BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-204C16
Chromosome15 (Build37)
Map Location 93,896,767 - 94,034,307
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043283, Glt8d3, Yaf2, Zcrb1, Pphln1, LOC627623, Prickle1, Zfp42-ps1, LOC100042627, LOC100042631
Downstream geneD630010B17Rik, Adamts20, Pus7l, Irak4, Twf1, Tmem117, LOC100043315
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-204C16.bB6Ng01-204C16.g
ACCGA024190GA024191
length1,142963
definitionB6Ng01-204C16.b B6Ng01-204C16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,896,767 - 93,897,911)(94,033,360 - 94,034,307)
sequence
gaattcattcattataaagtattatgtgtaaaaataagatgggaggaaga
aatggtgtctatctaaggctaaacacagatgtggagggcaattcaggaac
tgtcaatacctgagtgtaatgtgatgtcctaagacaatgtcggtgcttgc
agagcctaaggataaaagtcatttggttaccaggattgcttgatttaccc
aaactaaaagtaaatttatgtctggatttcttattttagtgtagcagcaa
gctgtctgtattgaatctgttgggctacatcatttttttactttgccatt
caaccccaaaagaatttaaactgtccaaaattatagaaatttaaaccgat
taaacttatccattttctttgattcttggaagtttgctttgcaatttaat
gtgctataatgtttttacctatgcttaatacatttagctttctcaaatga
tcatgtgaaattgcatcataaacaccatgaaggtatatacttttattttt
ctcaagaccacatggaacaaattcctgactttacttttattttattcctt
gatacaatttctcacatatttcaaaatatgtatttaaataataatattaa
taaattattttgggctagttatactgcatcaattagaatgaatgtcacaa
tccctaaatcatgttatcaataataatgacaatatgtccatggactcaat
taattctctaggctttaatagtgaaagcaaaaagccccatgcaaaactcc
ttcccttctgtctctcctatgtgcttgtataatattctcaggacttccag
cctaatgcccatcaccaagctccagtatctctcaactttgagagacacat
tcatactacagcctttggaatagctgtgtcattttatttttgcaattcaa
acacggtgaaacttaaactgtccgaactgtaagaggaacccttcatgttg
tgtggtagtgcttgtgttcactggagctgtgtcgttgcatgccttaccct
tgcttaatagttgacccaacgtctagttagtgtcgcccaccggggagact
agtagctggtggaacaaggatcatgtcatactcaacttggatctgtccat
gagcaagtaccttggcacattattcatgcatgtgcatccttg
gaattctatttgctcttctttacaactggaaacaaagacacaaccattaa
attaaacggaatggaatttgctattagaaataaaacttaaaaaaaaaaaa
aaacaaaaaaacaaaaggccctgaatcagtctgtgatgccaggaattcag
cacagaagaaggtaactgtgtgtgtgtttatggtaagaagtgcacacagt
tgcatgcttctgttgaagtggaccttgtaaatctcagcctcatgccttat
ccttaacatctacattctatgcataacttagatatagtgtttactataca
gtgttttatttgcctgtatatttctttgattctcagatttcttgatgaga
gagacagaaccttattggtatttgtatttggtctatggtacaagataggt
actcaaataatagataggtatcttttagtgtgttaatttgctcacaccaa
aacacaagtatgtaatacacattgtatgtaaatgtataggcaggtgcatg
cctgtgtatgtataaacataataccctgacatttctaaataagatatttt
gatatacttagtgatgggggtttctatgaagggcatttattctaccagaa
attcctgtgagcacctgtttcactttcttaatgagaacagtagccaatgg
tctggaggtgtagaggcaagcaggaacctccccagagaacactaagcaga
gtgcctctttgacgggaagctctggtgattctgagtctggagagtggccg
ctctggaatgcatgaggctaccatgaaggaaagcaatgtgtgacttccag
gtttatgaggtcacagcctggccatcttgagctaaaagtgtttgagggct
taagatgcttcttcggagcaacacaagttggttttgcagttagttgtgca
aggggttccttcctagctcgtggacacgcactgcaccacatgcatttaca
aaacattgcacac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_93896767_93897911
seq2: B6Ng01-204C16.b_44_1185

seq1  GAATTCATTCATTATAAAGTATTATGTGTAAAAATAAGATGGGAGGAAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCATTATAAAGTATTATGTGTAAAAATAAGATGGGAGGAAGA  50

seq1  AATGGTGTCTATCTAAGGCTAAACACAGATGTGGAGGGCAATTCAGGAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTGTCTATCTAAGGCTAAACACAGATGTGGAGGGCAATTCAGGAAC  100

seq1  TGTCAATACCTGAGTGTAATGTGATGTCCTAAGACAATGTCGGTGCTTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAATACCTGAGTGTAATGTGATGTCCTAAGACAATGTCGGTGCTTGC  150

