BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-211B05
Chromosome15 (Build37)
Map Location 66,538,429 - 66,650,922
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTg, Sla
Upstream geneC920006C10Rik, Oc90, F930104E18Rik, LOC100040835, Kcnq3, Lrrc6, LOC100040860, Tmem71, LOC100040881, Phf20l1
Downstream geneWisp1, Ndrg1, LOC100040667, St3gal1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-211B05.bB6Ng01-211B05.g
ACCGA029249GA029250
length1,1501,154
definitionB6Ng01-211B05.b B6Ng01-211B05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,649,770 - 66,650,922)(66,538,429 - 66,539,582)
sequence
gaattcttgtgaaaatcaaatgaaaccacaggtataaaaagatgtaatct
ataaaaaattcttcatataaatatgtactattgatattcctattgatgct
caaactataattttaaaatggtagactattctctagtccagtgattctta
acctatatgttgtgatacattgagagccgaatgatgctttcatagggctt
gcctaagaccaagactaagtctgtgctaaggctaaggactgatatttaca
ttatgattcataacagtaacaagattacagttatgagatatcaacaaaaa
taattttatggttgggggccaccacagcatgaggaactgtgtaaaatggt
cacaagtgttaggttgagaaccgctgctctagactaacagatcagcatta
gagtttcatctcagccaaggcattttccacagcctccccttgctggtgca
attagtcatggatcagtgcatgctgagctgaccctgactgatagttttac
acctaaccagctggttctgactgcgtgtcagtgacttaagtaacatcaaa
gtcaacttcaagcttgcttttcttctgacaataaaatcttatcatgagga
agtggagcatccagccatgaggaggcatcctgggagagcatgaggtgggg
tttcagtgagtgtgataacaatcttgctatggatcttagcctcatgttgc
actgtctgaaatacccagaggtggctcgccagttactttggcatggttac
tcacacgatgagggtgctggggcagaatggtgccaaggtcttcctcggac
agtgtcaggaagttgagcacagtggccttatcaccagccaggcagccagc
tgtttctagattcccagtataggtctttgttgctgctgtgagttcctcta
ttagagggctaattccggcaacttctgcacaaagatgccccagggaatcc
aaatcagcagacatgattaagccttaaaggtgtttagagatctagggaag
gggccttcttttctctctgtttgaactcattccctcagtcttctcagctc
cctcctcctatgaacatctacttgttcttacacagaacatgcatcacact
gactgcttgtttgttcccgcctcttgaactgatggtgttctgcaagttag

gaattctcacatgaaagactggggcttcagcgtatgactcagaacagaca
caatgtcaagttcatagcaagcataggagaaatatttaaagtatactaac
accttcctacaaacacacacacacacacacacacacacacacacacacac
acacacacactacgtgaggtactgtgatgatatttctttgtagctgtaga
gggttgggcaacaacattaacattcctcattattcctcctgagtcaaaag
cactattggtggactgatctgtagactatgggccaggtgaagaaaggact
tccagggtgagaaagaaacttgaacacagggatagagaagtgttcatttc
tagatccacctcatactcaaattcctggatgttgagagggggggtttcca
tttagatactgggcaatgcaatgagatacaggtcctgccttcatagagct
tccatcaaataggatgcactaagtacctaatcacagggaaatagaaacac
tgaccaaacttacccttgtgaaggagaggtttcaattccaggaaaaactg
tagcattggacaagaccaagttgggggtttggagatgttgtagtctattc
aggcagctatttcaaactatcataagctgggtggattttacaggcaacag
aactctgtttctcactattctggaatctggaagctcaagatcaaattacc
atcaactgaaaataccacagatggtgactttctaagtgtccttatatctt
agaaggcctcacctcctactatgatcactgatgactccaaaatttgggtt
tgtgagccattatgaaaggtgctctatgggcgacatggggtctcagtggt
gttctttgctggaggtggttacactacaagctttcagccagaatgtctgt
gttacccatgtaacttagtcatcaccatagggatcctgggagtgggaaga
agaaagagggagttacagagactgtaactcattgctgtgtccattctctt
gtcctaggtgtcactgactgtagaagatgaggcttggccttacagtggtg
acagaatggttcagtaccaagccagcagaagacagggaacgttgggagtt
ttctcgtgctgacagcgaagggggccgaaactacagtggttacgactagg
ctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_66649770_66650922
seq2: B6Ng01-211B05.b_47_1196 (reverse)

seq1  CTAACTTGCAG-ACACCATCAGTTCCAAGAGGCGGGGAC-AACAAGCAGT  48
      ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||
seq2  CTAACTTGCAGAACACCATCAGTT-CAAGAGGCGGGAACAAACAAGCAGT  49

seq1  CAGTGTGATGCAATGTCTGTGT-AGAACAAGTAGATGTTCATAGGGAGGA  97
      ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CAGTGTGATGCATGTTCTGTGTAAGAACAAGTAGATGTTCATA-GGAGGA  98

seq1  GGGAGCTGAGAAGACTGAGGGAATGAGTTTCAAACAGAGAGAAAAGAAGG  147
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGCTGAGAAGACTGAGGGAATGAG-TTCAAACAGAGAGAAAAGAAGG  147

