BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-296K24
Chromosome15 (Build37)
Map Location 94,935,358 - 95,069,135
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043315, Nell2
Upstream geneD630010B17Rik, Adamts20, Pus7l, Irak4, Twf1, Tmem117
Downstream geneDbx2, LOC100042684, LOC667849, EG629300, LOC667864, Tmem16f, LOC100043329, D030018L15Rik, LOC100043335, EG667869, LOC667874
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-296K24.bB6Ng01-296K24.g
ACCGA092231GA092232
length1,1441,143
definitionB6Ng01-296K24.b B6Ng01-296K24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(94,935,358 - 94,936,494)(95,068,004 - 95,069,135)
sequence
gaattctgggactctctaaagactactgacaagtgattcaggtagtgact
cctggtaccttatgttttcttgttagagtggataatattcaagagctatg
ctataaatggagtcttgcttgaagtctgatctcgtaagcccattggccct
aagggctaggcaggccctgtgctcttttctctatctctgagtgtataatt
gggattgacaaatttgacaagtgtcttagggttttattgctatgaacaga
caccatgaccaaggcaactcttataaaggacaacatttaattggaactgg
ctcacagattcggaagttcagtccactatcatcatggcaggaagcatggc
agcatccaggcagacatgatgctggaggagctgagagttctccatctcac
tcccaaggcaaacagaagactggcttctgcaaagcccaccaccacagaga
tacacttcctccaacaaggccatacctcttaatagtgccactccctggac
caagcatattcaaaccaccacaataggtaaagtaactgtcacattgtttc
ttcaacagttggagtaagaatccagtggaaacctgggaaactgatcatgt
acacccaagcaggagaataaagaaaaatgtatgtagaaaaaaatgcccta
gtggcatgggtacaggtaagttgatcccgagagcatgaatgtgggtaaac
tggctgtagcacttgggagagctggccttgcctttcactggctagagagc
cctgcaccgaacgtgagcagtgcagtagagctggctctggaggcatgggt
gagctggcccaagggcatgagagcaggagagatgtcctcaccccttgcct
tttggggcagtgctggagagctgggtctgatggtatagactcagcagaat
gggtagctaccactcaggcccagatccagaacttttatttagttgggccc
accccaacatataactgcatctatgaactgctagagcacatgaagggact
gggttctacagagccaaagcgacaggatctctgtgggtgcagggcaacaa
cagggtatctaggagagttccttggtgaagatccagtaatgatagagtag
cagccagggccagaggtctgaataaggcgagtgacctcattgcc
gaattcctttgtgagagctcttcactttccatggaatgcctgctttccac
cttgccccagggttttatttaactcagatatcatcacaaatgtgtctccc
agactttccatttgaaatcaccttcaacaatctggtcaatggccctgctt
tcctttccttaaaagaaataaccaattctgctggagtcatagtctatgcc
cctttgtctgtttgctgactacaccttaggatgcaagctcctaggtttgg
tttgcttgtcagctgctagatcaccagccagtcctgggacaatgtcaggc
acacgatagaccgactatatattgatttgcccagtgacattgagtgagat
gggaaatgggtagacagcgagatggtagcgttgccaacttgatataatct
aaatctacctgggcaacaagcttctgggcgtgcctgtggagggttacctt
gattaaatcaactgaggagggaagtgagatgtggtatgggaagatccatc
tccatgggctgagatctcattaaaaagaaaaggggggaggggcctagcta
tacccagcattcattgctctctgcttcctgacagtggaaacaatgtgccc
aactctctcaggctccagctcctgagtttcctgtcgcagaggacaatcat
aaacccaaatgaaccctttccccctggagccacttctgtcagggtattgt
atcaagccgcagaaaaagaaacagccacactgaggagagatagggaatct
tttaaattgaagcatgtttaggcatataatttatatcagaattcaacgtg
ggtatgaactatagaatagataaatatttaccatattaaatagacgtact
gttcaaacaaaaaaccaacaagtgaactcttaattcagaagtaaaaagac
aatgatgcattgaaataaagcatgagaaatggaagaacggcatagtaagg
gaacctgtcagattatgcagaaatgcctctcaaggaaaacccacaaacat
aggaaaagttttcccttttggaaacattgttctggaaggccgcgtctact
agaattgatcaattaaatcgtaagcatttcttagaaaggaactgtacgaa
tcacctccgaagtcacacttattctggaaggagtgcttaaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_94935358_94936494
seq2: B6Ng01-296K24.b_48_1191

