BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264K10
Chromosome15 (Build37)
Map Location 85,711,780 - 85,805,497
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTrmu, Celsr1
Upstream gene4930513L16Rik, Nup50, 5031439G07Rik, LOC628135, Upk3a, 3110048E14Rik, Smc1b, Ribc2, Fbln1, Atxn10, EG223745, Wnt7b, LOC100042240, Ppara, 2210021J22Rik, Pkdrej, AW124722, Gtse1
Downstream geneBC021523, Cerk, LOC100042300, Tbc1d22a, LOC100042309
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264K10.bB6Ng01-264K10.g
ACCGA068498GA068499
length1,1391,095
definitionB6Ng01-264K10.b B6Ng01-264K10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(85,711,780 - 85,712,903)(85,804,414 - 85,805,497)
sequence
gaattcaggacctctggaagagcagtcagtgctcttaactgctgagccat
ctctccagccccctgagtgtggtattttatttgttaaaggtttgtcagca
aaatccctggaattttttggaggagggggcaataatcaaacacttgaagc
ttttaatacagttccctgtctttccttacattcagcttattcggagggag
aaacagggttttgatgcaaggtgaaccacagtgagttttctgagacactg
gagggccagtgctgacctatgtgatatttggttgggtatttgtcacagtg
gagaagagagatcataaaacatgtggatgatagagccctacggaatagcc
aacgccttaatttaaatgtttggtgttgagaattgaacccagggcttcac
ccatgctaagtatgggctttcccctggaggtaccccctctgggtgataaa
attccaatttttttttaattccaataatttaattggctttaatttgataa
cttagaatgtaaaagtcttaataattggatagcttttaaaatgagttccc
tttaaaaataactggacagtgattatcttaaaaatattttaaattctgta
tgtatggatgttttatccacatgtatgtctgtgcaccatgtgaatacccg
gttttaagaaggtatcagatctcctggaactggagttacaggtggctgtg
acctgccatgtgggtactggaaattgaacctgggtctgctggagaatcag
cgagtgctcttaaacacagagctatctctccagccctgatcttttttaaa
aacaaaaacaaaacaaaacaaaatagaatcttgatatgtagcttgggatt
agcttcaaactcagtatcttcctgccctagcctcccaaatactggaatca
taggtatgtactaccacatctggctggctggtagcttgtatttgcattgg
gatctgagtttctgttcaccaatcaatcattcagcatatatctgatagac
ccatgcagttgtgttacagattgtattgaaaccattattgtagagaaaat
tacaatatgggaagaaaaactttgtttttccacctttgagaccacaaaac
aactcagtaccaaatgtacttagaagtgtgggggcctta
gaattcattcaccccatctcttagctcccttatttgcagtcttcctgtct
gaatgtgcttcctcctgtccatctgtctgtctccagtgtcccttcctggt
cactaaggtcctttgggttttgggcctgtggccaagctccaaattgagtc
ggggcccagcactgccggcttctgggcgtttctagggtggcttccccccc
tctccctctccctctccccctctctccacttcagggagacctgggaatag
ttacctagttatcatctctcgcctggggtacattcctgaatgacagcttt
gatgtcagcaggaggggcgggtagttcagctgcatccagatctgagaggg
gaggggtggtcactgtcacaactaaagctctctttgggtgtccctaactt
gatccctgttcttagagtccctccacccccttgctgcttgtcttcattct
gagtgtgtgtttctgtaaatccaaggcaaggggcgctttgcacagctgtc
gaatacaaagctgctgccccagctcagggccatgagctcctctgtctcct
atacagagaatgctccctagggatgggtgcaccctaggaggtagggcttg
gggaaccctcagtggtattcagtttgaactttgtaccagcccctgaagta
ctttcttcctttaagagcctcctcggactgcagaaccctcctgaagctga
gggtgttgtatctaggctcagtgtgattgcaagaacgcaatcacctgtgt
gtgtttaggagcaattttaaagtaaaagctcctagttataaatatagaca
ttatccaactcctatttagtttgaggtagagggatgctgttccttgtctc
cttggggacagtgtgccaggtggcccccatcagaaaccccatgttgtgtg
gtgcattgcctctgagccgtgtcctgatcctgcagaaaatctccttgagc
cacaggaaaggaggggcaccagtagaagctgaaaggtctatcaggttata
tcaactcagctacgtctggaagtgctctctaaccctcttacattagtctt
aagtgggggtataattatcagttaaggcgaaaaatcatatacatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_85711780_85712903
seq2: B6Ng01-264K10.b_48_1186

seq1  GAATTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACTGCTGAGCCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACTGCTGAGCCAT  50

seq1  CTCTCCAGCCCCCTGAGTGTGGTATTTTATTTGTTAAAGGTTTGTCAGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCAGCCCCCTGAGTGTGGTATTTTATTTGTTAAAGGTTTGTCAGCA  100

seq1  AAATCCCTGGAATTTTTTGGAGGAGGGGGCAATAATCAAACACTTGAAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCCTGGAATTTTTTGGAGGAGGGGGCAATAATCAAACACTTGAAGC  150

