BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-325E16
Chromosome15 (Build37)
Map Location 88,823,737 - 88,968,935
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMov10l1, Panx2, Trabd, 1300018J18Rik, Hdac10, Mapk12
Upstream geneLOC100042340, Zdhhc25, Brd1, Zbed4, Alg12, Creld2, Pim3, 1700019P01Rik, Mlc1, LOC667558
Downstream geneMapk11, Plxnb2, LOC100043185, 1700027J05Rik, Saps2, Sbf1, Adm2, Miox, Tmem112b, Ncaph2, Ecgf1, 2010001J22Rik, Klhdc7b, 1700007E06Rik, Cpt1b, Chkb, C730034F03Rik, Mapk8ip2, Arsa, Shank3, Acr, Rabl2a, LOC676575, Syt10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-325E16.bB6Ng01-325E16.g
ACCGA113387GA113388
length7401,115
definitionB6Ng01-325E16.b B6Ng01-325E16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(88,968,196 - 88,968,935)(88,823,737 - 88,824,851)
sequence
gaattcataatcctttgaaggacctgccttgacctccggcacactattcc
ttatctattctgcgctcagctcatgggtcacacctgtgagttatctgtct
ccaggcctttcctgtccttgctcttcccgctagctttggccatgactaaa
gcagtcgcccatctgccctttacctcctgtctattcttgccgcattctgt
cacagaaactaggagggcccatccagcatcatatccttgtttaaaccttt
ccacggctgctcgctcaatggagcaaagccaaagctgcccctgggatggg
agtgtgaggccccccttgggcttgctctgtcctttccttgattccttctt
ggcctgggcttcggccacttcctttctgtaccttactctgtagggacttt
cactcctgtgatggccatcaggcacctgacctctcatttgctcatttact
catccgtcctgggatttggatatatgcggccctcctcaggacaaactccc
ttgaccccggaggtcccgtcccctaaccaagtactgggaagccaatgtca
cattgtctatctgttgtccaactccctcaatcaaaagctgtgtttcaatt
ggtgcttggtctagacagccagaggggatggtcccaggaatgacctactg
ggaattcattcctcccaggggacggtccccactttggtcttgggtctgct
tcattgggaagaaaaaaagtgtgtgtgtgtggtggggggg
gaattcacagagatatgcctgcctctgccttctgagtgctgggatttaag
gtgtgcaccatgacacctggttaaaattacttttaatatggcaaaataaa
gcagattctgagggaaagtgagatgacaagcctgatttaagaatgaatga
ccatattgggttctctttctcttcaagcagtagctctcaccctgtgggtc
acaacccctgtggggtctcatgtgagacattcatagtatgcttcataacc
gtggcagaatcacagttacaaaggatcagtgaagtaattgtatgattggg
ggtcaccacaacatgaggaactgtattaaagggtcccagtattaggaagg
ttgagattcagtgtcttagcagctggagagtggttggtacctaaaacaga
aatcagggaagctggcctgaaaattacttgagcgtgtcataagctcagag
tgcactgcacatttgagtcctattgatattttctctttggccatttcagg
tttccacccatgcaagggtgactgggtagaggctgagtattggatcaggc
cagggacatggagcagtgaggcaatctctgtgaagcctctgaggtacaag
cgtgtggacaaggtaatgcactgatgaatgctttcttgtttccttaagga
agtagaggtgagactggagcagtcgctcagtggtgaagagcgctggctgt
ttttccagaggacctagatttgattcctagcacccacgtggtggctcaca
tctgtctaactccagttccaggggatccattaccctccctcttctggtat
cccaggaccctgcatgcatgtagtacaaagacgttcaggcagagcctccg
cacacaaaaagtaagatcgtctaggagaggaagcagaggcagcagcagct
ttctgtaactaagtctgacggcatgtccctggatgtgttaaagatgttct
aggacacagtgtgtacgtgacgaattgagggccctcaaacttgtcagctg
atgatttagggatggcgtgggtatagcagcattgggtttcgcactggggt
gaggtgatgcatgagcttgaatataagcagagatgctggggaaagatgtc
agcaccaccaccaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_88968196_88968935
seq2: B6Ng01-325E16.b_46_785 (reverse)

seq1  CCCCCCCACCACACACACACACTTTTTTTCTTCCCAATGAAGCAGACCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCACCACACACACACACTTTTTTTCTTCCCAATGAAGCAGACCCA  50

