BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-262P10
Chromosome15 (Build37)
Map Location 90,740,042 - 90,893,853
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKif21a
Upstream geneAlg10b, Cpne8, EG627342, LOC100042462, LOC100042471, EG667682, Tcea1-ps1, Spn-ps
Downstream geneEG635871, Abcd2, LOC545126, Slc2a13, Lrrk2, Muc19, Smgc, LOC100042529
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-262P10.bB6Ng01-262P10.g
ACCGA067248GA067249
length5141,169
definitionB6Ng01-262P10.b B6Ng01-262P10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,893,336 - 90,893,853)(90,740,042 - 90,741,228)
sequence
aaaagaaaaaaaaccgtaaattcaacacaaacacctcaatttcagatgat
cagtgtatgccaagtgaatgggctgctgtgattcggggtgctgtgattca
gggtgcctgaagagggacgagaggataagatgccctggaactgaagttac
aggcatctgtgagccaccaggcatggctacagggaacttggtaagagggt
ggagtgctcttaagtactgagccatgtctacagccctctctaatttttgt
gggttttaagcctacttgattaccgtaaatgatctttttgatgtgttctt
ggattcagtttgcaagtatttggggattctgtctttcaagtttttaataa
gtacctcatctcagtatgaataaaagggacagatttagtacaacaaggta
tttttaaaaatgtgtatgggtgggggctggagatatggctcagaggttaa
cagcacatactgctcatccataggtcctgagtttaattctcagcaaccac
atgggtggctcatt

gaattctcacctgaggaataccgaatggctgagaagcacctgaaaaaatg
ttcagcatccttaaacatcagggaaatgcaaatcaaaacaaccctgagat
tccacctcataccacccagaatggctaagatcaaaaattcaagggacagc
agatgctggcaaggatgtggagaaagaggaacactcctccattgttggtg
gaattgcaagcttgtaaatgcatctttcttaacctctcctcctgctcaca
aaatcttcaaggtaaataaaccaagctgtgtacagaacgagagaaccatg
acaacatgacttgggacttcccgattacttgtctcacttccactgaggaa
gagagcaggactcattgcaaatgtttccttccacaaggttttcagcactc
accctataataataaagcgggctttgtgggccacagggaagagcacataa
gtaaagataattactgcagtacatgatgtgtaattacaggacttctatac
ttccaccagaatagaacttctaattatctccgatgtctaccttcataaaa
atcatggacagtttccaaagaaattacacaaagtggtaaaactttagact
attggaatagaaaaaaaaatacgaagaatttttggaatggaatagcctgc
aggatcttcaaattctctgatccttctcgggccttttctttcaccatgtc
tgtaccactctgcctgactttgagtcactgtgtattaatttacgtgatga
atacaactaaaattctaatcagtctttaaacagggactcagaagtttctt
ttgctccaaagtgttgactcctcccttaggtccctcagatggatctaaaa
ggacgatgctttggtatgtctaccctcagtttgtgtctgtttcctctgct
tgcctgctttgcttacaactgcagctaaacatgctaaacactcactgtct
accctacctccttccaattcaaggtgagcaacagagataaatctttgtcc
tcacagaggacatctttgtcctcaatccttggatttcgggacatgaaatc
ctcagagacaggcatgcccaccccaacaaaggatgattcatggaactgac
cctctgctgatacaatcatttcatagtacgacttattctcacagtcacaa
gaaacaattgaccaggtta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_90893336_90893853
seq2: B6Ng01-262P10.b_42_560 (reverse)

seq1  ATGAGCCA-CCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTTTGGAAGA  49
      |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||
seq2  ATGAGCCACCCATGTGGTTGCTGAGAATTAAACTCAGGACCTATGGATGA  50

seq1  GCAGTCTGTGCTCTTAACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCACCCATAC  99
      ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTATGTGCTGTTAACCTCTGAGCCATATCTCCAGCCCCCACCCATAC  100

seq1  ACATTTTTAAAAATACCTTGTTGTACTAAATCTGTCCCTTTTATTCATAC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTTTAAAAATACCTTGTTGTACTAAATCTGTCCCTTTTATTCATAC  150

seq1  TGAGATGAGGTACTTATTAAAAACTTGAAAGACAGAATCCCCAAATACTT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATGAGGTACTTATTAAAAACTTGAAAGACAGAATCCCCAAATACTT  200

seq1  GCAAACTGAATCCAAGAACACATCAAAAAGATCATTTACGGTAATCAAGT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACTGAATCCAAGAACACATCAAAAAGATCATTTACGGTAATCAAGT  250

seq1  AGGCTTAAAACCCACAAAAATTAGAGAGGGCTGTAGACATGGCTCAGTAC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTAAAACCCACAAAAATTAGAGAGGGCTGTAGACATGGCTCAGTAC  300

seq1  TTAAGAGCACTCCACCCTCTTACCAAGTTCCCTGTAGCCATGCCTGGTGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAGCACTCCACCCTCTTACCAAGTTCCCTGTAGCCATGCCTGGTGG  350

seq1  CTCACAGATGCCTGTAACTTCAGTTCCAGGGCATCTTATCCTCTCGTCCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGATGCCTGTAACTTCAGTTCCAGGGCATCTTATCCTCTCGTCCC  400

seq1  TCTTCAGGCACCCTGAATCACAGCACCCCGAATCACAGCAGCCCATTCAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAGGCACCCTGAATCACAGCACCCCGAATCACAGCAGCCCATTCAC  450

