BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-129J12.T7 (MSMg01no129_j12.b1) | MSMg01-129J12.TJ (MSMg01no129_j12.g1) |
ACC | AG337564 | AG337565 |
length | 708 | 721 |
length of high quality (start - end) | 551 (61 - 611) | 194 (126 - 319) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no129_j12.b1 PHD_FILE: MSMg01no129_j12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:43:03 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no129_j12.g1 PHD_FILE: MSMg01no129_j12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:43:04 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (71,386,580 - 71,387,130) | (71,479,571 - 71,479,762) |
---|
sequence | GCGGCCGCTATACGACTCCTATATCCAGAGGATCCGCGGAATTCCAACAT
CTCTCATTGATGAGAAAAAGAGTGGCTTCCAGGGTGTATTCTATTGCCTT
TCTGCCTAGCCAGCTAGCCATAGTCAAAGCACACCTTGCTATTAAGCCTT
ATTATGGAAGGAATGAGACAAAATTGCACAGCATGGCACATGGATGGTTA
AATATCTTAAGGAATTCATGGCAACACAACTGCCAGAAGAGATGTCCACA
TCACAAATACCCCTGTCAAACCTTTGCCTCTCTTCAGCTACAATGCAGTT
CTTACTGTCTCACACCTGATTCAGCTCTGCCTTGGGAATACTTATGTTGG
CTTTATTTATGAGCTTTCATTAAACCCATGTTAAAGTGCTTCATTGATAA
TACACTAAAATATGCCTGGCCCTTTTACATAAGATATCAATAATGGTACA
GCAGCACCACCATCAAGCTTGTGAACTCTCAGTTACCTGACTTAGCGGTT
GAAGACTTTGAGCTGGGTGAATGGACTTTTAACACAGATGAATCCAGGTT
CTGATGGAAATATGACCTGCTTCTCANATAGCCATGTCCCTTCATCTCAT
CATTTCCCAGTTTTAACTACCTCAAAATTAGAACAAAAATATAGTATGAT
GAGTCTCTGTTCTCTCTTAAGTTTTTGAACAGCAAAGGGATGCCCAAGAA
CATCAAGC
| TCGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXAAAAATTCTGTTGGAGGTTGGTGGTTCAGCTCTG
GAAAGCACCATCAATTTTTATCCACTGAAAATAGAAGGTTGGCCCTTATG
CTAGTACTTCTCATATATTGTGGATGTTTGGAACAAGACACAGGGTAGTG
AGGATCATTTGCTTAAAATTAGGGAACTAGGCCCCTTTTTCTGAGTCTGG
AATGTGTCTTGGTATAGCCCAAGGACAAAGAGCTCCCTGACTTAGGCAGG
CTTACATAAAGACTGGGTAGTATTTATGAAGAAACTAAAGGGGATTCCAC
ACAGGCTTTTCTCTCTCTCCCGCTATCACGAGTGGGTGTCTGACCTACTT
GTTCTTCACTCATTTCCCCTTTTCCTCAAATTCTTCCCTTCCTCCCACTT
GCTTCCAGTAGAGGTGGTTGGAGGGTGAGGTTGGTATAAACTAGGCAGGC
ACTGATGAATGCTCCATGGTAACATTACTCCTCCTTCTATCTTTAAGTTG
ACTCTGACTGTTTCACTCTCCCGCGGTTCAACCATTCATTCTTGTAGTTC
TCTATCCCCGTAACGGTTCCGGCCCCCGCCAATCCGTCTGTTCTGTGCGA
TCCTCGACTTGTTCACTATGCTTTTCCTACCTTTATTTGCCCTACTTTAT
TCCGCGTCCCTATTTACCTAG
|
quality values | Open.Hide.18 21 23 19 17 15 19 12 10 10 15 16 23 20 13 19 10 10 10 22 22 19 18 10 10 10 12 17 19 22 28 28 24 24 28 30 43 48 36 36 36 22 22 16 19 10 19 21 19 9
9 9 6 6 6 8 7 11 19 17 21 19 33 33 33 33 47 36 36 35 33 28 28 24 37 37 50 47 47 40 40 40 42 50 47 47 43 43 50 57 57 57 53 53 53 53 47 47 50 50
50 31 27 27 15 13 14 11 9 9 9 9 9 9 18 17 23 23 33 29 29 29 30 30 30 32 35 36 47 36 37 37 37 40 40 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 48 48 57 57
57 68 68 68 57 57 54 54 54 57 50 48 48 48 41 41 47 54 57 57 47 47 41 46 41 41 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 48 50 41 43 47 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 52 57 57 57 68 50 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 54 54 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43 52 57 52 52 52 57 57 57 54 57 59 43
50 50 59 59 59 57 57 36 36 32 28 32 31 28 37 40 43 48 44 68 57 57 57 57 57 47 57 57 59 59 59 59 59 44 42 42 30 37 37 43 57 57 57 43 43 43 43 43 43 37
