BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-263H20
Chromosome15 (Build37)
Map Location 91,026,427 - 91,123,539
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC545126, Slc2a13
Upstream geneAlg10b, Cpne8, EG627342, LOC100042462, LOC100042471, EG667682, Tcea1-ps1, Spn-ps, Kif21a, EG635871, Abcd2
Downstream geneLrrk2, Muc19, Smgc, LOC100042529, Cntn1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-263H20.bB6Ng01-263H20.g
ACCGA067644GA067645
length5931,176
definitionB6Ng01-263H20.b B6Ng01-263H20.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,122,941 - 91,123,539)(91,026,427 - 91,027,623)
sequence
cttgctgacatgactacatccagaaactcattatgtagcttcatgtttta
atccattattagaaactgccaggcggcaccctgttattacatctgaatga
gtgttcttgtaggacatcagccactgcaaatgaattttctagttacaaag
tcattatgggacatttccagcttacatgagcatcctttctgttctaatta
tgggctggagtttaggatcaaaattgatcctgagtcagaagagtgtatgg
aggccagagacctgggtctgctgacgggctctcaccctctgagaagcatt
ttgtcgcccccccacacacacacactttagctgttgacgtcaatgcacta
tttcctgtccatgtggaaagagtgctaacttgggaggtgtaagccagttt
tcatcccatccctgtttctattagaattctccaaaaagaaaagcactctg
gaaagaggtctctatacttacccgaactagagggaaattatgctgaagga
gaaaaagagagtaaaataagattcaaatgcccctgctgtgtagtttaggg
aaatgtgcgtgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtt
gaattccagaggtaagagacttgtgaaaagaattaaataagaaagtaatc
aagacaaaaaaaaattgacatgggatttgtggtacaaggaaggctgaagg
tcagatattagagttatggaaagggtcagcgtgtgatttgatttgagagt
cagtcagtttagcacagacccaactataataatctaaaccccacctttat
cctccacactgcatgtaccaactgggggagggtgggtcctaagatttgaa
actaggcttctgatagggatagaaggattcagtttgagaggaaagaaggc
agaaaatgtgccacaacacatccaggtcaacaatgggtcgcatttaagaa
ctgaaaatttccctcttgcctattgactttgtaagcataagtgtcataga
atgtagcatcactcatgcatttgaattattcatgtcataaagagacttac
tgtgctcctggacataatataacaaaataccatatgctaggttataataa
taatgctactggtccatatagatactatactatacttttaattgttgttg
tacaggatacacctgattatcaaatggctttttaaaggaacactccagtt
ctatacttctcatgctaactgtatctctttgtatcaagagaacatacaga
ataatgtatacattcctactagttttgtggtactccacttcatgtttggc
caatgataatgccgcctagaattgatgctcaaagtgtatttgttttgtta
aacaatgcatggttacatattcttttaaagtaagacattaagactgttat
ggggtttcttttaattttttattgaaagaaaaaaataaagtcaatattag
tttgaatttcaactaggaaggaaaaaaaggagtgaaaaaaatcacttgtt
attgtagtaagcattataaaatttccactcaagcttctgcacttaatgta
atttcatatgggaaatattactttttttcccaaggggattataatctgag
aaactagtctgacatatgtttcaaattactatgcagatgctgaagatgga
tagcagctagagcatcactgttctgcagaggactgggatctagcactcat
ggtgaacccaaagtctgttgacttcagttcaggtctacatgccctcttaa
tggcctctaggattttataaggcatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_91122941_91123539
seq2: B6Ng01-263H20.b_44_642 (reverse)

seq1  AACACACACACACACACACACACACACACATGCACGCACATTTCCCTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACACACACACACACACACACACACATGCACGCACATTTCCCTAAA  50

seq1  CTACACAGCAGGGGCATTTGAATCTTATTTTACTCTCTTTTTCTCCTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACAGCAGGGGCATTTGAATCTTATTTTACTCTCTTTTTCTCCTTCA  100