seq1  AGACCAAAGTGGGGACCGTCCCCTGGGAGGAATGAATTCCCAGTAGGTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAAAGTGGGGACCGTCCCCTGGGAGGAATGAATTCCCAGTAGGTCA  100

seq1  TTCCTGGGACCATCCCCTCTGGCTGTCTAGACCAAGCACCAATTGAAACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGGGACCATCCCCTCTGGCTGTCTAGACCAAGCACCAATTGAAACA  150

seq1  CAGCTTTTGATTGAGGGAGTTGGACAACAGATAGACAATGTGACATTGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTTGATTGAGGGAGTTGGACAACAGATAGACAATGTGACATTGGC  200

seq1  TTCCCAGTACTTGGTTAGGGGACGGGACCTCCGGGGTCAAGGGAGTTTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAGTACTTGGTTAGGGGACGGGACCTCCGGGGTCAAGGGAGTTTGT  250

seq1  CCTGAGGAGGGCCGCATATATCCAAATCCCAGGACGGATGAGTAAATGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGGAGGGCCGCATATATCCAAATCCCAGGACGGATGAGTAAATGAG  300

seq1  CAAATGAGAGGTCAGGTGCCTGATGGCCATCACAGGAGTGAAAGTCCCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGAGAGGTCAGGTGCCTGATGGCCATCACAGGAGTGAAAGTCCCTA  350

seq1  CAGAGTAAGGTACAGAAAGGAAGTGGCCGAAGCCCAGGCCAAGAAGGAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTAAGGTACAGAAAGGAAGTGGCCGAAGCCCAGGCCAAGAAGGAAT  400

seq1  CAAGGAAAGGACAGAGCAAGCCCAAGGGGGGCCTCACACTCCCATCCCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGAAAGGACAGAGCAAGCCCAAGGGGGGCCTCACACTCCCATCCCAG  450

seq1  GGGCAGCTTTGGCTTTGCTCCATTGAGCGAGCAGCCGTGGAAAGGTTTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGCTTTGGCTTTGCTCCATTGAGCGAGCAGCCGTGGAAAGGTTTAA  500

seq1  ACAAGGATATGATGCTGGATGGGCCCTCCTAGTTTCTGTGACAGAATGCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGATATGATGCTGGATGGGCCCTCCTAGTTTCTGTGACAGAATGCG  550

seq1  GCAAGAATAGACAGGAGGTAAAGGGCAGATGGGCGACTGCTTTAGTCATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGAATAGACAGGAGGTAAAGGGCAGATGGGCGACTGCTTTAGTCATG  600

seq1  GCCAAAGCTAGCGGGAAGAGCAAGGACAGGAAAGGCCTGGAGACAGATAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAAGCTAGCGGGAAGAGCAAGGACAGGAAAGGCCTGGAGACAGATAA  650

seq1  CTCACAGGTGTGACCCATGAGCTGAGCGCAGAATAGATAAGGAATAGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGGTGTGACCCATGAGCTGAGCGCAGAATAGATAAGGAATAGTGT  700

seq1  GCCGGAGGTCAAGGCAGGTCCTTCAAAGGATTATGAATTC  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGGAGGTCAAGGCAGGTCCTTCAAAGGATTATGAATTC  740

seq1: chr15_88823737_88824851
seq2: B6Ng01-325E16.g_66_1180

seq1  GAATTCACAGAGATATGCCTGCCTCTGCCTTCTGAGTGCTGGGATTTAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGAGATATGCCTGCCTCTGCCTTCTGAGTGCTGGGATTTAAG  50

seq1  GTGTGCACCATGACACCTGGTTAAAATTACTTTTAATATGGCAAAATAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCACCATGACACCTGGTTAAAATTACTTTTAATATGGCAAAATAAA  100

seq1  GCAGATTCTGAGGGAAAGTGAGATGACAAGCCTGATTTAAGAATGAATGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATTCTGAGGGAAAGTGAGATGACAAGCCTGATTTAAGAATGAATGA  150

seq1  CCATATTGGGTTCTCTTTCTCTTCAAGCAGTAGCTCTCACCCTGTGGGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATTGGGTTCTCTTTCTCTTCAAGCAGTAGCTCTCACCCTGTGGGTC  200