seq1  GAATTCTGGGACTCTCTAAAGACTACTGACAAGTGATTCAGGTAGTGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGACTCTCTAAAGACTACTGACAAGTGATTCAGGTAGTGACT  50

seq1  CCTGGTACCTTATGTTTTCTTGTTAGAGTGGATAATATTCAAGAGCTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTACCTTATGTTTTCTTGTTAGAGTGGATAATATTCAAGAGCTATG  100

seq1  CTATAAATGGAGTCTTGCTTGAAGTCTGATCTCGTAAGCCCATTGGCCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAAATGGAGTCTTGCTTGAAGTCTGATCTCGTAAGCCCATTGGCCCT  150

seq1  AAGGGCTAGGCAGGCCCTGTGCTCTTTTCTCTATCTCTGAGTGTATAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCTAGGCAGGCCCTGTGCTCTTTTCTCTATCTCTGAGTGTATAATT  200

seq1  GGGATTGACAAATTTGACAAGTGTCTTAGGGTTTTATTGCTATGAACAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATTGACAAATTTGACAAGTGTCTTAGGGTTTTATTGCTATGAACAGA  250

seq1  CACCATGACCAAGGCAACTCTTATAAAGGACAACATTTAATTGGAACTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATGACCAAGGCAACTCTTATAAAGGACAACATTTAATTGGAACTGG  300

seq1  CTCACAGATTCGGAAGTTCAGTCCACTATCATCATGGCAGGAAGCATGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGATTCGGAAGTTCAGTCCACTATCATCATGGCAGGAAGCATGGC  350

seq1  AGCATCCAGGCAGACATGATGCTGGAGGAGCTGAGAGTTCTCCATCTCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCCAGGCAGACATGATGCTGGAGGAGCTGAGAGTTCTCCATCTCAC  400

seq1  TCCCAAGGCAAACAGAAGACTGGCTTCTGCAAAGCCCACCACCACAGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAGGCAAACAGAAGACTGGCTTCTGCAAAGCCCACCACCACAGAGA  450

seq1  TACACTTCCTCCAACAAGGCCATACCTCTTAATAGTGCCACTCCCTGGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTTCCTCCAACAAGGCCATACCTCTTAATAGTGCCACTCCCTGGAC  500

seq1  CAAGCATATTCAAACCACCACAATAGGTAAAGTAACTGTCACATTGTTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCATATTCAAACCACCACAATAGGTAAAGTAACTGTCACATTGTTTC  550

seq1  TTCAACAGTTGGAGTAAGAATCCAGTGGAAACCTGGGAAACTGATCATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACAGTTGGAGTAAGAATCCAGTGGAAACCTGGGAAACTGATCATGT  600

seq1  ACACCCAAGCAGGAGAATAAAGAAAAATGTATGTAGAAAAAAATGCCCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCAAGCAGGAGAATAAAGAAAAATGTATGTAGAAAAAAATGCCCTA  650

seq1  GTGGCATGGGTACAGGTAAGTTGATCCCGAGAGCATGAATGTGGGTAAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCATGGGTACAGGTAAGTTGATCCCGAGAGCATGAATGTGGGTAAAC  700

seq1  TGGCTGTAGCACTTGGGAGAGCTGGCCTTGCCTTTCACTGGCTAGAGAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGTAGCACTTGGGAGAGCTGGCCTTGCCTTTCACTGGCTAGAGAGC  750

