BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-229J18
Chromosome15 (Build37)
Map Location 3,740,553 - 3,741,711
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC674207, LOC666163, EG666167, Sepp1, LOC100039139, Ghr, LOC223278
Downstream geneFbxo4, AW549877, LOC100039196, Oxct1, Plcxd3, C6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-229J18.bB6Ng01-229J18.g
ACCGA042703GA042704
length1,146276
definitionB6Ng01-229J18.b B6Ng01-229J18.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcactgtttcctggaattggatgttaggacattcgtatgttagctc
agagctctgagctaatacgatatttgtccaaaaggttttggttatttcct
cgagaatgagcactttgtagtattatcctgggcttgttcaatgtcagtct
tgtttctatactacacaaaagcctactgtcaaagtgcatctgtaatatct
gagccctttatcattagctctgccctgtagtcaggtgactctgtggttcc
tcacattcaaccagacctccagatcaagcataagacattgaggaaacttt
cacatacttgcttaccctgtaaccttaagctctgatccaggttgcctctc
ccactgtacctttttgcctattaacatttctccttagttattttgggctg
ctgaaacaaaatgacttaagctttgtagcctataaataacataaactatt
ttcctgtaaattccaagatgaagatgctagcagatttatcacctattaag
gacctaatgtctatccccgaaatgggacctatttgtgctcttacacagta
tagggagttatctttgttttttcttttaaaggacacttatcccaaatcac
aaattatttgttgcaatcatttattcagaagccctatctccaaattctat
acctcaggattgattttaacctcataattttggtgatacaaatgttcaca
atatagtgcttgacaaccctctcctctgttccttatcttctctttcttat
acttctatttattctgagagcctttagttcttgggaactgaagcaaggca
aaaaaattaaataaataagcaattccatagatatgatacatagcataaat
gtcacttcactcagaatctaagtgtctaccacagagcctgcttaatgata
atcagtcaaagaaactaccattatgaaaacaaaaaataacaaattctatc
aaggatgtctgggacatgggaaccctcatatattgcaggcatgtatgtaa
actggtgtagcattgttgagcaattatggaggtcttcaaaaaaaatctaa
ataatataagatgatatcatcagcttatacacttctgggggtatatcgaa
gattctagcatatgtcacaatatgctacacatcatatatgtagcat
ctatccctttcaggacccacaatccttccttctagtcttccataagaatc
cccaagctccatccactgtttagctgtgggtaactctatctgtctgagtc
atttacatgtaaatggatattagccataaactacaggtaccatgttatac
tccacagacccaaagaagctaaataagaaggcccaagtaagaaagcttga
ttcttacttagaagggtcaataaaatagtcaaaagaggcagatggaggaa
gagaagtggaagggttggggggggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_3740553_3741711
seq2: B6Ng01-229J18.b_44_1189 (reverse)

seq1  ATGCTACAATAAATATA-GATGTGTAGGAAATATTGTGACATATGGCCTT  49
      |||||||     ||||| |||||||||   |||||||||||||||    |
seq2  ATGCTAC-----ATATATGATGTGTAG--CATATTGTGACATATG---CT  40

seq1  AGAATCCTTTGGATATACCCCCAGAAGTGGTAT-AGCTGAATGATATCAT  98
      ||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| 
seq2  AGAATC--TTCGATATACCCCCAGAAGT-GTATAAGCTG-ATGATATCA-  85

seq1  TCTTATA-TATTTAGATTTTTTTTGAGGAACCTCCAT-ATTGCTTCAACA  146
      ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||
seq2  TCTTATATTATTTAGATTTTTTTTGAAG-ACCTCCATAATTGC-TCAACA  133

seq1  ATTGCTACACCAGTTTACATACATGCCTGCAATATATGAGGGTTCCCATG  196
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-TGCTACACCAGTTTACATACATGCCTGCAATATATGAGGGTTCCCATG  182

seq1  T-CCAGACATCCTTGATAGAATTTGTTATTTTTTGTTTTCATAATGGTAG  245
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGACATCCTTGATAGAATTTGTTATTTTTTGTTTTCATAATGGTAG  232

