BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-326K03
Chromosome15 (Build37)
Map Location 81,709,349 - 81,837,554
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAco2, Polr3h, Csdc2, Pmm1, EG545121, 1700029P11Rik, D15Wsu75e
Upstream geneTnrc6b, Adsl, LOC625672, Rutbc3, Mkl1, LOC675966, Mchr1, Slc25a17, St13, Xpnpep3, Dnajb7, Rbx1, EG383080, Ep300, L3mbtl2, Rangap1, Zc3h7b, Tef, LOC667073, Tob2, Phf5a
Downstream geneXrcc6, Nhp2l1, 4930407I10Rik, Mei1, Ccdc134, Srebf2, LOC435145, Tnfrsf13c, Cenpm, 1500009C09Rik, Sept3, Wbp2nl, Naga, C920005C14Rik, 1500032L24Rik, Ndufa6, Cyp2d22, LOC545123, Cyp2d10, Cyp2d9, EG545124, EG667196, EG667177, 9030605E09Rik, BC018285, Cyp2d13, LOC380998, LOC627860, LOC676200, 1300013D18Rik, LOC271300, Cyp2d26, Tcf20, Nfam1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-326K03.bB6Ng01-326K03.g
ACCGA114394GA114395
length8831,038
definitionB6Ng01-326K03.b B6Ng01-326K03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,836,676 - 81,837,554)(81,709,349 - 81,710,388)
sequence
gaattcaaggtcagcctttgctgcgtagtaagttagaggccagcctagaa
tgcatgaccttttctcagaaaaggaaaaaaaaaaaagatctagacctttg
agtatagttcagtgatagagtacccgcttagcatgtacaagtctctgctc
ataccccagtacaaatgaaaatgtttagatgtaaagggtgaacgggcatg
gcggcgcagcctttaatcccagcacataggaggcagaggcaggcagagtt
ctgtgagttccaggacagccggggccacatagaaacactctgtctttaaa
agagaaacagagggcctggtgagatggctcagtaggtaagagcacccgac
tgctcttccagaggtcctgagttcaaatcccagaaaccacatggtggctc
acaaccatccgtaacaagatctgactccctcttctggtgtgtctgaagac
agctacagtctacttacatataatcaatcaataaatctttaaaaagagag
agagagaaacagagaggtatataacacaggaagtacaagcatgctgctct
ccttccatgcaacactgagcaagacctagaacagatgagggtgacactta
gcaatttgtgaaccttggcatttgactgctccggtgagtgggtgaggtca
cctgtgttcctacctccttcattgccttgctcatccttctgtgtgctgtg
tgtattgtctccttgcctgtctgtcttcatgttatgtgtgaatttgtctc
ctttgccttgtccttctgtgtgctgtgtgtattgtctcctttgcctgtct
gtctcatgttatgtgtgaattgtctccttgcctgttctgtgtgctgtgtg
tatgtctctttgcttgtctgtgtgtgggtgtga
gaattcaccaatggagctgacttcaaatgagggtcaaagccctctcttgc
tatgagagagccataatttaaatactatataatacatggctgaagtaata
tttagatgctggccctcaatacagactcagccctctggtttgatacccag
atgtggtaatgaatatttagtctacttactgctgttgtagatgttggagc
tgtgagctcaggcctgggggaactggaatcatatcagttgtcacatactg
acttcaggttcttttacttgtcacagacctaggacatttttttttcaaaa
gtctgtttgttttttgagacagggtttctttgtgtagccttggctgtcct
ggacctagctctatagaccaggctggcctcaaattcagagatctgtctgt
cctaggtggtcttttaccagggttgacctacttgtccttcacagtaaccc
taaaatgtcagcattcccagcctgcttttgtaatgataaaattgaggccc
atagatgttgactaattcatcttaggtcttaggtaacacactatacagcc
agatgttggttgcagagatgcattggaccatagtacttgggcttttgacc
actcagccaacctgtttccccagagccctcccctgggatagggtgtagaa
gccagatctctggagagtaggctggatatggggtgaacagttcagttgac
ccccactggtttcagtgtatgtctcttgaggctgtgattgccttctgccc
cagataccagtgaggtagaggtgtgggtttcacatggcagctttgttctt
gcctgggctcaaagggtgcctgaggagctttggtgaatgcccttctcggt
gtgctgctgcagaactggctgccaatctgccggctagagcaggcttagga
tttatatgcagcttgcaatctctgctactggaggaagagattagagggat
gagtgaatccatcagctgttataaggaacccctgctgcctttgctagaac
atttagaggcttgtgacttgggggggtggggggaggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_81836676_81837554
seq2: B6Ng01-326K03.b_46_927 (reverse)

