BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-258F12
Chromosome15 (Build37)
Map Location 37,326,660 - 37,476,808
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNcald, LOC667498, 4930447A16Rik, LOC100041313
Upstream geneEG545101, Ankrd46, 4631426E05Rik, Pabpc1, LOC626746, Ywhaz, Zfp706, LOC670911, LOC667492, LOC100041288, Grhl2
Downstream geneLOC667534, Rrm2b, LOC100041478, Edd1, Odf1, LOC382986, LOC667563, Klf10, Azin1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-258F12.bB6Ng01-258F12.g
ACCGA063804GA063805
length921781
definitionB6Ng01-258F12.b B6Ng01-258F12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,475,896 - 37,476,808)(37,326,660 - 37,327,440)
sequence
gaattccagttacagggagagaagcactgtaaggatccaagccaactgcc
cagagagcagtcttggagaacctctatcactttgcattttcccagagttt
tctatttaatgttgatatggttttcagcctttccaaaaatgaggaggctg
actatacctcagaaaacagattctgacaaaatacaagacctctgttaact
gccaagaatgttattgatcaccctttccaggatgaatgcagggaaagctc
aagaattaaatttcacttgaagcgcaggagacacagtctcgcattctgtt
ctccctgagcatcagctaatgcacttatgatgagggcttgggtttcctcc
agacctttgggggatgctccttggcagtaggttggctggtgtgtgtctaa
tgttcactgcatacatgatgaacactcccttctctccttgtctgatttga
tcagatcgttcttatgtaaggtcttttttcctcatgcctttccccttctt
cattaaacaattttaatgacttatccatattgtcttgtgtgtgtgacgct
ttgccaaagttatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatg
tggactacattcatgtacagtgcttgtgaaaatcagaatagggtgttgga
tcccctggagctgggagttacaggtggttatgagccaccatgggtgtgct
gagaactgagccaggctcctatgtaagagcagcacatactctgactactg
agtcatctctccacccacctttatttcattttgttcataagtccataggt
tctaaagcagactcttgaacaacgttcttttcttccaaaactttcttctc
tttataaaaagagttctttttgggctttttcaagatcatgttcaaagctt
tcttcaaaggaaacgtttctt
gaattcaaacctttcaaaaaccaccaagtgggtcacactaactgccctgg
caaaacaccaatttacaaacttagtcccatgctttcccaggtaacttctg
gatttttcttgtgacactcatgcttctctctctaacaggccagggtcctt
acctgtacaatctccagcatttctgccttgctgatgtagccattgccatc
caggtcatacatgctgaaggcccacttcagcttctgctccagcttgcccc
ttgatgtcacactcagggctatgatgaactctctaaagtctattgtccca
tcaccgtttgcatcgaaggtgcggaagacatgctctgcaaatttggaagc
atccccgtaagggaaaaagttcccatatattttcttaaactcttccattg
ataaatgtccgctggggcagtctctcaagaagcctttgtaccactcctgg
atctcgtgctctgtgaagtctgtgctttccagtaagtcctgcatgacttc
agggcgcagcttgctgttctgtttccccattctggcaacaagaattcaac
tgcaaagagaaaggaaaatacatatgttttttagagcggtcctttagggt
catgcgatcatgtagtattgttccttgagaagagggaaaatctaacaaac
tctctactagcccaatagctagaccaaatgatagcaaaacaggccagtca
gagatgcagaaagccatgttgctaaccagaccagtcagaaagcaagatat
ggatggatggatggatggatggatggatgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_37475896_37476808
seq2: B6Ng01-258F12.b_46_966 (reverse)

seq1  AAGCAACGTTTCCTTTGGAGAAAGCTTTG-ACATGATCTTG-AAAAGCC-  47
      ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| 
seq2  AAGAAACGTTTCCTTTGAAGAAAGCTTTGAACATGATCTTGAAAAAGCCC  50

seq1  -AAAAGAACTCTTTTTATTATGAGAAGAAAGTTTTGG-AGAAAAGAACGT  95
       ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AAAAAGAACTCTTTTTATAAAGAGAAGAAAGTTTTGGAAGAAAAGAACGT  100

seq1  TGTTCAAGGGTCTGCTTTAG-ACCTATGGACTTATGAACAAAATGAAAT-  143
      |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGTTCAAGAGTCTGCTTTAGAACCTATGGACTTATGAACAAAATGAAATA  150

seq1  AAGGTGGGTGGAGAGATGACTCAGTAGTCAGAGTATGTGCTGCTCTTACA  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGGGTGGAGAGATGACTCAGTAGTCAGAGTATGTGCTGCTCTTACA  200

seq1  TAGGAGCCTGGCTCAGTTCTCAGCACACCCATGGTGGCTCATAACCACCT  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGCCTGGCTCAGTTCTCAGCACACCCATGGTGGCTCATAACCACCT  250

seq1  GTAACT-CCAGCTCCAGGGGATCCAACACCCTATTCTGATTTTCACAAGC  292
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTCCCAGCTCCAGGGGATCCAACACCCTATTCTGATTTTCACAAGC  300

seq1  ACTGTACATGAATGTAGTCCACATACATACATACATACATACATACATAC  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTACATGAATGTAGTCCACATACATACATACATACATACATACATAC  350

seq1  ATACATACATAACTTTGGCAAAGCGTCACACACACAAGACAATATGGATA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATACATAACTTTGGCAAAGCGTCACACACACAAGACAATATGGATA  400

seq1  AGTCATTAAAATTGTTTAATGAAGAAGGGGAAAGGCATGAGGAAAAAAGA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATTAAAATTGTTTAATGAAGAAGGGGAAAGGCATGAGGAAAAAAGA  450

