BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-334L15
Chromosome15 (Build37)
Map Location 41,284,849 - 41,382,305
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC664872, Zfpm2, Ppia-ps25
Downstream geneOxr1, Abra, EG432946, LOC432947, LOC100039268, LOC100039197, Angpt1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-334L15.bB6Ng01-334L15.g
ACCGA120160GA120161
length1,1381,187
definitionB6Ng01-334L15.b B6Ng01-334L15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(41,284,849 - 41,286,009)(41,381,100 - 41,382,305)
sequence
gaattcaagagcgtcagtaagcagattctgaaatcaatgctgtagcaaag
gcaaagagaggatctgttctaagtctcacttgggtttatcattgctaaga
ctgatgaatagaaacttatggaagatgaaattttccctgtggaagatctt
tacctttgtgatcatttattacaaggaacaaggaggccgacacacctccc
aaagatttcacccttcaatagtatgccttttctatcctcagaatattcag
gatgtggtattgtgtgctctcagaatgccttataagtttgtaatttagag
tttctttggcctcttaaagaaggcaaaggcctgtgctgtgctgtttatca
ctgagagcacagtggctggtgttgacagcagcccattttattcaaggaaa
aatttatgcccttgacatttgtctggactgtcactagctaaaaaaacaca
gaactcagccttctggatcgtgaaccctgatttcagcaactttgatttga
ataactgtgttgtaagcagactgatagttgagccagagtactaccttcac
atttccaaggaaagaggcacaagggctgaggctgagtagatttgcaaatg
aacctagcagtccttaccagttggtgacttcaaactggagtcttgtagtc
catggagcttgacgctcctcgtctttaagtgacaaacggttatttttggt
tatatatggacttggttatggtgttagagagagtgattaaaatgatcaag
gacctttttgttttatcttgtttgggacgaatatagtatttaaattaact
gtatctcaaaagaaatatgaagctatggataatatcctttaattaggaca
cttttatttgaaaattcaagactggcattagttgatagttgtcgtatcgt
gatggttatgctttagaaattgatacagtgttattgcttgtgtatctttg
agatttcagttttcaaatgcaagttatttgtcagagtatcctgtagagct
gcacattcattctgggtcgtgattacatataaacaagctctgctatattt
acgggattgactatataaattatcaggtctggcatcattaatgatgggtg
tctatacctttctgaacctgagatcatggagccctaca
gaattctttatatagatatgggcttattgtggattcctagctgaggattc
agtagcagacgctataactgaagggaggcatgaaccaaaaagtgaatata
gcagtcagcccatgtttgggttcccctattgcgatattttgtaagaataa
acaagataaggacatttgtgggaagagtaaggatacctaaaagaatataa
ctgagaaggaaacaaaagagatacaaagtgagaaatgtgaaatagacaga
tttggtctaatgatttagctatggaattaacatcattaaaacagaaaaga
aaaaaacaatataatttagaagccagattactataactctctcccaaata
tttacacttgagattaatatatgcatagtaggcacttgataaatgttttg
cacatgaattgttccactaaaaatgctttaagtactaaagttagtcaatg
cattgtttaaacgactgcttctcaaatttgtggtagtaattcccctttct
ttgtaatatattccaccaaactcgtgttctatacaaagtaatttggaact
cacttctttggacatagcatatacaactgtaagtaatagtaaaaagaagt
aataggagttacagttatggaactagagcaggggagaacacatgatcatg
agaaaagctcagaaaatataactaatggggatcaaggttcaaaggaaggc
ttttcagaaatgactgagttaccatcgtcgtggttttttttcaaagcatg
tctttatgaagtgatttattagtattattgtgtctaatgaataaaagcaa
aactaattagttcccttcaattttatgttttcctgtaagtggtcagtgag
aaaaactaacaacaaaaagacagaaaggacatcactgaaaagaaaaactg
gcaacatgagcctactataacctttatttccagttctggaagaggacagt
caatgacttggtcactaacgtcacacatgagcattggaaacatcttccag
atgttcacaacgttgggggattgcctcttcaacctcaagcatattatgga
catcttgtcttatttttcttgacatctcagatatctacggcttagctcac
ctgggaaaactatcacaacctcccttgtgagcaggtaatgctggatacgc
acagaccagcttcttacagccaaatcacctctacctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr15_41284849_41286009
seq2: B6Ng01-334L15.b_46_1183