seq1  CACA-CAACACACAGGACAGGCAAAGAGACAATACACACAGCACACAGGA  49
      |||| | ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
seq2  CACACCCACACACA-GACAAGCAAAGAGAC-ATACACACAGCACACAGAA  48

seq1  CAGGCAAGGAGACAATTCACACATAACATGAAGACAGACAGGC-AAGGAG  98
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
seq2  CAGGCAAGGAGACAATTCACACATAACATG-AGACAGACAGGCAAAGGAG  97

seq1  ACAATACACACAGCACACAGAAGGAC-AGGC-AAGGAGAC-AATTCACAC  145
      |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||
seq2  ACAATACACACAGCACACAGAAGGACAAGGCAAAGGAGACAAATTCACAC  147

seq1  ATAACATGAAGACAGACAGGCAAGGAGACAATACACACAGCACACAGAAG  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACATGAAGACAGACAGGCAAGGAGACAATACACACAGCACACAGAAG  197

seq1  GATGAGCAAGGCAATGAAGGAGGTAGGAACACAGGTGACCTCACCCACTC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGCAAGGCAATGAAGGAGGTAGGAACACAGGTGACCTCACCCACTC  247

seq1  ACCGGAGCAGTC-AATTCCAAGGTTCACAAATTGCTAAGTGTCACCCTCA  294
      |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGGAGCAGTCAAATGCCAAGGTTCACAAATTGCTAAGTGTCACCCTCA  297

seq1  TCTGTTCTAGGTCTTGCTCAGTGTTGCATGGAAGGAGAGCAGCATGCTTG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTCTAGGTCTTGCTCAGTGTTGCATGGAAGGAGAGCAGCATGCTTG  347

seq1  TACTTCCTGTGTTATATACCTCTCTGTTTCTCTCTCTCTCTTTTTAAAGA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCCTGTGTTATATACCTCTCTGTTTCTCTCTCTCTCTTTTTAAAGA  397

seq1  TTTATTGATTGATTATATGTAAGTAGACTGTAGCTGTCTTCAGACACACC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTGATTGATTATATGTAAGTAGACTGTAGCTGTCTTCAGACACACC  447

seq1  AGAAGAGGGAGTCAGATCTTGTTACGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAGGGAGTCAGATCTTGTTACGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGT  497

seq1  TTCTGGGATTTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCGGGTGCTCTTAC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGGATTTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCGGGTGCTCTTAC  547

seq1  CTACTGAGCCATCTCACCAGGCCCTCTGTTTCTCTTTTAAAGACAGAGTG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGAGCCATCTCACCAGGCCCTCTGTTTCTCTTTTAAAGACAGAGTG  597

seq1  TTTCTATGTGGCCCCGGCTGTCCTGGAACTCACAGAACTCTGCCTGCCTC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTATGTGGCCCCGGCTGTCCTGGAACTCACAGAACTCTGCCTGCCTC  647

seq1  TGCCTCCTATGTGCTGGGATTAAAGGCTGCGCCGCCATGCCCGTTCACCC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCCTATGTGCTGGGATTAAAGGCTGCGCCGCCATGCCCGTTCACCC  697

seq1  TTTACATCTAAACATTTTCATTTGTACTGGGGTATGAGCAGAGACTTGTA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACATCTAAACATTTTCATTTGTACTGGGGTATGAGCAGAGACTTGTA  747

seq1  CATGCTAAGCGGGTACTCTATCACTGAACTATACTCAAAGGTCTAGATCT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTAAGCGGGTACTCTATCACTGAACTATACTCAAAGGTCTAGATCT  797

seq1  TTTTTTTTTTTCCTTTTCTGAGAAAAGGTCATGCATTCTAGGCTGGCCTC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTTCCTTTTCTGAGAAAAGGTCATGCATTCTAGGCTGGCCTC  847

seq1  TAACTTACTACGCAGCAAAGGCTGACCTTGAATTC  879
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTACTACGCAGCAAAGGCTGACCTTGAATTC  882

seq1: chr15_81709349_81710388
seq2: B6Ng01-326K03.g_63_1100

seq1  GAATTCACCAATGGAGCTGACTTCAAATGAGGGTCAAAGCCCTCTCTTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCAATGGAGCTGACTTCAAATGAGGGTCAAAGCCCTCTCTTGC  50

seq1  TATGAGAGAGCCATAATTTAAATACTATATAATACATGGCTGAAGTAATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGAGAGCCATAATTTAAATACTATATAATACATGGCTGAAGTAATA  100

