BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-248C24
Chromosome15 (Build37)
Map Location 24,696,636 - 24,837,486
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666989, LOC666999, LOC100040492, LOC100040499
Downstream geneLOC100040529, 9230109A22Rik, 4930445E18Rik, Basp1, EG432939, LOC100040583, Myo10, LOC100040602, Ppia-ps15_175.1, 1810015C04Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-248C24.bB6Ng01-248C24.g
ACCGA056326GA056327
length1,0921,159
definitionB6Ng01-248C24.b B6Ng01-248C24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,696,636 - 24,697,709)(24,836,327 - 24,837,486)
sequence
gaattcacctggacatctccttcttctctcttatgtctgaattgtaaata
gtccttataaagcagagaaagtacacacaccctttgatgtggcatctcca
tttgcaagattgtaacaggtcccaagaataggcatatgcttccatcatcc
tgggatcctcttcacttggcactgagcctgccacacatcaggcatcctac
tgctgtatggatgcactgtatctccatctgtttggaaaatggattcaatt
gattgcaacaggtgaaaaggtccagttaatttcaatgatttcttctcagt
ttaagataatagatccaagtaatcaaaaaaaaaaaaaagaaaatatatat
gtatatgtttaccaagactgaaaattgaatgtattaataaatctatgtac
atatatatatatatatatatatatacacatatgcattgcacactcataca
caaacatgaatatatattttatgtgtacattaatttatattttaaaagtt
atttcctaaaattttaatgatggttttcatgtttgctaaatataaacctg
ttttgtaaaaattcatatttaagaactcaacaaagtaaaataatacgtgg
ttactctcatgtatttttaacaattctatactggcaacaattggccgaag
taattttattctcaacctagaagatgacatagcttgataaaaatttttcc
attggtaaataccactgaaaatgttagagactttaataacctatttaaaa
agcaatgaaatataacaaaagcagtactttccatgtaaaagtcccaaata
gaataagaattaaaacaaaaatagatggataataacagttagtttaatat
gtaacttgaatttttaaagattatgtatattgaaaatacattttgacaat
tcttcttttattgtcatgggtaacaatttcctattacgaatccacaccag
tagaatagaattttataaagtacaaataacataatattgatttaatcatc
tgtctaacaatactaagaaataagtgcagtcccagtgatatttaatagca
ctgggtaggttctctgtaaccctctaacatttacaattatag
gaattcatgggagttcataatgataaggggttagaactgtggctcaggag
agaattggctcaggacacaatagttgataaactgtagattaaagatcgga
actcgtactaacgatgatgattaggatcatctcattttaatttactaagg
acttgcaatccaaaattcagggagggcatcagcacaacactacttatgca
tgattatgatacaaagagacgccagaggtttcttgttcaaaaacataaag
tttagcctcagttgcatgcaggtgaggtacatttagtgatgatatatggg
tgtagttcagaggctaaagagatatattaacaattctctgtcagtaatct
tgaaacccaaagtctattcttaagtcaggcattttatcttctaaggcctg
gagaaatattcaaatagtcaccactaacacttgctaattgactcagagaa
ttagtccaggtggctacaacccacaccatctgctttagatccttttttcc
agtctgctgtcctggatttctctgccactggcatcatgtcttggaagcct
tccctctgcctggctccaacagattgattacctatttggacagtctgcta
tgctttggacaatcactgcaacatgtgcagcttcttaaattaccctccac
ggcacccgtgaccagctgtaagtggtgtctcacctttctttgcagctccc
tggatacttgctgtgcccatttggggtcgggggaggggtggcggcagcat
tgagaggatttactgctatgttcctagactggacagattctgtgttcaaa
ttgctgttgaaaaccctgacacagttggtgcattctctgtatgttacaat
agccatcatcatataagataaagcctgcatcctaaagggataacaccatg
atgaccatgaacacaatgtgctcacaaacacatgacatcatggcaggaaa
atttgactcacttcagaataatcgctaagattttttttttaagttagaat
agcagcatgatattttgctgaattgttattatgcacgtggtaatttaaaa
gcatcacttggaaagacaatgataatttggcatctactgggatcgagctg
acttggaaaatatggaattttccgtgcttgccatagaatttcttaagcca
gaacagcct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_24696636_24697709
seq2: B6Ng01-248C24.b_45_1136

seq1  GAATTCACCTGGACATCTCCTTCTTCTCTCTTATGTCTGAATTGTAAATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTGGACATCTCCTTCTTCTCTCTTATGTCTGAATTGTAAATA  50

seq1  GTCCTTATAAAGCAGAGAAAGTACACACACCCTTTGATGTGGCATCTCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTATAAAGCAGAGAAAGTACACACACCCTTTGATGTGGCATCTCCA  100

seq1  TTTGCAAGATTGTAACAGGTCCCAAGAATAGGCATATGCTTCCATCATCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAAGATTGTAACAGGTCCCAAGAATAGGCATATGCTTCCATCATCC  150

seq1  TGGGATCCTCTTCACTTGGCACTGAGCCTGCCACACATCAGGCATCCTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATCCTCTTCACTTGGCACTGAGCCTGCCACACATCAGGCATCCTAC  200

seq1  TGCTGTATGGATGCACTGTATCTCCATCTGTTTGGAAAATGGATTCAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTATGGATGCACTGTATCTCCATCTGTTTGGAAAATGGATTCAATT  250

seq1  GATTGCAACAGGTGAAAAGGTCCAGTTAATTTCAATGATTTCTTCTCAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGCAACAGGTGAAAAGGTCCAGTTAATTTCAATGATTTCTTCTCAGT  300

seq1  TTAAGATAATAGATCCAAGTAATCAAAAAAAAAAAAAAGAAAATATATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGATAATAGATCCAAGTAATCAAAAAAAAAAAAAAGAAAATATATAT  350

seq1  GTATATGTTTACCAAGACTGAAAATTGAATGTATTAATAAATCTATGTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATGTTTACCAAGACTGAAAATTGAATGTATTAATAAATCTATGTAC  400

seq1  ATATATATATATATATATATATATACACATATGCATTGCACACTCATACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATATATATATACACATATGCATTGCACACTCATACA  450

seq1  CAAACATGAATATATATTTTATGTGTACATTAATTTATATTTTAAAAGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACATGAATATATATTTTATGTGTACATTAATTTATATTTTAAAAGTT  500

seq1  ATTTCCTAAAATTTTAATGATGGTTTTCATGTTTGCTAAATATAAACCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCTAAAATTTTAATGATGGTTTTCATGTTTGCTAAATATAAACCTG  550

seq1  TTTTGTAAAAATTCATATTTAAGAACTCAACAAAGTAAAATAATACGTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTAAAAATTCATATTTAAGAACTCAACAAAGTAAAATAATACGTGG  600

seq1  TTACTCTCATGTATTTTTAACAATTCTATACTGGCAACAATTGGCCGAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCTCATGTATTTTTAACAATTCTATACTGGCAACAATTGGCCGAAG  650

seq1  TAATTTTATTCTCAACCTAGAAGATGACATAGCTTGATAAAAATTTTTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTATTCTCAACCTAGAAGATGACATAGCTTGATAAAAATTTTTCC  700

seq1  ATTGGTAAATACCACTGAAAATGTTAGAGACTTTAATAACCTATTTAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTAAATACCACTGAAAATGTTAGAGACTTTAATAACCTATTTAAAA  750

seq1  AGCAATGAAATATAACAAAAGCAGTACTTTCCATGTAAAAGTCCCAAATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATGAAATATAACAAAAGCAGTACTTTCCATGTAAAAGTCCCAAATA  800

seq1  GAATAAGAATTAAAACAAAAATAGATGGATAATAACAGTTAGTTTAATAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAGAATTAAAACAAAAATAGATGGATAATAACAGTTAGTTTAATAT  850

seq1  GTAACTTGAATTTTTAAAGATTATGTATATTG-AAATACATTTTGACAAT  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GTAACTTGAATTTTTAAAGATTATGTATATTGAAAATACATTTTGACAAT  900

seq1  TCTTCTTTTATTGTCATGGGTAACAA-TTCCTATTACGAATCCACACCAG  948
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTTTATTGTCATGGGTAACAATTTCCTATTACGAATCCACACCAG  950

seq1  TAG-ATAGA--TTTATTAAGTACAA--TACAT-ATATTGA-TTAATCATC  991
      ||| |||||  ||||| ||||||||   |||| ||||||| |||||||||
seq2  TAGAATAGAATTTTATAAAGTACAAATAACATAATATTGATTTAATCATC  1000

seq1  TGTCTA--CATACTA--GAATAAGTGCAGT-CCAGTGATAATTAATAGCA  1036
      ||||||   ||||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||
seq2  TGTCTAACAATACTAAGAAATAAGTGCAGTCCCAGTGATATTTAATAGCA  1050

seq1  CT-GGTAGGTTCTCTGT-ACCCTCT-ACATTTAC-ATTATAG  1074
      || |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||
seq2  CTGGGTAGGTTCTCTGTAACCCTCTAACATTTACAATTATAG  1092

seq1: chr15_24836327_24837486
seq2: B6Ng01-248C24.g_66_1224 (reverse)

seq1  AGGCTGTCCT-GCTTAAGAAATTCTAAAGGCAAGCACCGAAATATTTCAT  49
      ||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||
seq2  AGGCTGTTCTGGCTTAAGAAATTCT-ATGGCAAGCACGGAAA-ATTCCAT  48

seq1  ATTTTCAAATTCA-CTCAAATCCAGTAGATTCCCAAATTATCATTGTCTT  98
      |||||| || ||| ||| |  |||||||| | ||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCAAGTCAGCTCGATCCCAGTAGA-TGCCAAATTATCATTGTCTT  97

seq1  TCC-AGTGATGCTTTTAAATTA-CACGTGGCATAATAACAATTCAGC-AA  145
      ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||
seq2  TCCAAGTGATGCTTTTAAATTACCACGT-GCATAATAACAATTCAGCAAA  146

seq1  ATATCATGCTGCTATTCTAACTTAAAAAAAAAAATCTTAGCGATTATTCT  195
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCATGCTGCTATTCTAACTT-AAAAAAAAAATCTTAGCGATTATTCT  195

seq1  GAAGTGAGTCAAATTTTCCTGCCATGATGTCATTGTGTTTGTGAGCACAT  245
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GAAGTGAGTCAAATTTTCCTGCCATGATGTCA-TGTGTTTGTGAGCACAT  244

seq1  TGTGTTCATGGTCATCATGGTGTTATCCCTTTAGGATGCAGGCTTTATCT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTCATGGTCATCATGGTGTTATCCCTTTAGGATGCAGGCTTTATCT  294

seq1  TATATGATGATGGCTATTGTAACATACAGAGAATGCACCAACTGTGTCAG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGATGATGGCTATTGTAACATACAGAGAATGCACCAACTGTGTCAG  344

seq1  GGTTTTCAACAGCAATTTGAACACAGAATCTGTCCAGTCTAGGAACATAG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTCAACAGCAATTTGAACACAGAATCTGTCCAGTCTAGGAACATAG  394

seq1  CAGTAAATCCTCTCAATGCTGCCGCCACCCCTCCCCCGACCCCAAATGGG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAATCCTCTCAATGCTGCCGCCACCCCTCCCCCGACCCCAAATGGG  444

seq1  CACAGCAAGTATCCAGGGAGCTGCAAAGAAAGGTGAGACACCACTTACAG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCAAGTATCCAGGGAGCTGCAAAGAAAGGTGAGACACCACTTACAG  494

seq1  CTGGTCACGGGTGCCGTGGAGGGTAATTTAAGAAGCTGCACATGTTGCAG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCACGGGTGCCGTGGAGGGTAATTTAAGAAGCTGCACATGTTGCAG  544

seq1  TGATTGTCCAAAGCATAGCAGACTGTCCAAATAGGTAATCAATCTGTTGG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTGTCCAAAGCATAGCAGACTGTCCAAATAGGTAATCAATCTGTTGG  594

seq1  AGCCAGGCAGAGGGAAGGCTTCCAAGACATGATGCCAGTGGCAGAGAAAT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGGCAGAGGGAAGGCTTCCAAGACATGATGCCAGTGGCAGAGAAAT  644

seq1  CCAGGACAGCAGACTGGAAAAAAGGATCTAAAGCAGATGGTGTGGGTTGT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACAGCAGACTGGAAAAAAGGATCTAAAGCAGATGGTGTGGGTTGT  694

seq1  AGCCACCTGGACTAATTCTCTGAGTCAATTAGCAAGTGTTAGTGGTGACT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACCTGGACTAATTCTCTGAGTCAATTAGCAAGTGTTAGTGGTGACT  744

seq1  ATTTGAATATTTCTCCAGGCCTTAGAAGATAAAATGCCTGACTTAAGAAT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAATATTTCTCCAGGCCTTAGAAGATAAAATGCCTGACTTAAGAAT  794

seq1  AGACTTTGGGTTTCAAGATTACTGACAGAGAATTGTTAATATATCTCTTT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTTGGGTTTCAAGATTACTGACAGAGAATTGTTAATATATCTCTTT  844

seq1  AGCCTCTGAACTACACCCATATATCATCACTAAATGTACCTCACCTGCAT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTGAACTACACCCATATATCATCACTAAATGTACCTCACCTGCAT  894

seq1  GCAACTGAGGCTAAACTTTATGTTTTTGAACAAGAAACCTCTGGCGTCTC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACTGAGGCTAAACTTTATGTTTTTGAACAAGAAACCTCTGGCGTCTC  944

seq1  TTTGTATCATAATCATGCATAAGTAGTGTTGTGCTGATGCCCTCCCTGAA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTATCATAATCATGCATAAGTAGTGTTGTGCTGATGCCCTCCCTGAA  994

seq1  TTTTGGATTGCAAGTCCTTAGTAAATTAAAATGAGATGATCCTAATCATC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGATTGCAAGTCCTTAGTAAATTAAAATGAGATGATCCTAATCATC  1044

seq1  ATCGTTAGTACGAGTTCCGATCTTTAATCTACAGTTTATCAACTATTGTG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGTTAGTACGAGTTCCGATCTTTAATCTACAGTTTATCAACTATTGTG  1094

seq1  TCCTGAGCCAATTCTCTCCTGAGCCACAGTTCTAACCCCTTATCATTATG  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAGCCAATTCTCTCCTGAGCCACAGTTCTAACCCCTTATCATTATG  1144

seq1  AACTCCCATGAATTC  1160
      |||||||||||||||
seq2  AACTCCCATGAATTC  1159