seq1  CCTGCACCGAACGTGAGCAGTGCAGTAGAGCTGGCTCTGGAGGCATGGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCACCGAACGTGAGCAGTGCAGTAGAGCTGGCTCTGGAGGCATGGGT  800

seq1  GAGCTGGCCCAAGGGCATGAGAGCAGGAGAGATGTCCTCACCCCTTGCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGGCCCAAGGGCATGAGAGCAGGAGAGATGTCCTCACCCCTTGCCT  850

seq1  TTTGGGGCAGTGCTGGAGAGCTGGGTCTGATGGTATAGACTCAGCAGAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGGCAGTGCTGGAGAGCTGGGTCTGATGGTATAGACTCAGCAGAAT  900

seq1  GGGTAGCTACCACTCAGGCCCAGATCCAGAACTTTTATTTAGTT-GGCCC  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGGTAGCTACCACTCAGGCCCAGATCCAGAACTTTTATTTAGTTGGGCCC  950

seq1  ACCCCAACATATAACTGCATCTATGAACTGCTAGAGCACATGAAGGGACT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCAACATATAACTGCATCTATGAACTGCTAGAGCACATGAAGGGACT  1000

seq1  -GGTTCTACAGAGCCAAAGCGACAGGATCTCTGT-GGTGCAGGGCAACAA  1047
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GGGTTCTACAGAGCCAAAGCGACAGGATCTCTGTGGGTGCAGGGCAACAA  1050

seq1  CAGGGTATCTAAGAAGAGT--CCTGGTGAAGATCCAGTATTGATAGAGTA  1095
      |||||||||| || |||||  | |||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CAGGGTATCT-AGGAGAGTTCCTTGGTGAAGATCCAGTAATGATAGAGTA  1099

seq1  GCAG-CAGG--CAGAGGTCTTGAACCAGGCGAGTGA-CTCATTGCC  1137
      |||| ||||  |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||
seq2  GCAGCCAGGGCCAGAGGTC-TGAATAAGGCGAGTGACCTCATTGCC  1144

seq1: chr15_95068004_95069135
seq2: B6Ng01-296K24.g_68_1210 (reverse)

seq1  TTTTAAAGCACTCC-TCCAGA--TAGTGCTGACTTCGGA-GTGAATCGTA  46
      |||| ||||||||| ||||||   |||| |||||||||| |||| |||||
seq2  TTTTTAAGCACTCCTTCCAGAATAAGTG-TGACTTCGGAGGTGATTCGTA  49

seq1  CAGT---CTTCTAAGAAATGCTACAGATTTTATTGATCAATCTTAGTAGA  93
      ||||    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||  |||||||
seq2  CAGTTCCTTTCTAAGAAATGCTTACGATTTAATTGATCAATTCTAGTAGA  99

seq1  CGCGG-CTTCCAGAACAATGTTTCC-AAAGGGAAAACTTTT-CTATGTTT  140
      ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
seq2  CGCGGCCTTCCAGAACAATGTTTCCAAAAGGGAAAACTTTTCCTATGTTT  149

seq1  GTGGGTTTTCCTTGAGAGGCATTTCTGCAT-ATCTGACAGGTTCCCTTAC  189
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTTTTCCTTGAGAGGCATTTCTGCATAATCTGACAGGTTCCCTTAC  199

seq1  TATGCCG-TCTTCCATTTCTCATGCTTTATTTCAATGCATCATTGTCTTT  238
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCGTTCTTCCATTTCTCATGCTTTATTTCAATGCATCATTGTCTTT  249

seq1  TTACTTCCTGAATTAAGAGTTCACTTGTTGGTTTTTTGTTTGAACAGTAC  288
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTT-CTGAATTAAGAGTTCACTTGTTGGTTTTTTGTTTGAACAGTAC  298

seq1  GTCTATTTAATATGGTAAATATTTATCTATTCTATAGTTCATACCCACGT  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATTTAATATGGTAAATATTTATCTATTCTATAGTTCATACCCACGT  348