seq1  AGAGCCTAAGGATAAAAGTCATTTGGTTACCAGGATTGCTTGATTTACCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCTAAGGATAAAAGTCATTTGGTTACCAGGATTGCTTGATTTACCC  200

seq1  AAACTAAAAGTAAATTTATGTCTGGATTTCTTATTTTAGTGTAGCAGCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAAAAGTAAATTTATGTCTGGATTTCTTATTTTAGTGTAGCAGCAA  250

seq1  GCTGTCTGTATTGAATCTGTTGGGCTACATCATTTTTTTACTTTGCCATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCTGTATTGAATCTGTTGGGCTACATCATTTTTTTACTTTGCCATT  300

seq1  CAACCCCAAAAGAATTTAAACTGTCCAAAATTATAGAAATTTAAACCGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCCAAAAGAATTTAAACTGTCCAAAATTATAGAAATTTAAACCGAT  350

seq1  TAAACTTATCCATTTTCTTTGATTCTTGGAAGTTTGCTTTGCAATTTAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTTATCCATTTTCTTTGATTCTTGGAAGTTTGCTTTGCAATTTAAT  400

seq1  GTGCTATAATGTTTTTACCTATGCTTAATACATTTAGCTTTCTCAAATGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTATAATGTTTTTACCTATGCTTAATACATTTAGCTTTCTCAAATGA  450

seq1  TCATGTGAAATTGCATCATAAACACCATGAAGGTATATACTTTTATTTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTGAAATTGCATCATAAACACCATGAAGGTATATACTTTTATTTTT  500

seq1  CTCAAGACCACATGGAACAAATTCCTGACTTTACTTTTATTTTATTCCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGACCACATGGAACAAATTCCTGACTTTACTTTTATTTTATTCCTT  550

seq1  GATACAATTTCTCACATATTTCAAAATATGTATTTAAATAATAATATTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACAATTTCTCACATATTTCAAAATATGTATTTAAATAATAATATTAA  600

seq1  TAAATTATTTTGGGCTAGTTATACTGCATCAATTAGAATGAATGTCACAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTATTTTGGGCTAGTTATACTGCATCAATTAGAATGAATGTCACAA  650

seq1  TCCCTAAATCATGTTATCAATAATAATGACAATATGTCCATGGACTCAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTAAATCATGTTATCAATAATAATGACAATATGTCCATGGACTCAAT  700

seq1  TAATTCTCTAGGCTTTAATAGTGAAAGCAAAAAGCCCCATGCAAAACTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCTCTAGGCTTTAATAGTGAAAGCAAAAAGCCCCATGCAAAACTCC  750

seq1  TTCCCTTCTGTCTCTCCTATGTGCTTGTATAATATTCTCAGGACTTCCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTTCTGTCTCTCCTATGTGCTTGTATAATATTCTCAGGACTTCCAG  800

seq1  CCTAATGCCCATCACCAAGCTCCAGTATCTCTCAACTTTGAGAGACACAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATGCCCATCACCAAGCTCCAGTATCTCTCAACTTTGAGAGACACAT  850

seq1  TCATACTACAGCCTTTGGAATAGCTGTGTCATTTTATTTTTGCAATTCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACTACAGCCTTTGGAATAGCTGTGTCATTTTATTTTTGCAATTCAA  900

seq1  ACACGGTGAAACTTAAACTGTCCGAACTGTAAGAGGAACCCTTCATG-TG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ACACGGTGAAACTTAAACTGTCCGAACTGTAAGAGGAACCCTTCATGTTG  950

seq1  TGTGGTAGTGCTTGTGTTCACTGGAGCTGTGTCGTTGCATG-CTTA-CCT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
seq2  TGTGGTAGTGCTTGTGTTCACTGGAGCTGTGTCGTTGCATGCCTTACCCT  1000

seq1  TGCTT-ATAGTTGAACCCAACGTCTTAGTTTAGTTGTCGGCCCACCGGGG  1046
      ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||
seq2  TGCTTAATAGTTG-ACCCAACGTC-TAG-TTAG-TGTC-GCCCACCGGGG  1045

seq1  AGACAAGTAGCT-GTGG-ACAAGGATCATGTCATACTCAACTTTGGATCC  1094
      |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| 
seq2  AGACTAGTAGCTGGTGGAACAAGGATCATGTCATACTCAAC-TTGGATC-  1093

seq1  TTGT-CATGAGCAAAGTACC-TGGCACCATTATCAATGCCATGTGCATAC  1142
       ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||| |
seq2  -TGTCCATGAGC-AAGTACCTTGGCA-CATTATTCATG-CATGTGCATCC  1139

