BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-273F22
Chromosome15 (Build37)
Map Location 72,789,261 - 72,971,483
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1810044A24Rik, Chrac1, Eif2c2
Upstream geneCol22a1, Kcnk9, LOC665621, Peg13, LOC100041120
Downstream genePtk2, LOC666053, LOC100040929, Dennd3, Slc45a4, Gpr20, LOC100040946, pPtp4a3, Gm628, LOC100041273, EG625276, LOC100040966, EG666113, LOC100041307
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-273F22.bB6Ng01-273F22.g
ACCGA074961GA074962
length1,1471,080
definitionB6Ng01-273F22.b B6Ng01-273F22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,789,261 - 72,790,336)(72,970,415 - 72,971,483)
sequence
gaattctcaactgaggattactgaatggctgagaagcacctgaaaaaatg
ttcagcatccttaatcatcagggaaatgcaaatcaaagcaaccctgagat
tccacctcacaccagtcagaatggttaagataaaaaattcaggtgacagc
agatgctggtgaggatgtggagaaagaggaacactcctccattgttgatg
ggattgcaggcttgtacaaccactctggaaatcagtctggcggttcctca
gaaaactggacatagtactaccagaagatccagcaatacctctcctggac
atatactcagaagatgttccaacttgtaataaggacacatgttccactat
gttcatagcagccttatttataatagccagaagctggaaagaacccagat
gtccctcaacagaggaatggattcagaaaatgtggtacatttacacaatg
gagtactacccagcaattaaaaacaatgaatttatgaaattcttaggcaa
atggatgaatctggaggatatcacctgagtgaggtaacccaatcacaaaa
gaaaacacatgatatgcactttctgataaggggatgtgtccttaaagtgt
gcatattgtcccacggctctgttcccctgacccccacctctctctctgtt
tcccagctgccaagcaagcagctctcttccccacatgcctctgctatgct
gcactgtttgacacagagctaagggaccacaagctaaaacctgaaacaat
gaagcagaataaatcttttctactttaaaagccttgtctcgggtactttg
tcacagtaacagaaaactgactcatgtttcatatgttccagtaccctcag
ctcatttctatggaaatgttggcccagtgcacagcttttgcactggcttt
tcattgagtgggaatggagatgtcatcaaggggatcagaggcttcaaaag
tgacaactccacctctaggaactgtctatgactctacacagatttgctgg
gaaaaagaatcctgaagagggggggctggtgagaatggctccgtggctaa
tagcactgactgctcttccggaggtcctgagtccagatcccaacactcac
atggttgctcacaacacactgtatgagattctgaagacagcttacag
gaattccaagctcagaatgtaccacccccaataaccctgttccccaaaca
gttgcctctgtgcattttagggcaagaggctgagtccaaagccaagtgca
ttgtgggggagagccttaatatgtattgtagactgatatcctcagcggga
ctggtacctggtgaaggaagtgccccttgctggtgccgcttctgtcgcag
ctgctggaggagagtgactgtcttaggctctgttatctgacctgctgaac
aatgtgcctagaaatgctaaacatcaggtgtgatcctttcagtcaatgtg
ctcctgtaacaagcccatttctgcacaaaggctgctggcctggctgggtt
gaactggtcggtgctgagggtcttttatgtgtctcaatgaagattgataa
gtgggtgtgtcagcttgcttgatagcttcttgggtcagaaacctgttggt
ctccctgttgtagtgcacaccctccagactggaaagagggtgggccgaga
ctctgctgtcacctgggcctctgtggttcctatcaggttcctgtcacgcc
atccacagccatccacaggaaaccctttctgaaaggaggcccgactcagg
ctcccaccaggcactggtgtgtggctggcaatggtcacgtggtgttttac
ggacgctgctgctcttttcctgtcgctcggcgtcacatctgtaagaagct
gaggttgccatggttagaaactgcgtcagttcagtctctcggcaactgag
ggggctgggtgctgcagactgaagcaaagggccagcccactagacttgca
aatgattgggagagctcctgactggttagatatgcaaacctttaatgttc
ttcattttcgctgttagttgtgggaggccagattcaggtccagtgatgtt
caaatagttgtggttgcttcattgtgggatctctcctcagaagcagccag
tgctccagtgtgcttgcatgtgaatatggtgtcctccccaggacccccac
tcccatccctaattggagaaaaagccctgcagtacagacttgtcaaaatg
gggcttcagcagtcaggcagctgaatgctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_72789261_72790336
seq2: B6Ng01-273F22.b_121_1197

seq1  GGGAAATGCAAATCAAAGCAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAATGCAAATCAAAGCAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGA  50

seq1  ATGGTTAAGATAAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTAAGATAAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGG  100