seq1  TTTCTTTGACTGATTATCATTAAGCAGGCTCTGTGGTAGACACTTAGATT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTGACTGATTATCATTAAGCAGGCTCTGTGGTAGACACTTAGATT  282

seq1  CTGAGTGAAGTGACATTTATGCTATGTATCATATCTATGGAATTGCTTAT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTGAAGTGACATTTATGCTATGTATCATATCTATGGAATTGCTTAT  332

seq1  TTATTTAATTTTTTTGCCTTGCTTCAGTTCCCAAGAACTAAAGGCTCTCA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTAATTTTTTTGCCTTGCTTCAGTTCCCAAGAACTAAAGGCTCTCA  382

seq1  GAATAAATAGAAGTATAAGAAAGAGAAGATAAGGAACAGAGGAGAGGGTT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAATAGAAGTATAAGAAAGAGAAGATAAGGAACAGAGGAGAGGGTT  432

seq1  GTCAAGCACTATATTGTGAACATTTGTATCACCAAAATTATGAGGTTAAA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAGCACTATATTGTGAACATTTGTATCACCAAAATTATGAGGTTAAA  482

seq1  ATCAATCCTGAGGTATAGAATTTGGAGATAGGGCTTCTGAATAAATGATT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATCCTGAGGTATAGAATTTGGAGATAGGGCTTCTGAATAAATGATT  532

seq1  GCAACAAATAATTTGTGATTTGGGATAAGTGTCCTTTAAAAGAAAAAACA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACAAATAATTTGTGATTTGGGATAAGTGTCCTTTAAAAGAAAAAACA  582

seq1  AAGATAACTCCCTATACTGTGTAAGAGCACAAATAGGTCCCATTTCGGGG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATAACTCCCTATACTGTGTAAGAGCACAAATAGGTCCCATTTCGGGG  632

seq1  ATAGACATTAGGTCCTTAATAGGTGATAAATCTGCTAGCATCTTCATCTT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACATTAGGTCCTTAATAGGTGATAAATCTGCTAGCATCTTCATCTT  682

seq1  GGAATTTACAGGAAAATAGTTTATGTTATTTATAGGCTACAAAGCTTAAG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTTACAGGAAAATAGTTTATGTTATTTATAGGCTACAAAGCTTAAG  732

seq1  TCATTTTGTTTCAGCAGCCCAAAATAACTAAGGAGAAATGTTAATAGGCA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTTGTTTCAGCAGCCCAAAATAACTAAGGAGAAATGTTAATAGGCA  782

seq1  AAAAGGTACAGTGGGAGAGGCAACCTGGATCAGAGCTTAAGGTTACAGGG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGTACAGTGGGAGAGGCAACCTGGATCAGAGCTTAAGGTTACAGGG  832

seq1  TAAGCAAGTATGTGAAAGTTTCCTCAATGTCTTATGCTTGATCTGGAGGT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAAGTATGTGAAAGTTTCCTCAATGTCTTATGCTTGATCTGGAGGT  882

seq1  CTGGTTGAATGTGAGGAACCACAGAGTCACCTGACTACAGGGCAGAGCTA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTGAATGTGAGGAACCACAGAGTCACCTGACTACAGGGCAGAGCTA  932

seq1  ATGATAAAGGGCTCAGATATTACAGATGCACTTTGACAGTAGGCTTTTGT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATAAAGGGCTCAGATATTACAGATGCACTTTGACAGTAGGCTTTTGT  982

seq1  GTAGTATAGAAACAAGACTGACATTGAACAAGCCCAGGATAATACTACAA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTATAGAAACAAGACTGACATTGAACAAGCCCAGGATAATACTACAA  1032

seq1  AGTGCTCATTCTCGAGGAAATAACCAAAACCTTTTGGACAAATATCGTAT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTCATTCTCGAGGAAATAACCAAAACCTTTTGGACAAATATCGTAT  1082

seq1  TAGCTCAGAGCTCTGAGCTAACATACGAATGTCCTAACATCCAATTCCAG  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCAGAGCTCTGAGCTAACATACGAATGTCCTAACATCCAATTCCAG  1132

seq1  GAAACAGTGAATTC  1159
      ||||||||||||||
seq2  GAAACAGTGAATTC  1146