seq1  TTG  1145
      |||
seq2  TTG  1142

seq1: chr15_94033360_94034307
seq2: B6Ng01-204C16.g_67_1029 (reverse)

seq1  GTGTGC-ATG-TTTGT-GATGCATGT-GTGCAGTGCGTGTCCACG-GCTA  45
      |||||| ||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||
seq2  GTGTGCAATGTTTTGTAAATGCATGTGGTGCAGTGCGTGTCCACGAGCTA  50

seq1  GGAAGGA--CCCCTGCAC-ACTAACTGC-AAACCCACTTGTG-TGCTCCG  90
      |||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||
seq2  GGAAGGAACCCCTTGCACAACTAACTGCAAAACCAACTTGTGTTGCTCCG  100

seq1  AAG-AGCATCTTAAGCCCTC-AACACTTTTAGCTC-AGAT-GCCAGGCTG  136
      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||
seq2  AAGAAGCATCTTAAGCCCTCAAACACTTTTAGCTCAAGATGGCCAGGCTG  150

seq1  TGACCTCATAAACCTGGAAGTCACACATTGCTTTCCTTCATGGTAGCCTC  186
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTCATAAACCTGGAAGTCACACATTGCTTTCCTTCATGGTAGCCTC  200

seq1  ATGCATTCCAGAGCGGCCACTCTCCAGACTCAGAATCACCAGAGCTTCCC  236
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATTCCAGAGCGGCCACTCTCCAGACTCAGAATCACCAGAGCTTCCC  250

seq1  GTCAAAGAGGCACTCTGCTTAGTGTTCTCTGGGGAGGTTCCTGCTTGCCT  286
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAAGAGGCACTCTGCTTAGTGTTCTCTGGGGAGGTTCCTGCTTGCCT  300

seq1  CTACACCTCCAGACCATTGGCTACTGTTCTCATTAAGAAAGTGAAACAGG  336
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACCTCCAGACCATTGGCTACTGTTCTCATTAAGAAAGTGAAACAGG  350

seq1  TGCTCACAGGAATTTCTGGTAGAAT-AATGCCCTTCATAGAAACCCCCAT  385
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCACAGGAATTTCTGGTAGAATAAATGCCCTTCATAGAAACCCCCAT  400

seq1  CACTAAGTATATCAAAATATCTTATTTAGAAATGTCAGGGTATTATGTTT  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAAGTATATCAAAATATCTTATTTAGAAATGTCAGGGTATTATGTTT  450

seq1  ATACATACACAGGCATGCACCTGCCTATACATTTACATACAATGTGTATT  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATACACAGGCATGCACCTGCCTATACATTTACATACAATGTGTATT  500

seq1  ACATACTTGTGTTTTGGTGTGAGCAAATTAACACACTAAAAGATACCTAT  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACTTGTGTTTTGGTGTGAGCAAATTAACACACTAAAAGATACCTAT  550

seq1  CTATTATTTGAGTACCTATCTTGTACCATAGACCAAATACAAATACCAAT  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTATTTGAGTACCTATCTTGTACCATAGACCAAATACAAATACCAAT  600

seq1  AAGGTTCTGTCTCTCTCATCAAGAAATCTGAGAATCAAAGAAATATACAG  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTTCTGTCTCTCTCATCAAGAAATCTGAGAATCAAAGAAATATACAG  650

seq1  GCAAATAAAACACTGTATAGTAAACACTATATCTAAGTTATGCATAGAAT  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAATAAAACACTGTATAGTAAACACTATATCTAAGTTATGCATAGAAT  700

seq1  GTAGATGTTAAGGATAAGGCATGAGGCTGAGATTTACAAGGTCCACTTCA  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATGTTAAGGATAAGGCATGAGGCTGAGATTTACAAGGTCCACTTCA  750

seq1  ACAGAAGCATGCAACTGTGTGCACTTCTTACCATAAACACACACACAGTT  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAGCATGCAACTGTGTGCACTTCTTACCATAAACACACACACAGTT  800

seq1  ACCTTCTTCTGTGCTGAATTCCTGGCATCACAGACTGATTCAGGGCCTTT  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCTTCTGTGCTGAATTCCTGGCATCACAGACTGATTCAGGGCCTTT  850

seq1  TGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTAAGTTTTATTTCTAATAGCAAATTC  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTAAGTTTTATTTCTAATAGCAAATTC  900

seq1  CATTCCGTTTAATTTAATGGTTGTGTCTTTGTTTCCAGTTGTAAAGAAGA  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCGTTTAATTTAATGGTTGTGTCTTTGTTTCCAGTTGTAAAGAAGA  950

seq1  GCAAATAGAATTC  948
      |||||||||||||
seq2  GCAAATAGAATTC  963