seq1  AGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGATGGGATTGCAGGCTTGTACAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGATGGGATTGCAGGCTTGTACAAC  150

seq1  CACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAACTGGACATAGTACTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAACTGGACATAGTACTA  200

seq1  CCAGAAGATCCAGCAATACCTCTCCTGGACATATACTCAGAAGATGTTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAGATCCAGCAATACCTCTCCTGGACATATACTCAGAAGATGTTCC  250

seq1  AACTTGTAATAAGGACACATGTTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGTAATAAGGACACATGTTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTA  300

seq1  TAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGTCCCTCAACAGAGGAATGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGTCCCTCAACAGAGGAATGG  350

seq1  ATTCAGAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACCCAGCAATTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACCCAGCAATTAA  400

seq1  AAACAATGAATTTATGAAATTCTTAGGCAAATGGATGAATCTGGAGGATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAATGAATTTATGAAATTCTTAGGCAAATGGATGAATCTGGAGGATA  450

seq1  TCACCTGAGTGAGGTAACCCAATCACAAAAGAAAACACATGATATGCACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTGAGTGAGGTAACCCAATCACAAAAGAAAACACATGATATGCACT  500

seq1  TTCTGATAAGGGGATGTGTCCTTAAAGTGTGCATATTGTCCCACGGCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATAAGGGGATGTGTCCTTAAAGTGTGCATATTGTCCCACGGCTCT  550

seq1  GTTCCCCTGACCCCCACCTCTCTCTCTGTTTCCCAGCTGCCAAGCAAGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCCCTGACCCCCACCTCTCTCTCTGTTTCCCAGCTGCCAAGCAAGCA  600

seq1  GCTCTCTTCCCCACATGCCTCTGCTATGCTGCACTGTTTGACACAGAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCTTCCCCACATGCCTCTGCTATGCTGCACTGTTTGACACAGAGCT  650

seq1  AAGGGACCACAAGCTAAAACCTGAAACAATGAAGCAGAATAAATCTTTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGACCACAAGCTAAAACCTGAAACAATGAAGCAGAATAAATCTTTTC  700

seq1  TACTTTAAAAGCCTTGTCTCGGGTACTTTGTCACAGTAACAGAAAACTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTAAAAGCCTTGTCTCGGGTACTTTGTCACAGTAACAGAAAACTGA  750

seq1  CTCATGTTTCATATGTTCCAGTACCCTCAGCTCATTTCTATGGAAATGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGTTTCATATGTTCCAGTACCCTCAGCTCATTTCTATGGAAATGTT  800

seq1  GGCCCAGTGCACAGCTTTTGCACTGGCTTTTCATTGAGTGGGAATGGAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCAGTGCACAGCTTTTGCACTGGCTTTTCATTGAGTGGGAATGGAGA  850

seq1  TGTCATCAAGGGGATCAGAGGCTTCAAAAGTGACAACTCCACCTCTAGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATCAAGGGGATCAGAGGCTTCAAAAGTGACAACTCCACCTCTAGGA  900

seq1  ACTGTCTATGACTCTACACAGATTTGCTGGGAAAAAAGAATCCTGAAGAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 
seq2  ACTGTCTATGACTCTACACAGATTTGCTGGG-AAAAAGAATCCTGAAGAG  949

seq1  GGGGGGCTGGTGAG-ATGGCTCCGTGGCTAATAGCACTGACTGCTCTTCC  999
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGCTGGTGAGAATGGCTCCGTGGCTAATAGCACTGACTGCTCTTCC  999

seq1  GGAGGTCCTGAGTTCAGATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCACC  1049
      ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| |||||||||   |
seq2  GGAGGTCCTGAGTCCAGATCCCAACACTCACATGGTTGCTCACAACACAC  1049

seq1  TGTAATGAGA-TCTGAAGACAGC-TACAG  1076
      ||| |||||| |||||||||||| |||||
seq2  TGT-ATGAGATTCTGAAGACAGCTTACAG  1077

seq1: chr15_72970415_72971483
seq2: B6Ng01-273F22.g_67_1145 (reverse)

seq1  AGCACTCAGCTGCCTG-CTGCTGA--GCCCATTTTGCCAAG-CTGTACTG  46
      |||| ||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||||
seq2  AGCATTCAGCTGCCTGACTGCTGAAGCCCCATTTTGACAAGTCTGTACTG  50

seq1  CAGGGC-TCTTCTCC-ACTAGGGATGGGAGT-GGGGTCCTGGGGA-GACA  92
      |||||| | |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  CAGGGCTTTTTCTCCAATTAGGGATGGGAGTGGGGGTCCTGGGGAGGACA  100