seq1  TTGGCATACACTGATCATCTGAAATTGAGGTGTTTGTGTTGAATTTACGG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCATACACTGATCATCTGAAATTGAGGTGTTTGTGTTGAATTTACGG  500

seq1  TTTTTTTTCTTTTGAATTC  518
      |||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTCTTTTGAATTC  519


seq1: chr15_90740042_90741228
seq2: B6Ng01-262P10.g_65_1233

seq1  GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCTGAGAAGCACCTGAAAAAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCTGAGAAGCACCTGAAAAAATG  50

seq1  TTCAGCATCCTTAAACATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCATCCTTAAACATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGAT  100

seq1  TCCACCTCATACCACCCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAAGGGACAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCTCATACCACCCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAAGGGACAGC  150

seq1  AGATGCTGGCAAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCTGGCAAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTG  200

seq1  GAATTGCAAGCTTGTAAATGCATCTTTCTTAACCTCTCCTCCTGCTCACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGCAAGCTTGTAAATGCATCTTTCTTAACCTCTCCTCCTGCTCACA  250

seq1  AAATCTTCAAGGTAAATAAACCAAGCTGTGTACAGAACGAGAGAACCATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTTCAAGGTAAATAAACCAAGCTGTGTACAGAACGAGAGAACCATG  300

seq1  ACAACATGACTTGGGACTTCCCGATTACTTGTCTCACTTCCACTGAGGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACATGACTTGGGACTTCCCGATTACTTGTCTCACTTCCACTGAGGAA  350

seq1  GAGAGCAGGACTCATTGCAAATGTTTCCTTCCACAAGGTTTTCAGCACTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGCAGGACTCATTGCAAATGTTTCCTTCCACAAGGTTTTCAGCACTC  400

seq1  ACCCTATAATAATAAAGCGGGCTTTGTGGGCCACAGGGAAGAGCACATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTATAATAATAAAGCGGGCTTTGTGGGCCACAGGGAAGAGCACATAA  450

seq1  GTAAAGATAATTACTGCAGTACATGATGTGTAATTACAGGACTTCTATAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGATAATTACTGCAGTACATGATGTGTAATTACAGGACTTCTATAC  500

seq1  TTCCACCAGAATAGAACTTCTAATTATCTCCGATGTCTACCTTCATAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACCAGAATAGAACTTCTAATTATCTCCGATGTCTACCTTCATAAAA  550

seq1  ATCATGGACAGTTTCCAAAGAAATTACACAAAGTGGTAAAACTTTAGACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGGACAGTTTCCAAAGAAATTACACAAAGTGGTAAAACTTTAGACT  600

seq1  ATTGGAATAGAAAAAAAAATACGAAGAATTTTTGGAATGGAATAGCCTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGAATAGAAAAAAAAATACGAAGAATTTTTGGAATGGAATAGCCTGC  650

seq1  AGGATCTTCAAATTCTCTGATCCTTCTCGGGCCTTTTCTTTCACCATGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCTTCAAATTCTCTGATCCTTCTCGGGCCTTTTCTTTCACCATGTC  700

seq1  TGTACCACTCTGCCTGACTTTGAGTCACTGTGTATTAATTTACGTGATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACCACTCTGCCTGACTTTGAGTCACTGTGTATTAATTTACGTGATGA  750

seq1  ATACAACTAAAATTCTAATCAGTCTTTAAACAGGGACTCAGAAGTTTCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAACTAAAATTCTAATCAGTCTTTAAACAGGGACTCAGAAGTTTCTT  800

seq1  TTGCTCCAAAGTGTTGACTCCTCCCTTAGGTCCCTCAGATGGATCTAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCCAAAGTGTTGACTCCTCCCTTAGGTCCCTCAGATGGATCTAAAA  850

seq1  GGACGATGCTTTGGTATGTCTACCCTCAGTTTGTGTCTGTTTCCTCTGCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACGATGCTTTGGTATGTCTACCCTCAGTTTGTGTCTGTTTCCTCTGCT  900

seq1  TGCCTGCTTTGCTTACAACTGCAGCTAAACATGCTAAACACTCACTGTCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGCTTTGCTTACAACTGCAGCTAAACATGCTAAACACTCACTGTCT  950

seq1  ACCCTACCTCCTTCCAATTCAAGGGTGAAGCAACAGAGATAAATCTTTGT  1000
      |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTACCTCCTTCCAATTCAA-GGTG-AGCAACAGAGATAAATCTTTGT  998

seq1  CCTCAACCAGAGGACAATCTTTGTCCTCAATCCTTGGATTTCGGGACATG  1050
      |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CCTCA--CAGAGGAC-ATCTTTGTCCTCAATCCTTGGATTTCGGGACAT-  1044

seq1  GAAAACCTCAGAGGACAGGCATGGCCCACCCCAAACAAAGGGAATGATCC  1100
      |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |
seq2  GAAATCCTCAGA-GACAGGCAT-GCCCACCCC-AACAAAGG--ATGATTC  1089

seq1  ATGGACTTGACACTCCTTGCCTGATACAATCATTTCATAGGGAAACAGAC  1150
      |||||  |||| |||  || ||||||||||||||||||||    || |||
seq2  ATGGAACTGACCCTC--TG-CTGATACAATCATTTCATAG---TAC-GAC  1132

seq1  TAATCTCCACCAGGCACAGAAAACAATTGA-CAGGTTA  1187
      | || ||   ||| ||||  |||||||||| |||||||
seq2  TTAT-TCTCACAGTCACAAGAAACAATTGACCAGGTTA  1169


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |