BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-331B05
Chromosome15 (Build37)
Map Location 73,261,364 - 73,413,388
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDennd3, Slc45a4
Upstream geneKcnk9, 1810044A24Rik, LOC665621, Peg13, LOC100041120, Chrac1, Eif2c2, Ptk2, LOC666053, LOC100040929
Downstream geneGpr20, LOC100040946, pPtp4a3, Gm628, LOC100041273, EG625276, LOC100040966, EG666113, LOC100041307, LOC100040984, Bai1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-331B05.bB6Ng01-331B05.g
ACCGA117543GA117544
length1,092437
definitionB6Ng01-331B05.b B6Ng01-331B05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,412,308 - 73,413,388)(73,261,364 - 73,261,806)
sequence
gaattcagcatgattattcagtatgatggtgaatttttgacattttggag
ttttaatgatagtagtagtagattggtttctaataattaaaattagagaa
agcatacatatgtgatttcagcccttaaattgattgattataccatctgt
ggcccagcatgtcccatatatggtgaaatgggtggtgcgccctgtggcct
ctgtcggttgagtaaggcgggcttttcttctgttctttctggtgtctgca
aggtgtctttaaaatctccctctgactatggtgtacacaagtctaaaatc
tgattgtggtttccatcttctgggtagattggccttcatatctctaggac
aaagtctcctttggagacttgggggtgagtatagccatgttgtgccaggc
atgcacatgttcatgttgttcaagaaacatgaacaaatagaactgcctgg
ttggtgttccctgctctgtcacctgagcccacatgcatgtgagtgaagag
ctccctgctctccaaggagatcttcagagtaagggggggcacccctatgt
ctgccctgcctctctttcttaggactggaggtagttttctggggaataag
gtcctgattaggttgtagaactacttctgtgtttcccgctatgagccata
atgttctacctctctttttaatgcccagtgccaggctgggctctggggaa
tccagttgctagctgcctagcttaggagagtgtgtcttctccctcagtgc
agtcagtgcgcatagccttgaggtactaatgaagaccgccttctctgtgc
cctcacacctgtgtcccttcccttgcagtatgtccaccacagtcccgggg
aattccaagcgtggattttggcattgactgcgccatccttctcctgtcag
gtctacatctcccagatcctggttgcatctgcccttggggggcgtggtcg
acgctgtgaatagtatcgttgtcatccccaatagtggcctctgttaggct
ctttcttgggcttcttgacagccacatttcttggtcatctaccctgaggt
tgtcaaaaggaaccttatgaagaacagaaaaggtcctgtcct
tgtctcaaaacaacctacggggactgcagaggtggctcaggggggcaagg
tttacttcacaagcatgagaacatggatttgaatccctggtgcccacagc
tgtatgtgcttgtatcttcaaagctaggggcagagaccgaacgcctgcag
cttactagccagcctgggcagcagtgagcctcaagtcagcaaaaggccct
gtctcaaggaaataaggtggagcttgattgggtaggatgcctgtgacatc
gtcctctgtctctgtgtgcacaatagcacatgcatgcatagaccacacac
aaacacacacaattacttttttttttaattaacagccaggtatggccctt
gactgcacttagtaggctaagaaaggttgttgcaagtcctaccagcccat
acagagcaagacaggagtgggggagttgggggaagga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_73412308_73413388
seq2: B6Ng01-331B05.b_48_1139 (reverse)

seq1  AGGACAGG--CCTTTCTGTTCCTCCTTAGGTTCC-TCTGAC-ACCTCAGG  46
      ||||||||  | ||||||||| || | ||||||| | |||| ||||||||
seq2  AGGACAGGACCTTTTCTGTTCTTCATAAGGTTCCTTTTGACAACCTCAGG  50

seq1  GTAGATGACC-AGGAATGTGGCTGTCAAGAAGCCCAGGAAAGAGCCT-AC  94
      |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
seq2  GTAGATGACCAAGAAATGTGGCTGTCAAGAAGCCCAAGAAAGAGCCTAAC  100

seq1  AGAGGCCACTA-TGGGGATGACAACGATACTATTCACAGCGTCGACCACG  143
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCCACTATTGGGGATGACAACGATACTATTCACAGCGTCGACCACG  150

seq1  -CCCCCAAGGGCAGATGCAACCAGGATCTGGGAGATGTAGACCTGACAGG  192
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCAAGGGCAGATGCAACCAGGATCTGGGAGATGTAGACCTGACAGG  200

seq1  AG-AGGATGGCGCAGTCAATGCC-AAATCCACGCTTGGAATTCCCC-GGA  239
      || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
seq2  AGAAGGATGGCGCAGTCAATGCCAAAATCCACGCTTGGAATTCCCCGGGA  250

seq1  CTGTGGTGGACATACTGCAAGGGAAGGGACACAGGTGTGAGGGCACAGAG  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGTGGACATACTGCAAGGGAAGGGACACAGGTGTGAGGGCACAGAG  300

seq1  AAGGCGGTCTTCATTAGTACCTCAAGGCTATGCGCACTGACTGCACTGAG  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCGGTCTTCATTAGTACCTCAAGGCTATGCGCACTGACTGCACTGAG  350

seq1  GGAGAAGACACACTCTCCTAAGCTAGGCAGCTAGCAACTGGATTCCCCAG  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAGACACACTCTCCTAAGCTAGGCAGCTAGCAACTGGATTCCCCAG  400

seq1  AGCCCAGCCTGGCACTGGGCATTAAAAAGAGAGGTAGAACATTATGGCTC  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGCCTGGCACTGGGCATTAAAAAGAGAGGTAGAACATTATGGCTC  450

seq1  ATAGCGGGAAACACAGAAGTAGTTCTACAACCTAATCAGGACCTTATTCC  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCGGGAAACACAGAAGTAGTTCTACAACCTAATCAGGACCTTATTCC  500

seq1  CCAGAAAACTACCTCCAGTCCTAAGAAAGAGAGGCAGGGCAGACATAGGG  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAAACTACCTCCAGTCCTAAGAAAGAGAGGCAGGGCAGACATAGGG  550

seq1  GTGCCCCCCCTTACTCTGAAGATCTCCTTGGAGAGCAGGGAGCTCTTCAC  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCCCCCTTACTCTGAAGATCTCCTTGGAGAGCAGGGAGCTCTTCAC  600

seq1  TCACATGCATGTGGGCTCAGGTGACAGAGCAGGGAACACCAACCAGGCAG  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATGCATGTGGGCTCAGGTGACAGAGCAGGGAACACCAACCAGGCAG  650

seq1  TTCTATTTGTTCATGTTTCTTGAACAACATGAACATGTGCATGCCTGGCA  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATTTGTTCATGTTTCTTGAACAACATGAACATGTGCATGCCTGGCA  700

seq1  CAACATGGCTATACTCACCCCCAAGTCTCCAAAGGAGACTTTGTCCTAGA  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATGGCTATACTCACCCCCAAGTCTCCAAAGGAGACTTTGTCCTAGA  750

seq1  GATATGAAGGCCAATCTACCCAGAAGATGGAAACCACAATCAGATTTTAG  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGAAGGCCAATCTACCCAGAAGATGGAAACCACAATCAGATTTTAG  800

seq1  ACTTGTGTACACCATAGTCAGAGGGAGATTTTAAAGACACCTTGCAGACA  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTGTACACCATAGTCAGAGGGAGATTTTAAAGACACCTTGCAGACA  850

seq1  CCAGAAAGAACAGAAGAAAAGCCCGCCTTACTCAACCGACAGAGGCCACA  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAAGAACAGAAGAAAAGCCCGCCTTACTCAACCGACAGAGGCCACA  900

seq1  GGGCGCACCACCCATTTCACCATATATGGGACATGCTGGGCCACAGATGG  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCGCACCACCCATTTCACCATATATGGGACATGCTGGGCCACAGATGG  950

seq1  TATAATCAATCAATTTAAGGGCTGAAATCACATATGTATGCTTTCTCTAA  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATCAATCAATTTAAGGGCTGAAATCACATATGTATGCTTTCTCTAA  1000

seq1  TTTTAATTATTAGAAACCAATCTACTACTACTATCATTAAAACTCCAAAA  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATTATTAGAAACCAATCTACTACTACTATCATTAAAACTCCAAAA  1050

seq1  TGTCAAAAATTCACCATCATACTGAATAATCATGCTGAATTC  1081
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAAAAATTCACCATCATACTGAATAATCATGCTGAATTC  1092

seq1: chr15_73261364_73261806
seq2: B6Ng01-331B05.g_67_509

seq1  GAATTCTGTCTCAAAACAACCTACGGGGACTGCAGAGGTGGCTCAGGGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTCTCAAAACAACCTACGGGGACTGCAGAGGTGGCTCAGGGGG  50

seq1  GCAAGGTTTACTTCACAAGCATGAGAACATGGATTTGAATCCCTGGTGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGTTTACTTCACAAGCATGAGAACATGGATTTGAATCCCTGGTGCC  100

seq1  CACAGCTGTATGTGCTTGTATCTTCAAAGCTAGGGGCAGAGACCGAACGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCTGTATGTGCTTGTATCTTCAAAGCTAGGGGCAGAGACCGAACGC  150

seq1  CTGCAGCTTACTAGCCAGCCTGGGCAGCAGTGAGCCTCAAGTCAGCAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGCTTACTAGCCAGCCTGGGCAGCAGTGAGCCTCAAGTCAGCAAAA  200

seq1  GGCCCTGTCTCAAGGAAATAAGGTGGAGCTTGATTGGGTAGGATGCCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCTGTCTCAAGGAAATAAGGTGGAGCTTGATTGGGTAGGATGCCTGT  250

seq1  GACATCGTCCTCTGTCTCTGTGTGCACAATAGCACATGCATGCATAGACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATCGTCCTCTGTCTCTGTGTGCACAATAGCACATGCATGCATAGACC  300

seq1  ACACACAAACACACACAATTACTTTTTTTTTTAATTAACAGCCAGGTATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACAAACACACACAATTACTTTTTTTTTTAATTAACAGCCAGGTATG  350

seq1  GCCCTTGACTGCACTTAGTAGGCTAAGAAAGGTTGTTGCAAGTCCTACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTTGACTGCACTTAGTAGGCTAAGAAAGGTTGTTGCAAGTCCTACCA  400

seq1  GCCCATACAGAGCAAGACAGGAGTGGGGGAGTTGGGGGAAGGA  443
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCATACAGAGCAAGACAGGAGTGGGGGAGTTGGGGGAAGGA  443