seq1  ACAACCCCTGTGGGGTCTCATGTGAGACATTCATAGTATGCTTCATAACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACCCCTGTGGGGTCTCATGTGAGACATTCATAGTATGCTTCATAACC  250

seq1  GTGGCAGAATCACAGTTACAAAGGATCAGTGAAGTAATTGTATGATTGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCAGAATCACAGTTACAAAGGATCAGTGAAGTAATTGTATGATTGGG  300

seq1  GGTCACCACAACATGAGGAACTGTATTAAAGGGTCCCAGTATTAGGAAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACCACAACATGAGGAACTGTATTAAAGGGTCCCAGTATTAGGAAGG  350

seq1  TTGAGATTCAGTGTCTTAGCAGCTGGAGAGTGGTTGGTACCTAAAACAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGATTCAGTGTCTTAGCAGCTGGAGAGTGGTTGGTACCTAAAACAGA  400

seq1  AATCAGGGAAGCTGGCCTGAAAATTACTTGAGCGTGTCATAAGCTCAGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAGGGAAGCTGGCCTGAAAATTACTTGAGCGTGTCATAAGCTCAGAG  450

seq1  TGCACTGCACATTTGAGTCCTATTGATATTTTCTCTTTGGCCATTTCAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTGCACATTTGAGTCCTATTGATATTTTCTCTTTGGCCATTTCAGG  500

seq1  TTTCCACCCATGCAAGGGTGACTGGGTAGAGGCTGAGTATTGGATCAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCACCCATGCAAGGGTGACTGGGTAGAGGCTGAGTATTGGATCAGGC  550

seq1  CAGGGACATGGAGCAGTGAGGCAATCTCTGTGAAGCCTCTGAGGTACAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGACATGGAGCAGTGAGGCAATCTCTGTGAAGCCTCTGAGGTACAAG  600

seq1  CGTGTGGACAAGGTAATGCACTGATGAATGCTTTCTTGTTTCCTTAAGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTGGACAAGGTAATGCACTGATGAATGCTTTCTTGTTTCCTTAAGGA  650

seq1  AGTAGAGGTGAGACTGGAGCAGTCGCTCAGTGGTGAAGAGCGCTGGCTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGAGGTGAGACTGGAGCAGTCGCTCAGTGGTGAAGAGCGCTGGCTGT  700

seq1  TTTTCCAGAGGACCTAGATTTGATTCCTAGCACCCACGTGGTGGCTCACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCAGAGGACCTAGATTTGATTCCTAGCACCCACGTGGTGGCTCACA  750

seq1  TCTGTCTAACTCCAGTTCCAGGGGATCCATTACCCTCCCTCTTCTGGTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTAACTCCAGTTCCAGGGGATCCATTACCCTCCCTCTTCTGGTAT  800

seq1  CCCAGGACCCTGCATGCATGTAGTACAAAGACGTTCAGGCAGAGCCTCCG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGACCCTGCATGCATGTAGTACAAAGACGTTCAGGCAGAGCCTCCG  850

seq1  CACACAAAAAGTAAGATCGTCTAGGAGAGGAAGCAGAGGCAGCAGCAGC-  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CACACAAAAAGTAAGATCGTCTAGGAGAGGAAGCAGAGGCAGCAGCAGCT  900

seq1  TTCTGTAACTAAGGTCTGACGGCATGTCCCTGGATGTGTTAAAGATGTTC  949
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTAACTAA-GTCTGACGGCATGTCCCTGGATGTGTTAAAGATGTTC  949

seq1  TAGGACACAGTGTGTACGTGACGAATTGA-GGCCCTCAAACTTGTCAGCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TAGGACACAGTGTGTACGTGACGAATTGAGGGCCCTCAAACTTGTCAGCT  999

seq1  GATGATTTAGGGATGGCGTGGGTTATAGCAGCATTGGGTTTCGCACTGGG  1048
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATTTAGGGATGGCGTGGG-TATAGCAGCATTGGGTTTCGCACTGGG  1048

seq1  TTGAGGTGGATGCATGAGC-TGGATAT-AGCAGAGATGCTGGGGAAAGAT  1096
       |||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGT-GATGCATGAGCTTGAATATAAGCAGAGATGCTGGGGAAAGAT  1097

seq1  GTCAGGCACCACCACCAAC  1115
      |||| ||||||||||||||
seq2  GTCA-GCACCACCACCAAC  1115