seq1  GAATTCAAGAGCGTCAGTAAGCAGATTCTGAAATCAATGCTGTAGCAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGAGCGTCAGTAAGCAGATTCTGAAATCAATGCTGTAGCAAAG  50

seq1  GCAAAGAGAGGATCTGTTCTAAGTCTCACTTGGGTTTATCATTGCTAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGAGAGGATCTGTTCTAAGTCTCACTTGGGTTTATCATTGCTAAGA  100

seq1  CTGATGAATAGAAACTTATGGAAGATGAAATTTTCCCTGTGGAAGATCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGAATAGAAACTTATGGAAGATGAAATTTTCCCTGTGGAAGATCTT  150

seq1  TACCTTTGTGATCATTTATTACAAGGAACAAGGAGGCCGACACACCTCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTTTGTGATCATTTATTACAAGGAACAAGGAGGCCGACACACCTCCC  200

seq1  AAAGATTTCACCCTTCAATAGTATGCCTTTTCTATCCTCAGAATATTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATTTCACCCTTCAATAGTATGCCTTTTCTATCCTCAGAATATTCAG  250

seq1  GATGTGGTATTGTGTGCTCTCAGAATGCCTTATAAGTTTGTAATTTAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGGTATTGTGTGCTCTCAGAATGCCTTATAAGTTTGTAATTTAGAG  300

seq1  TTTCTTTGGCCTCTTAAAGAAGGCAAAGGCCTGTGCTGTGCTGTTTATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTGGCCTCTTAAAGAAGGCAAAGGCCTGTGCTGTGCTGTTTATCA  350

seq1  CTGAGAGCACAGTGGCTGGTGTTGACAGCAGCCCATTTTATTCAAGGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGAGCACAGTGGCTGGTGTTGACAGCAGCCCATTTTATTCAAGGAAA  400

seq1  AATTTATGCCCTTGACATTTGTCTGGACTGTCACTAGCTAAAAAAACACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTATGCCCTTGACATTTGTCTGGACTGTCACTAGCTAAAAAAACACA  450

seq1  GAACTCAGCCTTCTGGATCGTGAACCCTGATTTCAGCAACTTTGATTTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCAGCCTTCTGGATCGTGAACCCTGATTTCAGCAACTTTGATTTGA  500

seq1  ATAACTGTGTTGTAAGCAGACTGATAGTTGAGCCAGAGTACTACCTTCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTGTGTTGTAAGCAGACTGATAGTTGAGCCAGAGTACTACCTTCAC  550

seq1  ATTTCCAAGGAAAGAGGCACAAGGGCTGAGGCTGAGTAGATTTGCAAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCAAGGAAAGAGGCACAAGGGCTGAGGCTGAGTAGATTTGCAAATG  600

seq1  AACCTAGCAGTCCTTACCAGTTGGTGACTTCAAACTGGAGTCTTGTAGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTAGCAGTCCTTACCAGTTGGTGACTTCAAACTGGAGTCTTGTAGTC  650

seq1  CATGGAGCTTGACGCTCCTCGTCTTTAAGTGACAAACGGTTATTTTTGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAGCTTGACGCTCCTCGTCTTTAAGTGACAAACGGTTATTTTTGGT  700

seq1  TATATATGGACTTGGTTATGGTGTTAGAGAGAGTGATTAAAATGATCAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATGGACTTGGTTATGGTGTTAGAGAGAGTGATTAAAATGATCAAG  750

seq1  GACCTTTTTGTTTTATCTTGTTTGGGACGAATATAGTATTTAAATTAACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTTTTGTTTTATCTTGTTTGGGACGAATATAGTATTTAAATTAACT  800

seq1  GTATCTCAAAAGAAATATGAAGCTATGGATAATATCCTTTAATTAGGACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCTCAAAAGAAATATGAAGCTATGGATAATATCCTTTAATTAGGACA  850

seq1  CTTTTATTTGAAAATTCAAGACTGGCATTAGTTGATAGTTGTCGTATCGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTATTTGAAAATTCAAGACTGGCATTAGTTGATAGTTGTCGTATCGT  900

seq1  GATGGTTATGCTTTAGAAATTGATACAGTGTTATTGCTTTGTGTATCTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GATGGTTATGCTTTAGAAATTGATACAGTGTTATTGC-TTGTGTATCTTT  949

seq1  GAAGAATTTCAGGTTTTCAAAATGCAAGTTTATTTGTCAGAGGTATCCTG  1000
      ||   |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||
seq2  GA--GATTTCA-GTTTTC-AAATGCAAG-TTATTTGTCAGA-GTATCCTG  993

seq1  TTAGAGCTGCACATTCATTTCCTGGGTCGTGATTAACATAT-AACAAGCT  1049
       ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||
seq2  -TAGAGCTGCACATTCATT--CTGGGTCGTGATT-ACATATAAACAAGCT  1039

seq1  CTGCTATATTTACGGGATTTGACTATATTAAAATATATCAAGTCTGGCAT  1099
      ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||
seq2  CTGCTATATTTACGGGA-TTGACTATAT--AAAT-TATCAGGTCTGGCAT  1085

seq1  CATTAATGATGGTGTGTTTCTAATAACTTTTCTGGAGCTTTGAGATACAT  1149
      ||||||||||||   || ||||   || |||||| | |  |||||| |||
seq2  CATTAATGATGG---GTGTCTA--TACCTTTCTGAACC--TGAGAT-CAT  1127

seq1  GGAGCCCCTACA  1161
      |||| |||||||
seq2  GGAG-CCCTACA  1138

seq1: chr15_41381100_41382305
seq2: B6Ng01-334L15.g_66_1252 (reverse)

seq1  AAGGT-GAGGTGATTTGGCTGCTAGAAGCTTGGTCTGTGTGCTGTATCAA  49
      ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||    ||||| |
seq2  AAGGTAGAGGTGATTTGGCTGTAAGAAGC-TGGTCTGTG---CGTATCCA  46

seq1  GCATTTTACACTGCTCACAAAGGGAGTTTGTGGATATGTTTCCCCAGGGT  99
      |||  |||| |||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||| |||
seq2  GCA--TTAC-CTGCTCAC-AAGGGAGGTTGT-GATA-GTTTTCCCA-GGT  89

seq1  GAGCTAAAGCCGTAGATTATCTGAGATGGTCAAG-AAAATAAGACAAGGA  148
      ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||
seq2  GAGCT-AAGCCGTAGA-TATCTGAGAT-GTCAAGAAAAATAAGACAA-GA  135

seq1  TGTCCATAAATTATGGCTTGAGGTTGAAGAGGCAATCCCCCAACGTTGTG  198
      |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGTCCATAA--TAT-GCTTGAGGTTGAAGAGGCAATCCCCCAACGTTGT-  181

seq1  GAACATCTTGGAGATGTTTCCAATGCTCATGTGTGACGTTAGTGACCAAG  248
      |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATCTGGAAGATGTTTCCAATGCTCATGTGTGACGTTAGTGACCAAG  231

seq1  TCATTGACTTGTCCTCTTCCAGAACTGGAAAATAAAGGTTATAGTAGGCT  298
      |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGAC-TGTCCTCTTCCAGAACTGG-AAATAAAGGTTATAGTAGGCT  279

seq1  CATGTTGCCAGTTTTTCTTTTCAGTGATGTCCTTTCTGTCTTTTTGTTGT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTGCCAGTTTTTCTTTTCAGTGATGTCCTTTCTGTCTTTTTGTTGT  329