seq1  TTTTAATACAGTTCCCTGTCTTTCCTTACATTCAGCTTATTCGGAGGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATACAGTTCCCTGTCTTTCCTTACATTCAGCTTATTCGGAGGGAG  200

seq1  AAACAGGGTTTTGATGCAAGGTGAACCACAGTGAGTTTTCTGAGACACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGGGTTTTGATGCAAGGTGAACCACAGTGAGTTTTCTGAGACACTG  250

seq1  GAGGGCCAGTGCTGACCTATGTGATATTTGGTTGGGTATTTGTCACAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGCCAGTGCTGACCTATGTGATATTTGGTTGGGTATTTGTCACAGTG  300

seq1  GAGAAGAGAGATCATAAAACATGTGGATGATAGAGCCCTACGGAATAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGAGAGATCATAAAACATGTGGATGATAGAGCCCTACGGAATAGCC  350

seq1  AACGCCTTAATTTAAATGTTTGGTGTTGAGAATTGAACCCAGGGCTTCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGCCTTAATTTAAATGTTTGGTGTTGAGAATTGAACCCAGGGCTTCAC  400

seq1  CCATGCTAAGTATGGGCTTTCCCCTGGAGGTACCCCCTCTGGGTGATAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCTAAGTATGGGCTTTCCCCTGGAGGTACCCCCTCTGGGTGATAAA  450

seq1  ATTCCAATTTTTTTTTAATTCCAATAATTTAATTGGCTTTAATTTGATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAATTTTTTTTTAATTCCAATAATTTAATTGGCTTTAATTTGATAA  500

seq1  CTTAGAATGTAAAAGTCTTAATAATTGGATAGCTTTTAAAATGAGTTCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAATGTAAAAGTCTTAATAATTGGATAGCTTTTAAAATGAGTTCCC  550

seq1  TTTAAAAATAACTGGACAGTGATTATCTTAAAAATATTTTAAATTCTGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAATAACTGGACAGTGATTATCTTAAAAATATTTTAAATTCTGTA  600

seq1  TGTATGGATGTTTTATCCACATGTATGTCTGTGCACCATGTGAATACCCG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGGATGTTTTATCCACATGTATGTCTGTGCACCATGTGAATACCCG  650

seq1  GTTTTAAGAAGGTATCAGATCTCCTGGAACTGGAGTTACAGGTGGCTGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTAAGAAGGTATCAGATCTCCTGGAACTGGAGTTACAGGTGGCTGTG  700

seq1  ACCTGCCATGTGGGTACTGGAAATTGAACCTGGGTCTGCTGGAGAATCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGCCATGTGGGTACTGGAAATTGAACCTGGGTCTGCTGGAGAATCAG  750

seq1  CGAGTGCTCTTAAACACAGAGCTATCTCTCCAGCCCTGATC-TTTTTAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CGAGTGCTCTTAAACACAGAGCTATCTCTCCAGCCCTGATCTTTTTTAAA  800

seq1  AACAAAAACAAAACAAAACAAAATAGAATCTTGATATGTAGCTTGGGATT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAAACAAAACAAAACAAAATAGAATCTTGATATGTAGCTTGGGATT  850

seq1  AGCTTCAAACTCAGTATCTTCCTGCCCTAGCCTCCCAAATACTGGAATCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCAAACTCAGTATCTTCCTGCCCTAGCCTCCCAAATACTGGAATCA  900

seq1  TAGGTATGTACTACCACATCTGGCTGGCTGGTAGCTTGTATTTGCATTGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTATGTACTACCACATCTGGCTGGCTGGTAGCTTGTATTTGCATTGG  950

seq1  GATCTGAGTTTCTGTTCACCATTCAATCATTCAGCATATATCTGATAGAC  999
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTGAGTTTCTGTTCACCAATCAATCATTCAGCATATATCTGATAGAC  1000

seq1  CCATGCAG-TGTGTTACAGATTGTATTGACA-CAT--ATGTAGAGAAA--  1043
      |||||||| |||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||  
seq2  CCATGCAGTTGTGTTACAGATTGTATTGAAACCATTATTGTAGAGAAAAT  1050

seq1  TAC-ATATGGGA--GAAAACTTTGTTTT--CA-CTTTGAGGACAC-AAAC  1086
      ||| ||||||||   |||||||||||||  || |||||||  ||| ||||
seq2  TACAATATGGGAAGAAAAACTTTGTTTTTCCACCTTTGAGACCACAAAAC  1100

seq1  AACTTCAGTACACAATGTAC-TAGAAG-GTGGGGGCCTTA  1124
      ||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||
seq2  AAC-TCAGTACCAAATGTACTTAGAAGTGTGGGGGCCTTA  1139

seq1: chr15_85804414_85805497
seq2: B6Ng01-264K10.g_63_1157 (reverse)

seq1  AATGTA-ATGA-TCTTCGCCTTAACTGATAATTAT-CCCCCACATTAAGG  47
      |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
seq2  AATGTATATGATTTTTCGCCTTAACTGATAATTATACCCCCAC-TTAA-G  48