seq1  CCCCTTCCCCTAAGATCTCTAAACACCTTAAGGCCTTAATCATGTTCTGC  197
      |||||||||   ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||
seq2  CCCCTTCCC--TAGATCTCTAAACACCTTTAAGGCTTAATCATG-TCTGC  194

seq1  TGATTTGGATTCCCTGGGGCATCTTTGTGCAGAAGTTGCCGGAATTAGCC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTGGATTCCCTGGGGCATCTTTGTGCAGAAGTTGCCGGAATTAGCC  244

seq1  CTCTAATAGAGGAACTCACAGCAGCAACAAAGACCTATACTGGGAATCTA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAATAGAGGAACTCACAGCAGCAACAAAGACCTATACTGGGAATCTA  294

seq1  GAAACAGCTGGCTGCCTGGCTGGTGATAAGGCCACTGTGCTCAACTTCCT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAGCTGGCTGCCTGGCTGGTGATAAGGCCACTGTGCTCAACTTCCT  344

seq1  GACACTGTCCGAGGAAGACCTTGGCACCATTCTGCCCCAGCACCCTCATC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTGTCCGAGGAAGACCTTGGCACCATTCTGCCCCAGCACCCTCATC  394

seq1  GTGTGAGTAACCATGCCAAAGTAACTGGCGAGCCACCTCTGGGTATTTCA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAGTAACCATGCCAAAGTAACTGGCGAGCCACCTCTGGGTATTTCA  444

seq1  GACAGTGCAACATGAGGCTAAGATCCATAGCAAGATTGTTATCACACTCA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTGCAACATGAGGCTAAGATCCATAGCAAGATTGTTATCACACTCA  494

seq1  CTGAAACCCCACCTCATGCTCTCCCAGGATGCCTCCTCATGGCTGGATGC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAACCCCACCTCATGCTCTCCCAGGATGCCTCCTCATGGCTGGATGC  544

seq1  TCCACTTCCTCATGATAAGATTTTATTGTCAGAAGAAAAGCAAGCTTGAA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACTTCCTCATGATAAGATTTTATTGTCAGAAGAAAAGCAAGCTTGAA  594

seq1  GTTGACTTTGATGTTACTTAAGTCACTGACACGCAGTCAGAACCAGCTGG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACTTTGATGTTACTTAAGTCACTGACACGCAGTCAGAACCAGCTGG  644

seq1  TTAGGTGTAAAACTATCAGTCAGGGTCAGCTCAGCATGCACTGATCCATG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTGTAAAACTATCAGTCAGGGTCAGCTCAGCATGCACTGATCCATG  694

seq1  ACTAATTGCACCAGCAAGGGGAGGCTGTGGAAAATGCCTTGGCTGAGATG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATTGCACCAGCAAGGGGAGGCTGTGGAAAATGCCTTGGCTGAGATG  744

seq1  AAACTCTAATGCTGATCTGTTAGTCTAGAGCAGCGGTTCTCAACCTAACA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCTAATGCTGATCTGTTAGTCTAGAGCAGCGGTTCTCAACCTAACA  794

seq1  CTTGTGACCATTTTACACAGTTCCTCATGCTGTGGTGGCCCCCAACCATA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGACCATTTTACACAGTTCCTCATGCTGTGGTGGCCCCCAACCATA  844

seq1  AAATTATTTTTGTTGATATCTCATAACTGTAATCTTGTTACTGTTATGAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTATTTTTGTTGATATCTCATAACTGTAATCTTGTTACTGTTATGAA  894

seq1  TCATAATGTAAATATCAGTCCTTAGCCTTAGCACAGACTTAGTCTTGGTC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAATGTAAATATCAGTCCTTAGCCTTAGCACAGACTTAGTCTTGGTC  944

seq1  TTAGGCAAGCCCTATGAAAGCATCATTCGGCTCTCAATGTATCACAACAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGCAAGCCCTATGAAAGCATCATTCGGCTCTCAATGTATCACAACAT  994

seq1  ATAGGTTAAGAATCACTGGACTAGAGAATAGTCTACCATTTTAAAATTAT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGTTAAGAATCACTGGACTAGAGAATAGTCTACCATTTTAAAATTAT  1044

seq1  AGTTTGAGCATCAATAGGAATATCAATAGTACATATTTATATGAAGAATT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGAGCATCAATAGGAATATCAATAGTACATATTTATATGAAGAATT  1094

seq1  TTTTATAGATTACATCTTTTTATACCTGTGGTTTCATTTGATTTTCACAA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATAGATTACATCTTTTTATACCTGTGGTTTCATTTGATTTTCACAA  1144

seq1  GAATTC  1153
      ||||||
seq2  GAATTC  1150

seq1: chr15_66538429_66539582
seq2: B6Ng01-211B05.g_68_1221

seq1  GAATTCTCACATGAAAGACTGGGGCTTCAGCGTATGACTCAGAACAGACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACATGAAAGACTGGGGCTTCAGCGTATGACTCAGAACAGACA  50