37 43 44 59 59 48 48 43 43 39 24 19 10 10 10 21 27 46 46 39 47 39 43 43 43 43 48 43 48 43 46 46 46 46 47 47 59 35 39 37 21 16 9 9 9 13 23 37 41 41
47 47 37 37 28 37 30 28 28 37 37 43 48 48 48 48 57 57 48 59 48 59 59 57 54 48 48 42 42 39 42 35 28 28 33 33 42 39 39 43 43 40 43 39 39 31 31 30 32 31
28 28 25 37 31 39 39 47 57 48 48 48 48 48 46 46 43 43 43 57 57 57 54 48 42 43 40 39 32 34 34 40 37 30 37 39 39 39 48 48 48 28 28 15 15 15 19 19 23 23
32 22 20 23 23 32 32 37 30 25 17 17 30 28 22 17 22 21 24 26 30 30 30 33 43 43 43 42 42 42 37 28 28 28 20 32 31 43 42 42 36 36 24 28 12 13 13 19 19 30
37 40 33 23 23 23 28 36 39 48 48 48 48 39 39 39 37 33 41 41 32 29 23 18 16 3 0 3 25 23 41 41 43 32 26 17 17 19 30 23 34 28 23 23 23 32 37 28 23 23
32 34 43 48 48 41 41 23 23 20 16 16 14 14 19 30 28 20 13 11 10 10 8 9 14 17 17 15 15 10 10 9 10 12 12 10 14 21 24 28 23 18 10 9 9 9 19 15 21 21
19 19 24 22 24 29 34 25 19 12 12 15 19 16 20 23 28 32 20 20 28 28 30 28 34 30 15 10 10 8 10 8 8 8 13 16 37 37 37 31 30 23 14 12 11 11 10 12 9 9
10 10 10 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 6 10 9 9 9 9 17 17 11 11 9 14 13 28 23 25 41 42 33 33 33 33 33 33 47 27 27 9 6 6 6 6 7 6 9 9 18 17 17 22 17 28 30 30 31 36 36
50 33 33 33 33 30 21 21 11 9 9 9 7 7 6 6 6 6 10 12 10 10 8 10 15 17 22 28 31 44 31 36 30 35 35 32 36 36 36 36 42 37 40 36 37 37 47 57 57 57
57 36 26 14 14 12 26 26 33 31 31 30 27 16 15 12 13 10 6 6 6 6 6 6 10 24 30 30 30 37 33 33 28 28 37 28 38 36 36 36 36 47 47 48 57 57 50 50 48 48
48 48 48 57 57 54 54 54 54 50 50 50 68 50 57 57 50 47 47 41 41 32 40 33 40 40 46 50 50 59 57 57 48 48 48 48 47 47 43 43 43 43 47 47 47 44 39 39 37 39
57 42 42 50 50 47 50 57 57 57 48 48 43 50 59 50 54 54 50 50 50 54 54 50 50 47 41 41 50 44 44 44 43 50 50 57 57 57 57 57 54 43 44 43 57 48 46 57 48 47
47 47 46 46 41 39 39 44 42 42 37 35 39 39 57 44 47 47 57 57 54 57 57 57 57 54 48 48 48 48 43 46 43 42 42 41 36 36 42 42 47 43 43 43 43 43 47 47 48 48
48 57 57 57 48 48 48 48 43 37 37 37 37 34 26 18 12 11 11 10 9 8 6 6 6 6 7 17 37 31 31 30 37 37 43 43 43 43 43 43 47 43 47 47 50 50 47 48 48 48
41 41 41 28 28 12 11 11 10 9 9 9 9 9 11 11 19 17 14 14 9 9 9 11 12 12 11 11 11 16 16 32 31 39 41 43 35 37 37 39 39 39 39 42 39 43 43 48 43 59
59 59 59 57 57 57 48 48 48 57 59 59 48 57 48 59 59 37 32 25 19 15 13 13 10 9 9 9 9 10 18 20 28 32 33 39 43 43 43 37 39 30 30 30 37 30 30 30 32 40
59 59 59 48 47 42 39 22 23 11 11 11 23 23 28 28 13 13 13 15 15 21 24 15 15 14 15 21 31 24 21 18 10 8 8 8 10 10 10 19 19 16 9 9 10 12 10 8 8 8
8 8 10 18 15 20 13 11 13 11 8 8 9 15 16 22 19 19 16 16 24 19 19 10 10 10 12 10 8 10 10 8 8 10 17 18 17 12 11 10 10 9 9 9 12 10 10 11 16 18
22 28 28 12 12 9 8 8 8 8 8 8 8 9 12 16 28 24 30 28 28 28 18 10 8 6 7 7 6 6 6 8 8 16 19 24 19 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 11 12 12
14 26 12 12 12 19 20 17 15 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 10 13 17 14 10 11 9 9 8 8 8 8 10
9 7 11 8 6 6 8 8 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 21 15 12 12 15 8 8 8 8 10 10 10 13 15 20 22 13 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9
10 13 12 11 11 11 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 |