BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-315C14
Chromosome15 (Build37)
Map Location 85,226,886 - 85,376,086
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAtxn10, EG223745, Wnt7b
Upstream gene1810041L15Rik, Ldoc1l, Arhgap8, 3110043J09Rik, Phf21b, LOC100043084, 4930513L16Rik, Nup50, 5031439G07Rik, LOC628135, Upk3a, 3110048E14Rik, Smc1b, Ribc2, Fbln1
Downstream geneLOC100042240, Ppara, 2210021J22Rik, Pkdrej, AW124722, Gtse1, Trmu, Celsr1, BC021523, Cerk, LOC100042300, Tbc1d22a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-315C14.bB6Ng01-315C14.g
ACCGA105883GA105884
length8691,120
definitionB6Ng01-315C14.b B6Ng01-315C14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(85,375,222 - 85,376,086)(85,226,886 - 85,228,007)
sequence
gaattcctccctggggtggccacttccatcacccctcaacagccggtcag
ccgactttgccaggtctgagcagaggggaaagagaatttgccagcttccc
taagggtcttggtgacctaatttagacccaggaacgtggattcctgcacc
tgcccagtctctgctttatccagggctcctgtccagcctctcccaggaca
gggacaaggcagctctgggtcctctgaaaacaatactggccacacaggac
tgtgcagagtccatttggcttaggggctatctccattctctcctatctcg
tgtgataagtggagctcagagcccacagaccctggaaatgtattctggca
agagaggttctggtgggggtaggggtggcccagaagggcaaagcagaggc
tgctatatgcttgagacaattgtccttatctgagggaagagggtccccca
gtgatcacttccttcccccgtgggaaggaagacaccttctggtatggctt
ggtgggtagataggtgggcatagagatggctcttaatgtggtttatggac
ctggcttgactctgacccattttgtagtggtgggtcacagcagacacagc
ctcagatagtagagactgcaaccgggtacccaggacaggctgggacaggc
aggtgctgccatgaggccttgctaaggctgggccttgtttttctaccacc
ctcgctgaccatatctgaccataggccctgctgtccatagatgaggtggt
agggaggcactcctcactgaggttcaccctgggttcctgaggtgggcctt
cattgagcctgctgggtaaccacacactgccatgagctggagcccctgaa
ggaaactgggagaaaccgg
gaattcctttcctggggaagcagctatcttttctctacaagctcctgaga
acacaccaaagtatgatcctggggaatccacagttcacccagagaaccag
ggaaatttgggggcttactttgggtaagagactactagtaagagtggggg
gactccaaagcattagcacccagaaatcttggcttccccatggcttcata
gatggagttcctaccagtttgctttcccagcctatatactctagcacctc
cggaagctacttgcagttagggcagaatttcatacaaatggctgggagac
acagggggagaagaatctccctctctaagggtagagaagtcatcttccct
ctaatgatcccgtgagggctcttgcaagcaggcacagcttgtgaaaaata
cagttgttttgctaaaggattgtgttctataaggaacatctggggatctt
gcctctgacccaccaagctattggcaacaggaactttggtagaatcttta
tacaatgcatggaagccttttgaaccctactcgatttctgcttgtcacat
aaagtcattcattggaatggcatgtccagcagctgagtaaggcacctctg
tggcctttcgagtttcctgccttttgcatctgcattgggtcactagagct
tactctgaaaaaggttgacagaagaattgttaccattagtttctaatgga
gaaaccaaggctcagggagatttcagtgtgatttaatttaactgaaattt
gaatcagtttgaatgcaagcttgatgctgtaggttctgaagatgatgttg
tcagtaggggctaacatgtgcactggtactattacttaacaattgtgtta
cagaggcctgccagagaggatctgaaaggctgtcttgtactctagggtgg
ccattccagaatagttctttctggcaaagctggacacgaggacatagagt
tagtgggatggggagatcatcttcccttctgttttctgcactttggacac
ctgctcagaaatgtatggagctcagtcctccctgggtcacgctgtggctc
tggatgttccagtgctgctcgactataaaaggtctagcttctttaacaag
tcatgacgaggtgctctaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_85375222_85376086
seq2: B6Ng01-315C14.b_48_916 (reverse)

seq1  CCGGTTTCTCCCTGTTTCCTTCA-GGGCTCCAGCTCATGGCAGTGTGTGG  49
      |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGTTTCTCCCAGTTTCCTTCAGGGGCTCCAGCTCATGGCAGTGTGTGG  50

seq1  TTACCCAGCAGGCTC-ATGAAGG-CCACCTCAGGAACCCAGGGTGAACCT  97
      ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCCAGCAGGCTCAATGAAGGCCCACCTCAGGAACCCAGGGTGAACCT  100

