BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-215B08
Chromosome15 (Build37)
Map Location 28,630,682 - 28,740,971
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040702, LOC667153
Upstream geneTrio, LOC667126, Dnahc5, EG382974, LOC100040675, LOC100040689
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-215B08.bB6Ng01-215B08.g
ACCGA032156GA032157
length8351,147
definitionB6Ng01-215B08.b B6Ng01-215B08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(28,630,682 - 28,631,513)(28,739,833 - 28,740,971)
sequence
gaattcactccatagttaaggtctgatctacatatgtgtaccatgctctc
tcctcattcacaatgaatgtatgaatgcatgcatgcatgaatgaatcaat
gaacaaataaatgttaatatgtttaccatctcccatcacaatttattgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtaaaaacaactcagcagagact
gaaaaggttgcttagaggttaagaatacaggatgctcttgtagaacacac
aggtttagttccaagcccccatgtggtggatcacaactatctattaactt
cagttcaagggactgaatgccctcttttggactctgaatgcagcaagcac
acatgtaatatgcatgcaaggaaaacatccataaatgtaaaataaaaata
atgaaatattagaaaaacattattttatctgccttagttactattggtaa
aagagacaatttccagaaaggtccgctatactcagctttctctattcatc
actgtacaatatagtcacctaccatctttttgaaataagttaattatatt
taactgagataatatttttatacattttgtcttacaacattatatatata
tatatataaactagatcattataaagccaagtcaattagcatttccatct
tattatagctttggcttccactaaagttgtccttgccctagtgatcaaca
tcaacaaaaatgaaggaaaaacctagatcatcctttttaatagacacaaa
gaaacaaataatgaaagagttccacatggctaattcaaagtggtcacatc
aagcttaataacttgctgtctcattatttgttggg
gaattctttcctcattgcctggatttctagataagatagaagatctactc
tgagaccaccaactctagtcaacaaaaatttacacatttttgaaaggtat
tttttaatcttagaagtcatccagtgattctaaaaagccattaggtataa
gtagtggttgttccaatcctagccttcaggcaggttaatggctgatatta
tttatccatatttttgaggctccttcattctcagtacatgagggaaatta
taaggactataaataagactataaattggctgaaacaatttgagctcttc
ttggagagtaagaatgctaagacatctagtggtctctttaataatgagac
ctttcacccagcaaacaggtagactgagaaggatgcatttcaagactaaa
aactgggcagaaaacagaagaagtgaaaattaagctagcaaaccaactag
tcttgatcaaatgacatctagcaaagggaatgccacttaagtaataacag
cattggttttggaaatgttttgcctatggtgataaagacttaatatacag
aaagcttccatatgtgctgaagtggattatgattgacacatataggcatt
tatatgtatctatatctatatgcacatgcatacattattttcaaaaatgt
gatacttaagcactatcatcttaaaattcctaactcctatttggcaaagc
tgtgatcttaatatttataccaaatgcagattttggagtcaaatagaaaa
taaacttgatttagcatgttttaatatagtatattaaaagtatgctcttt
taaaaagataagacatgtttagaacataactaaatctattgacataacac
ttagagtactgtctcaagtgtattgctatagtttttgttgttacaagaaa
ggtttacgtctaatgggttcaacactcatgggaacttggactctgaaaga
tgatcttctgagtttctcaggtccatttttgttttatttattttgcaatg
ttaccaagtttcaattcacgatatttagaagaattattagagaaattgca
attttatgttcacactaattcattaatattagaaaacatgttggtaagaa
agaactcattaaataacaagagatgctcattgtgcaattatataatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_28630682_28631513
seq2: B6Ng01-215B08.b_46_880

seq1  GAATTCACTCCATAGTTAAGGTCTGATCTACATATGTGTACCATGCTCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCCATAGTTAAGGTCTGATCTACATATGTGTACCATGCTCTC  50

seq1  TCCTCATTCACAATGAATGTATGAATGCATGCATGCATGAATGAATCAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCATTCACAATGAATGTATGAATGCATGCATGCATGAATGAATCAAT  100

seq1  GAACAAATAAATGTTAATATGTTTACCATCTCCCATCACAATTTATTGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAATAAATGTTAATATGTTTACCATCTCCCATCACAATTTATTGTG  150