seq1  TGAATTCTGATATAAATTATATGCCT-AACATGCTTCAATTTAAAAGATT  387
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTCTGATATAAATTATATGCCTAAACATGCTTCAATTTAAAAGATT  398

seq1  CCCTATCTCTCCTCAGTGTGGCTGTTTCTTTTTCTGCGGCTTGATACAAT  437
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTATCTCTCCTCAGTGTGGCTGTTTCTTTTTCTGCGGCTTGATACAAT  448

seq1  ACCCTGACAGAAGTGGCTCCAGGGGGAAAGGGTTCATTTGGGTTTATGAT  487
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGACAGAAGTGGCTCCAGGGGGAAAGGGTTCATTTGGGTTTATGAT  498

seq1  TGTCCTCTGCGACAGGAAACTCAGGAGCTGGAGCCTGAGAGAGTTGGGCA  537
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTCTGCGACAGGAAACTCAGGAGCTGGAGCCTGAGAGAGTTGGGCA  548

seq1  CATTGTTTCCACTGTCAGGAAGCAGAGAGCAATGAATGCTGGGTATAGCT  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTTTCCACTGTCAGGAAGCAGAGAGCAATGAATGCTGGGTATAGCT  598

seq1  AGGCCCCTCCCCCCTTTTCTTTTTAATGAGATCTCAGCCCATGGAGATGG  637
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCCTCCCCCCTTTTCTTTTTAATGAGATCTCAGCCCATGGAGATGG  648

seq1  ATCTTCCCATACCACATCTCACTTCCCTCCTCAGTTGATTTAATCAAGGT  687
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCCCATACCACATCTCACTTCCCTCCTCAGTTGATTTAATCAAGGT  698

seq1  AACCCTCCACAGGCACGCCCAGAAGCTTGTTGCCCAGGTAGATTTAGATT  737
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTCCACAGGCACGCCCAGAAGCTTGTTGCCCAGGTAGATTTAGATT  748

seq1  ATATCAAGTTGGCAACGCTACCATCTCGCTGTCTACCCATTTCCCATCTC  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCAAGTTGGCAACGCTACCATCTCGCTGTCTACCCATTTCCCATCTC  798

seq1  ACTCAATGTCACTGGGCAAATCAATATATAGTCGGTCTATCGTGTGCCTG  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAATGTCACTGGGCAAATCAATATATAGTCGGTCTATCGTGTGCCTG  848

seq1  ACATTGTCCCAGGACTGGCTGGTGATCTAGCAGCTGACAAGCAAACCAAA  887
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGTCCCAGGACTGGCTGGTGATCTAGCAGCTGACAAGCAAACCAAA  898

seq1  CCTAGGAGCTTGCATCCTAAGGTGTAGTCAGCAAACAGACAAAGGGGCAT  937
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGGAGCTTGCATCCTAAGGTGTAGTCAGCAAACAGACAAAGGGGCAT  948

seq1  AGACTATGACTCCAGCAGAATTGGTTATTTCTTTTAAGGAAAGGAAAGCA  987
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTATGACTCCAGCAGAATTGGTTATTTCTTTTAAGGAAAGGAAAGCA  998

seq1  GGGCCATTGACCAGATTGTTGAAGGTGATTTCAAATGGAAAGTCTGGGAG  1037
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCATTGACCAGATTGTTGAAGGTGATTTCAAATGGAAAGTCTGGGAG  1048

seq1  ACACATTTGTGATGATATCTGAGTTAAATAAAACCCTGGGGCAAGGTGGA  1087
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATTTGTGATGATATCTGAGTTAAATAAAACCCTGGGGCAAGGTGGA  1098

seq1  AAGCAGGCATTCCATGGAAAGTGAAGAGCTCTCACAAAGGAATTC  1132
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGCATTCCATGGAAAGTGAAGAGCTCTCACAAAGGAATTC  1143