seq1  GCATAATTTCCCTCTAGTTCGGGTAAGTATAGAGACCTCTTTCCAGAGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAATTTCCCTCTAGTTCGGGTAAGTATAGAGACCTCTTTCCAGAGTG  150

seq1  CTTTTCTTTTTGGAGAATTCTAATAGAAACAGGGATGGGATGAAAACTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCTTTTTGGAGAATTCTAATAGAAACAGGGATGGGATGAAAACTGG  200

seq1  CTTACACCTCCCAAGTTAGCACTCTTTCCACATGGACAGGAAATAGTGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACACCTCCCAAGTTAGCACTCTTTCCACATGGACAGGAAATAGTGCA  250

seq1  TTGACGTCAACAGCTAAAGTGTGTGTGTGTGGGGGGGCGACAAAATGCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACGTCAACAGCTAAAGTGTGTGTGTGTGGGGGGGCGACAAAATGCTT  300

seq1  CTCAGAGGGTGAGAGCCCGTCAGCAGACCCAGGTCTCTGGCCTCCATACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAGGGTGAGAGCCCGTCAGCAGACCCAGGTCTCTGGCCTCCATACA  350

seq1  CTCTTCTGACTCAGGATCAATTTTGATCCTAAACTCCAGCCCATAATTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTGACTCAGGATCAATTTTGATCCTAAACTCCAGCCCATAATTAG  400

seq1  AACAGAAAGGATGCTCATGTAAGCTGGAAATGTCCCATAATGACTTTGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAAAGGATGCTCATGTAAGCTGGAAATGTCCCATAATGACTTTGTA  450

seq1  ACTAGAAAATTCATTTGCAGTGGCTGATGTCCTACAAGAACACTCATTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGAAAATTCATTTGCAGTGGCTGATGTCCTACAAGAACACTCATTCA  500

seq1  GATGTAATAACAGGGTGCCGCCTGGCAGTTTCTAATAATGGATTAAAACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTAATAACAGGGTGCCGCCTGGCAGTTTCTAATAATGGATTAAAACA  550

seq1  TGAAGCTACATAATGAGTTTCTGGATGTAGTCATGTCAGCAAGGAATTC  599
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCTACATAATGAGTTTCTGGATGTAGTCATGTCAGCAAGGAATTC  599

seq1: chr15_91026427_91027623
seq2: B6Ng01-263H20.g_67_1242

seq1  GAATTCCAGAGGTAAGAGACTTGTGAAAAGAATTAAATAAGAAAGTAATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGAGGTAAGAGACTTGTGAAAAGAATTAAATAAGAAAGTAATC  50

seq1  AAGACAAAAAAAAATTGACATGGGATTTGTGGTACAAGGAAGGCTGAAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAAAAAAAAATTGACATGGGATTTGTGGTACAAGGAAGGCTGAAGG  100

seq1  TCAGATATTAGAGTTATGGAAAGGGTCAGCGTGTGATTTGATTTGAGAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATATTAGAGTTATGGAAAGGGTCAGCGTGTGATTTGATTTGAGAGT  150

seq1  CAGTCAGTTTAGCACAGACCCAACTATAATAATCTAAACCCCACCTTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAGTTTAGCACAGACCCAACTATAATAATCTAAACCCCACCTTTAT  200

seq1  CCTCCACACTGCATGTACCAACTGGGGGAGGGTGGGTCCTAAGATTTGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCACACTGCATGTACCAACTGGGGGAGGGTGGGTCCTAAGATTTGAA  250

seq1  ACTAGGCTTCTGATAGGGATAGAAGGATTCAGTTTGAGAGGAAAGAAGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGGCTTCTGATAGGGATAGAAGGATTCAGTTTGAGAGGAAAGAAGGC  300

seq1  AGAAAATGTGCCACAACACATCCAGGTCAACAATGGGTCGCATTTAAGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAATGTGCCACAACACATCCAGGTCAACAATGGGTCGCATTTAAGAA  350

seq1  CTGAAAATTTCCCTCTTGCCTATTGACTTTGTAAGCATAAGTGTCATAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAATTTCCCTCTTGCCTATTGACTTTGTAAGCATAAGTGTCATAGA  400