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAAAACAACTCAGCAGAGACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAAAACAACTCAGCAGAGACT  200

seq1  GAAAAGGTTGCTTAGAGGTTAAGAATACAGGATGCTCTTGTAGAACACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGGTTGCTTAGAGGTTAAGAATACAGGATGCTCTTGTAGAACACAC  250

seq1  AGGTTTAGTTCCAAGCCCCCATGTGGTGGATCACAACTATCTATTAACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTAGTTCCAAGCCCCCATGTGGTGGATCACAACTATCTATTAACTT  300

seq1  CAGTTCAAGGGACTGAATGCCCTCTTTTGGACTCTGAATGCAGCAAGCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCAAGGGACTGAATGCCCTCTTTTGGACTCTGAATGCAGCAAGCAC  350

seq1  ACATGTAATATGCATGCAAGGAAAACATCCATAAATGTAAAATAAAAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTAATATGCATGCAAGGAAAACATCCATAAATGTAAAATAAAAATA  400

seq1  ATGAAATATTAGAAAAACATTATTTTATCTGCCTTAGTTACTATTGGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAATATTAGAAAAACATTATTTTATCTGCCTTAGTTACTATTGGTAA  450

seq1  AAGAGACAATTTCCAGAAAGGTCCGCTATACTCAGCTTTCTCTATTCATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGACAATTTCCAGAAAGGTCCGCTATACTCAGCTTTCTCTATTCATC  500

seq1  ACTGTACAATATAGTCACCTACCATCTTTTTGAAATAAGTTAATTATATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTACAATATAGTCACCTACCATCTTTTTGAAATAAGTTAATTATATT  550

seq1  TAACTGAGATAATATTTTTATACATTTTGTCTTACAACATTATATATATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGAGATAATATTTTTATACATTTTGTCTTACAACATTATATATATA  600

seq1  TATATATAAACTAGATCATTATAAAGCCAAGTCAATTAGCATTTCCATCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATAAACTAGATCATTATAAAGCCAAGTCAATTAGCATTTCCATCT  650

seq1  TATTATAGCTTTGGCTTCCACTAAAGTTGTCCTTGCCCTAGTGATCAACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATAGCTTTGGCTTCCACTAAAGTTGTCCTTGCCCTAGTGATCAACA  700

seq1  TCAACAAAAATGAAGG-AAAACCTAGATCATCC-TTTTAATAGACACAAA  748
      |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCAACAAAAATGAAGGAAAAACCTAGATCATCCTTTTTAATAGACACAAA  750

seq1  GAAAC-AATAATGAAAGAGTTCCACATGGCTAATTC-AAGTGGTCACATC  796
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GAAACAAATAATGAAAGAGTTCCACATGGCTAATTCAAAGTGGTCACATC  800

seq1  AAGCTAAATAACTTGCTGTCTCATTATTTTGTTGGG  832
      ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AAGCTTAATAACTTGCTGTCTCATTA-TTTGTTGGG  835

seq1: chr15_28739833_28740971
seq2: B6Ng01-215B08.g_67_1213 (reverse)

seq1  AATTATATAATTTGCCACAAATGAGCTATCCTCTTGGTTATTTTAATGGA  50
      ||||||||||||   ||| ||||||| || ||||| |||| |||||| ||
seq2  AATTATATAATT--GCAC-AATGAGC-AT-CTCTT-GTTA-TTTAAT-GA  42

seq1  GTTC--TCTTA-CAACATG-TTTCTAATATTAATGAATTAGTTGTG-ACA  95
      ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||
seq2  GTTCTTTCTTACCAACATGTTTTCTAATATTAATGAATTAG-TGTGAACA  91

seq1  T-AAATTGC-ATTTCTCTTATAAT--CTCTAAATATTGTGAATTG-AACT  140
      | ||||||| |||||||| |||||   ||||||||| |||||||| ||||
seq2  TAAAATTGCAATTTCTCTAATAATTCTTCTAAATATCGTGAATTGAAACT  141

seq1  TGGT-ACATTGCAAAATAAATAAA--CAAAATGGA-CTGAGAAACTCAG-  185
      |||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| 
seq2  TGGTAACATTGCAAAATAAATAAAACAAAAATGGACCTGAGAAACTCAGA  191

seq1  AGATCATCTTTCAGAGTCCAAGTT-CCATGAGTGTTGAACCCATTAGACG  234
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCATCTTTCAGAGTCCAAGTTCCCATGAGTGTTGAACCCATTAGACG  241