seq1  CCTTACATAAGAACGATCTGATCAAATCAGACAAGGAGAGAAGGGAGTGT  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACATAAGAACGATCTGATCAAATCAGACAAGGAGAGAAGGGAGTGT  500

seq1  TCATCATGTATGCAGTGAACATTAGACACACACCAGCCAACCTACTGCCA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCATGTATGCAGTGAACATTAGACACACACCAGCCAACCTACTGCCA  550

seq1  AGGAGCATCCCCCAAAGGTCTGGAGGAAACCCAAGCCCTCATCATAAGTG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCATCCCCCAAAGGTCTGGAGGAAACCCAAGCCCTCATCATAAGTG  600

seq1  CATTAGCTGATGCTCAGGGAGAACAGAATGCGAGACTGTGTCTCCTGCGC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAGCTGATGCTCAGGGAGAACAGAATGCGAGACTGTGTCTCCTGCGC  650

seq1  TTCAAGTGAAATTTAATTCTTGAGCTTTCCCTGCATTCATCCTGGAAAGG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGTGAAATTTAATTCTTGAGCTTTCCCTGCATTCATCCTGGAAAGG  700

seq1  GTGATCAATAACATTCTTGGCAGTTAACAGAGGTCTTGTATTTTGTCAGA  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATCAATAACATTCTTGGCAGTTAACAGAGGTCTTGTATTTTGTCAGA  750

seq1  ATCTGTTTTCTGAGGTATAGTCAGCCTCCTCATTTTTGGAAAGGCTGAAA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTTTTCTGAGGTATAGTCAGCCTCCTCATTTTTGGAAAGGCTGAAA  800

seq1  ACCATATCAACATTAAATAGAAAACTCTGGGAAAATGCAAAGTGATAGAG  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATATCAACATTAAATAGAAAACTCTGGGAAAATGCAAAGTGATAGAG  850

seq1  GTTCTCCAAGACTGCTCTCTGGGCAGTTGGCTTGGATCCTTACAGTGCTT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTCCAAGACTGCTCTCTGGGCAGTTGGCTTGGATCCTTACAGTGCTT  900

seq1  CTCTCCCTGTAACTGGAATTC  913
      |||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCCTGTAACTGGAATTC  921

seq1: chr15_37326660_37327440
seq2: B6Ng01-258F12.g_65_845

seq1  GAATTCAAACCTTTCAAAAACCACCAAGTGGGTCACACTAACTGCCCTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAACCTTTCAAAAACCACCAAGTGGGTCACACTAACTGCCCTGG  50

seq1  CAAAACACCAATTTACAAACTTAGTCCCATGCTTTCCCAGGTAACTTCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACACCAATTTACAAACTTAGTCCCATGCTTTCCCAGGTAACTTCTG  100

seq1  GATTTTTCTTGTGACACTCATGCTTCTCTCTCTAACAGGCCAGGGTCCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTTCTTGTGACACTCATGCTTCTCTCTCTAACAGGCCAGGGTCCTT  150

seq1  ACCTGTACAATCTCCAGCATTTCTGCCTTGCTGATGTAGCCATTGCCATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTACAATCTCCAGCATTTCTGCCTTGCTGATGTAGCCATTGCCATC  200

seq1  CAGGTCATACATGCTGAAGGCCCACTTCAGCTTCTGCTCCAGCTTGCCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCATACATGCTGAAGGCCCACTTCAGCTTCTGCTCCAGCTTGCCCC  250

seq1  TTGATGTCACACTCAGGGCTATGATGAACTCTCTAAAGTCTATTGTCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGTCACACTCAGGGCTATGATGAACTCTCTAAAGTCTATTGTCCCA  300

seq1  TCACCGTTTGCATCGAAGGTGCGGAAGACATGCTCTGCAAATTTGGAAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCGTTTGCATCGAAGGTGCGGAAGACATGCTCTGCAAATTTGGAAGC  350

seq1  ATCCCCGTAAGGGAAAAAGTTCCCATATATTTTCTTAAACTCTTCCATTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCCGTAAGGGAAAAAGTTCCCATATATTTTCTTAAACTCTTCCATTG  400

seq1  ATAAATGTCCGCTGGGGCAGTCTCTCAAGAAGCCTTTGTACCACTCCTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGTCCGCTGGGGCAGTCTCTCAAGAAGCCTTTGTACCACTCCTGG  450

seq1  ATCTCGTGCTCTGTGAAGTCTGTGCTTTCCAGTAAGTCCTGCATGACTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCGTGCTCTGTGAAGTCTGTGCTTTCCAGTAAGTCCTGCATGACTTC  500

seq1  AGGGCGCAGCTTGCTGTTCTGTTTCCCCATTCTGGCAACAAGAATTCAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCGCAGCTTGCTGTTCTGTTTCCCCATTCTGGCAACAAGAATTCAAC  550

seq1  TGCAAAGAGAAAGGAAAATACATATGTTTTTTAGAGCGGTCCTTTAGGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAGAGAAAGGAAAATACATATGTTTTTTAGAGCGGTCCTTTAGGGT  600

seq1  CATGCGATCATGTAGTATTGTTCCTTGAGAAGAGGGAAAATCTAACAAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCGATCATGTAGTATTGTTCCTTGAGAAGAGGGAAAATCTAACAAAC  650

seq1  TCTCTACTAGCCCAATAGCTAGACCAAATGATAGCAAAACAGGCCAGTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTACTAGCCCAATAGCTAGACCAAATGATAGCAAAACAGGCCAGTCA  700

seq1  GAGATGCAGAAAGCCATGTTGCTAACCAGACCAGTCAGAAAGCAAGATAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGCAGAAAGCCATGTTGCTAACCAGACCAGTCAGAAAGCAAGATAT  750

seq1  GGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGA  781
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGA  781