagaacttca
catcccctgcctactagatagacatactcagccttaccaagggacacatg
agacaggcatgggttgaatggagactcttcttcttagcattaaaaggctt
cacactcccaaacaaagtcagaccaagactctgactatcaggacaacaca
gaaggaaggcattgctttttccatcttccttgggaatgaagagatgtctc
agttcttgggcttttcacggtgattagactgtccatcactgagagtggat
agagcatacctgacactttacgattggatgactcctctgggctaagcagg
tgagtctgggttacctctgacaccagctgtgcaatggactatggatctta
cctacctcccacctccaataaggcgatgctggcagagactcagttccact
ctctgcccattgattcagtcaacgtggccacactgtgtacaaaatcacag
acacagaagctcctagatgtggcaggttgggatttgtgaataaagtggat
atttcaagaccttcatctgtgtcgatgtagctgggtctaacctgtgccct
ttggctataagacaactacaaaataagggtagagattaatgctttctttg
acctttgaccttttgtcatagcaagtggtggaaaacagagatgagggagc
ccttggggcaaccaaattttgtagccagaggtgaaagttagggttgtatg
ctaacacccttgaatgagtaggtggtatcctgacattttacagaggatga
tacccctaagccctggagttatggccctcacaagtatttgagcttcagtt
gtatgtacaaattacaccaaattattgtcacaattgttacaaataacatg
tctgtacagagagttaagtgtacttacagtggacgatgttttccaactag
gaccttgagtagatatgcgctccagcaaatgacatatgtctcatcaacac
ctccagtcttgcag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_87378240_87379067
seq2: B6Ng01-191P10.b_46_881 (reverse)

seq1  CCGGGGAGTT-CAGTGGAGGAGAGACAGTGGGCCCGCCTCTTTAAC-ATA  48
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CCGGGGAGTTCCAGTGGAGGAGAGACAGTGGGCCCGCCTCTTTAACAATA  50

seq1  GAGTTGTTTTTT--CCCCCTCAAATAAATCCTGTTAGAATTGAATTGTGC  96
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTGTTTTTTTCCCCCCTCAAATAAATCCTGTTAGAATTGAATTGTGC  100

seq1  CGTTCAGTT-AAATCTCATGTCCACAGCTGCGAGTAG-AAGAAATTAC-A  143
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
seq2  CGTTCAGTTAAAATCTCATGTCCACAGCTGCGAGTAGAAAGAAATTACAA  150

seq1  AACAAG-TTTTGAATTGTTTTTAATCCATTAGAATACTAACCGAGCGTAG  192
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGTTTTTGAATTGTTTTTAATCCATTAGAATACTAACCGAGCGTAG  200

seq1  GCACTTTGATGGTCCCCAACACGCATTTCCTTTACAAATACAATTTGTGG  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTTTGATGGTCCCCAACACGCATTTCCTTTACAAATACAATTTGTGG  250

seq1  CATACTTAGTGCGGACAGCAATGTGCTGTACTCCTGCTGATCAAATGTGA  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTTAGTGCGGACAGCAATGTGCTGTACTCCTGCTGATCAAATGTGA  300

seq1  TTTCTGAAGTTCTCAAGGAGGTAAAATTGAAAAGACCACAGGCTTCACAA  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGAAGTTCTCAAGGAGGTAAAATTGAAAAGACCACAGGCTTCACAA  350

seq1  AGTGATGCCTTTCTGGAAGTAGCGCTCCCTTTCACTTCCTGCCTCCTGTG  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATGCCTTTCTGGAAGTAGCGCTCCCTTTCACTTCCTGCCTCCTGTG  400

seq1  CCCTATGTTTTTATTTGATGAACATCTAGCGGGAAATACACTGTTTCTTT  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTATGTTTTTATTTGATGAACATCTAGCGGGAAATACACTGTTTCTTT  450