seq1  TAAACCTTTC-TGTAACAACAAAAACTATAGCAATACACTTGAGACAGTA  283
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACCTTTCTTGTAACAACAAAAACTATAGCAATACACTTGAGACAGTA  291

seq1  CTCTAAGTGTTATGTCAATAGATTTAGTTATGTTCTAAACATGTCTTATC  333
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAAGTGTTATGTCAATAGATTTAGTTATGTTCTAAACATGTCTTATC  341

seq1  TTTTTAAAAGAGCATACTTTTAATATACTATATTAAAACATGCTAAATCA  383
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAAAGAGCATACTTTTAATATACTATATTAAAACATGCTAAATCA  391

seq1  AGTTTATTTTCTATTTGACTCCAAAATCTGCATTTGGTATAAATATTAAG  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTATTTTCTATTTGACTCCAAAATCTGCATTTGGTATAAATATTAAG  441

seq1  ATCACAGCTTTGCCAAATAGGAGTTAGGAATTTTAAGATGATAGTGCTTA  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAGCTTTGCCAAATAGGAGTTAGGAATTTTAAGATGATAGTGCTTA  491

seq1  AGTATCACATTTTTGAAAATAATGTATGCATGTGCATATAGATATAGATA  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATCACATTTTTGAAAATAATGTATGCATGTGCATATAGATATAGATA  541

seq1  CATATAAATGCCTATATGTGTCAATCATAATCCACTTCAGCACATATGGA  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATAAATGCCTATATGTGTCAATCATAATCCACTTCAGCACATATGGA  591

seq1  AGCTTTCTGTATATTAAGTCTTTATCACCATAGGCAAAACATTTCCAAAA  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTCTGTATATTAAGTCTTTATCACCATAGGCAAAACATTTCCAAAA  641

seq1  CCAATGCTGTTATTACTTAAGTGGCATTCCCTTTGCTAGATGTCATTTGA  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGCTGTTATTACTTAAGTGGCATTCCCTTTGCTAGATGTCATTTGA  691

seq1  TCAAGACTAGTTGGTTTGCTAGCTTAATTTTCACTTCTTCTGTTTTCTGC  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGACTAGTTGGTTTGCTAGCTTAATTTTCACTTCTTCTGTTTTCTGC  741

seq1  CCAGTTTTTAGTCTTGAAATGCATCCTTCTCAGTCTACCTGTTTGCTGGG  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTTTTAGTCTTGAAATGCATCCTTCTCAGTCTACCTGTTTGCTGGG  791

seq1  TGAAAGGTCTCATTATTAAAGAGACCACTAGATGTCTTAGCATTCTTACT  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGGTCTCATTATTAAAGAGACCACTAGATGTCTTAGCATTCTTACT  841

seq1  CTCCAAGAAGAGCTCAAATTGTTTCAGCCAATTTATAGTCTTATTTATAG  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAAGAAGAGCTCAAATTGTTTCAGCCAATTTATAGTCTTATTTATAG  891

seq1  TCCTTATAATTTCCCTCATGTACTGAGAATGAAGGAGCCTCAAAAATATG  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTATAATTTCCCTCATGTACTGAGAATGAAGGAGCCTCAAAAATATG  941

seq1  GATAAATAATATCAGCCATTAACCTGCCTGAAGGCTAGGATTGGAACAAC  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATAATATCAGCCATTAACCTGCCTGAAGGCTAGGATTGGAACAAC  991

seq1  CACTACTTATACCTAATGGCTTTTTAGAATCACTGGATGACTTCTAAGAT  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTACTTATACCTAATGGCTTTTTAGAATCACTGGATGACTTCTAAGAT  1041

seq1  TAAAAAATACCTTTCAAAAATGTGTAAATTTTTGTTGACTAGAGTTGGTG  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAATACCTTTCAAAAATGTGTAAATTTTTGTTGACTAGAGTTGGTG  1091

seq1  GTCTCAGAGTAGATCTTCTATCTTATCTAGAAATCCAGGCAATGAGGAAA  1133
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAGAGTAGATCTTCTATCTTATCTAGAAATCCAGGCAATGAGGAAA  1141

seq1  GAATTC  1139
      ||||||
seq2  GAATTC  1147