seq1  CAATGTCAAGTTCATAGCAAGCATAGGAGAAATATTTAAAGTATACTAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTCAAGTTCATAGCAAGCATAGGAGAAATATTTAAAGTATACTAAC  100

seq1  ACCTTCCTACAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCCTACAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  150

seq1  ACACACACACTACGTGAGGTACTGTGATGATATTTCTTTGTAGCTGTAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACTACGTGAGGTACTGTGATGATATTTCTTTGTAGCTGTAGA  200

seq1  GGGTTGGGCAACAACATTAACATTCCTCATTATTCCTCCTGAGTCAAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGGGCAACAACATTAACATTCCTCATTATTCCTCCTGAGTCAAAAG  250

seq1  CACTATTGGTGGACTGATCTGTAGACTATGGGCCAGGTGAAGAAAGGACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATTGGTGGACTGATCTGTAGACTATGGGCCAGGTGAAGAAAGGACT  300

seq1  TCCAGGGTGAGAAAGAAACTTGAACACAGGGATAGAGAAGTGTTCATTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGGTGAGAAAGAAACTTGAACACAGGGATAGAGAAGTGTTCATTTC  350

seq1  TAGATCCACCTCATACTCAAATTCCTGGATGTTGAGAGGGGGGGTTTCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCCACCTCATACTCAAATTCCTGGATGTTGAGAGGGGGGGTTTCCA  400

seq1  TTTAGATACTGGGCAATGCAATGAGATACAGGTCCTGCCTTCATAGAGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGATACTGGGCAATGCAATGAGATACAGGTCCTGCCTTCATAGAGCT  450

seq1  TCCATCAAATAGGATGCACTAAGTACCTAATCACAGGGAAATAGAAACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCAAATAGGATGCACTAAGTACCTAATCACAGGGAAATAGAAACAC  500

seq1  TGACCAAACTTACCCTTGTGAAGGAGAGGTTTCAATTCCAGGAAAAACTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAAACTTACCCTTGTGAAGGAGAGGTTTCAATTCCAGGAAAAACTG  550

seq1  TAGCATTGGACAAGACCAAGTTGGGGGTTTGGAGATGTTGTAGTCTATTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATTGGACAAGACCAAGTTGGGGGTTTGGAGATGTTGTAGTCTATTC  600

seq1  AGGCAGCTATTTCAAACTATCATAAGCTGGGTGGATTTTACAGGCAACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGCTATTTCAAACTATCATAAGCTGGGTGGATTTTACAGGCAACAG  650

seq1  AACTCTGTTTCTCACTATTCTGGAATCTGGAAGCTCAAGATCAAATTACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTGTTTCTCACTATTCTGGAATCTGGAAGCTCAAGATCAAATTACC  700

seq1  ATCAACTGAAAATACCACAGATGGTGACTTTCTAAGTGTCCTTATATCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAACTGAAAATACCACAGATGGTGACTTTCTAAGTGTCCTTATATCTT  750

seq1  AGAAGGCCTCACCTCCTACTATGATCACTGATGACTCCAAAATTTGGGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGCCTCACCTCCTACTATGATCACTGATGACTCCAAAATTTGGGTT  800

seq1  TGTGAGCCATTATGAAAGGTGCTCTATGGGCGACATGGGGTCTCAGTGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCCATTATGAAAGGTGCTCTATGGGCGACATGGGGTCTCAGTGGT  850

seq1  GTTCTTTGCTGGAGGTGGTTACACTACAAGCTTTCAGCCAGAATGTCTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTTGCTGGAGGTGGTTACACTACAAGCTTTCAGCCAGAATGTCTGT  900

seq1  GTTACCCATGTAACTTAGTCATCACCATAGGGATCCTGGGAGTTGGAAG-  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 
seq2  GTTACCCATGTAACTTAGTCATCACCATAGGGATCCTGGGAGTGGGAAGA  950

seq1  AGAAAGAGGGAGTTACAGAGACCTGTAACTCATTGCTGTGTCCA-TCTCT  998
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AGAAAGAGGGAGTTACAGAGA-CTGTAACTCATTGCTGTGTCCATTCTCT  999

seq1  TGTCCTAGGTGTCACTGACTGTCAGAAGAATGAGGC-TGGCC-TACAGT-  1045
      |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| 
seq2  TGTCCTAGGTGTCACTGACTGT-AGAAG-ATGAGGCTTGGCCTTACAGTG  1047

seq1  GTGACCAGAATGG-TCAGTACCAAGCCAGCCAGAAGAACAGGGACAGTGG  1094
      |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  || |
seq2  GTGA-CAGAATGGTTCAGTACCAAGCCAG-CAGAAG-ACAGGGAACGTTG  1094

seq1  GGAAGTTTTCTGCGTG--GACAGCGA--GGGGCGGAAACTACAGTGGTTA  1140
      || |||||||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||
seq2  GG-AGTTTTCT-CGTGCTGACAGCGAAGGGGGCCGAAACTACAGTGGTTA  1142

seq1  CAGACAGAGGCTGG  1154
      | |||  |||||||
seq2  C-GAC-TAGGCTGG  1154