seq1  CCATATCACCATGCAAGCACACTGGAGCACTGGCTGCTTCCTGAGGAGAG  142
      ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CCATATTCACATGCAAGCACACTGGAGCACTGGCTGCTT-CTGAGGAGAG  149

seq1  ATCCCACAATGAGGC-ACCAC-ACTATTTGAACATCACTTGGACCTGAAT  190
      |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ATCCCACAATGAAGCAACCACAACTATTTGAACATCAC-TGGACCTGAAT  198

seq1  CTGGCCTCCCACAACTAACAGCG-AAATGAAGAACATTAAAGGTTTGCAT  239
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCTCCCACAACTAACAGCGAAAATGAAGAACATTAAAGGTTTGCAT  248

seq1  ATCTAACCAGTCAGGAGCTCTCCCAATCATTTGCAAGTCTAGTGGGCTGG  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAACCAGTCAGGAGCTCTCCCAATCATTTGCAAGTCTAGTGGGCTGG  298

seq1  CCC-TTGCTTCAGTCTGCAGCACCCAGCCCCCTCAGTTGCCGAGAGACTG  338
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTGCTTCAGTCTGCAGCACCCAGCCCCCTCAGTTGCCGAGAGACTG  348

seq1  AACTGACGCAGTTTCTAACCATGGCAACCTCAGCTTCTTACAGATGTGAC  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGACGCAGTTTCTAACCATGGCAACCTCAGCTTCTTACAGATGTGAC  398

seq1  GCCGAGCGACAGGAAAAGAGCAGCAGCGTCCGTAAAACACCACGTGACCA  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGAGCGACAGGAAAAGAGCAGCAGCGTCCGTAAAACACCACGTGACCA  448

seq1  TTGCCAGCCACACACCAGTGCCTGGTGGGAGCCTGAGTCGGGCCTCCTTT  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCAGCCACACACCAGTGCCTGGTGGGAGCCTGAGTCGGGCCTCCTTT  498

seq1  CAGAAAGGGTTTCCTGTGGATGGCTGTGGATGGCGTGACAGGAACCTGAT  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAGGGTTTCCTGTGGATGGCTGTGGATGGCGTGACAGGAACCTGAT  548

seq1  AGGAACCACAGAGGCCCAGGTGACAGCAGAGTCTCGGCCCACCCTCTTTC  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACCACAGAGGCCCAGGTGACAGCAGAGTCTCGGCCCACCCTCTTTC  598

seq1  CAGTCTGGAGGGTGTGCACTACAACAGGGAGACCAACAGGTTTCTGACCC  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTGGAGGGTGTGCACTACAACAGGGAGACCAACAGGTTTCTGACCC  648

seq1  AAGAAGCTATCAAGCAAGCTGACACACCCACTTATCAATCTTCATTGAGA  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGCTATCAAGCAAGCTGACACACCCACTTATCAATCTTCATTGAGA  698

seq1  CACATAAAAGACCCTCAGCACCGACCAGTTCAACCCAGCCAGGCCAGCAG  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAAAAGACCCTCAGCACCGACCAGTTCAACCCAGCCAGGCCAGCAG  748

seq1  CCTTTGTGCAGAAATGGGCTTGTTACAGGAGCACATTGACTGAAAGGATC  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGTGCAGAAATGGGCTTGTTACAGGAGCACATTGACTGAAAGGATC  798

seq1  ACACCTGATGTTTAGCATTTCTAGGCACATTGTTCAGCAGGTCAGATAAC  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTGATGTTTAGCATTTCTAGGCACATTGTTCAGCAGGTCAGATAAC  848

seq1  AGAGCCTAAGACAGTCACTCTCCTCCAGCAGCTGCGACAGAAGCGGCACC  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCTAAGACAGTCACTCTCCTCCAGCAGCTGCGACAGAAGCGGCACC  898

seq1  AGCAAGGGGCACTTCCTTCACCAGGTACCAGTCCCGCTGAGGATATCAGT  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGGGGCACTTCCTTCACCAGGTACCAGTCCCGCTGAGGATATCAGT  948

seq1  CTACAATACATATTAAGGCTCTCCCCCACAATGCACTTGGCTTTGGACTC  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAATACATATTAAGGCTCTCCCCCACAATGCACTTGGCTTTGGACTC  998

seq1  AGCCTCTTGCCCTAAAATGCACAGAGGCAACTGTTTGGGGAACAGGGTTA  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTTGCCCTAAAATGCACAGAGGCAACTGTTTGGGGAACAGGGTTA  1048

seq1  TTGGGGGTGGTACATTCTGAGCTTGGAATTC  1069
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGGTGGTACATTCTGAGCTTGGAATTC  1079