seq1  CAGTGAGGAGTGCCTCCCTACCACCTCATCTATGGACAGCAGGGCCTATG  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGAGGAGTGCCTCCCTACCACCTCATCTATGGACAGCAGGGCCTATG  150

seq1  GTCAGATATGGTCAGCGAGGGTGGTAG-AAAACAAGGCCCAGCCTTAGCA  196
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGATATGGTCAGCGAGGGTGGTAGAAAAACAAGGCCCAGCCTTAGCA  200

seq1  AGGCCTCATGGCAGCACCTGCCTGTCCCAGCCTGTCCTGGGTACCCGGTT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTCATGGCAGCACCTGCCTGTCCCAGCCTGTCCTGGGTACCCGGTT  250

seq1  GCAGTCTCTACTATCTGAGGCTGTGTCTGCTGTGACCCACCACTACAAAA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTCTCTACTATCTGAGGCTGTGTCTGCTGTGACCCACCACTACAAAA  300

seq1  TGGGTCAGAGTCAAGCCAGGTCCATAAACCACATTAAGAGCCATCTCTAT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCAGAGTCAAGCCAGGTCCATAAACCACATTAAGAGCCATCTCTAT  350

seq1  GCCCACCTATCTACCCACCAAGCCATACCAGAAGGTGTCTTCCTTCCCAC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCACCTATCTACCCACCAAGCCATACCAGAAGGTGTCTTCCTTCCCAC  400

seq1  GGGGGAAGGAAGTGATCACTGGGGGACCCTCTTCCCTCAGATAAGGACAA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGAAGGAAGTGATCACTGGGGGACCCTCTTCCCTCAGATAAGGACAA  450

seq1  TTGTCTCAAGCATATAGCAGCCTCTGCTTTGCCCTTCTGGGCCACCCCTA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTCAAGCATATAGCAGCCTCTGCTTTGCCCTTCTGGGCCACCCCTA  500

seq1  CCCCCACCAGAACCTCTCTTGCCAGAATACATTTCCAGGGTCTGTGGGCT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCACCAGAACCTCTCTTGCCAGAATACATTTCCAGGGTCTGTGGGCT  550

seq1  CTGAGCTCCACTTATCACACGAGATAGGAGAGAATGGAGATAGCCCCTAA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCTCCACTTATCACACGAGATAGGAGAGAATGGAGATAGCCCCTAA  600

seq1  GCCAAATGGACTCTGCACAGTCCTGTGTGGCCAGTATTGTTTTCAGAGGA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAATGGACTCTGCACAGTCCTGTGTGGCCAGTATTGTTTTCAGAGGA  650

seq1  CCCAGAGCTGCCTTGTCCCTGTCCTGGGAGAGGCTGGACAGGAGCCCTGG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAGCTGCCTTGTCCCTGTCCTGGGAGAGGCTGGACAGGAGCCCTGG  700

seq1  ATAAAGCAGAGACTGGGCAGGTGCAGGAATCCACGTTCCTGGGTCTAAAT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGCAGAGACTGGGCAGGTGCAGGAATCCACGTTCCTGGGTCTAAAT  750

seq1  TAGGTCACCAAGACCCTTAGGGAAGCTGGCAAATTCTCTTTCCCCTCTGC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTCACCAAGACCCTTAGGGAAGCTGGCAAATTCTCTTTCCCCTCTGC  800

seq1  TCAGACCTGGCAAAGTCGGCTGACCGGCTGTTGAGGGGTGATGGAAGTGG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACCTGGCAAAGTCGGCTGACCGGCTGTTGAGGGGTGATGGAAGTGG  850

seq1  CCACCCCAGGGAGGAATTC  865
      |||||||||||||||||||
seq2  CCACCCCAGGGAGGAATTC  869

seq1: chr15_85226886_85228007
seq2: B6Ng01-315C14.g_67_1186

seq1  GAATTCCTTTCCTGGGGAAGCAGCTATCTTTTCTCTACAAGCTCCTGAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTTCCTGGGGAAGCAGCTATCTTTTCTCTACAAGCTCCTGAGA  50

seq1  ACACACCAAAGTATGATCCTGGGGAATCCACAGTTCACCCAGAGAACCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACCAAAGTATGATCCTGGGGAATCCACAGTTCACCCAGAGAACCAG  100

seq1  GGAAATTTGGGGGCTTACTTTGGGTAAGAGACTACTAGTAAGAGTGGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATTTGGGGGCTTACTTTGGGTAAGAGACTACTAGTAAGAGTGGGGG  150