seq1  ACTAATGTTAGAGGGTTAGGAACCACTCCCAG-CGTAGCTGAGTTG-TAT  95
      |||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||| |||
seq2  ACTAATGTAAGAGGGTTAGAGAGCACTTCCAGACGTAGCTGAGTTGATAT  98

seq1  ACCCTG-TAG--CCTTCAGC-TCTCTGGGTGCCCCTCC-TTCCTGT-GCT  139
      | |||| |||  | |||||| |||   ||||||||||| ||||||| |||
seq2  AACCTGATAGACCTTTCAGCTTCTACTGGTGCCCCTCCTTTCCTGTGGCT  148

seq1  CAAGGAGATTTTTCTGCAGGATCAGGACACGGCTCAGAGGCAATGCACCA  189
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGAGA-TTTTCTGCAGGATCAGGACACGGCTCAGAGGCAATGCACCA  197

seq1  CACAACATGGGGTTTTCTGAT-GGGGCCACCTGGCACACTGTCCCCAAGG  238
      |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAACATGGGG-TTTCTGATGGGGGCCACCTGGCACACTGTCCCCAAGG  246

seq1  AGAC-AGGAACAGCATCCCTCTACCTCAAACT-AATAGGAGTTGGATAAT  286
      |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGACAAGGAACAGCATCCCTCTACCTCAAACTAAATAGGAGTTGGATAAT  296

seq1  GTCTATATTTATAACTAGG-GCTTTTACTTTAAAATTGCTCCTAAACACA  335
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATATTTATAACTAGGAGCTTTTACTTTAAAATTGCTCCTAAACACA  346

seq1  CACAGGTGATTGCGTTCTTGCAATCACACTGAGCCTAGATACAACACCCT  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGTGATTGCGTTCTTGCAATCACACTGAGCCTAGATACAACACCCT  396

seq1  CAGCTTCAGGAGGGTTCTGCAGTCCGAGGAGGCTCTTAAAGGAAGAAAGT  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTCAGGAGGGTTCTGCAGTCCGAGGAGGCTCTTAAAGGAAGAAAGT  446

seq1  ACTTCAGGGGCTGGTACAAAGTTCAAACTGAATACCACTGAGGGTTCCCC  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAGGGGCTGGTACAAAGTTCAAACTGAATACCACTGAGGGTTCCCC  496

seq1  AAGCCCTACCTCCTAGGGTGCACCCATCCCTAGGGAGCATTCTCTGTATA  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCCTACCTCCTAGGGTGCACCCATCCCTAGGGAGCATTCTCTGTATA  546

seq1  GGAGACAGAGGAGCTCATGGCCCTGAGCTGGGGCAGCAGCTTTGTATTCG  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACAGAGGAGCTCATGGCCCTGAGCTGGGGCAGCAGCTTTGTATTCG  596

seq1  ACAGCTGTGCAAAGCGCCCCTTGCCTTGGATTTACAGAAACACACACTCA  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTGTGCAAAGCGCCCCTTGCCTTGGATTTACAGAAACACACACTCA  646

seq1  GAATGAAGACAAGCAGCAAGGGGGTGGAGGGACTCTAAGAACAGGGATCA  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAAGACAAGCAGCAAGGGGGTGGAGGGACTCTAAGAACAGGGATCA  696

seq1  AGTTAGGGACACCCAAAGAGAGCTTTAGTTGTGACAGTGACCACCCCTCC  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAGGGACACCCAAAGAGAGCTTTAGTTGTGACAGTGACCACCCCTCC  746

seq1  CCTCTCAGATCTGGATGCAGCTGAACTACCCGCCCCTCCTGCTGACATCA  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCAGATCTGGATGCAGCTGAACTACCCGCCCCTCCTGCTGACATCA  796

seq1  AAGCTGTCATTCAGGAATGTACCCCAGGCGAGAGATGATAACTAGGTAAC  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGTCATTCAGGAATGTACCCCAGGCGAGAGATGATAACTAGGTAAC  846

seq1  TATTCCCAGGTCTCCCTGAAGTGGAGAGAGGGGGAGAGGGAGAGGGAGAG  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCCCAGGTCTCCCTGAAGTGGAGAGAGGGGGAGAGGGAGAGGGAGAG  896

seq1  GGGGGGAAGCCACCCTAGAAACGCCCAGAAGCCGGCAGTGCTGGGCCCCG  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGAAGCCACCCTAGAAACGCCCAGAAGCCGGCAGTGCTGGGCCCCG  946

seq1  ACTCAATTTGGAGCTTGGCCACAGGCCCAAAACCCAAAGGACCTTAGTGA  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAATTTGGAGCTTGGCCACAGGCCCAAAACCCAAAGGACCTTAGTGA  996

seq1  CCAGGAAGGGACACTGGAGACAGACAGATGGACAGGAGGAAGCACATTCA  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAAGGGACACTGGAGACAGACAGATGGACAGGAGGAAGCACATTCA  1046

seq1  GACAGGAAGACTGCAAATAAGGGAGCTAAGAGATGGGGTGAATGAATTC  1084
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGAAGACTGCAAATAAGGGAGCTAAGAGATGGGGTGAATGAATTC  1095