seq1  CAGCCACATAAAGTAACTATAGGCTGTATTCCCTAGCTGGACTCAGAGCC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCACATAAAGTAACTATAGGCTGTATTCCCTAGCTGGACTCAGAGCC  500

seq1  GGGAAGGGGGCGGGGTACACATGGAGACAGGCATTTTGCATCCTTTGAGG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGGGGGCGGGGTACACATGGAGACAGGCATTTTGCATCCTTTGAGG  550

seq1  GTTTTCTGTTTAGAAACCTGCAGGAATCAACTTGGACTTGACTATCCCTT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCTGTTTAGAAACCTGCAGGAATCAACTTGGACTTGACTATCCCTT  600

seq1  GCTCTCGTTCAGAGCTAGGGCTGCTCCTGGACAGAGTGTCTAGACTACCC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCGTTCAGAGCTAGGGCTGCTCCTGGACAGAGTGTCTAGACTACCC  650

seq1  CTGCCCTTCCCCCCAACCTCCCGGTGGGGCCATTTTTTTATCAGAGTCTA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCTTCCCCCCAACCTCCCGGTGGGGCCATTTTTTTATCAGAGTCTA  700

seq1  CTGCCTACTTTACACTTCCATACTGGGCTGGATTCTTGCTCCCGTTAGTT  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTACTTTACACTTCCATACTGGGCTGGATTCTTGCTCCCGTTAGTT  750

seq1  ATGAGCTATCCAGACCCCACTGATGCCACAGGCGGTTGGAACCAGTAAAA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCTATCCAGACCCCACTGATGCCACAGGCGGTTGGAACCAGTAAAA  800

seq1  GAGCTTGACTACACAAGACTCCTCCCTGCTGAATTC  828
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTGACTACACAAGACTCCTCCCTGCTGAATTC  836

seq1: chr15_87255959_87257124
seq2: B6Ng01-191P10.g_72_1235

seq1  GAATTCTCACTGCCCACCACAGACCACAACAATATGTAATGATCAAGATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACTGCCCACCACAGACCACAACAATATGTAATGATCAAGATG  50

seq1  GAAATGTCCAGAATAAGCCAACAAACTGAGGATAGTCTGACATAGAAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGTCCAGAATAAGCCAACAAACTGAGGATAGTCTGACATAGAAGTT  100

seq1  AAGGTCTGGGGGCAGGATTTGGGGAGGGAGCTTTTGGTAGTCTAGGTATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCTGGGGGCAGGATTTGGGGAGGGAGCTTTTGGTAGTCTAGGTATC  150

seq1  TGAGCAAGAGAAACTCCTTCCACATCACAGTCCAAGAGACAAGAACTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAAGAGAAACTCCTTCCACATCACAGTCCAAGAGACAAGAACTTCA  200

seq1  CATCCCCTGCCTACTAGATAGACATACTCAGCCTTACCAAGGGACACATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCCTGCCTACTAGATAGACATACTCAGCCTTACCAAGGGACACATG  250

seq1  AGACAGGCATGGGTTGAATGGAGACTCTTCTTCTTAGCATTAAAAGGCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGGCATGGGTTGAATGGAGACTCTTCTTCTTAGCATTAAAAGGCTT  300

seq1  CACACTCCCAAACAAAGTCAGACCAAGACTCTGACTATCAGGACAACACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTCCCAAACAAAGTCAGACCAAGACTCTGACTATCAGGACAACACA  350

seq1  GAAGGAAGGCATTGCTTTTTCCATCTTCCTTGGGAATGAAGAGATGTCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAAGGCATTGCTTTTTCCATCTTCCTTGGGAATGAAGAGATGTCTC  400

seq1  AGTTCTTGGGCTTTTCACGGTGATTAGACTGTCCATCACTGAGAGTGGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTTGGGCTTTTCACGGTGATTAGACTGTCCATCACTGAGAGTGGAT  450