seq1  GACTCCAAAGCATTAGCACCCAGAAATCTTGGCTTCCCCATGGCTTCATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCCAAAGCATTAGCACCCAGAAATCTTGGCTTCCCCATGGCTTCATA  200

seq1  GATGGAGTTCCTACCAGTTTGCTTTCCCAGCCTATATACTCTAGCACCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAGTTCCTACCAGTTTGCTTTCCCAGCCTATATACTCTAGCACCTC  250

seq1  CGGAAGCTACTTGCAGTTAGGGCAGAATTTCATACAAATGGCTGGGAGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAAGCTACTTGCAGTTAGGGCAGAATTTCATACAAATGGCTGGGAGAC  300

seq1  ACAGGGGGAGAAGAATCTCCCTCTCTAAGGGTAGAGAAGTCATCTTCCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGGGAGAAGAATCTCCCTCTCTAAGGGTAGAGAAGTCATCTTCCCT  350

seq1  CTAATGATCCCGTGAGGGCTCTTGCAAGCAGGCACAGCTTGTGAAAAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGATCCCGTGAGGGCTCTTGCAAGCAGGCACAGCTTGTGAAAAATA  400

seq1  CAGTTGTTTTGCTAAAGGATTGTGTTCTATAAGGAACATCTGGGGATCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGTTTTGCTAAAGGATTGTGTTCTATAAGGAACATCTGGGGATCTT  450

seq1  GCCTCTGACCCACCAAGCTATTGGCAACAGGAACTTTGGTAGAATCTTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTGACCCACCAAGCTATTGGCAACAGGAACTTTGGTAGAATCTTTA  500

seq1  TACAATGCATGGAAGCCTTTTGAACCCTACTCGATTTCTGCTTGTCACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAATGCATGGAAGCCTTTTGAACCCTACTCGATTTCTGCTTGTCACAT  550

seq1  AAAGTCATTCATTGGAATGGCATGTCCAGCAGCTGAGTAAGGCACCTCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCATTCATTGGAATGGCATGTCCAGCAGCTGAGTAAGGCACCTCTG  600

seq1  TGGCCTTTCGAGTTTCCTGCCTTTTGCATCTGCATTGGGTCACTAGAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTTTCGAGTTTCCTGCCTTTTGCATCTGCATTGGGTCACTAGAGCT  650

seq1  TACTCTGAAAAAGGTTGACAGAAGAATTGTTACCATTAGTTTCTAATGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTGAAAAAGGTTGACAGAAGAATTGTTACCATTAGTTTCTAATGGA  700

seq1  GAAACCAAGGCTCAGGGAGATTTCAGTGTGATTTAATTTAACTGAAATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCAAGGCTCAGGGAGATTTCAGTGTGATTTAATTTAACTGAAATTT  750

seq1  GAATCAGTTTGAATGCAAGCTTGATGCTGTAGGTTCTGAAGATGATGTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCAGTTTGAATGCAAGCTTGATGCTGTAGGTTCTGAAGATGATGTTG  800

seq1  TCAGTAGGGGCTAACATGTGCACTGGTACTATTACTTAACAATTGTGTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTAGGGGCTAACATGTGCACTGGTACTATTACTTAACAATTGTGTTA  850

seq1  CAGAGGCCTGCCAGAGAGGATCTGAAAGGCTGTCTTGTACTCTAGGGTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGCCTGCCAGAGAGGATCTGAAAGGCTGTCTTGTACTCTAGGGTGG  900

seq1  CCATTCCAGAATAGTTCTTTCTGGCAAAGCTGGAACACGAGGACATAGAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCATTCCAGAATAGTTCTTTCTGGCAAAGCTGG-ACACGAGGACATAGAG  949

seq1  TTAGTGGGAT-GGGAGATCATCT--CCCTCTG-TTTCTGCACCTTTGGAC  996
      |||||||||| ||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||||
seq2  TTAGTGGGATGGGGAGATCATCTTCCCTTCTGTTTTCTGCA-CTTTGGAC  998

seq1  AACCTGCTCAGAAATGTATGGAGCTCAGCCCTCCCTGGGTCACGCTGTGG  1046
       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  -ACCTGCTCAGAAATGTATGGAGCTCAGTCCTCCCTGGGTCACGCTGTGG  1047

seq1  CTCT-GATGTTCAGGTTGCTGCTCGAACTATAAAA-GTCTAGCCTTCTTT  1094
      |||| |||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||
seq2  CTCTGGATGTTCCAG-TGCTGCTCG-ACTATAAAAGGTCTAG-CTTCTTT  1094

seq1  ACCAAGTCATGACAGAGGTGCTCCTAAC  1122
      | ||||||||||| |||||||| |||||
seq2  AACAAGTCATGAC-GAGGTGCT-CTAAC  1120