seq1  TAGTTTTTCTCACTGACCACTTACAGGAAAACATAAAATTGAAGGGAACT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTTTCTCACTGACCACTTACAGGAAAACATAAAATTGAAGGGAACT  379

seq1  AATTAGTTTTGCTTTTATTCATTAGACACAATAATACTAATAAATCACTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAGTTTTGCTTTTATTCATTAGACACAATAATACTAATAAATCACTT  429

seq1  CATAAAGACATGCTTTGAAAAAAAACCACGACGATGGTAACTCAGTCATT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAGACATGCTTTGAAAAAAAACCACGACGATGGTAACTCAGTCATT  479

seq1  TCTGAAAAGCCTTCCTTTGAACCTTGATCCCCATTAGTTATATTTTCTGA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAAAGCCTTCCTTTGAACCTTGATCCCCATTAGTTATATTTTCTGA  529

seq1  GCTTTTCTCATGATCATGTGTTCTCCCCTGCTCTAGTTCCATAACTGTAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTCTCATGATCATGTGTTCTCCCCTGCTCTAGTTCCATAACTGTAA  579

seq1  CTCCTATTACTTCTTTTTACTATTACTTACAGTTGTATATGCTATGTCCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTATTACTTCTTTTTACTATTACTTACAGTTGTATATGCTATGTCCA  629

seq1  AAGAAGTGAGTTCCAAATTACTTTGTATAGAACACGAGTTTGGTGGAATA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGTGAGTTCCAAATTACTTTGTATAGAACACGAGTTTGGTGGAATA  679

seq1  TATTACAAAGAAAGGGGAATTACTACCACAAATTTGAGAAGCAGTCGTTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACAAAGAAAGGGGAATTACTACCACAAATTTGAGAAGCAGTCGTTT  729

seq1  AAACAATGCATTGACTAACTTTAGTACTTAAAGCATTTTTAGTGGAACAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAATGCATTGACTAACTTTAGTACTTAAAGCATTTTTAGTGGAACAA  779

seq1  TTCATGTGCAAAACATTTATCAAGTGCCTACTATGCATATATTAATCTCA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGTGCAAAACATTTATCAAGTGCCTACTATGCATATATTAATCTCA  829

seq1  AGTGTAAATATTTGGGAGAGAGTTATAGTAATCTGGCTTCTAAATTATAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTAAATATTTGGGAGAGAGTTATAGTAATCTGGCTTCTAAATTATAT  879

seq1  TGTTTTTTTCTTTTCTGTTTTAATGATGTTAATTCCATAGCTAAATCATT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTTTTCTTTTCTGTTTTAATGATGTTAATTCCATAGCTAAATCATT  929

seq1  AGACCAAATCTGTCTATTTCACATTTCTCACTTTGTATCTCTTTTGTTTC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAAATCTGTCTATTTCACATTTCTCACTTTGTATCTCTTTTGTTTC  979

seq1  CTTCTCAGTTATATTCTTTTAGGTATCCTTACTCTTCCCACAAATGTCCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCAGTTATATTCTTTTAGGTATCCTTACTCTTCCCACAAATGTCCT  1029

seq1  TATCTTGTTTATTCTTACAAAATATCGCAATAGGGGAACCCAAACATGGG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTGTTTATTCTTACAAAATATCGCAATAGGGGAACCCAAACATGGG  1079

seq1  CTGACTGCTATATTCACTTTTTGGTTCATGCCTCCCTTCAGTTATAGCGT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTGCTATATTCACTTTTTGGTTCATGCCTCCCTTCAGTTATAGCGT  1129

seq1  CTGCTACTGAATCCTCAGCTAGGAATCCACAATAAGCCCATATCTATATA  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTACTGAATCCTCAGCTAGGAATCCACAATAAGCCCATATCTATATA  1179

seq1  AAGAATTC  1206
      ||||||||
seq2  AAGAATTC  1187