seq1  AGAGCATACCTGACACTTTACGATTGGATGACTCCTCTGGGCTAAGCAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCATACCTGACACTTTACGATTGGATGACTCCTCTGGGCTAAGCAGG  500

seq1  TGAGTCTGGGTTACCTCTGACACCAGCTGTGCAATGGACTATGGATCTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCTGGGTTACCTCTGACACCAGCTGTGCAATGGACTATGGATCTTA  550

seq1  CCTACCTCCCACCTCCAATAAGGCGATGCTGGCAGAGACTCAGTTCCACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCTCCCACCTCCAATAAGGCGATGCTGGCAGAGACTCAGTTCCACT  600

seq1  CTCTGCCCATTGATTCAGTCAACGTGGCCACACTGTGTACAAAATCACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCCCATTGATTCAGTCAACGTGGCCACACTGTGTACAAAATCACAG  650

seq1  ACACAGAAGCTCCTAGATGTGGCAGGTTGGGATTTGTGAATAAAGTGGGA  700
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ACACAGAAGCTCCTAGATGTGGCAGGTTGGGATTTGTGAATAAAGT-GGA  699

seq1  TATTTCAAGACCTTCATCTGTGTCGATGTAGCTGGGTCTAACCTGTGCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCAAGACCTTCATCTGTGTCGATGTAGCTGGGTCTAACCTGTGCCC  749

seq1  TTTGGCTATAAGACAACTACAAAATAAGGGTAGAGATTAATGCTTTC-TT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTTGGCTATAAGACAACTACAAAATAAGGGTAGAGATTAATGCTTTCTTT  799

seq1  GACCTTTGACC-TTTGTCATAGCAAGTGGTGGAAAACAGAGATGAGGGAG  848
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTTGACCTTTTGTCATAGCAAGTGGTGGAAAACAGAGATGAGGGAG  849

seq1  CCCTT-GGGCACCCAAA-TTTGTAGCCAGAGGTGAAAG-TAGGGTTGTAT  895
      ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CCCTTGGGGCAACCAAATTTTGTAGCCAGAGGTGAAAGTTAGGGTTGTAT  899

seq1  GC-AACACCC-TGAATGAGTAGGTGGTAT-CTGACA-TTTACAGAGGATG  941
      || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
seq2  GCTAACACCCTTGAATGAGTAGGTGGTATCCTGACATTTTACAGAGGATG  949

seq1  ATACCCCTAAGCCCTGGAG-TATGGCCC-CACAAAGGTATTTGGAGCTCA  989
      ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||  
seq2  ATACCCCTAAGCCCTGGAGTTATGGCCCTCACAA--GTATTT-GAGCTTC  996

seq1  AGTTGTATGTACAAATAACA-CAAAATAATGT-ACAAATGTTACAAATAA  1037
      |||||||||||||||| ||| |||| || ||| |||| ||||||||||||
seq2  AGTTGTATGTACAAATTACACCAAATTATTGTCACAATTGTTACAAATAA  1046

seq1  CATGT-TGTACAAGAAGGAGTTAAGTG-ACTTAACAGTGGGCACGATGTT  1085
      ||||| ||||| |||  |||||||||| |||| |||||||  ||||||||
seq2  CATGTCTGTAC-AGA--GAGTTAAGTGTACTT-ACAGTGG--ACGATGTT  1090

seq1  TCCCAACTAGGGACCTGAGTAGGATAAGGCGTCACAGCAAATGACTAATG  1135
      | |||||||||  | |||||| ||| | |||   |||||||||||  |||
seq2  TTCCAACTAGGACCTTGAGTA-GAT-ATGCGCTCCAGCAAATGACATATG  1138

seq1  TCTTCACTCCAACCACCCTCCAGTCTTGCAG  1166
      |||   |  ||||   |||||||||||||||
seq2  TCT---CATCAAC--ACCTCCAGTCTTGCAG  1164