seq1  ATGTAGCATCACTCATGCATTTGAATTATTCATGTCATAAAGAGACTTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGCATCACTCATGCATTTGAATTATTCATGTCATAAAGAGACTTAC  450

seq1  TGTGCTCCTGGACATAATATAACAAAATACCATATGCTAGGTTATAATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTCCTGGACATAATATAACAAAATACCATATGCTAGGTTATAATAA  500

seq1  TAATGCTACTGGTCCATATAGATACTATACTATACTTTTAATTGTTGTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGCTACTGGTCCATATAGATACTATACTATACTTTTAATTGTTGTTG  550

seq1  TACAGGATACACCTGATTATCAAATGGCTTTTTAAAGGAACACTCCAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGATACACCTGATTATCAAATGGCTTTTTAAAGGAACACTCCAGTT  600

seq1  CTATACTTCTCATGCTAACTGTATCTCTTTGTATCAAGAGAACATACAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACTTCTCATGCTAACTGTATCTCTTTGTATCAAGAGAACATACAGA  650

seq1  ATAATGTATACATTCCTACTAGTTTTGTGGTACTCCACTTCATGTTTGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGTATACATTCCTACTAGTTTTGTGGTACTCCACTTCATGTTTGGC  700

seq1  CAATGATAATGCCGCCTAGAATTGATGCTCAAAGTGTATTTGTTTTGTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGATAATGCCGCCTAGAATTGATGCTCAAAGTGTATTTGTTTTGTTA  750

seq1  AACAATGCATGGTTACATATTCTTTTAAAGTAAGACATTAAGACTGTTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATGCATGGTTACATATTCTTTTAAAGTAAGACATTAAGACTGTTAT  800

seq1  GGGGTTTCTTTTAATTTTTTATTGAAAGAAAAAAATAAAGTCAATATTAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTTTCTTTTAATTTTTTATTGAAAGAAAAAAATAAAGTCAATATTAG  850

seq1  TTTGAATTTCAAACTAGGAAAGGAAAAAAAAGGAGTGAAAAAAATCACTT  900
      |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATTTC-AACTAGGAA--GGAAAAAAAGGAGTGAAAAAAATCACTT  897

seq1  GTTATTGTAGTAAGCATTATAAAATTTCCACTCAAGCTTCTGCACTTAAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTGTAGTAAGCATTATAAAATTTCCACTCAAGCTTCTGCACTTAAT  947

seq1  GTAATTTCATATGGAAAATATTAACTTTTTTCCCAAGGGGATTAATAATC  1000
      |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||
seq2  GTAATTTCATATGGGAAATATTACTTTTTTTCCCAAGGGGATT-ATAATC  996

seq1  TGAGAAAACTAGTCTGACATTAATGTTTCAAATTTACTAATGCAGAAGGC  1050
      |||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| | ||
seq2  TGAG-AAACTAGTCTGACAT--ATGTTTCAAA-TTACT-ATGCAG-ATGC  1040

seq1  TGGAAAGATGGATAAGCAGCTAAGAGCATTCACTGTTCTTGCAGAGGACC  1100
      ||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |
seq2  TG--AAGATGGAT-AGCAGCT-AGAGCA-TCACTGTTC-TGCAGAGGA-C  1083

seq1  TGGGATCCTAGCACCCTCATGGTG-ACCCACAG-CTGTTTAGAACTCCAG  1148
      |||||| ||||||  ||||||||| ||||| || |||||    ||| |||
seq2  TGGGAT-CTAGCA--CTCATGGTGAACCCAAAGTCTGTT---GACTTCAG  1127

seq1  TTCCAGGGTCTTACATGCCCTCTT-ATGGCCTCTAAGGA---TATTAGGC  1194
      |||   |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||   ||| ||||
seq2  TTC--AGGTC-TACATGCCCTCTTAATGGCCTCT-AGGATTTTATAAGGC  1173

seq1  ATG  1197
      |||
seq2  ATG  1176