seq1  TTTAGATGCTGGCCCTCAATACAGACTCAGCCCTCTGGTTTGATACCCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGATGCTGGCCCTCAATACAGACTCAGCCCTCTGGTTTGATACCCAG  150

seq1  ATGTGGTAATGAATATTTAGTCTACTTACTGCTGTTGTAGATGTTGGAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGTAATGAATATTTAGTCTACTTACTGCTGTTGTAGATGTTGGAGC  200

seq1  TGTGAGCTCAGGCCTGGGGGAACTGGAATCATATCAGTTGTCACATACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCTCAGGCCTGGGGGAACTGGAATCATATCAGTTGTCACATACTG  250

seq1  ACTTCAGGTTCTTTTACTTGTCACAGACCTAGGACATTTTTTTTTCAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAGGTTCTTTTACTTGTCACAGACCTAGGACATTTTTTTTTCAAAA  300

seq1  GTCTGTTTGTTTTTTGAGACAGGGTTTCTTTGTGTAGCCTTGGCTGTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTTTGTTTTTTGAGACAGGGTTTCTTTGTGTAGCCTTGGCTGTCCT  350

seq1  GGACCTAGCTCTATAGACCAGGCTGGCCTCAAATTCAGAGATCTGTCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCTAGCTCTATAGACCAGGCTGGCCTCAAATTCAGAGATCTGTCTGT  400

seq1  CCTAGGTGGTCTTTTACCAGGGTTGACCTACTTGTCCTTCACAGTAACCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGGTGGTCTTTTACCAGGGTTGACCTACTTGTCCTTCACAGTAACCC  450

seq1  TAAAATGTCAGCATTCCCAGCCTGCTTTTGTAATGATAAAATTGAGGCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGTCAGCATTCCCAGCCTGCTTTTGTAATGATAAAATTGAGGCCC  500

seq1  ATAGATGTTGACTAATTCATCTTAGGTCTTAGGTAACACACTATACAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATGTTGACTAATTCATCTTAGGTCTTAGGTAACACACTATACAGCC  550

seq1  AGATGTTGGTTGCAGAGATGCATTGGACCATAGTACTTGGGCTTTTGACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTTGGTTGCAGAGATGCATTGGACCATAGTACTTGGGCTTTTGACC  600

seq1  ACTCAGCCAACCTGTTTCCCCAGAGCCCTCCCCTGGGATAGGGTGTAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGCCAACCTGTTTCCCCAGAGCCCTCCCCTGGGATAGGGTGTAGAA  650

seq1  GCCAGATCTCTGGAGAGTAGGCTGGATATGGGGTGAACAGTTCAGTTGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGATCTCTGGAGAGTAGGCTGGATATGGGGTGAACAGTTCAGTTGAC  700

seq1  CCCCACTGGTTTCAGTGTATGTCTCTTGAGGCTGTGATTGCCTTCTGCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACTGGTTTCAGTGTATGTCTCTTGAGGCTGTGATTGCCTTCTGCCC  750

seq1  CAGATACCAGTGAGGTAGAGGTGTGGGTTTCACATGGCAGCTTTGTTCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATACCAGTGAGGTAGAGGTGTGGGTTTCACATGGCAGCTTTGTTCTT  800

seq1  GCCTGGGCTCAAAGGGTGCCTGAGGAGCTTTGGTGAATGCCCTTCTCGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGGCTCAAAGGGTGCCTGAGGAGCTTTGGTGAATGCCCTTCTCGGT  850

seq1  GTGCTGCTGCAGAACTGGCTGCCAATCTGCCGGCTAGAGCAGGGCTTAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTGCTGCTGCAGAACTGGCTGCCAATCTGCCGGCTAGAGCA-GGCTTAGG  899

seq1  ATTTATATGCAGCTTGCAATCTCTGCTACTGGAGGAAAGAGAATTAGAGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2  ATTTATATGCAGCTTGCAATCTCTGCTACTGGAGG-AAGAG-ATTAGAGG  947

seq1  GATGAGTGAATCCATCAGCCTGTTTATTAAAGGAACCCCTGCTGCCTTTG  1000
      |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGTGAATCCATCAG-CTG-TTAT--AAGGAACCCCTGCTGCCTTTG  993

seq1  CTAG-ACATTTAGAGGC-TGTGACTTGGGGG---TGGGGGAGGGA  1040
      |||| |||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||
seq2  CTAGAACATTTAGAGGCTTGTGACTTGGGGGGGTGGGGGGAGGGA  1038